MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid lp54

Total Repeats: 1112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017804	ATCA	2	8	12	19	50 %	25 %	0 %	25 %	386853318
2	NC_017804	T	6	6	49	54	0 %	100 %	0 %	0 %	386853318
3	NC_017804	A	6	6	134	139	100 %	0 %	0 %	0 %	386853318
4	NC_017804	TAA	2	6	273	278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853318
5	NC_017804	ATT	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853318
6	NC_017804	TA	3	6	321	326	50 %	50 %	0 %	0 %	386853318
7	NC_017804	TGA	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386853318
8	NC_017804	TTTTA	2	10	418	427	20 %	80 %	0 %	0 %	386853318
9	NC_017804	CT	3	6	457	462	0 %	50 %	0 %	50 %	386853318
10	NC_017804	GGTT	2	8	467	474	0 %	50 %	50 %	0 %	386853318
11	NC_017804	TCT	3	9	500	508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386853318
12	NC_017804	AATA	2	8	598	605	75 %	25 %	0 %	0 %	386853318
13	NC_017804	ACC	2	6	632	637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386853318
14	NC_017804	TTA	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853318
15	NC_017804	GCA	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386853318
16	NC_017804	ATC	2	6	751	756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853318
17	NC_017804	A	6	6	779	784	100 %	0 %	0 %	0 %	386853318
18	NC_017804	AT	3	6	1020	1025	50 %	50 %	0 %	0 %	386853319
19	NC_017804	AAC	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853319
20	NC_017804	T	7	7	1106	1112	0 %	100 %	0 %	0 %	386853319
21	NC_017804	CTA	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853319
22	NC_017804	TTC	2	6	1247	1252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386853319
23	NC_017804	CAATTC	2	12	1259	1270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853319
24	NC_017804	TTA	2	6	1272	1277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853319
25	NC_017804	ATTT	2	8	1285	1292	25 %	75 %	0 %	0 %	386853319
26	NC_017804	ATT	2	6	1296	1301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853319
27	NC_017804	CAA	2	6	1450	1455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853319
28	NC_017804	CAT	2	6	1519	1524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853319
29	NC_017804	TTA	2	6	1569	1574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853319
30	NC_017804	T	8	8	1665	1672	0 %	100 %	0 %	0 %	386853319
31	NC_017804	ACA	2	6	1719	1724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853319
32	NC_017804	AAT	2	6	1794	1799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853319
33	NC_017804	ATT	2	6	1806	1811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853319
34	NC_017804	TCAA	2	8	2435	2442	50 %	25 %	0 %	25 %	386853320
35	NC_017804	GAA	2	6	2448	2453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853320
36	NC_017804	CAA	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853320
37	NC_017804	TAA	2	6	2501	2506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853320
38	NC_017804	AAC	2	6	2520	2525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853320
39	NC_017804	ACA	2	6	2528	2533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853320
40	NC_017804	AAT	2	6	2564	2569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853320
41	NC_017804	A	6	6	2571	2576	100 %	0 %	0 %	0 %	386853320
42	NC_017804	AAATGA	2	12	2591	2602	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386853320
43	NC_017804	AATT	2	8	2605	2612	50 %	50 %	0 %	0 %	386853320
44	NC_017804	A	6	6	2647	2652	100 %	0 %	0 %	0 %	386853320
45	NC_017804	A	6	6	2668	2673	100 %	0 %	0 %	0 %	386853320
46	NC_017804	AATA	2	8	2696	2703	75 %	25 %	0 %	0 %	386853320
47	NC_017804	A	6	6	2753	2758	100 %	0 %	0 %	0 %	386853320
48	NC_017804	AGA	2	6	2769	2774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853320
49	NC_017804	TTATT	2	10	2775	2784	20 %	80 %	0 %	0 %	386853320
50	NC_017804	ATG	2	6	2797	2802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386853320
51	NC_017804	AAAAT	2	10	2803	2812	80 %	20 %	0 %	0 %	386853320
52	NC_017804	A	6	6	2814	2819	100 %	0 %	0 %	0 %	386853320
53	NC_017804	ATT	2	6	2871	2876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853320
54	NC_017804	T	7	7	2883	2889	0 %	100 %	0 %	0 %	386853320
55	NC_017804	AGA	2	6	3053	3058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853320
56	NC_017804	TTA	2	6	3061	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853320
57	NC_017804	AAT	2	6	3107	3112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853320
58	NC_017804	AGA	2	6	3181	3186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853320
59	NC_017804	TAC	2	6	3193	3198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853320
60	NC_017804	TGT	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386853320
61	NC_017804	ACT	2	6	3223	3228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853320
62	NC_017804	ACA	2	6	3438	3443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853321
63	NC_017804	TTG	2	6	3475	3480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386853321
64	NC_017804	AAC	2	6	3525	3530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853321
65	NC_017804	AATC	2	8	3543	3550	50 %	25 %	0 %	25 %	386853321
66	NC_017804	TCAAA	2	10	3567	3576	60 %	20 %	0 %	20 %	386853321
67	NC_017804	AGA	2	6	3590	3595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853321
68	NC_017804	AAG	2	6	3624	3629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853321
