MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ak (Acyrthosiphon kondoi) plasmid pLeu

Total Repeats: 203

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017257	ATA	3	9	367	375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228017
2	NC_017257	T	7	7	391	397	0 %	100 %	0 %	0 %	384228017
3	NC_017257	CTT	2	6	474	479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228017
4	NC_017257	TTC	3	9	509	517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228017
5	NC_017257	ATCA	2	8	595	602	50 %	25 %	0 %	25 %	384228017
6	NC_017257	ATCC	2	8	644	651	25 %	25 %	0 %	50 %	384228017
7	NC_017257	TTG	2	6	655	660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228017
8	NC_017257	T	6	6	661	666	0 %	100 %	0 %	0 %	384228017
9	NC_017257	T	8	8	679	686	0 %	100 %	0 %	0 %	384228017
10	NC_017257	A	6	6	706	711	100 %	0 %	0 %	0 %	384228017
11	NC_017257	T	7	7	768	774	0 %	100 %	0 %	0 %	384228017
12	NC_017257	TAAT	2	8	810	817	50 %	50 %	0 %	0 %	384228017
13	NC_017257	TTA	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228017
14	NC_017257	GAA	2	6	914	919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228017
15	NC_017257	TCT	2	6	985	990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228017
16	NC_017257	A	6	6	1034	1039	100 %	0 %	0 %	0 %	384228017
17	NC_017257	AAG	2	6	1101	1106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228017
18	NC_017257	TAT	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228017
19	NC_017257	T	6	6	1121	1126	0 %	100 %	0 %	0 %	384228017
20	NC_017257	GGT	2	6	1127	1132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384228017
21	NC_017257	A	6	6	1135	1140	100 %	0 %	0 %	0 %	384228017
22	NC_017257	TA	3	6	1156	1161	50 %	50 %	0 %	0 %	384228017
23	NC_017257	A	7	7	1482	1488	100 %	0 %	0 %	0 %	384228018
24	NC_017257	A	6	6	1492	1497	100 %	0 %	0 %	0 %	384228018
25	NC_017257	A	6	6	1504	1509	100 %	0 %	0 %	0 %	384228018
26	NC_017257	TA	3	6	1511	1516	50 %	50 %	0 %	0 %	384228018
27	NC_017257	TAT	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228018
28	NC_017257	T	6	6	1587	1592	0 %	100 %	0 %	0 %	384228018
29	NC_017257	CAA	2	6	1593	1598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228018
30	NC_017257	TATT	2	8	1603	1610	25 %	75 %	0 %	0 %	384228018
31	NC_017257	TAG	2	6	1651	1656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228018
32	NC_017257	TAG	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228018
33	NC_017257	ATT	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228018
34	NC_017257	A	6	6	1759	1764	100 %	0 %	0 %	0 %	384228018
35	NC_017257	GGAT	2	8	1770	1777	25 %	25 %	50 %	0 %	384228018
36	NC_017257	A	6	6	1802	1807	100 %	0 %	0 %	0 %	384228018
37	NC_017257	TCT	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228018
38	NC_017257	A	6	6	1873	1878	100 %	0 %	0 %	0 %	384228018
39	NC_017257	AT	3	6	1949	1954	50 %	50 %	0 %	0 %	384228018
40	NC_017257	TTC	2	6	1981	1986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228018
41	NC_017257	A	6	6	2146	2151	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
42	NC_017257	TA	5	10	2153	2162	50 %	50 %	0 %	0 %	384228019
43	NC_017257	A	7	7	2198	2204	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
44	NC_017257	ATTT	2	8	2212	2219	25 %	75 %	0 %	0 %	384228019
45	NC_017257	A	6	6	2231	2236	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
46	NC_017257	TAAAT	2	10	2263	2272	60 %	40 %	0 %	0 %	384228019
47	NC_017257	TAAA	2	8	2331	2338	75 %	25 %	0 %	0 %	384228019
48	NC_017257	TAT	2	6	2381	2386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228019
49	NC_017257	TAA	2	6	2470	2475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
50	NC_017257	TAA	2	6	2499	2504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
51	NC_017257	A	7	7	2540	2546	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
52	NC_017257	A	7	7	2579	2585	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
53	NC_017257	T	7	7	2586	2592	0 %	100 %	0 %	0 %	384228019
54	NC_017257	T	6	6	2603	2608	0 %	100 %	0 %	0 %	384228019
55	NC_017257	AAAT	2	8	2634	2641	75 %	25 %	0 %	0 %	384228019
56	NC_017257	TAA	2	6	2653	2658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
57	NC_017257	A	8	8	2672	2679	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
58	NC_017257	ATA	2	6	2720	2725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
59	NC_017257	A	6	6	2739	2744	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
60	NC_017257	ATTA	2	8	2774	2781	50 %	50 %	0 %	0 %	384228019
61	NC_017257	A	8	8	2825	2832	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
62	NC_017257	GATA	2	8	2833	2840	50 %	25 %	25 %	0 %	384228019
63	NC_017257	TA	3	6	2865	2870	50 %	50 %	0 %	0 %	384228019
64	NC_017257	A	9	9	2870	2878	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
65	NC_017257	ATA	3	9	2881	2889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
66	NC_017257	TTA	2	6	3037	3042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228020
67	NC_017257	AGCA	2	8	3070	3077	50 %	0 %	25 %	25 %	384228020
68	NC_017257	CAAG	2	8	3081	3088	50 %	0 %	25 %	25 %	384228020
69	NC_017257	TCA	2	6	3171	3176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228020
70	NC_017257	A	6	6	3218	3223	100 %	0 %	0 %	0 %	384228020
