MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. JF99 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 17104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017253	AATCA	2	10	564236	564245	60 %	20 %	0 %	20 %	414562877
15002	NC_017253	ACA	2	6	564246	564251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562877
15003	NC_017253	CAA	2	6	564253	564258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562877
15004	NC_017253	TCT	2	6	564264	564269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562877
15005	NC_017253	TAC	2	6	564329	564334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562877
15006	NC_017253	A	6	6	564339	564344	100 %	0 %	0 %	0 %	414562877
15007	NC_017253	TATT	2	8	564396	564403	25 %	75 %	0 %	0 %	414562877
15008	NC_017253	GT	3	6	564526	564531	0 %	50 %	50 %	0 %	414562877
15009	NC_017253	ATG	2	6	564534	564539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562877
15010	NC_017253	TCTTGT	2	12	564621	564632	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414562877
15011	NC_017253	TCCA	2	8	564633	564640	25 %	25 %	0 %	50 %	414562877
15012	NC_017253	TAG	2	6	564646	564651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562877
15013	NC_017253	AGT	3	9	564713	564721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562877
15014	NC_017253	TTA	2	6	564933	564938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562878
15015	NC_017253	CTT	2	6	564958	564963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562878
15016	NC_017253	T	8	8	564967	564974	0 %	100 %	0 %	0 %	414562878
15017	NC_017253	CTG	2	6	564976	564981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562878
15018	NC_017253	CAT	2	6	565000	565005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562878
15019	NC_017253	GCGG	2	8	565052	565059	0 %	0 %	75 %	25 %	414562878
15020	NC_017253	CGA	2	6	565143	565148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562878
15021	NC_017253	T	6	6	565208	565213	0 %	100 %	0 %	0 %	414562878
15022	NC_017253	T	6	6	565233	565238	0 %	100 %	0 %	0 %	414562878
15023	NC_017253	TA	3	6	565246	565251	50 %	50 %	0 %	0 %	414562878
15024	NC_017253	T	6	6	565271	565276	0 %	100 %	0 %	0 %	414562878
15025	NC_017253	TAA	2	6	565297	565302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562878
15026	NC_017253	GAA	2	6	565320	565325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562878
15027	NC_017253	AAT	2	6	565358	565363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562878
15028	NC_017253	ACG	3	9	565364	565372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562878
15029	NC_017253	T	6	6	565416	565421	0 %	100 %	0 %	0 %	414562879
15030	NC_017253	T	7	7	565423	565429	0 %	100 %	0 %	0 %	414562879
15031	NC_017253	T	6	6	565432	565437	0 %	100 %	0 %	0 %	414562879
15032	NC_017253	ACC	2	6	565540	565545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562879
15033	NC_017253	AT	3	6	565595	565600	50 %	50 %	0 %	0 %	414562879
15034	NC_017253	GTA	3	9	565673	565681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562879
15035	NC_017253	TA	3	6	565680	565685	50 %	50 %	0 %	0 %	414562879
15036	NC_017253	T	6	6	565704	565709	0 %	100 %	0 %	0 %	414562879
15037	NC_017253	TGA	2	6	565743	565748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562879
15038	NC_017253	T	6	6	565924	565929	0 %	100 %	0 %	0 %	414562880
15039	NC_017253	T	6	6	565943	565948	0 %	100 %	0 %	0 %	414562880
15040	NC_017253	AAAT	2	8	565990	565997	75 %	25 %	0 %	0 %	414562880
15041	NC_017253	T	6	6	566010	566015	0 %	100 %	0 %	0 %	414562880
15042	NC_017253	TCT	2	6	566037	566042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562880
15043	NC_017253	A	7	7	566085	566091	100 %	0 %	0 %	0 %	414562880
15044	NC_017253	TAT	2	6	566092	566097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562880
15045	NC_017253	A	6	6	566133	566138	100 %	0 %	0 %	0 %	414562880
15046	NC_017253	T	7	7	566147	566153	0 %	100 %	0 %	0 %	414562880
15047	NC_017253	ATT	5	15	566308	566322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562881
15048	NC_017253	ATG	2	6	566340	566345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562881
15049	NC_017253	ACA	2	6	566350	566355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562881
15050	NC_017253	TATAT	2	10	566368	566377	40 %	60 %	0 %	0 %	414562881
15051	NC_017253	GTT	2	6	566430	566435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562881
15052	NC_017253	T	6	6	566438	566443	0 %	100 %	0 %	0 %	414562881
15053	NC_017253	A	8	8	566470	566477	100 %	0 %	0 %	0 %	414562881
15054	NC_017253	T	7	7	566484	566490	0 %	100 %	0 %	0 %	414562881
