MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-3

Total Repeats: 441

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017405	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
2	NC_017405	ATT	2	6	295	300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
3	NC_017405	TTA	2	6	301	306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
4	NC_017405	AAT	2	6	340	345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
5	NC_017405	A	6	6	368	373	100 %	0 %	0 %	0 %	387826796
6	NC_017405	AAAT	2	8	386	393	75 %	25 %	0 %	0 %	387826796
7	NC_017405	CAAA	2	8	400	407	75 %	0 %	0 %	25 %	387826796
8	NC_017405	ATT	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
9	NC_017405	ATA	2	6	476	481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
10	NC_017405	CTA	2	6	488	493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826796
11	NC_017405	ATT	3	9	553	561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
12	NC_017405	AAAG	2	8	574	581	75 %	0 %	25 %	0 %	387826796
13	NC_017405	GGA	2	6	655	660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826796
14	NC_017405	ACA	2	6	707	712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826796
15	NC_017405	CGA	2	6	732	737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826796
16	NC_017405	ATAC	2	8	747	754	50 %	25 %	0 %	25 %	387826796
17	NC_017405	AAT	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
18	NC_017405	TAG	4	12	789	800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826796
19	NC_017405	TTA	2	6	801	806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
20	NC_017405	ATA	2	6	820	825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
21	NC_017405	ATT	2	6	847	852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
22	NC_017405	A	6	6	863	868	100 %	0 %	0 %	0 %	387826796
23	NC_017405	ATT	2	6	1074	1079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826797
24	NC_017405	AAT	2	6	1093	1098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826797
25	NC_017405	A	8	8	1106	1113	100 %	0 %	0 %	0 %	387826797
26	NC_017405	A	6	6	1141	1146	100 %	0 %	0 %	0 %	387826797
27	NC_017405	ATA	2	6	1148	1153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826797
28	NC_017405	CAA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826797
29	NC_017405	AATA	2	8	1180	1187	75 %	25 %	0 %	0 %	387826797
30	NC_017405	AT	3	6	1193	1198	50 %	50 %	0 %	0 %	387826797
31	NC_017405	A	6	6	1202	1207	100 %	0 %	0 %	0 %	387826797
32	NC_017405	AT	3	6	1248	1253	50 %	50 %	0 %	0 %	387826797
33	NC_017405	TAT	2	6	1258	1263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826797
34	NC_017405	ATTA	2	8	1267	1274	50 %	50 %	0 %	0 %	387826797
35	NC_017405	CAA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826797
36	NC_017405	ACT	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826797
37	NC_017405	AAACTA	2	12	1330	1341	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387826797
38	NC_017405	AACTA	2	10	1349	1358	60 %	20 %	0 %	20 %	387826797
39	NC_017405	CTA	3	9	1361	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826797
40	NC_017405	TAA	2	6	1535	1540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826798
41	NC_017405	AC	3	6	1550	1555	50 %	0 %	0 %	50 %	387826798
42	NC_017405	ACA	2	6	1559	1564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826798
43	NC_017405	A	6	6	1578	1583	100 %	0 %	0 %	0 %	387826798
44	NC_017405	TAG	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826798
45	NC_017405	TAAAC	2	10	1650	1659	60 %	20 %	0 %	20 %	387826798
46	NC_017405	TAA	2	6	2268	2273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
47	NC_017405	CAG	2	6	2312	2317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826799
48	NC_017405	A	6	6	2323	2328	100 %	0 %	0 %	0 %	387826799
49	NC_017405	CTT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826799
50	NC_017405	T	6	6	2337	2342	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
51	NC_017405	CTT	2	6	2362	2367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826799
52	NC_017405	ATTT	2	8	2370	2377	25 %	75 %	0 %	0 %	387826799
53	NC_017405	T	6	6	2472	2477	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
54	NC_017405	CAA	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
55	NC_017405	CAA	2	6	2501	2506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
56	NC_017405	AGA	2	6	2511	2516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826799
57	NC_017405	ACA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
58	NC_017405	T	6	6	2565	2570	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
59	NC_017405	CAT	2	6	2603	2608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826799
60	NC_017405	ATC	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826799
61	NC_017405	AATT	2	8	2646	2653	50 %	50 %	0 %	0 %	387826799
62	NC_017405	TTC	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826799
63	NC_017405	TTA	2	6	2707	2712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826799
64	NC_017405	T	6	6	2727	2732	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
65	NC_017405	ATATAG	2	12	2735	2746	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387826799
66	NC_017405	ATA	2	6	2794	2799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
67	NC_017405	AAT	2	6	2849	2854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
68	NC_017405	CAA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
69	NC_017405	CTA	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826799
70	NC_017405	ATA	2	6	2924	2929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
