MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-4

Total Repeats: 556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017416	A	6	6	350	355	100 %	0 %	0 %	0 %	387828030
2	NC_017416	AT	3	6	391	396	50 %	50 %	0 %	0 %	387828030
3	NC_017416	AAC	2	6	411	416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828030
4	NC_017416	CTAT	2	8	498	505	25 %	50 %	0 %	25 %	387828030
5	NC_017416	ATTA	2	8	519	526	50 %	50 %	0 %	0 %	387828030
6	NC_017416	A	6	6	533	538	100 %	0 %	0 %	0 %	387828030
7	NC_017416	TAC	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828030
8	NC_017416	AAC	2	6	565	570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828030
9	NC_017416	ATT	2	6	576	581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828030
10	NC_017416	A	6	6	641	646	100 %	0 %	0 %	0 %	387828030
11	NC_017416	AT	3	6	698	703	50 %	50 %	0 %	0 %	387828030
12	NC_017416	TCAA	2	8	727	734	50 %	25 %	0 %	25 %	387828030
13	NC_017416	AAT	2	6	735	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828030
14	NC_017416	ATT	2	6	745	750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828030
15	NC_017416	CTA	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828030
16	NC_017416	T	7	7	803	809	0 %	100 %	0 %	0 %	387828030
17	NC_017416	A	7	7	869	875	100 %	0 %	0 %	0 %	387828030
18	NC_017416	T	6	6	930	935	0 %	100 %	0 %	0 %	387828030
19	NC_017416	A	6	6	949	954	100 %	0 %	0 %	0 %	387828030
20	NC_017416	ATT	2	6	1062	1067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
21	NC_017416	ATT	2	6	1075	1080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
22	NC_017416	TTA	2	6	1081	1086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
23	NC_017416	AAT	2	6	1120	1125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828031
24	NC_017416	A	6	6	1148	1153	100 %	0 %	0 %	0 %	387828031
25	NC_017416	TTA	2	6	1322	1327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
26	NC_017416	A	7	7	1351	1357	100 %	0 %	0 %	0 %	387828031
27	NC_017416	AGA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828031
28	NC_017416	TA	3	6	1393	1398	50 %	50 %	0 %	0 %	387828031
29	NC_017416	G	6	6	1420	1425	0 %	0 %	100 %	0 %	387828031
30	NC_017416	AATC	2	8	1452	1459	50 %	25 %	0 %	25 %	387828031
31	NC_017416	ATC	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828031
32	NC_017416	TC	3	6	1479	1484	0 %	50 %	0 %	50 %	387828031
33	NC_017416	AT	3	6	1508	1513	50 %	50 %	0 %	0 %	387828031
34	NC_017416	A	8	8	1695	1702	100 %	0 %	0 %	0 %	387828032
35	NC_017416	A	7	7	1705	1711	100 %	0 %	0 %	0 %	387828032
36	NC_017416	A	6	6	1729	1734	100 %	0 %	0 %	0 %	387828032
37	NC_017416	ATA	2	6	1746	1751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828032
38	NC_017416	AAC	2	6	1774	1779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828032
39	NC_017416	ATT	2	6	1834	1839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828032
40	NC_017416	AAT	2	6	1854	1859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828032
41	NC_017416	A	8	8	1867	1874	100 %	0 %	0 %	0 %	387828032
42	NC_017416	A	6	6	1902	1907	100 %	0 %	0 %	0 %	387828032
43	NC_017416	CAA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828032
44	NC_017416	AT	3	6	1954	1959	50 %	50 %	0 %	0 %	387828032
45	NC_017416	ATA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828032
46	NC_017416	AT	3	6	2009	2014	50 %	50 %	0 %	0 %	387828032
47	NC_017416	TAT	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828032
48	NC_017416	ATTA	2	8	2028	2035	50 %	50 %	0 %	0 %	387828032
49	NC_017416	ACT	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828032
50	NC_017416	ACA	2	6	2099	2104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828032
51	NC_017416	CTA	2	6	2122	2127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828032
52	NC_017416	A	7	7	2253	2259	100 %	0 %	0 %	0 %	387828033
53	NC_017416	TAA	2	6	2297	2302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828033
54	NC_017416	AC	3	6	2312	2317	50 %	0 %	0 %	50 %	387828033
55	NC_017416	ACA	2	6	2321	2326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828033
56	NC_017416	A	6	6	2340	2345	100 %	0 %	0 %	0 %	387828033
57	NC_017416	TAG	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828033
58	NC_017416	ACA	2	6	2408	2413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828033
59	NC_017416	TTA	2	6	2443	2448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828033
60	NC_017416	AAC	2	6	2473	2478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828033
61	NC_017416	TAA	2	6	2493	2498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828033
62	NC_017416	A	7	7	2510	2516	100 %	0 %	0 %	0 %	387828033
63	NC_017416	TAC	2	6	2530	2535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828033
64	NC_017416	CAAT	2	8	2537	2544	50 %	25 %	0 %	25 %	387828033
65	NC_017416	ACT	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828033
66	NC_017416	A	6	6	2774	2779	100 %	0 %	0 %	0 %	387828034
67	NC_017416	TA	3	6	2780	2785	50 %	50 %	0 %	0 %	387828034
68	NC_017416	TTA	3	9	2884	2892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828034
69	NC_017416	TTA	2	6	3068	3073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828035
70	NC_017416	ACA	2	6	3112	3117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828035
71	NC_017416	AAC	2	6	3121	3126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828035
