MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_017243	CGTC	2	8	580715	580722	0 %	25 %	25 %	50 %	384208014
14503	NC_017243	AAG	2	6	580760	580765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208014
14504	NC_017243	TAT	2	6	580797	580802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208014
14505	NC_017243	TA	3	6	580844	580849	50 %	50 %	0 %	0 %	384208015
14506	NC_017243	TTAAAT	2	12	580870	580881	50 %	50 %	0 %	0 %	384208015
14507	NC_017243	AAT	2	6	580897	580902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208015
14508	NC_017243	TAAA	2	8	580919	580926	75 %	25 %	0 %	0 %	384208015
14509	NC_017243	AT	3	6	580992	580997	50 %	50 %	0 %	0 %	384208015
14510	NC_017243	A	6	6	581012	581017	100 %	0 %	0 %	0 %	384208015
14511	NC_017243	TGAC	2	8	581031	581038	25 %	25 %	25 %	25 %	384208015
14512	NC_017243	TTA	2	6	581072	581077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208015
14513	NC_017243	T	7	7	581079	581085	0 %	100 %	0 %	0 %	384208015
14514	NC_017243	T	6	6	581092	581097	0 %	100 %	0 %	0 %	384208015
14515	NC_017243	T	7	7	581133	581139	0 %	100 %	0 %	0 %	384208015
14516	NC_017243	CCTT	2	8	581181	581188	0 %	50 %	0 %	50 %	384208015
14517	NC_017243	GA	3	6	581211	581216	50 %	0 %	50 %	0 %	384208015
14518	NC_017243	T	6	6	581346	581351	0 %	100 %	0 %	0 %	384208015
14519	NC_017243	ATT	2	6	581359	581364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208015
14520	NC_017243	T	6	6	581380	581385	0 %	100 %	0 %	0 %	384208015
14521	NC_017243	GTA	2	6	581431	581436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208015
14522	NC_017243	T	7	7	581451	581457	0 %	100 %	0 %	0 %	384208015
14523	NC_017243	TTC	2	6	581460	581465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384208015
14524	NC_017243	GAA	2	6	581473	581478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208015
14525	NC_017243	TAA	2	6	581488	581493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208015
14526	NC_017243	TCT	2	6	581494	581499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384208015
14527	NC_017243	ACT	2	6	581500	581505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208015
14528	NC_017243	TTTC	3	12	581512	581523	0 %	75 %	0 %	25 %	384208015
14529	NC_017243	AGA	2	6	581526	581531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208015
14530	NC_017243	AAT	2	6	581550	581555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208015
14531	NC_017243	TA	3	6	581591	581596	50 %	50 %	0 %	0 %	384208015
14532	NC_017243	TTG	2	6	581619	581624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384208015
14533	NC_017243	ATT	3	9	581679	581687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208016
14534	NC_017243	T	7	7	581689	581695	0 %	100 %	0 %	0 %	384208016
14535	NC_017243	T	7	7	581725	581731	0 %	100 %	0 %	0 %	384208016
14536	NC_017243	T	7	7	581779	581785	0 %	100 %	0 %	0 %	384208016
14537	NC_017243	TCT	2	6	581792	581797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384208016
14538	NC_017243	AAC	2	6	581818	581823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384208016
14539	NC_017243	TAT	2	6	581845	581850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208016
14540	NC_017243	CCAT	2	8	581870	581877	25 %	25 %	0 %	50 %	384208016
14541	NC_017243	CTT	2	6	581940	581945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384208016
14542	NC_017243	CTG	2	6	581955	581960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384208016
14543	NC_017243	ATTGT	2	10	581971	581980	20 %	60 %	20 %	0 %	384208016
14544	NC_017243	AAC	2	6	582010	582015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384208016
14545	NC_017243	CTT	2	6	582078	582083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384208016
14546	NC_017243	AT	3	6	582138	582143	50 %	50 %	0 %	0 %	384208017
14547	NC_017243	ATA	2	6	582224	582229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208017
14548	NC_017243	AT	3	6	582240	582245	50 %	50 %	0 %	0 %	384208017
14549	NC_017243	CAT	2	6	582249	582254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208017
14550	NC_017243	ATTAA	2	10	582293	582302	60 %	40 %	0 %	0 %	384208017
14551	NC_017243	TAG	2	6	582315	582320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208017
14552	NC_017243	TCAT	2	8	582356	582363	25 %	50 %	0 %	25 %	384208017
14553	NC_017243	T	7	7	582375	582381	0 %	100 %	0 %	0 %	384208017
14554	NC_017243	TAT	2	6	582403	582408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208017
14555	NC_017243	CTA	2	6	582417	582422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208017
14556	NC_017243	CTA	2	6	582438	582443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208017
14557	NC_017243	TA	3	6	582559	582564	50 %	50 %	0 %	0 %	384208017
14558	NC_017243	ATG	2	6	583708	583713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208018
14559	NC_017243	T	6	6	583783	583788	0 %	100 %	0 %	0 %	384208018
14560	NC_017243	TA	3	6	583881	583886	50 %	50 %	0 %	0 %	384208018
14561	NC_017243	ATA	2	6	583916	583921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208018
14562	NC_017243	TC	3	6	583970	583975	0 %	50 %	0 %	50 %	384208018
14563	NC_017243	T	6	6	583990	583995	0 %	100 %	0 %	0 %	384208018
14564	NC_017243	T	6	6	584042	584047	0 %	100 %	0 %	0 %	384208018
14565	NC_017243	TAG	2	6	584157	584162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208018
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14570	NC_017243	TAT	2	6	584287	584292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208018
14571	NC_017243	TA	3	6	584349	584354	50 %	50 %	0 %	0 %	384208018
14572	NC_017243	CT	3	6	584359	584364	0 %	50 %	0 %	50 %	384208018
14573	NC_017243	TCT	2	6	584422	584427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384208018
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14579	NC_017243	TC	3	6	584618	584623	0 %	50 %	0 %	50 %	384208018
14580	NC_017243	GGC	2	6	584663	584668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384208018
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14590	NC_017243	CTT	2	6	584903	584908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384208018
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14594	NC_017243	T	6	6	585035	585040	0 %	100 %	0 %	0 %	384208018
14595	NC_017243	CTT	2	6	585042	585047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384208018
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14605	NC_017243	TA	3	6	585253	585258	50 %	50 %	0 %	0 %	384208018
14606	NC_017243	TTGT	2	8	585286	585293	0 %	75 %	25 %	0 %	384208018
14607	NC_017243	ATA	2	6	585357	585362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208018
14608	NC_017243	T	6	6	585389	585394	0 %	100 %	0 %	0 %	384208018
14609	NC_017243	TGA	2	6	585400	585405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208018
14610	NC_017243	T	6	6	585410	585415	0 %	100 %	0 %	0 %	384208018
14611	NC_017243	TCA	2	6	585458	585463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208018
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14615	NC_017243	AT	4	8	585575	585582	50 %	50 %	0 %	0 %	384208018
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14621	NC_017243	T	8	8	585774	585781	0 %	100 %	0 %	0 %	384208018
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