MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. LL01 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 16099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_017255	AATTAA	2	12	638175	638186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227448
16002	NC_017255	T	7	7	638212	638218	0 %	100 %	0 %	0 %	384227448
16003	NC_017255	GAA	2	6	638243	638248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384227448
16004	NC_017255	TTTAA	2	10	638249	638258	40 %	60 %	0 %	0 %	384227448
16005	NC_017255	A	8	8	638275	638282	100 %	0 %	0 %	0 %	384227448
16006	NC_017255	TCT	2	6	638302	638307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384227448
16007	NC_017255	GAA	2	6	638309	638314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384227448
16008	NC_017255	AGG	2	6	638356	638361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384227448
16009	NC_017255	AAGA	2	8	638408	638415	75 %	0 %	25 %	0 %	384227448
16010	NC_017255	TGC	2	6	638458	638463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384227448
16011	NC_017255	TAG	2	6	638485	638490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227448
16012	NC_017255	ATA	2	6	638496	638501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227448
16013	NC_017255	G	7	7	638560	638566	0 %	0 %	100 %	0 %	384227448
16014	NC_017255	A	6	6	638574	638579	100 %	0 %	0 %	0 %	384227448
16015	NC_017255	ACTTC	2	10	638594	638603	20 %	40 %	0 %	40 %	384227448
16016	NC_017255	TAC	2	6	638626	638631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227448
16017	NC_017255	GTTTT	2	10	638715	638724	0 %	80 %	20 %	0 %	384227448
16018	NC_017255	A	9	9	638835	638843	100 %	0 %	0 %	0 %	384227448
16019	NC_017255	TTA	2	6	638844	638849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227448
16020	NC_017255	ATA	3	9	638853	638861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227448
16021	NC_017255	A	6	6	638869	638874	100 %	0 %	0 %	0 %	384227448
16022	NC_017255	TAT	2	6	638927	638932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227448
16023	NC_017255	AGA	2	6	638944	638949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384227448
16024	NC_017255	A	9	9	638949	638957	100 %	0 %	0 %	0 %	384227448
16025	NC_017255	A	7	7	638998	639004	100 %	0 %	0 %	0 %	384227448
16026	NC_017255	ATTA	2	8	639013	639020	50 %	50 %	0 %	0 %	384227448
16027	NC_017255	A	6	6	639023	639028	100 %	0 %	0 %	0 %	384227448
16028	NC_017255	A	7	7	639035	639041	100 %	0 %	0 %	0 %	384227448
16029	NC_017255	AAG	2	6	639078	639083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384227448
16030	NC_017255	AAT	2	6	639104	639109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227448
16031	NC_017255	AAGT	2	8	639126	639133	50 %	25 %	25 %	0 %	384227448
16032	NC_017255	T	8	8	639139	639146	0 %	100 %	0 %	0 %	384227448
16033	NC_017255	A	6	6	639157	639162	100 %	0 %	0 %	0 %	384227448
16034	NC_017255	ATTG	2	8	639167	639174	25 %	50 %	25 %	0 %	384227448
16035	NC_017255	CTA	2	6	639244	639249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227449
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16037	NC_017255	GTA	2	6	639353	639358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227449
16038	NC_017255	A	7	7	639375	639381	100 %	0 %	0 %	0 %	384227449
16039	NC_017255	T	7	7	639385	639391	0 %	100 %	0 %	0 %	384227449
16040	NC_017255	AGA	2	6	639414	639419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384227449
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16042	NC_017255	ATTTTT	2	12	639546	639557	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227449
16043	NC_017255	A	6	6	639628	639633	100 %	0 %	0 %	0 %	384227450
16044	NC_017255	TAA	2	6	639689	639694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227450
16045	NC_017255	ATTTTA	2	12	639728	639739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227450
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16048	NC_017255	TCTT	2	8	639818	639825	0 %	75 %	0 %	25 %	384227450
16049	NC_017255	AAT	2	6	639859	639864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227450
16050	NC_017255	T	6	6	639876	639881	0 %	100 %	0 %	0 %	384227450
16051	NC_017255	TAA	2	6	639938	639943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227450
16052	NC_017255	T	7	7	639953	639959	0 %	100 %	0 %	0 %	384227450
16053	NC_017255	ATTT	2	8	639986	639993	25 %	75 %	0 %	0 %	384227450
16054	NC_017255	ACT	2	6	639994	639999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227450
16055	NC_017255	ACA	2	6	640000	640005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384227450
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16057	NC_017255	TGA	2	6	640051	640056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227450
16058	NC_017255	TAT	2	6	640077	640082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227450
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16061	NC_017255	TGT	2	6	640242	640247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384227450
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16063	NC_017255	TTA	2	6	640295	640300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227450
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16065	NC_017255	TA	3	6	640373	640378	50 %	50 %	0 %	0 %	384227450
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16091	NC_017255	T	9	9	641421	641429	0 %	100 %	0 %	0 %	384227451
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16096	NC_017255	A	6	6	641532	641537	100 %	0 %	0 %	0 %	384227451
16097	NC_017255	ATA	2	6	641551	641556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227451
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16099	NC_017255	AT	3	6	641567	641572	50 %	50 %	0 %	0 %	384227451

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.