MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-9

Total Repeats: 598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017402	AGA	2	6	1318	1323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
2	NC_017402	AGA	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
3	NC_017402	AGA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
4	NC_017402	GCA	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827868
5	NC_017402	AGCA	2	8	1425	1432	50 %	0 %	25 %	25 %	387827868
6	NC_017402	ATT	2	6	1531	1536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827868
7	NC_017402	AGG	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827868
8	NC_017402	TTGC	2	8	1613	1620	0 %	50 %	25 %	25 %	387827868
9	NC_017402	GTTC	2	8	1678	1685	0 %	50 %	25 %	25 %	387827868
10	NC_017402	GA	3	6	1740	1745	50 %	0 %	50 %	0 %	387827868
11	NC_017402	ATTAA	2	10	1781	1790	60 %	40 %	0 %	0 %	387827868
12	NC_017402	A	6	6	1792	1797	100 %	0 %	0 %	0 %	387827868
13	NC_017402	TTC	3	9	1810	1818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827868
14	NC_017402	AGA	2	6	1855	1860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
15	NC_017402	AGA	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827869
16	NC_017402	A	6	6	2050	2055	100 %	0 %	0 %	0 %	387827869
17	NC_017402	TAG	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827869
18	NC_017402	ACA	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827869
19	NC_017402	TGG	3	9	2280	2288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827869
20	NC_017402	TGGCA	2	10	2331	2340	20 %	20 %	40 %	20 %	387827869
21	NC_017402	AAATGG	2	12	2391	2402	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387827869
22	NC_017402	TGCT	2	8	2531	2538	0 %	50 %	25 %	25 %	387827869
23	NC_017402	AATTA	2	10	2569	2578	60 %	40 %	0 %	0 %	387827869
24	NC_017402	TGA	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827870
25	NC_017402	ACAAG	2	10	2683	2692	60 %	0 %	20 %	20 %	387827870
26	NC_017402	TGA	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827870
27	NC_017402	AGA	2	6	2892	2897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827870
28	NC_017402	TA	3	6	2967	2972	50 %	50 %	0 %	0 %	387827870
29	NC_017402	CTGATA	2	12	2987	2998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387827870
30	NC_017402	ATGT	2	8	3017	3024	25 %	50 %	25 %	0 %	387827870
31	NC_017402	TAG	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827870
32	NC_017402	GTAT	2	8	3042	3049	25 %	50 %	25 %	0 %	387827870
33	NC_017402	ATAA	2	8	3124	3131	75 %	25 %	0 %	0 %	387827870
34	NC_017402	TTA	2	6	3140	3145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827870
35	NC_017402	TGG	3	9	3153	3161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827870
36	NC_017402	CCA	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827870
37	NC_017402	TAAT	2	8	3173	3180	50 %	50 %	0 %	0 %	387827870
38	NC_017402	CT	3	6	3190	3195	0 %	50 %	0 %	50 %	387827870
39	NC_017402	CAAT	2	8	3206	3213	50 %	25 %	0 %	25 %	387827870
40	NC_017402	TGG	2	6	3336	3341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827870
41	NC_017402	ATT	2	6	3974	3979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
42	NC_017402	TGA	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
43	NC_017402	ATT	2	6	3988	3993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
44	NC_017402	TAT	2	6	4037	4042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
45	NC_017402	CCA	2	6	4094	4099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827871
46	NC_017402	ACA	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827871
47	NC_017402	ATT	2	6	4207	4212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
48	NC_017402	AT	3	6	4277	4282	50 %	50 %	0 %	0 %	387827871
49	NC_017402	TAA	3	9	4292	4300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827871
50	NC_017402	TC	3	6	4312	4317	0 %	50 %	0 %	50 %	387827871
51	NC_017402	AGT	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
52	NC_017402	TTA	2	6	4354	4359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
53	NC_017402	A	6	6	4403	4408	100 %	0 %	0 %	0 %	387827871
54	NC_017402	ACT	2	6	4439	4444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827871
55	NC_017402	AGA	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827871
56	NC_017402	GTG	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827871
57	NC_017402	A	6	6	4513	4518	100 %	0 %	0 %	0 %	387827871
58	NC_017402	CGA	2	6	4550	4555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827871
59	NC_017402	GAT	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
60	NC_017402	CAG	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827871
61	NC_017402	AGT	2	6	4641	4646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
62	NC_017402	TAA	2	6	4691	4696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827871
63	NC_017402	AGA	2	6	4700	4705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827871
64	NC_017402	TTA	2	6	4771	4776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
65	NC_017402	AGTA	2	8	4788	4795	50 %	25 %	25 %	0 %	387827871
66	NC_017402	CTAC	2	8	4800	4807	25 %	25 %	0 %	50 %	387827871
67	NC_017402	TCAT	2	8	4847	4854	25 %	50 %	0 %	25 %	387827871
68	NC_017402	GGT	2	6	4872	4877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827871
69	NC_017402	CTA	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827871
70	NC_017402	A	7	7	4890	4896	100 %	0 %	0 %	0 %	387827871
