MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017789	T	6	6	335	340	0 %	100 %	0 %	0 %	386858641
2	NC_017789	AAG	2	6	391	396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858641
3	NC_017789	AT	5	10	439	448	50 %	50 %	0 %	0 %	386858641
4	NC_017789	TAT	2	6	484	489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858641
5	NC_017789	T	6	6	502	507	0 %	100 %	0 %	0 %	386858641
6	NC_017789	CTT	2	6	519	524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858641
7	NC_017789	A	7	7	533	539	100 %	0 %	0 %	0 %	386858641
8	NC_017789	TA	3	6	568	573	50 %	50 %	0 %	0 %	386858641
9	NC_017789	CAA	2	6	582	587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858641
10	NC_017789	TCT	2	6	593	598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858641
11	NC_017789	AAT	2	6	618	623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858641
12	NC_017789	TTC	2	6	664	669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858641
13	NC_017789	TC	3	6	778	783	0 %	50 %	0 %	50 %	386858641
14	NC_017789	ATT	2	6	806	811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858641
15	NC_017789	ATA	2	6	857	862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858641
16	NC_017789	TTTTAT	2	12	868	879	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386858641
17	NC_017789	CAT	2	6	880	885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858641
18	NC_017789	TAAC	2	8	906	913	50 %	25 %	0 %	25 %	386858641
19	NC_017789	TTTA	2	8	1053	1060	25 %	75 %	0 %	0 %	386858642
20	NC_017789	A	6	6	1123	1128	100 %	0 %	0 %	0 %	386858642
21	NC_017789	TAT	2	6	1169	1174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858642
22	NC_017789	ACT	2	6	1192	1197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858642
23	NC_017789	AAC	2	6	1305	1310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858642
24	NC_017789	ATA	2	6	1327	1332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858642
25	NC_017789	ATT	2	6	1354	1359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858642
26	NC_017789	TAA	2	6	1380	1385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858642
27	NC_017789	ATC	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858642
28	NC_017789	CAA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858642
29	NC_017789	CTATC	2	10	1511	1520	20 %	40 %	0 %	40 %	386858642
30	NC_017789	ATC	2	6	1566	1571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858642
31	NC_017789	ATCA	2	8	1617	1624	50 %	25 %	0 %	25 %	386858642
32	NC_017789	AAT	2	6	1648	1653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858642
33	NC_017789	ATA	2	6	1663	1668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858642
34	NC_017789	TTGA	2	8	1696	1703	25 %	50 %	25 %	0 %	386858642
35	NC_017789	ATT	2	6	1714	1719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858642
36	NC_017789	T	8	8	1726	1733	0 %	100 %	0 %	0 %	386858642
37	NC_017789	TCCG	2	8	1754	1761	0 %	25 %	25 %	50 %	386858643
38	NC_017789	TACC	2	8	1840	1847	25 %	25 %	0 %	50 %	386858643
39	NC_017789	TAA	2	6	1859	1864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858643
40	NC_017789	TA	3	6	1919	1924	50 %	50 %	0 %	0 %	386858643
41	NC_017789	ATA	2	6	1953	1958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858643
42	NC_017789	TTC	2	6	1964	1969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858643
43	NC_017789	T	6	6	1986	1991	0 %	100 %	0 %	0 %	386858643
44	NC_017789	A	6	6	2011	2016	100 %	0 %	0 %	0 %	386858643
45	NC_017789	AAAT	2	8	2048	2055	75 %	25 %	0 %	0 %	386858643
46	NC_017789	T	6	6	2068	2073	0 %	100 %	0 %	0 %	386858643
47	NC_017789	A	6	6	2102	2107	100 %	0 %	0 %	0 %	386858643
48	NC_017789	ATAC	2	8	2137	2144	50 %	25 %	0 %	25 %	386858643
49	NC_017789	T	6	6	2221	2226	0 %	100 %	0 %	0 %	386858643
50	NC_017789	T	7	7	2241	2247	0 %	100 %	0 %	0 %	386858643
51	NC_017789	CAA	2	6	2290	2295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858644
52	NC_017789	TAA	2	6	2355	2360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858644
53	NC_017789	ATT	2	6	2366	2371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858644
54	NC_017789	AAT	2	6	2410	2415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858644
55	NC_017789	TTC	2	6	2454	2459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858644
56	NC_017789	AT	3	6	2482	2487	50 %	50 %	0 %	0 %	386858644
57	NC_017789	TCT	2	6	2508	2513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858644
58	NC_017789	T	6	6	2522	2527	0 %	100 %	0 %	0 %	386858644
59	NC_017789	T	7	7	2542	2548	0 %	100 %	0 %	0 %	386858644
60	NC_017789	TTC	2	6	2684	2689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858644
61	NC_017789	T	8	8	2690	2697	0 %	100 %	0 %	0 %	386858644
62	NC_017789	T	7	7	2708	2714	0 %	100 %	0 %	0 %	386858644
63	NC_017789	CTA	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858644
64	NC_017789	TCTTAT	2	12	2740	2751	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386858644
65	NC_017789	TCTAT	2	10	2763	2772	20 %	60 %	0 %	20 %	386858644
66	NC_017789	CTTC	2	8	2776	2783	0 %	50 %	0 %	50 %	386858644
67	NC_017789	TGT	2	6	2819	2824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858644
68	NC_017789	AG	3	6	2840	2845	50 %	0 %	50 %	0 %	386858644
69	NC_017789	ATC	2	6	2852	2857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858644
70	NC_017789	CTT	2	6	2870	2875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858644
71	NC_017789	TA	3	6	2876	2881	50 %	50 %	0 %	0 %	386858644
72	NC_017789	TCTT	2	8	2903	2910	0 %	75 %	0 %	25 %	386858644
73	NC_017789	T	8	8	2909	2916	0 %	100 %	0 %	0 %	386858644
74	NC_017789	TTC	2	6	2928	2933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858644
75	NC_017789	TAT	2	6	2938	2943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858644
76	NC_017789	TAT	3	9	2947	2955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858644
77	NC_017789	ATT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858644
78	NC_017789	TGTT	2	8	3014	3021	0 %	75 %	25 %	0 %	386858644
79	NC_017789	GAT	2	6	3022	3027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858644
80	NC_017789	GTT	2	6	3040	3045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858644
81	NC_017789	TCT	2	6	3054	3059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858644
82	NC_017789	T	6	6	3059	3064	0 %	100 %	0 %	0 %	386858644
83	NC_017789	T	6	6	3101	3106	0 %	100 %	0 %	0 %	386858644

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.