MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11004	NC_017243	CT	3	6	440510	440515	0 %	50 %	0 %	50 %	384207900
11005	NC_017243	CTT	2	6	440538	440543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207900
11006	NC_017243	AAG	2	6	440624	440629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207900
11007	NC_017243	CTG	2	6	440686	440691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207900
11008	NC_017243	ATA	2	6	440703	440708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207900
11009	NC_017243	ATT	2	6	440715	440720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207900
11010	NC_017243	T	7	7	440740	440746	0 %	100 %	0 %	0 %	384207901
11011	NC_017243	ATA	2	6	440748	440753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207901
11012	NC_017243	T	7	7	440762	440768	0 %	100 %	0 %	0 %	384207901
11013	NC_017243	AAT	2	6	440839	440844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207901
11014	NC_017243	CAT	2	6	440858	440863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207901
11015	NC_017243	ATC	2	6	440879	440884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207901
11016	NC_017243	TATG	2	8	440920	440927	25 %	50 %	25 %	0 %	384207901
11017	NC_017243	TCA	2	6	440931	440936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207901
11018	NC_017243	T	8	8	440984	440991	0 %	100 %	0 %	0 %	384207901
11019	NC_017243	CTTT	2	8	440994	441001	0 %	75 %	0 %	25 %	384207901
11020	NC_017243	T	7	7	440999	441005	0 %	100 %	0 %	0 %	384207901
11021	NC_017243	CTT	2	6	441063	441068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207901
11022	NC_017243	TTA	2	6	441138	441143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207901
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11025	NC_017243	TAT	2	6	441238	441243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207901
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11028	NC_017243	T	6	6	441416	441421	0 %	100 %	0 %	0 %	384207902
11029	NC_017243	TTCT	2	8	441478	441485	0 %	75 %	0 %	25 %	384207902
11030	NC_017243	TTC	3	9	441503	441511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207902
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11034	NC_017243	TTC	2	6	441640	441645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207902
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11041	NC_017243	T	6	6	441993	441998	0 %	100 %	0 %	0 %	384207903
11042	NC_017243	ATTT	2	8	442008	442015	25 %	75 %	0 %	0 %	384207903
11043	NC_017243	TATTT	2	10	442023	442032	20 %	80 %	0 %	0 %	384207903
11044	NC_017243	T	8	8	442095	442102	0 %	100 %	0 %	0 %	384207903
11045	NC_017243	ATC	2	6	442146	442151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207903
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11052	NC_017243	T	7	7	442391	442397	0 %	100 %	0 %	0 %	384207904
11053	NC_017243	ATA	2	6	442433	442438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207904
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11056	NC_017243	AAAT	2	8	442490	442497	75 %	25 %	0 %	0 %	384207904
11057	NC_017243	ATG	2	6	442538	442543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207904
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11059	NC_017243	TATT	2	8	442552	442559	25 %	75 %	0 %	0 %	384207904
11060	NC_017243	TA	3	6	442561	442566	50 %	50 %	0 %	0 %	384207904
11061	NC_017243	ATG	2	6	442574	442579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207904
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11063	NC_017243	TA	3	6	442660	442665	50 %	50 %	0 %	0 %	384207904
11064	NC_017243	AT	3	6	442676	442681	50 %	50 %	0 %	0 %	384207904
11065	NC_017243	AGA	2	6	442694	442699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207904
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11089	NC_017243	A	6	6	443441	443446	100 %	0 %	0 %	0 %	384207904
11090	NC_017243	AAAAT	2	10	443451	443460	80 %	20 %	0 %	0 %	384207904
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11093	NC_017243	AGTA	2	8	443721	443728	50 %	25 %	25 %	0 %	384207905
11094	NC_017243	GAA	2	6	443752	443757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207905
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11100	NC_017243	TA	3	6	444038	444043	50 %	50 %	0 %	0 %	384207905
11101	NC_017243	TAAA	2	8	444065	444072	75 %	25 %	0 %	0 %	384207905
11102	NC_017243	ATAGT	2	10	444182	444191	40 %	40 %	20 %	0 %	384207905
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11110	NC_017243	ATT	2	6	444531	444536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207905
11111	NC_017243	ATT	2	6	444600	444605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207905
11112	NC_017243	TTA	2	6	444611	444616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207905
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11116	NC_017243	AT	3	6	444800	444805	50 %	50 %	0 %	0 %	384207905
11117	NC_017243	TAT	2	6	444808	444813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207905
11118	NC_017243	AAT	2	6	444817	444822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207905
11119	NC_017243	TCA	2	6	444838	444843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207905
11120	NC_017243	CCTTT	2	10	444916	444925	0 %	60 %	0 %	40 %	384207905
11121	NC_017243	ATT	2	6	444948	444953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207905
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