15055	NC_017253	TGA	2	6	566497	566502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562881
15056	NC_017253	GTG	2	6	566550	566555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562881
15057	NC_017253	A	6	6	566562	566567	100 %	0 %	0 %	0 %	414562881
15058	NC_017253	CATTTT	2	12	566578	566589	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414562881
15059	NC_017253	TAT	2	6	566614	566619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562882
15060	NC_017253	AAAG	2	8	566672	566679	75 %	0 %	25 %	0 %	414562882
15061	NC_017253	CTT	2	6	566692	566697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562882
15062	NC_017253	AAT	2	6	566711	566716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562882
15063	NC_017253	TCT	2	6	566723	566728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562882
15064	NC_017253	CTT	2	6	566738	566743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562882
15065	NC_017253	T	6	6	566782	566787	0 %	100 %	0 %	0 %	414562882
15066	NC_017253	TCA	2	6	566822	566827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562882
15067	NC_017253	ATT	2	6	566845	566850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562882
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15069	NC_017253	AT	3	6	566892	566897	50 %	50 %	0 %	0 %	414562882
15070	NC_017253	TAA	2	6	566908	566913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562882
15071	NC_017253	A	6	6	566927	566932	100 %	0 %	0 %	0 %	414562882
15072	NC_017253	TATAC	2	10	567070	567079	40 %	40 %	0 %	20 %	414562883
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15075	NC_017253	CTTT	2	8	567199	567206	0 %	75 %	0 %	25 %	414562883
15076	NC_017253	AT	3	6	567207	567212	50 %	50 %	0 %	0 %	414562883
15077	NC_017253	CTT	2	6	567220	567225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562883
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15079	NC_017253	TCGTC	2	10	567337	567346	0 %	40 %	20 %	40 %	414562883
15080	NC_017253	CTTCTC	2	12	567355	567366	0 %	50 %	0 %	50 %	414562883
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15083	NC_017253	AT	3	6	567438	567443	50 %	50 %	0 %	0 %	414562883
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15093	NC_017253	A	8	8	567827	567834	100 %	0 %	0 %	0 %	414562883
15094	NC_017253	AAT	2	6	568318	568323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562884
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15096	NC_017253	ATT	2	6	568366	568371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562884
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15101	NC_017253	CCTCTT	2	12	568472	568483	0 %	50 %	0 %	50 %	414562884
15102	NC_017253	AAT	2	6	568493	568498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562884
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15104	NC_017253	ATT	2	6	568532	568537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562884
15105	NC_017253	T	7	7	568536	568542	0 %	100 %	0 %	0 %	414562884
15106	NC_017253	T	8	8	568546	568553	0 %	100 %	0 %	0 %	414562884
15107	NC_017253	T	6	6	568570	568575	0 %	100 %	0 %	0 %	414562884
15108	NC_017253	TAA	2	6	568581	568586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562884
15109	NC_017253	CAAG	2	8	568613	568620	50 %	0 %	25 %	25 %	414562884
15110	NC_017253	TCC	2	6	568627	568632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414562884
15111	NC_017253	ATA	2	6	568756	568761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562884
15112	NC_017253	ATA	2	6	568765	568770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562884
15113	NC_017253	AAT	2	6	568772	568777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562884
15114	NC_017253	TCA	2	6	568808	568813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562884
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15118	NC_017253	TTGA	2	8	569022	569029	25 %	50 %	25 %	0 %	414562884
15119	NC_017253	A	7	7	569047	569053	100 %	0 %	0 %	0 %	414562884
15120	NC_017253	GTCC	2	8	569054	569061	0 %	25 %	25 %	50 %	414562884
15121	NC_017253	ATTTT	2	10	569087	569096	20 %	80 %	0 %	0 %	414562884
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15496	NC_017253	A	6	6	586872	586877	100 %	0 %	0 %	0 %	414562898
15497	NC_017253	CCT	2	6	586928	586933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414562899
15498	NC_017253	GTG	2	6	586957	586962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562899
15499	NC_017253	A	7	7	586966	586972	100 %	0 %	0 %	0 %	414562899
15500	NC_017253	AT	3	6	587029	587034	50 %	50 %	0 %	0 %	414562899

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