MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017243	GAAA	2	8	495480	495487	75 %	0 %	25 %	0 %	384207945
12502	NC_017243	ATAG	2	8	495497	495504	50 %	25 %	25 %	0 %	384207945
12503	NC_017243	CTA	2	6	495531	495536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207945
12504	NC_017243	A	6	6	495540	495545	100 %	0 %	0 %	0 %	384207945
12505	NC_017243	GGA	2	6	495578	495583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207945
12506	NC_017243	AAT	2	6	495614	495619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207945
12507	NC_017243	TCT	2	6	495626	495631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207945
12508	NC_017243	AAAAG	2	10	495674	495683	80 %	0 %	20 %	0 %	384207945
12509	NC_017243	GCT	2	6	495725	495730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207945
12510	NC_017243	CTG	2	6	495735	495740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207945
12511	NC_017243	TGAAT	2	10	495742	495751	40 %	40 %	20 %	0 %	384207945
12512	NC_017243	GAA	3	9	495857	495865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207945
12513	NC_017243	A	6	6	495875	495880	100 %	0 %	0 %	0 %	384207945
12514	NC_017243	GAT	2	6	495923	495928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207945
12515	NC_017243	CAT	2	6	495953	495958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207945
12516	NC_017243	ATA	2	6	495996	496001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207945
12517	NC_017243	TAA	2	6	496048	496053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207945
12518	NC_017243	TAA	2	6	496056	496061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207945
12519	NC_017243	A	6	6	496127	496132	100 %	0 %	0 %	0 %	384207945
12520	NC_017243	TGT	2	6	496147	496152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207945
12521	NC_017243	TAA	2	6	496186	496191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207945
12522	NC_017243	GTT	2	6	496316	496321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207945
12523	NC_017243	TTAT	2	8	496343	496350	25 %	75 %	0 %	0 %	384207945
12524	NC_017243	TAA	3	9	496364	496372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207945
12525	NC_017243	T	6	6	496391	496396	0 %	100 %	0 %	0 %	384207946
12526	NC_017243	T	6	6	496463	496468	0 %	100 %	0 %	0 %	384207946
12527	NC_017243	AAAG	2	8	496472	496479	75 %	0 %	25 %	0 %	384207946
12528	NC_017243	AAT	2	6	496483	496488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207946
12529	NC_017243	CTT	2	6	496555	496560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207946
12530	NC_017243	TTTATC	2	12	496574	496585	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384207946
12531	NC_017243	TATT	2	8	496593	496600	25 %	75 %	0 %	0 %	384207946
12532	NC_017243	TAT	3	9	496619	496627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207946
12533	NC_017243	AAT	2	6	496640	496645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207946
12534	NC_017243	TAA	2	6	496666	496671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207946
12535	NC_017243	ATA	2	6	496672	496677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207946
12536	NC_017243	TAT	2	6	496691	496696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207946
12537	NC_017243	ATA	2	6	496776	496781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207947
12538	NC_017243	CTCA	2	8	496816	496823	25 %	25 %	0 %	50 %	384207947
12539	NC_017243	AGG	2	6	496834	496839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207947
12540	NC_017243	TTG	2	6	496863	496868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207947
12541	NC_017243	TAG	2	6	496917	496922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207947
12542	NC_017243	AATA	2	8	496924	496931	75 %	25 %	0 %	0 %	384207947
12543	NC_017243	ATC	2	6	496933	496938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207947
12544	NC_017243	TTGCT	2	10	496989	496998	0 %	60 %	20 %	20 %	384207947
12545	NC_017243	TTGAA	2	10	497109	497118	40 %	40 %	20 %	0 %	384207947
12546	NC_017243	TAC	2	6	497161	497166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207947
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12548	NC_017243	ATAAAA	2	12	497453	497464	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384207948
12549	NC_017243	ATA	2	6	497471	497476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207948
12550	NC_017243	AATT	2	8	497477	497484	50 %	50 %	0 %	0 %	384207948
12551	NC_017243	TGT	2	6	497505	497510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207948
12552	NC_017243	T	6	6	497592	497597	0 %	100 %	0 %	0 %	384207948
12553	NC_017243	TAC	2	6	497637	497642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207948
12554	NC_017243	A	6	6	497654	497659	100 %	0 %	0 %	0 %	384207948
12555	NC_017243	A	6	6	497676	497681	100 %	0 %	0 %	0 %	384207948
12556	NC_017243	ATA	2	6	499484	499489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207949
12557	NC_017243	GAA	2	6	499495	499500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207949
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12559	NC_017243	A	7	7	499532	499538	100 %	0 %	0 %	0 %	384207949
12560	NC_017243	TGA	2	6	499547	499552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207949
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12562	NC_017243	AT	3	6	499567	499572	50 %	50 %	0 %	0 %	384207949
12563	NC_017243	AGA	2	6	499574	499579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207949
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12565	NC_017243	GAA	2	6	499599	499604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207949
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12578	NC_017243	T	6	6	506268	506273	0 %	100 %	0 %	0 %	384207950
12579	NC_017243	T	7	7	506284	506290	0 %	100 %	0 %	0 %	384207950
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12593	NC_017243	TTG	2	6	506897	506902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207951
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12604	NC_017243	AAAGAT	2	12	507388	507399	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384207952
12605	NC_017243	GAT	2	6	507454	507459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207952
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12607	NC_017243	CTTA	2	8	507548	507555	25 %	50 %	0 %	25 %	384207952
12608	NC_017243	AAG	2	6	507568	507573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207952
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12611	NC_017243	TAT	2	6	507754	507759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207952
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12613	NC_017243	GTA	2	6	507878	507883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207952
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12619	NC_017243	AT	3	6	508056	508061	50 %	50 %	0 %	0 %	384207952
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12621	NC_017243	CGG	2	6	508074	508079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384207952
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