72	NC_017416	TAA	2	6	3141	3146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828035
73	NC_017416	CAA	2	6	3176	3181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828035
74	NC_017416	AAACA	2	10	3192	3201	80 %	0 %	0 %	20 %	387828035
75	NC_017416	A	6	6	3218	3223	100 %	0 %	0 %	0 %	387828035
76	NC_017416	A	9	9	3252	3260	100 %	0 %	0 %	0 %	387828035
77	NC_017416	A	6	6	3333	3338	100 %	0 %	0 %	0 %	387828035
78	NC_017416	CTA	2	6	3339	3344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828035
79	NC_017416	T	8	8	4051	4058	0 %	100 %	0 %	0 %	387828036
80	NC_017416	AAAT	2	8	4094	4101	75 %	25 %	0 %	0 %	387828036
81	NC_017416	TAA	2	6	4133	4138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
82	NC_017416	AGA	2	6	4161	4166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
83	NC_017416	ATT	2	6	4177	4182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828036
84	NC_017416	CAAAA	2	10	4183	4192	80 %	0 %	0 %	20 %	387828036
85	NC_017416	A	6	6	4189	4194	100 %	0 %	0 %	0 %	387828036
86	NC_017416	AGA	2	6	4206	4211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
87	NC_017416	AGA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
88	NC_017416	A	9	9	4221	4229	100 %	0 %	0 %	0 %	387828036
89	NC_017416	ATA	2	6	4256	4261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
90	NC_017416	AAAT	2	8	4289	4296	75 %	25 %	0 %	0 %	387828036
91	NC_017416	TATAT	2	10	4315	4324	40 %	60 %	0 %	0 %	387828036
92	NC_017416	AAAT	2	8	4386	4393	75 %	25 %	0 %	0 %	387828036
93	NC_017416	ACA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828036
94	NC_017416	A	6	6	4495	4500	100 %	0 %	0 %	0 %	387828036
95	NC_017416	TAAAA	2	10	4536	4545	80 %	20 %	0 %	0 %	387828036
96	NC_017416	AT	3	6	4563	4568	50 %	50 %	0 %	0 %	387828036
97	NC_017416	TAA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
98	NC_017416	ATC	2	6	4601	4606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828036
99	NC_017416	AGA	2	6	4626	4631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
100	NC_017416	CGCAAT	2	12	4641	4652	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387828036
101	NC_017416	ATC	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828036
102	NC_017416	CAA	2	6	4737	4742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828036
103	NC_017416	AAT	2	6	4747	4752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
104	NC_017416	GAT	2	6	4756	4761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828036
105	NC_017416	A	6	6	4765	4770	100 %	0 %	0 %	0 %	387828036
106	NC_017416	A	7	7	4776	4782	100 %	0 %	0 %	0 %	387828036
107	NC_017416	CTT	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828036
108	NC_017416	TAG	2	6	4805	4810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828036
109	NC_017416	TTAA	2	8	4816	4823	50 %	50 %	0 %	0 %	387828036
110	NC_017416	AT	3	6	6633	6638	50 %	50 %	0 %	0 %	387828037
111	NC_017416	ATT	2	6	6700	6705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828037
112	NC_017416	AGA	2	6	6763	6768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828037
113	NC_017416	A	6	6	6774	6779	100 %	0 %	0 %	0 %	387828037
114	NC_017416	AAAT	2	8	6793	6800	75 %	25 %	0 %	0 %	387828037
115	NC_017416	A	7	7	6806	6812	100 %	0 %	0 %	0 %	387828037
116	NC_017416	AAC	2	6	8128	8133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828038
117	NC_017416	T	7	7	8151	8157	0 %	100 %	0 %	0 %	387828038
118	NC_017416	CAA	2	6	8158	8163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828038
119	NC_017416	A	7	7	8191	8197	100 %	0 %	0 %	0 %	387828038
120	NC_017416	AGA	2	6	8231	8236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828038
121	NC_017416	A	7	7	8269	8275	100 %	0 %	0 %	0 %	387828038
122	NC_017416	GAA	2	6	8294	8299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828038
123	NC_017416	TAT	2	6	8305	8310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828038
124	NC_017416	AGA	3	9	8842	8850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
125	NC_017416	A	6	6	8858	8863	100 %	0 %	0 %	0 %	387828039
126	NC_017416	CAA	2	6	8864	8869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
127	NC_017416	GAA	2	6	8870	8875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
128	NC_017416	A	6	6	8885	8890	100 %	0 %	0 %	0 %	387828039
129	NC_017416	CAA	2	6	8891	8896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
130	NC_017416	GAA	2	6	8897	8902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
131	NC_017416	A	6	6	8912	8917	100 %	0 %	0 %	0 %	387828039
132	NC_017416	CAA	2	6	8918	8923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
133	NC_017416	GAA	2	6	8924	8929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
134	NC_017416	A	6	6	8939	8944	100 %	0 %	0 %	0 %	387828039
135	NC_017416	CAA	2	6	8945	8950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
136	NC_017416	GAA	2	6	8951	8956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
137	NC_017416	A	6	6	8966	8971	100 %	0 %	0 %	0 %	387828039
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139	NC_017416	GAA	2	6	8978	8983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
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402	NC_017416	AT	3	6	20832	20837	50 %	50 %	0 %	0 %	387828046
403	NC_017416	T	6	6	20841	20846	0 %	100 %	0 %	0 %	387828046
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