71	NC_017257	T	7	7	3316	3322	0 %	100 %	0 %	0 %	384228020
72	NC_017257	A	6	6	3356	3361	100 %	0 %	0 %	0 %	384228020
73	NC_017257	ATA	2	6	3375	3380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
74	NC_017257	T	6	6	3391	3396	0 %	100 %	0 %	0 %	384228020
75	NC_017257	AAAG	2	8	3401	3408	75 %	0 %	25 %	0 %	384228020
76	NC_017257	TAG	2	6	3452	3457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
77	NC_017257	TAA	2	6	3496	3501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
78	NC_017257	TAA	2	6	3568	3573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
79	NC_017257	TTTG	2	8	3581	3588	0 %	75 %	25 %	0 %	384228020
80	NC_017257	ATG	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
81	NC_017257	CAGG	2	8	3678	3685	25 %	0 %	50 %	25 %	384228020
82	NC_017257	AGA	2	6	3746	3751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228020
83	NC_017257	AGA	2	6	3776	3781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228020
84	NC_017257	CTA	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228020
85	NC_017257	ATT	2	6	3837	3842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228020
86	NC_017257	TAA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
87	NC_017257	TAG	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
88	NC_017257	TTC	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228020
89	NC_017257	TCA	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228020
90	NC_017257	A	6	6	3938	3943	100 %	0 %	0 %	0 %	384228020
91	NC_017257	AGA	2	6	3945	3950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228020
92	NC_017257	TAG	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
93	NC_017257	A	7	7	4062	4068	100 %	0 %	0 %	0 %	384228020
94	NC_017257	TGC	2	6	4094	4099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228020
95	NC_017257	T	6	6	4100	4105	0 %	100 %	0 %	0 %	384228020
96	NC_017257	AGCATT	2	12	4151	4162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384228020
97	NC_017257	TAA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
98	NC_017257	CAA	2	6	4173	4178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228020
99	NC_017257	T	6	6	4206	4211	0 %	100 %	0 %	0 %	384228020
100	NC_017257	ATT	2	6	4256	4261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228020
101	NC_017257	A	8	8	4268	4275	100 %	0 %	0 %	0 %	384228020
102	NC_017257	TCT	2	6	4287	4292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228020
103	NC_017257	TTG	2	6	4378	4383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228020
104	NC_017257	A	6	6	4438	4443	100 %	0 %	0 %	0 %	384228020
105	NC_017257	GAT	2	6	4499	4504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
106	NC_017257	ATA	2	6	4516	4521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
107	NC_017257	TAA	2	6	4541	4546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
108	NC_017257	A	6	6	4562	4567	100 %	0 %	0 %	0 %	384228020
109	NC_017257	TAAT	2	8	4577	4584	50 %	50 %	0 %	0 %	384228020
110	NC_017257	A	7	7	4649	4655	100 %	0 %	0 %	0 %	384228021
111	NC_017257	AAG	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228021
112	NC_017257	A	10	10	4735	4744	100 %	0 %	0 %	0 %	384228021
113	NC_017257	GAA	2	6	4766	4771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228021
114	NC_017257	GGA	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384228021
115	NC_017257	TATTT	2	10	4855	4864	20 %	80 %	0 %	0 %	384228021
116	NC_017257	A	6	6	4880	4885	100 %	0 %	0 %	0 %	384228021
117	NC_017257	T	6	6	4956	4961	0 %	100 %	0 %	0 %	384228021
118	NC_017257	AT	3	6	5043	5048	50 %	50 %	0 %	0 %	384228021
119	NC_017257	G	6	6	5069	5074	0 %	0 %	100 %	0 %	384228021
120	NC_017257	ATTT	2	8	5075	5082	25 %	75 %	0 %	0 %	384228021
121	NC_017257	A	7	7	5206	5212	100 %	0 %	0 %	0 %	384228021
122	NC_017257	TTC	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228021
123	NC_017257	GA	4	8	5260	5267	50 %	0 %	50 %	0 %	384228021
124	NC_017257	TAG	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228021
125	NC_017257	A	6	6	5285	5290	100 %	0 %	0 %	0 %	384228021
126	NC_017257	TATC	2	8	5303	5310	25 %	50 %	0 %	25 %	384228021
127	NC_017257	CTA	2	6	5331	5336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228021
128	NC_017257	AT	3	6	5367	5372	50 %	50 %	0 %	0 %	384228021
129	NC_017257	TAT	3	9	5370	5378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228021
130	NC_017257	TGA	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228021
131	NC_017257	A	7	7	5466	5472	100 %	0 %	0 %	0 %	384228021
132	NC_017257	GAAT	2	8	5580	5587	50 %	25 %	25 %	0 %	384228021
133	NC_017257	A	7	7	5635	5641	100 %	0 %	0 %	0 %	384228021
134	NC_017257	ATA	2	6	5667	5672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228021
135	NC_017257	T	6	6	5677	5682	0 %	100 %	0 %	0 %	384228021
136	NC_017257	AAATG	2	10	5689	5698	60 %	20 %	20 %	0 %	384228021
137	NC_017257	TAAT	2	8	5721	5728	50 %	50 %	0 %	0 %	384228021
138	NC_017257	AAT	2	6	5733	5738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228021
139	NC_017257	GAA	2	6	5745	5750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228022
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141	NC_017257	A	7	7	5795	5801	100 %	0 %	0 %	0 %	384228022
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.