MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_017243	AAG	2	6	560636	560641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207997
14003	NC_017243	TGATAA	2	12	560653	560664	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384207997
14004	NC_017243	TC	3	6	560694	560699	0 %	50 %	0 %	50 %	384207997
14005	NC_017243	AT	3	6	560709	560714	50 %	50 %	0 %	0 %	384207997
14006	NC_017243	TGA	2	6	560794	560799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207997
14007	NC_017243	AGAAA	2	10	560845	560854	80 %	0 %	20 %	0 %	384207997
14008	NC_017243	AT	3	6	560898	560903	50 %	50 %	0 %	0 %	384207997
14009	NC_017243	ATC	2	6	560962	560967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207997
14010	NC_017243	TAT	2	6	560982	560987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207997
14011	NC_017243	CGG	2	6	561007	561012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384207997
14012	NC_017243	TA	3	6	561021	561026	50 %	50 %	0 %	0 %	384207997
14013	NC_017243	TCA	2	6	561027	561032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207997
14014	NC_017243	ATA	2	6	561033	561038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207997
14015	NC_017243	AATTA	2	10	561039	561048	60 %	40 %	0 %	0 %	384207997
14016	NC_017243	AT	5	10	561052	561061	50 %	50 %	0 %	0 %	384207997
14017	NC_017243	GCCTTT	2	12	561094	561105	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384207997
14018	NC_017243	ATT	2	6	561166	561171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207997
14019	NC_017243	AAG	2	6	561183	561188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207997
14020	NC_017243	ACA	2	6	561233	561238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207997
14021	NC_017243	CAG	2	6	561249	561254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207997
14022	NC_017243	GA	3	6	561281	561286	50 %	0 %	50 %	0 %	384207997
14023	NC_017243	A	6	6	561816	561821	100 %	0 %	0 %	0 %	384207998
14024	NC_017243	AAT	3	9	561823	561831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207998
14025	NC_017243	A	6	6	561835	561840	100 %	0 %	0 %	0 %	384207998
14026	NC_017243	GGC	2	6	561870	561875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384207998
14027	NC_017243	AATC	2	8	561907	561914	50 %	25 %	0 %	25 %	384207998
14028	NC_017243	TA	3	6	561934	561939	50 %	50 %	0 %	0 %	384207998
14029	NC_017243	GAT	2	6	561946	561951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207998
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14032	NC_017243	TAA	2	6	562101	562106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207998
14033	NC_017243	GAA	2	6	562166	562171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207998
14034	NC_017243	ATA	2	6	562220	562225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207998
14035	NC_017243	ATG	2	6	562259	562264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207998
14036	NC_017243	TAT	2	6	562368	562373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207998
14037	NC_017243	AT	3	6	562455	562460	50 %	50 %	0 %	0 %	384207998
14038	NC_017243	TGA	2	6	562461	562466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207998
14039	NC_017243	CTTT	2	8	562481	562488	0 %	75 %	0 %	25 %	384207998
14040	NC_017243	A	6	6	562534	562539	100 %	0 %	0 %	0 %	384207998
14041	NC_017243	TA	3	6	562540	562545	50 %	50 %	0 %	0 %	384207998
14042	NC_017243	AAT	2	6	562623	562628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207998
14043	NC_017243	CTG	2	6	562631	562636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207998
14044	NC_017243	TAT	2	6	562643	562648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207998
14045	NC_017243	AGAA	2	8	562650	562657	75 %	0 %	25 %	0 %	384207998
14046	NC_017243	ATG	2	6	562658	562663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207998
14047	NC_017243	TGA	2	6	562752	562757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207998
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14049	NC_017243	TAG	2	6	562820	562825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207998
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14052	NC_017243	ATA	2	6	562967	562972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207998
14053	NC_017243	CAAAA	2	10	563013	563022	80 %	0 %	0 %	20 %	384207998
14054	NC_017243	CGG	2	6	563031	563036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384207998
14055	NC_017243	CTT	2	6	563057	563062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207998
14056	NC_017243	CTA	2	6	563129	563134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207998
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14058	NC_017243	AAAG	2	8	563212	563219	75 %	0 %	25 %	0 %	384207998
14059	NC_017243	AGAAA	2	10	563251	563260	80 %	0 %	20 %	0 %	384207998
14060	NC_017243	ATG	2	6	563272	563277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207998
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14062	NC_017243	ATAA	2	8	563377	563384	75 %	25 %	0 %	0 %	384207998
14063	NC_017243	CTT	2	6	563390	563395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207998
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14069	NC_017243	A	6	6	563710	563715	100 %	0 %	0 %	0 %	384207998
14070	NC_017243	TCT	2	6	563729	563734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207998
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14103	NC_017243	A	6	6	564935	564940	100 %	0 %	0 %	0 %	384207999
14104	NC_017243	TA	3	6	564941	564946	50 %	50 %	0 %	0 %	384207999
14105	NC_017243	GA	4	8	564986	564993	50 %	0 %	50 %	0 %	384207999
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14112	NC_017243	ATA	2	6	565206	565211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207999
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14120	NC_017243	AGAAA	2	10	565652	565661	80 %	0 %	20 %	0 %	384207999
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14242	NC_017243	T	6	6	570956	570961	0 %	100 %	0 %	0 %	384208004
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