MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017243	ATT	2	6	609230	609235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208029
15003	NC_017243	AGAT	2	8	609240	609247	50 %	25 %	25 %	0 %	384208029
15004	NC_017243	TA	3	6	609254	609259	50 %	50 %	0 %	0 %	384208029
15005	NC_017243	TTAT	2	8	609306	609313	25 %	75 %	0 %	0 %	384208029
15006	NC_017243	TAGT	2	8	609329	609336	25 %	50 %	25 %	0 %	384208029
15007	NC_017243	ATAG	2	8	609367	609374	50 %	25 %	25 %	0 %	384208029
15008	NC_017243	GAA	2	6	609376	609381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208029
15009	NC_017243	ATT	2	6	609390	609395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208029
15010	NC_017243	ATA	2	6	609404	609409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208029
15011	NC_017243	TAG	2	6	609419	609424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208029
15012	NC_017243	GAT	2	6	609484	609489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208029
15013	NC_017243	A	6	6	609490	609495	100 %	0 %	0 %	0 %	384208029
15014	NC_017243	AT	3	6	609508	609513	50 %	50 %	0 %	0 %	384208029
15015	NC_017243	TAT	2	6	609517	609522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208029
15016	NC_017243	AGA	3	9	609609	609617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208029
15017	NC_017243	AATA	2	8	609618	609625	75 %	25 %	0 %	0 %	384208029
15018	NC_017243	TTA	2	6	609626	609631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208029
15019	NC_017243	A	6	6	609700	609705	100 %	0 %	0 %	0 %	384208029
15020	NC_017243	AAAT	2	8	609717	609724	75 %	25 %	0 %	0 %	384208029
15021	NC_017243	GAA	2	6	609748	609753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208029
15022	NC_017243	AAG	2	6	609806	609811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208029
15023	NC_017243	ATT	3	9	609899	609907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208029
15024	NC_017243	TTA	2	6	609908	609913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208029
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15026	NC_017243	A	6	6	610000	610005	100 %	0 %	0 %	0 %	384208029
15027	NC_017243	TAC	2	6	610011	610016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208029
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15029	NC_017243	AT	3	6	610028	610033	50 %	50 %	0 %	0 %	384208029
15030	NC_017243	CATAT	2	10	610049	610058	40 %	40 %	0 %	20 %	384208029
15031	NC_017243	TA	4	8	610071	610078	50 %	50 %	0 %	0 %	384208029
15032	NC_017243	TAAA	2	8	610088	610095	75 %	25 %	0 %	0 %	384208029
15033	NC_017243	A	6	6	610093	610098	100 %	0 %	0 %	0 %	384208029
15034	NC_017243	GAA	2	6	610099	610104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208029
15035	NC_017243	TAAA	2	8	610154	610161	75 %	25 %	0 %	0 %	384208029
15036	NC_017243	A	7	7	610175	610181	100 %	0 %	0 %	0 %	384208029
15037	NC_017243	AAC	2	6	610229	610234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384208029
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15039	NC_017243	AAGA	2	8	610274	610281	75 %	0 %	25 %	0 %	384208029
15040	NC_017243	AT	3	6	610869	610874	50 %	50 %	0 %	0 %	384208030
15041	NC_017243	AAT	2	6	610881	610886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208030
15042	NC_017243	TTG	2	6	610898	610903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384208030
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15045	NC_017243	TGG	2	6	610962	610967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384208030
15046	NC_017243	A	6	6	610972	610977	100 %	0 %	0 %	0 %	384208030
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15049	NC_017243	TG	3	6	611095	611100	0 %	50 %	50 %	0 %	384208031
15050	NC_017243	AG	3	6	611121	611126	50 %	0 %	50 %	0 %	384208031
15051	NC_017243	A	8	8	611176	611183	100 %	0 %	0 %	0 %	384208031
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15054	NC_017243	ATC	2	6	613680	613685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208032
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15056	NC_017243	T	7	7	613782	613788	0 %	100 %	0 %	0 %	384208032
15057	NC_017243	ATA	2	6	613794	613799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208032
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15061	NC_017243	ATT	2	6	613946	613951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208033
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15064	NC_017243	GGA	2	6	614067	614072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384208033
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15068	NC_017243	CAAA	2	8	614574	614581	75 %	0 %	0 %	25 %	384208034
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15095	NC_017243	T	7	7	616322	616328	0 %	100 %	0 %	0 %	384208036
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15098	NC_017243	TACA	2	8	616504	616511	50 %	25 %	0 %	25 %	384208036
15099	NC_017243	TA	3	6	616561	616566	50 %	50 %	0 %	0 %	384208036
15100	NC_017243	AATAT	2	10	616567	616576	60 %	40 %	0 %	0 %	384208036
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15106	NC_017243	AAG	2	6	616955	616960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208036
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