71	NC_017405	A	6	6	2959	2964	100 %	0 %	0 %	0 %	387826799
72	NC_017405	T	7	7	2966	2972	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
73	NC_017405	TTAA	2	8	3896	3903	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
74	NC_017405	AAT	2	6	3919	3924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
75	NC_017405	TTA	2	6	3937	3942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
76	NC_017405	TTC	2	6	3956	3961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
77	NC_017405	T	6	6	3972	3977	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
78	NC_017405	TCT	2	6	4011	4016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
79	NC_017405	ATTTTC	2	12	4052	4063	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826800
80	NC_017405	TTA	2	6	4107	4112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
81	NC_017405	T	6	6	4200	4205	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
82	NC_017405	TCT	3	9	4239	4247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
83	NC_017405	TCT	2	6	4310	4315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
84	NC_017405	ATA	2	6	4353	4358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
85	NC_017405	AAT	2	6	4359	4364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
86	NC_017405	T	6	6	4364	4369	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
87	NC_017405	TA	4	8	4400	4407	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
88	NC_017405	TA	3	6	4486	4491	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
89	NC_017405	T	6	6	4495	4500	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
90	NC_017405	TATC	2	8	4549	4556	25 %	50 %	0 %	25 %	387826800
91	NC_017405	CTTT	2	8	4572	4579	0 %	75 %	0 %	25 %	387826800
92	NC_017405	A	6	6	4595	4600	100 %	0 %	0 %	0 %	387826800
93	NC_017405	TGA	2	6	4614	4619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
94	NC_017405	ATT	2	6	4655	4660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
95	NC_017405	AT	3	6	4716	4721	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
96	NC_017405	TTAA	2	8	4758	4765	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
97	NC_017405	AAT	2	6	4793	4798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
98	NC_017405	T	6	6	4820	4825	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
99	NC_017405	TAATT	2	10	4841	4850	40 %	60 %	0 %	0 %	387826800
100	NC_017405	ATC	2	6	4862	4867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826800
101	NC_017405	TAT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
102	NC_017405	T	6	6	5017	5022	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
103	NC_017405	TAGT	2	8	5055	5062	25 %	50 %	25 %	0 %	387826800
104	NC_017405	AT	4	8	5065	5072	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
105	NC_017405	TTA	2	6	5146	5151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
106	NC_017405	CAC	3	9	5194	5202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826800
107	NC_017405	TTG	2	6	5235	5240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826800
108	NC_017405	T	7	7	5256	5262	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
109	NC_017405	GAT	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
110	NC_017405	TTTAT	2	10	5316	5325	20 %	80 %	0 %	0 %	387826800
111	NC_017405	T	6	6	5398	5403	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
112	NC_017405	GGA	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826800
113	NC_017405	CTT	2	6	5437	5442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
114	NC_017405	T	6	6	5512	5517	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
115	NC_017405	TTAA	2	8	5631	5638	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
116	NC_017405	ATT	2	6	5646	5651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
117	NC_017405	TA	3	6	5663	5668	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
118	NC_017405	TTC	2	6	5675	5680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
119	NC_017405	T	6	6	5746	5751	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
120	NC_017405	TCT	2	6	5760	5765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
121	NC_017405	T	7	7	5791	5797	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
122	NC_017405	T	6	6	5826	5831	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
123	NC_017405	A	6	6	5840	5845	100 %	0 %	0 %	0 %	387826800
124	NC_017405	AG	3	6	5866	5871	50 %	0 %	50 %	0 %	387826800
125	NC_017405	ATG	2	6	5888	5893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
126	NC_017405	AGC	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826800
127	NC_017405	CTC	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826800
128	NC_017405	CTTT	2	8	6063	6070	0 %	75 %	0 %	25 %	387826800
129	NC_017405	AAT	2	6	6074	6079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
130	NC_017405	T	7	7	6101	6107	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
131	NC_017405	A	6	6	6171	6176	100 %	0 %	0 %	0 %	387826800
132	NC_017405	GCT	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826800
133	NC_017405	TGA	2	6	6248	6253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
134	NC_017405	ATC	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826800
135	NC_017405	TTTC	2	8	6302	6309	0 %	75 %	0 %	25 %	387826800
136	NC_017405	CTT	2	6	6388	6393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
137	NC_017405	CAA	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826800
138	NC_017405	AGT	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826800
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