MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8503	NC_017243	TTTC	2	8	344202	344209	0 %	75 %	0 %	25 %	384207814
8504	NC_017243	ATGT	2	8	344227	344234	25 %	50 %	25 %	0 %	384207814
8505	NC_017243	ATA	2	6	344289	344294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207814
8506	NC_017243	CCG	2	6	344299	344304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384207814
8507	NC_017243	TCT	2	6	344317	344322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207814
8508	NC_017243	TTCA	2	8	344343	344350	25 %	50 %	0 %	25 %	384207814
8509	NC_017243	CAT	2	6	344406	344411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207814
8510	NC_017243	CCG	2	6	344461	344466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384207814
8511	NC_017243	CA	3	6	344469	344474	50 %	0 %	0 %	50 %	384207814
8512	NC_017243	TTTA	2	8	344481	344488	25 %	75 %	0 %	0 %	384207814
8513	NC_017243	T	6	6	344510	344515	0 %	100 %	0 %	0 %	384207814
8514	NC_017243	ATA	2	6	344562	344567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207814
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8516	NC_017243	GAA	2	6	344590	344595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207814
8517	NC_017243	TGT	2	6	344601	344606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207814
8518	NC_017243	TCC	2	6	344616	344621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207814
8519	NC_017243	CAA	2	6	344678	344683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207814
8520	NC_017243	TAA	2	6	344699	344704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207814
8521	NC_017243	GGCAT	2	10	344724	344733	20 %	20 %	40 %	20 %	384207814
8522	NC_017243	TTTA	2	8	344751	344758	25 %	75 %	0 %	0 %	384207814
8523	NC_017243	ATT	2	6	344874	344879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207814
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8526	NC_017243	T	6	6	344896	344901	0 %	100 %	0 %	0 %	384207814
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8530	NC_017243	ATA	2	6	344996	345001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207815
8531	NC_017243	ATC	2	6	345008	345013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207815
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8533	NC_017243	TTC	3	9	345074	345082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207815
8534	NC_017243	AGT	2	6	345098	345103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207815
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8536	NC_017243	CCG	2	6	345228	345233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384207815
8537	NC_017243	TGCT	2	8	345253	345260	0 %	50 %	25 %	25 %	384207815
8538	NC_017243	ATC	2	6	345314	345319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207815
8539	NC_017243	TGTC	2	8	345360	345367	0 %	50 %	25 %	25 %	384207815
8540	NC_017243	TGAA	2	8	345396	345403	50 %	25 %	25 %	0 %	384207815
8541	NC_017243	TCA	2	6	345492	345497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207815
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8543	NC_017243	ATT	2	6	345597	345602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207815
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8545	NC_017243	TTA	2	6	345649	345654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207815
8546	NC_017243	ACT	2	6	345714	345719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207815
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8550	NC_017243	CTG	2	6	346066	346071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207815
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8553	NC_017243	AGT	2	6	346160	346165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207815
8554	NC_017243	CTC	2	6	346180	346185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207815
8555	NC_017243	TCCTG	2	10	346209	346218	0 %	40 %	20 %	40 %	384207815
8556	NC_017243	TTG	2	6	347164	347169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207816
8557	NC_017243	GTATT	2	10	347179	347188	20 %	60 %	20 %	0 %	384207816
8558	NC_017243	TAA	2	6	347189	347194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207816
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8564	NC_017243	AT	3	6	347279	347284	50 %	50 %	0 %	0 %	384207816
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8999	NC_017243	CTT	2	6	360823	360828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207824
9000	NC_017243	CAT	2	6	360902	360907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207824

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