MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. LL01 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 16099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017255	TTTAA	2	10	205	214	40 %	60 %	0 %	0 %	384226875
2	NC_017255	GTT	2	6	232	237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226875
3	NC_017255	AGC	2	6	261	266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384226875
4	NC_017255	TCA	2	6	274	279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226875
5	NC_017255	ATT	2	6	297	302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226875
6	NC_017255	CTCA	2	8	304	311	25 %	25 %	0 %	50 %	384226875
7	NC_017255	A	6	6	311	316	100 %	0 %	0 %	0 %	384226875
8	NC_017255	GGT	2	6	400	405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226875
9	NC_017255	ATG	2	6	406	411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226875
10	NC_017255	CTG	2	6	470	475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226875
11	NC_017255	CTA	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226875
12	NC_017255	A	8	8	525	532	100 %	0 %	0 %	0 %	384226875
13	NC_017255	A	6	6	537	542	100 %	0 %	0 %	0 %	384226875
14	NC_017255	AAT	2	6	547	552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226875
15	NC_017255	TGT	2	6	603	608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226875
16	NC_017255	GT	3	6	611	616	0 %	50 %	50 %	0 %	384226875
17	NC_017255	AATT	2	8	630	637	50 %	50 %	0 %	0 %	384226875
18	NC_017255	AGC	2	6	660	665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384226875
19	NC_017255	T	6	6	672	677	0 %	100 %	0 %	0 %	384226875
20	NC_017255	AGG	2	6	678	683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384226875
21	NC_017255	CTG	2	6	713	718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226875
22	NC_017255	CGC	2	6	803	808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384226875
23	NC_017255	TTA	2	6	844	849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226875
24	NC_017255	T	6	6	878	883	0 %	100 %	0 %	0 %	384226875
25	NC_017255	CAT	2	6	904	909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226875
26	NC_017255	CA	3	6	933	938	50 %	0 %	0 %	50 %	384226875
27	NC_017255	A	6	6	947	952	100 %	0 %	0 %	0 %	384226875
28	NC_017255	ATA	2	6	961	966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226875
29	NC_017255	AT	3	6	991	996	50 %	50 %	0 %	0 %	384226875
30	NC_017255	T	6	6	1002	1007	0 %	100 %	0 %	0 %	384226875
31	NC_017255	TAG	2	6	1172	1177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226875
32	NC_017255	T	7	7	1239	1245	0 %	100 %	0 %	0 %	384226875
33	NC_017255	ATTA	2	8	1281	1288	50 %	50 %	0 %	0 %	384226875
34	NC_017255	T	6	6	1297	1302	0 %	100 %	0 %	0 %	384226875
35	NC_017255	ACT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226875
36	NC_017255	GAA	2	6	1333	1338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226875
37	NC_017255	TTG	2	6	1354	1359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226875
38	NC_017255	GCA	2	6	1372	1377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384226875
39	NC_017255	GAT	2	6	1444	1449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226875
40	NC_017255	ACT	2	6	1453	1458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226875
41	NC_017255	CTTT	2	8	1510	1517	0 %	75 %	0 %	25 %	384226875
42	NC_017255	AGA	2	6	1521	1526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226875
43	NC_017255	A	9	9	1641	1649	100 %	0 %	0 %	0 %	384226875
44	NC_017255	A	7	7	1686	1692	100 %	0 %	0 %	0 %	384226875
45	NC_017255	TA	3	6	1694	1699	50 %	50 %	0 %	0 %	384226875
46	NC_017255	TTAAT	2	10	1703	1712	40 %	60 %	0 %	0 %	384226875
47	NC_017255	TTA	2	6	1735	1740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226875
48	NC_017255	TTG	2	6	1799	1804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226875
49	NC_017255	AGA	2	6	1869	1874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226875
50	NC_017255	A	6	6	1890	1895	100 %	0 %	0 %	0 %	384226875
51	NC_017255	ATC	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226875
52	NC_017255	TCT	2	6	1948	1953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226875
53	NC_017255	GTT	2	6	1957	1962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226875
54	NC_017255	A	6	6	1963	1968	100 %	0 %	0 %	0 %	384226875
55	NC_017255	GCT	2	6	2029	2034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226875
56	NC_017255	TTA	2	6	2044	2049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226875
57	NC_017255	A	7	7	2058	2064	100 %	0 %	0 %	0 %	384226875
58	NC_017255	AT	3	6	2315	2320	50 %	50 %	0 %	0 %	384226876
59	NC_017255	TCA	2	6	2324	2329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226876
60	NC_017255	AGAT	2	8	2344	2351	50 %	25 %	25 %	0 %	384226876
61	NC_017255	ATT	2	6	2367	2372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226876
62	NC_017255	TCT	2	6	2388	2393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226876
63	NC_017255	ATT	2	6	2395	2400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226876
64	NC_017255	T	7	7	2424	2430	0 %	100 %	0 %	0 %	384226876
65	NC_017255	T	9	9	2447	2455	0 %	100 %	0 %	0 %	384226876
66	NC_017255	T	6	6	2461	2466	0 %	100 %	0 %	0 %	384226876
67	NC_017255	A	8	8	2477	2484	100 %	0 %	0 %	0 %	384226876
68	NC_017255	TATT	2	8	2608	2615	25 %	75 %	0 %	0 %	384226876