69	NC_017804	A	8	8	3643	3650	100 %	0 %	0 %	0 %	386853321
70	NC_017804	TGC	3	9	3674	3682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386853321
71	NC_017804	A	6	6	3742	3747	100 %	0 %	0 %	0 %	386853321
72	NC_017804	TAA	2	6	3751	3756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853321
73	NC_017804	A	7	7	3755	3761	100 %	0 %	0 %	0 %	386853321
74	NC_017804	T	6	6	3893	3898	0 %	100 %	0 %	0 %	386853322
75	NC_017804	GTT	2	6	3918	3923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386853322
76	NC_017804	A	7	7	4024	4030	100 %	0 %	0 %	0 %	386853322
77	NC_017804	ACA	2	6	4068	4073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853322
78	NC_017804	ACA	2	6	4087	4092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853322
79	NC_017804	AT	3	6	4106	4111	50 %	50 %	0 %	0 %	386853322
80	NC_017804	ATTG	2	8	4145	4152	25 %	50 %	25 %	0 %	386853322
81	NC_017804	TAA	2	6	4154	4159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853322
82	NC_017804	A	7	7	4164	4170	100 %	0 %	0 %	0 %	386853323
83	NC_017804	T	8	8	4187	4194	0 %	100 %	0 %	0 %	386853323
84	NC_017804	TTC	2	6	4208	4213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386853323
85	NC_017804	T	9	9	4216	4224	0 %	100 %	0 %	0 %	386853323
86	NC_017804	ACA	2	6	4253	4258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853323
87	NC_017804	TTTA	2	8	4271	4278	25 %	75 %	0 %	0 %	386853323
88	NC_017804	TTA	2	6	4283	4288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853323
89	NC_017804	ACTAA	2	10	4471	4480	60 %	20 %	0 %	20 %	386853324
90	NC_017804	TTG	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386853324
91	NC_017804	TAA	2	6	4505	4510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853324
92	NC_017804	A	7	7	4562	4568	100 %	0 %	0 %	0 %	386853324
93	NC_017804	AAAT	2	8	4581	4588	75 %	25 %	0 %	0 %	386853324
94	NC_017804	AAAGAA	2	12	4608	4619	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386853324
95	NC_017804	A	6	6	4622	4627	100 %	0 %	0 %	0 %	386853324
96	NC_017804	GCT	2	6	4651	4656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386853324
97	NC_017804	A	8	8	4673	4680	100 %	0 %	0 %	0 %	386853324
98	NC_017804	AT	3	6	4686	4691	50 %	50 %	0 %	0 %	386853324
99	NC_017804	AAAT	2	8	4694	4701	75 %	25 %	0 %	0 %	386853324
100	NC_017804	AATT	2	8	4719	4726	50 %	50 %	0 %	0 %	386853324
101	NC_017804	TGA	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386853324
102	NC_017804	GAA	2	6	4774	4779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853324
103	NC_017804	A	6	6	4826	4831	100 %	0 %	0 %	0 %	386853324
104	NC_017804	ACA	2	6	4865	4870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853324
105	NC_017804	AGC	2	6	4914	4919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386853324
106	NC_017804	ATAG	2	8	4936	4943	50 %	25 %	25 %	0 %	386853324
107	NC_017804	TAA	2	6	4955	4960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853324
108	NC_017804	AAT	2	6	4968	4973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853324
109	NC_017804	AGACA	2	10	5042	5051	60 %	0 %	20 %	20 %	386853324
110	NC_017804	A	7	7	5061	5067	100 %	0 %	0 %	0 %	386853324
111	NC_017804	TGA	2	6	5082	5087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386853324
112	NC_017804	A	6	6	5103	5108	100 %	0 %	0 %	0 %	386853324
113	NC_017804	AGG	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386853325
114	NC_017804	A	7	7	5491	5497	100 %	0 %	0 %	0 %	386853325
115	NC_017804	TTA	2	6	5525	5530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853325
116	NC_017804	AAT	2	6	5532	5537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853325
117	NC_017804	AAAG	2	8	5608	5615	75 %	0 %	25 %	0 %	386853325
118	NC_017804	T	6	6	5625	5630	0 %	100 %	0 %	0 %	386853325
119	NC_017804	AAAT	2	8	5631	5638	75 %	25 %	0 %	0 %	386853325
120	NC_017804	AGA	4	12	5673	5684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853325
121	NC_017804	AAG	2	6	5713	5718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853325
122	NC_017804	A	8	8	5732	5739	100 %	0 %	0 %	0 %	386853325
123	NC_017804	TGC	3	9	5763	5771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386853325
124	NC_017804	AAT	2	6	5850	5855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853325
125	NC_017804	A	6	6	5882	5887	100 %	0 %	0 %	0 %	386853325
126	NC_017804	TTCA	2	8	5977	5984	25 %	50 %	0 %	25 %	386853325
127	NC_017804	TA	3	6	6026	6031	50 %	50 %	0 %	0 %	386853325
128	NC_017804	AAG	2	6	6044	6049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853325
129	NC_017804	CTA	2	6	6058	6063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853325
130	NC_017804	TAAAAC	2	12	6083	6094	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853325
131	NC_017804	ACA	2	6	6149	6154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853325
132	NC_017804	ATTA	2	8	6226	6233	50 %	50 %	0 %	0 %	386853325
133	NC_017804	TGC	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386853326
134	NC_017804	AAAG	2	8	6583	6590	75 %	0 %	25 %	0 %	386853326
135	NC_017804	TAAA	2	8	6620	6627	75 %	25 %	0 %	0 %	386853326
136	NC_017804	AGA	2	6	6657	6662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853326
137	NC_017804	TAC	2	6	6723	6728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853326
138	NC_017804	AACCC	2	10	6756	6765	40 %	0 %	0 %	60 %	386853326
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399	NC_017804	A	6	6	21274	21279	100 %	0 %	0 %	0 %	386853347
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