MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-4

Total Repeats: 485

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017407	ATT	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826818
2	NC_017407	TG	3	6	271	276	0 %	50 %	50 %	0 %	387826818
3	NC_017407	T	6	6	278	283	0 %	100 %	0 %	0 %	387826818
4	NC_017407	GAT	2	6	342	347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826818
5	NC_017407	CTT	2	6	369	374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826818
6	NC_017407	AGA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
7	NC_017407	TTCT	2	8	559	566	0 %	75 %	0 %	25 %	387826818
8	NC_017407	GAA	2	6	633	638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
9	NC_017407	GAA	2	6	675	680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
10	NC_017407	AGT	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826818
11	NC_017407	A	6	6	808	813	100 %	0 %	0 %	0 %	387826818
12	NC_017407	TAA	2	6	815	820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826818
13	NC_017407	ATA	2	6	859	864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826818
14	NC_017407	GAA	2	6	921	926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
15	NC_017407	A	6	6	925	930	100 %	0 %	0 %	0 %	387826818
16	NC_017407	AC	3	6	933	938	50 %	0 %	0 %	50 %	387826818
17	NC_017407	TAA	2	6	968	973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826818
18	NC_017407	TGG	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826818
19	NC_017407	AGA	2	6	1052	1057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
20	NC_017407	AAG	2	6	1061	1066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
21	NC_017407	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
22	NC_017407	AAT	2	6	1203	1208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826818
23	NC_017407	GAA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
24	NC_017407	A	6	6	1555	1560	100 %	0 %	0 %	0 %	387826819
25	NC_017407	CTT	2	6	1561	1566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826819
26	NC_017407	AT	3	6	1612	1617	50 %	50 %	0 %	0 %	387826819
27	NC_017407	TCAA	2	8	1641	1648	50 %	25 %	0 %	25 %	387826819
28	NC_017407	AAT	2	6	1649	1654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826819
29	NC_017407	ATT	2	6	1659	1664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826819
30	NC_017407	CTA	2	6	1692	1697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826819
31	NC_017407	T	7	7	1717	1723	0 %	100 %	0 %	0 %	387826819
32	NC_017407	A	7	7	1783	1789	100 %	0 %	0 %	0 %	387826819
33	NC_017407	T	6	6	1844	1849	0 %	100 %	0 %	0 %	387826819
34	NC_017407	TTA	2	6	2235	2240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826820
35	NC_017407	A	7	7	2264	2270	100 %	0 %	0 %	0 %	387826820
36	NC_017407	AGA	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826820
37	NC_017407	TA	3	6	2306	2311	50 %	50 %	0 %	0 %	387826820
38	NC_017407	G	7	7	2333	2339	0 %	0 %	100 %	0 %	387826820
39	NC_017407	AATC	2	8	2366	2373	50 %	25 %	0 %	25 %	387826820
40	NC_017407	ATC	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826820
41	NC_017407	TC	3	6	2393	2398	0 %	50 %	0 %	50 %	387826820
42	NC_017407	AT	3	6	2422	2427	50 %	50 %	0 %	0 %	387826820
43	NC_017407	A	6	6	2452	2457	100 %	0 %	0 %	0 %	387826820
44	NC_017407	TAG	3	9	2461	2469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826820
45	NC_017407	TAC	2	6	2477	2482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826820
46	NC_017407	A	6	6	2538	2543	100 %	0 %	0 %	0 %	387826820
47	NC_017407	A	8	8	2609	2616	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
48	NC_017407	A	7	7	2619	2625	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
49	NC_017407	A	6	6	2643	2648	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
50	NC_017407	ATA	2	6	2660	2665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826821
51	NC_017407	AAC	2	6	2688	2693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826821
52	NC_017407	ATT	2	6	2748	2753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826821
53	NC_017407	AAT	2	6	2768	2773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826821
54	NC_017407	A	8	8	2781	2788	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
55	NC_017407	A	6	6	2816	2821	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
56	NC_017407	CAA	2	6	2847	2852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826821
57	NC_017407	AT	3	6	2868	2873	50 %	50 %	0 %	0 %	387826821
58	NC_017407	ATA	2	6	2891	2896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826821
59	NC_017407	AT	3	6	2923	2928	50 %	50 %	0 %	0 %	387826821
60	NC_017407	TAT	2	6	2933	2938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826821
61	NC_017407	ATTA	2	8	2942	2949	50 %	50 %	0 %	0 %	387826821
62	NC_017407	ACT	2	6	2982	2987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826821
63	NC_017407	ACA	2	6	3013	3018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826821
64	NC_017407	CTA	2	6	3036	3041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826821
65	NC_017407	A	7	7	3167	3173	100 %	0 %	0 %	0 %	387826822
66	NC_017407	TAA	2	6	3211	3216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826822
67	NC_017407	AC	3	6	3226	3231	50 %	0 %	0 %	50 %	387826822
68	NC_017407	ACA	2	6	3235	3240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826822
69	NC_017407	A	6	6	3254	3259	100 %	0 %	0 %	0 %	387826822
