MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017243	CTTT	2	8	521929	521936	0 %	75 %	0 %	25 %	384207965
13003	NC_017243	T	8	8	521960	521967	0 %	100 %	0 %	0 %	384207965
13004	NC_017243	TGT	2	6	521970	521975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207965
13005	NC_017243	TTA	2	6	521986	521991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207965
13006	NC_017243	A	6	6	521994	521999	100 %	0 %	0 %	0 %	384207965
13007	NC_017243	CAT	2	6	522023	522028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207965
13008	NC_017243	TCC	2	6	522050	522055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207965
13009	NC_017243	TGAGCT	2	12	522060	522071	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384207965
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13011	NC_017243	ATT	3	9	522503	522511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207966
13012	NC_017243	TAG	2	6	522633	522638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207966
13013	NC_017243	ATT	2	6	522672	522677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207967
13014	NC_017243	ATT	2	6	522710	522715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207967
13015	NC_017243	TTC	2	6	522719	522724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207967
13016	NC_017243	TAT	2	6	522770	522775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207967
13017	NC_017243	CTT	2	6	522787	522792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207967
13018	NC_017243	CTT	2	6	522862	522867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207967
13019	NC_017243	T	6	6	522923	522928	0 %	100 %	0 %	0 %	384207967
13020	NC_017243	ATT	2	6	522948	522953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207967
13021	NC_017243	T	6	6	523511	523516	0 %	100 %	0 %	0 %	384207968
13022	NC_017243	AGA	2	6	523683	523688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207968
13023	NC_017243	ACT	2	6	523713	523718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207968
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13026	NC_017243	T	6	6	523825	523830	0 %	100 %	0 %	0 %	384207968
13027	NC_017243	ACA	2	6	523876	523881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207968
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13029	NC_017243	ATC	2	6	523962	523967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207968
13030	NC_017243	ATC	2	6	523969	523974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207968
13031	NC_017243	ATA	2	6	524020	524025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207968
13032	NC_017243	TAG	2	6	524111	524116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207968
13033	NC_017243	ATC	2	6	524169	524174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207968
13034	NC_017243	TAG	2	6	524249	524254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207968
13035	NC_017243	TAT	2	6	524271	524276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207968
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13037	NC_017243	TCTTT	2	10	524332	524341	0 %	80 %	0 %	20 %	384207968
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13040	NC_017243	TAT	2	6	524424	524429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207968
13041	NC_017243	TAA	2	6	524453	524458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207968
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13045	NC_017243	ATT	3	9	524568	524576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207968
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13052	NC_017243	ATTA	2	8	524763	524770	50 %	50 %	0 %	0 %	384207968
13053	NC_017243	ACCAT	2	10	524779	524788	40 %	20 %	0 %	40 %	384207968
13054	NC_017243	AT	3	6	524798	524803	50 %	50 %	0 %	0 %	384207968
13055	NC_017243	CTGCAT	2	12	524915	524926	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384207968
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13058	NC_017243	GTA	2	6	524980	524985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207968
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13060	NC_017243	TCA	2	6	525001	525006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207968
13061	NC_017243	ATC	2	6	525045	525050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207968
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13063	NC_017243	AT	3	6	525153	525158	50 %	50 %	0 %	0 %	384207968
13064	NC_017243	TAT	2	6	525173	525178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207968
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13088	NC_017243	TAT	2	6	526284	526289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207969
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13104	NC_017243	TCTT	2	8	526961	526968	0 %	75 %	0 %	25 %	384207970
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13109	NC_017243	ATA	2	6	527128	527133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207970
13110	NC_017243	ATA	2	6	527139	527144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207970
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13113	NC_017243	TCT	2	6	527318	527323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207971
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13116	NC_017243	TCCA	2	8	527484	527491	25 %	25 %	0 %	50 %	384207971
13117	NC_017243	AAAG	2	8	527524	527531	75 %	0 %	25 %	0 %	384207971
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