69	NC_017255	T	7	7	2620	2626	0 %	100 %	0 %	0 %	384226876
70	NC_017255	GATT	2	8	2651	2658	25 %	50 %	25 %	0 %	384226876
71	NC_017255	ATTT	2	8	2666	2673	25 %	75 %	0 %	0 %	384226876
72	NC_017255	CTG	2	6	2716	2721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226876
73	NC_017255	ATATTA	2	12	2722	2733	50 %	50 %	0 %	0 %	384226876
74	NC_017255	GT	3	6	2752	2757	0 %	50 %	50 %	0 %	384226876
75	NC_017255	T	8	8	2757	2764	0 %	100 %	0 %	0 %	384226876
76	NC_017255	ATTTT	2	10	2766	2775	20 %	80 %	0 %	0 %	384226876
77	NC_017255	ATT	2	6	2915	2920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226876
78	NC_017255	TTTTA	2	10	2948	2957	20 %	80 %	0 %	0 %	384226876
79	NC_017255	TGC	2	6	2968	2973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226876
80	NC_017255	TGG	2	6	2976	2981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226876
81	NC_017255	T	6	6	2990	2995	0 %	100 %	0 %	0 %	384226876
82	NC_017255	TAA	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226876
83	NC_017255	TTTTAT	2	12	3044	3055	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384226876
84	NC_017255	TA	3	6	3171	3176	50 %	50 %	0 %	0 %	384226877
85	NC_017255	TGG	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226877
86	NC_017255	GGAATT	2	12	3222	3233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226877
87	NC_017255	ATT	2	6	3284	3289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226877
88	NC_017255	T	6	6	3300	3305	0 %	100 %	0 %	0 %	384226877
89	NC_017255	TA	3	6	3358	3363	50 %	50 %	0 %	0 %	384226877
90	NC_017255	AT	3	6	3570	3575	50 %	50 %	0 %	0 %	384226878
91	NC_017255	CCT	2	6	3580	3585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384226878
92	NC_017255	ATT	2	6	3586	3591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226878
93	NC_017255	A	7	7	3642	3648	100 %	0 %	0 %	0 %	384226878
94	NC_017255	TA	3	6	3662	3667	50 %	50 %	0 %	0 %	384226878
95	NC_017255	A	9	9	3674	3682	100 %	0 %	0 %	0 %	384226878
96	NC_017255	ATT	2	6	3694	3699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226878
97	NC_017255	AGA	2	6	3762	3767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226878
98	NC_017255	AGA	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226878
99	NC_017255	A	7	7	3796	3802	100 %	0 %	0 %	0 %	384226878
100	NC_017255	AGT	2	6	3870	3875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226878
101	NC_017255	A	6	6	3899	3904	100 %	0 %	0 %	0 %	384226878
102	NC_017255	A	8	8	3910	3917	100 %	0 %	0 %	0 %	384226878
103	NC_017255	GAT	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226878
104	NC_017255	GTT	2	6	3942	3947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226878
105	NC_017255	CTT	2	6	3962	3967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226878
106	NC_017255	AAT	2	6	4050	4055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226879
107	NC_017255	AT	3	6	4075	4080	50 %	50 %	0 %	0 %	384226879
108	NC_017255	TTA	2	6	4087	4092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226879
109	NC_017255	A	6	6	4110	4115	100 %	0 %	0 %	0 %	384226879
110	NC_017255	T	6	6	4124	4129	0 %	100 %	0 %	0 %	384226879
111	NC_017255	TGA	2	6	4193	4198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226879
112	NC_017255	A	6	6	4205	4210	100 %	0 %	0 %	0 %	384226879
113	NC_017255	TAA	2	6	4213	4218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226879
114	NC_017255	AT	3	6	4246	4251	50 %	50 %	0 %	0 %	384226879
115	NC_017255	ATA	2	6	4255	4260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226879
116	NC_017255	CAT	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226879
117	NC_017255	TTC	2	6	4380	4385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226879
118	NC_017255	A	8	8	4388	4395	100 %	0 %	0 %	0 %	384226879
119	NC_017255	TA	4	8	4403	4410	50 %	50 %	0 %	0 %	384226879
120	NC_017255	AAT	2	6	4452	4457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226879
121	NC_017255	ATC	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226879
122	NC_017255	AT	3	6	4531	4536	50 %	50 %	0 %	0 %	384226880
123	NC_017255	ATTA	2	8	4564	4571	50 %	50 %	0 %	0 %	384226880
124	NC_017255	AAGA	2	8	4572	4579	75 %	0 %	25 %	0 %	384226880
125	NC_017255	AATC	2	8	4601	4608	50 %	25 %	0 %	25 %	384226880
126	NC_017255	TAT	2	6	4624	4629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
127	NC_017255	TAT	2	6	4645	4650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
128	NC_017255	TAA	2	6	4702	4707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226880
129	NC_017255	T	6	6	4840	4845	0 %	100 %	0 %	0 %	384226880
130	NC_017255	AGT	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226880
131	NC_017255	ACA	2	6	4897	4902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384226880
132	NC_017255	T	7	7	4909	4915	0 %	100 %	0 %	0 %	384226880
133	NC_017255	AATT	2	8	5028	5035	50 %	50 %	0 %	0 %	384226880
134	NC_017255	ATT	2	6	5081	5086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
135	NC_017255	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
136	NC_017255	TGT	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226880
137	NC_017255	A	6	6	5162	5167	100 %	0 %	0 %	0 %	384226880
138	NC_017255	AGA	2	6	5170	5175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226880
139	NC_017255	TTTA	2	8	5185	5192	25 %	75 %	0 %	0 %	384226880
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