MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-3

Total Repeats: 691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017427	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387826640
2	NC_017427	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387826640
3	NC_017427	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387826640
4	NC_017427	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826640
5	NC_017427	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826640
6	NC_017427	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826640
7	NC_017427	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826640
8	NC_017427	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826640
9	NC_017427	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387826640
10	NC_017427	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826640
11	NC_017427	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387826640
12	NC_017427	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826640
13	NC_017427	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826640
14	NC_017427	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826640
15	NC_017427	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826640
16	NC_017427	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	387826640
17	NC_017427	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826640
18	NC_017427	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826640
19	NC_017427	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826640
20	NC_017427	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	387826640
21	NC_017427	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826640
22	NC_017427	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826640
23	NC_017427	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826640
24	NC_017427	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826640
25	NC_017427	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826640
26	NC_017427	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826640
27	NC_017427	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826641
28	NC_017427	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826641
29	NC_017427	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826641
30	NC_017427	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826641
31	NC_017427	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	387826641
32	NC_017427	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	387826641
33	NC_017427	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	387826641
34	NC_017427	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	387826641
35	NC_017427	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826641
36	NC_017427	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826641
37	NC_017427	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	387826641
38	NC_017427	CAA	2	6	2086	2091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826642
39	NC_017427	T	6	6	2141	2146	0 %	100 %	0 %	0 %	387826642
40	NC_017427	TGG	2	6	2154	2159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826642
41	NC_017427	AAC	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826642
42	NC_017427	TGG	3	9	2274	2282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826642
43	NC_017427	GT	3	6	2299	2304	0 %	50 %	50 %	0 %	387826642
44	NC_017427	AAGA	2	8	2380	2387	75 %	0 %	25 %	0 %	387826642
45	NC_017427	TAAAT	2	10	2415	2424	60 %	40 %	0 %	0 %	387826642
46	NC_017427	CA	3	6	2498	2503	50 %	0 %	0 %	50 %	387826642
47	NC_017427	ATTT	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	387826642
48	NC_017427	TAA	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826642
49	NC_017427	GCT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826643
50	NC_017427	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	387826643
51	NC_017427	TGA	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826643
52	NC_017427	AGT	2	6	2815	2820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826643
53	NC_017427	TA	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	387826643
54	NC_017427	CTGATA	2	12	2984	2995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826643
55	NC_017427	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	387826643
56	NC_017427	GTAT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	25 %	0 %	387826643
57	NC_017427	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	387826643
58	NC_017427	TTA	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826643
59	NC_017427	CCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826643
60	NC_017427	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	387826643
61	NC_017427	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	387826643
62	NC_017427	TGG	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826643
63	NC_017427	TAAA	2	8	3362	3369	75 %	25 %	0 %	0 %	387826644
64	NC_017427	AAG	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826644
65	NC_017427	T	6	6	3501	3506	0 %	100 %	0 %	0 %	387826644
66	NC_017427	ATC	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826644
67	NC_017427	TGG	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826644
68	NC_017427	CTA	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826644
69	NC_017427	AAT	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826644
70	NC_017427	TAG	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826644
71	NC_017427	TAA	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826644
72	NC_017427	TTTA	2	8	3889	3896	25 %	75 %	0 %	0 %	387826644
73	NC_017427	TAA	2	6	3939	3944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826644
74	NC_017427	ATT	2	6	3968	3973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826645
75	NC_017427	TGA	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826645
76	NC_017427	ATT	2	6	3982	3987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826645
77	NC_017427	TAT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826645
78	NC_017427	A	6	6	4093	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	387826645
79	NC_017427	ACA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826645
80	NC_017427	ATT	2	6	4201	4206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826645
81	NC_017427	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	387826645
82	NC_017427	TAA	3	9	4286	4294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826645
83	NC_017427	AGT	2	6	4329	4334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826645
84	NC_017427	TTA	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826645
85	NC_017427	ACT	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826645
86	NC_017427	AGA	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826645
87	NC_017427	GTG	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826645
88	NC_017427	A	6	6	4507	4512	100 %	0 %	0 %	0 %	387826645
89	NC_017427	CGA	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826645
90	NC_017427	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826645
91	NC_017427	GCA	3	9	4614	4622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826645
92	NC_017427	AGT	2	6	4635	4640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826645
93	NC_017427	TAA	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826645
94	NC_017427	AGA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826645
95	NC_017427	TTA	2	6	4765	4770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826645
96	NC_017427	AGTA	2	8	4782	4789	50 %	25 %	25 %	0 %	387826645
97	NC_017427	CTAC	2	8	4794	4801	25 %	25 %	0 %	50 %	387826645
98	NC_017427	GGT	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826645
99	NC_017427	CTA	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826645
100	NC_017427	GAA	3	9	4981	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826646
101	NC_017427	TACT	2	8	5150	5157	25 %	50 %	0 %	25 %	387826646
102	NC_017427	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826646
103	NC_017427	GAATTT	2	12	5203	5214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826646
104	NC_017427	A	6	6	5224	5229	100 %	0 %	0 %	0 %	387826646
105	NC_017427	TGAACT	2	12	5241	5252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826646
106	NC_017427	ATT	2	6	5255	5260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826646
107	NC_017427	TAG	2	6	5265	5270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826646
108	NC_017427	GAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826646
109	NC_017427	GGC	2	6	5287	5292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387826646
110	NC_017427	G	6	6	5295	5300	0 %	0 %	100 %	0 %	387826646
111	NC_017427	TG	3	6	5380	5385	0 %	50 %	50 %	0 %	387826646
112	NC_017427	AATG	2	8	5396	5403	50 %	25 %	25 %	0 %	387826646
113	NC_017427	TGT	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826647
114	NC_017427	TTC	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826647
115	NC_017427	AG	3	6	5521	5526	50 %	0 %	50 %	0 %	387826647
116	NC_017427	TTA	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826647
117	NC_017427	ATTTA	2	10	5695	5704	40 %	60 %	0 %	0 %	387826647
118	NC_017427	TGG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826648
119	NC_017427	AT	3	6	5914	5919	50 %	50 %	0 %	0 %	387826648
120	NC_017427	AAT	2	6	5921	5926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826648
121	NC_017427	TA	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	387826648
122	NC_017427	TAT	2	6	6015	6020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826648
123	NC_017427	AAGT	2	8	6061	6068	50 %	25 %	25 %	0 %	387826648
124	NC_017427	GTA	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826648
125	NC_017427	GCA	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826648
126	NC_017427	TTG	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826648
127	NC_017427	AAT	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826649
128	NC_017427	GCT	2	6	6289	6294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826649
129	NC_017427	ATA	2	6	6304	6309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826649
130	NC_017427	AT	4	8	6406	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	387826649
131	NC_017427	AT	3	6	6543	6548	50 %	50 %	0 %	0 %	387826649
132	NC_017427	AATT	2	8	6555	6562	50 %	50 %	0 %	0 %	387826649
133	NC_017427	TAAT	2	8	6602	6609	50 %	50 %	0 %	0 %	387826649
134	NC_017427	AGG	2	6	6689	6694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826649
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