71	NC_017402	GAA	3	9	4987	4995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827872
72	NC_017402	TA	3	6	5136	5141	50 %	50 %	0 %	0 %	387827872
73	NC_017402	TTAC	2	8	5155	5162	25 %	50 %	0 %	25 %	387827872
74	NC_017402	GTT	2	6	5200	5205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827872
75	NC_017402	GAATTT	2	12	5209	5220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387827872
76	NC_017402	A	6	6	5230	5235	100 %	0 %	0 %	0 %	387827872
77	NC_017402	TGAACT	2	12	5247	5258	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387827872
78	NC_017402	ATT	2	6	5261	5266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827872
79	NC_017402	TAG	2	6	5271	5276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827872
80	NC_017402	GAA	2	6	5287	5292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827872
81	NC_017402	GGC	2	6	5293	5298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387827872
82	NC_017402	G	6	6	5301	5306	0 %	0 %	100 %	0 %	387827872
83	NC_017402	TG	3	6	5386	5391	0 %	50 %	50 %	0 %	387827872
84	NC_017402	AATG	2	8	5402	5409	50 %	25 %	25 %	0 %	387827872
85	NC_017402	TGT	2	6	5495	5500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827873
86	NC_017402	TTC	2	6	5516	5521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827873
87	NC_017402	AG	3	6	5527	5532	50 %	0 %	50 %	0 %	387827873
88	NC_017402	TTA	2	6	5569	5574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827873
89	NC_017402	TGG	2	6	5818	5823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827874
90	NC_017402	TAG	2	6	5899	5904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827874
91	NC_017402	AT	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	387827874
92	NC_017402	AAT	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827874
93	NC_017402	TA	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	387827874
94	NC_017402	CTA	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827874
95	NC_017402	AAGT	2	8	6067	6074	50 %	25 %	25 %	0 %	387827874
96	NC_017402	GTA	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827874
97	NC_017402	GCA	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827874
98	NC_017402	TTG	2	6	6108	6113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827874
99	NC_017402	AAT	2	6	6235	6240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827875
100	NC_017402	ATC	2	6	6269	6274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827875
101	NC_017402	GCT	2	6	6295	6300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827875
102	NC_017402	ATA	2	6	6310	6315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827875
103	NC_017402	AT	4	8	6412	6419	50 %	50 %	0 %	0 %	387827875
104	NC_017402	TAA	2	6	6552	6557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827875
105	NC_017402	AGG	2	6	6692	6697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827875
106	NC_017402	A	6	6	7829	7834	100 %	0 %	0 %	0 %	387827876
107	NC_017402	GTTT	2	8	7858	7865	0 %	75 %	25 %	0 %	387827876
108	NC_017402	TGG	2	6	7872	7877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827876
109	NC_017402	CAA	2	6	7922	7927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827876
110	NC_017402	TAG	2	6	7938	7943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827876
111	NC_017402	TAA	2	6	7964	7969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827876
112	NC_017402	TGA	2	6	8058	8063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827876
113	NC_017402	ACA	2	6	8072	8077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827876
114	NC_017402	ATT	2	6	8140	8145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827876
115	NC_017402	AAG	2	6	8178	8183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827876
116	NC_017402	CTG	2	6	8189	8194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827876
117	NC_017402	A	6	6	8237	8242	100 %	0 %	0 %	0 %	387827876
118	NC_017402	ACA	2	6	8252	8257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827876
119	NC_017402	A	7	7	8786	8792	100 %	0 %	0 %	0 %	387827877
120	NC_017402	CTTG	2	8	8801	8808	0 %	50 %	25 %	25 %	387827877
121	NC_017402	AATT	2	8	8947	8954	50 %	50 %	0 %	0 %	387827877
122	NC_017402	TGC	2	6	9018	9023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827878
123	NC_017402	A	6	6	9027	9032	100 %	0 %	0 %	0 %	387827878
124	NC_017402	A	6	6	9079	9084	100 %	0 %	0 %	0 %	387827878
125	NC_017402	GTA	2	6	9095	9100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827878
126	NC_017402	AAT	2	6	9118	9123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827878
127	NC_017402	A	6	6	9136	9141	100 %	0 %	0 %	0 %	387827878
128	NC_017402	AG	3	6	9175	9180	50 %	0 %	50 %	0 %	387827878
129	NC_017402	A	6	6	9211	9216	100 %	0 %	0 %	0 %	387827878
130	NC_017402	GAC	2	6	9296	9301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827878
131	NC_017402	AGC	2	6	9351	9356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827878
132	NC_017402	TTG	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827878
133	NC_017402	GTAA	2	8	9427	9434	50 %	25 %	25 %	0 %	387827878
134	NC_017402	CGG	2	6	9438	9443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387827878
135	NC_017402	T	6	6	9448	9453	0 %	100 %	0 %	0 %	387827878
136	NC_017402	TTA	2	6	9458	9463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827878
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