70	NC_017407	TAG	2	6	3272	3277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826822
71	NC_017407	ACA	2	6	3322	3327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826822
72	NC_017407	TTA	2	6	3357	3362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826822
73	NC_017407	AAC	2	6	3387	3392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826822
74	NC_017407	TAA	2	6	3407	3412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826822
75	NC_017407	A	7	7	3424	3430	100 %	0 %	0 %	0 %	387826822
76	NC_017407	TAC	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826822
77	NC_017407	CAAT	2	8	3451	3458	50 %	25 %	0 %	25 %	387826822
78	NC_017407	ACT	2	6	3490	3495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826822
79	NC_017407	A	6	6	3688	3693	100 %	0 %	0 %	0 %	387826823
80	NC_017407	TA	3	6	3694	3699	50 %	50 %	0 %	0 %	387826823
81	NC_017407	TTA	3	9	3798	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826823
82	NC_017407	TTA	2	6	3982	3987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826824
83	NC_017407	ACA	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826824
84	NC_017407	AAC	2	6	4035	4040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826824
85	NC_017407	TAA	2	6	4055	4060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826824
86	NC_017407	CAA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826824
87	NC_017407	AAACA	2	10	4106	4115	80 %	0 %	0 %	20 %	387826824
88	NC_017407	A	6	6	4132	4137	100 %	0 %	0 %	0 %	387826824
89	NC_017407	A	8	8	4166	4173	100 %	0 %	0 %	0 %	387826824
90	NC_017407	T	8	8	4965	4972	0 %	100 %	0 %	0 %	387826825
91	NC_017407	AAAT	2	8	5008	5015	75 %	25 %	0 %	0 %	387826825
92	NC_017407	TAA	2	6	5047	5052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826825
93	NC_017407	AGA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826825
94	NC_017407	ATT	2	6	5091	5096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826825
95	NC_017407	CAAAA	2	10	5097	5106	80 %	0 %	0 %	20 %	387826825
96	NC_017407	A	6	6	5103	5108	100 %	0 %	0 %	0 %	387826825
97	NC_017407	AGA	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826825
98	NC_017407	AGA	2	6	5130	5135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826825
99	NC_017407	A	9	9	5135	5143	100 %	0 %	0 %	0 %	387826825
100	NC_017407	ATA	2	6	5170	5175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826825
101	NC_017407	AAAT	2	8	5203	5210	75 %	25 %	0 %	0 %	387826825
102	NC_017407	TATAT	2	10	5229	5238	40 %	60 %	0 %	0 %	387826825
103	NC_017407	AAAT	2	8	5300	5307	75 %	25 %	0 %	0 %	387826825
104	NC_017407	ACA	2	6	5343	5348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826825
105	NC_017407	A	6	6	5409	5414	100 %	0 %	0 %	0 %	387826825
106	NC_017407	TAAAA	2	10	5450	5459	80 %	20 %	0 %	0 %	387826825
107	NC_017407	AT	3	6	5477	5482	50 %	50 %	0 %	0 %	387826825
108	NC_017407	TAA	2	6	5488	5493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826825
109	NC_017407	ATC	2	6	5515	5520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826825
110	NC_017407	AGA	2	6	5540	5545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826825
111	NC_017407	CGCAAT	2	12	5555	5566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387826825
112	NC_017407	ATC	2	6	5625	5630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826825
113	NC_017407	CAA	2	6	5651	5656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826825
114	NC_017407	AAT	2	6	5661	5666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826825
115	NC_017407	GAT	2	6	5670	5675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826825
116	NC_017407	A	6	6	5679	5684	100 %	0 %	0 %	0 %	387826825
117	NC_017407	A	7	7	5690	5696	100 %	0 %	0 %	0 %	387826825
118	NC_017407	CTT	2	6	5698	5703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826825
119	NC_017407	TAG	2	6	5719	5724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826825
120	NC_017407	TTAA	2	8	5730	5737	50 %	50 %	0 %	0 %	387826825
121	NC_017407	TCA	2	6	6327	6332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826826
122	NC_017407	GAT	2	6	6366	6371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826826
123	NC_017407	AGC	2	6	6399	6404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826826
124	NC_017407	GTA	2	6	6454	6459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826826
125	NC_017407	AAT	2	6	6469	6474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826826
126	NC_017407	TAA	2	6	6485	6490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826826
127	NC_017407	A	6	6	6501	6506	100 %	0 %	0 %	0 %	387826826
128	NC_017407	A	6	6	6535	6540	100 %	0 %	0 %	0 %	387826826
129	NC_017407	TGA	2	6	6591	6596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826826
130	NC_017407	ATAAAA	2	12	6605	6616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826826
131	NC_017407	AAC	2	6	6636	6641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826826
132	NC_017407	TAAAA	2	10	6660	6669	80 %	20 %	0 %	0 %	387826826
133	NC_017407	A	6	6	6666	6671	100 %	0 %	0 %	0 %	387826826
134	NC_017407	TGTT	2	8	6690	6697	0 %	75 %	25 %	0 %	387826826
135	NC_017407	AT	3	6	7546	7551	50 %	50 %	0 %	0 %	387826827
136	NC_017407	ATT	2	6	7613	7618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826827
137	NC_017407	AGA	2	6	7676	7681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826827
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