MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
81501	NC_017243	TA	3	6	3208727	3208732	50 %	50 %	0 %	0 %	384210291
81502	NC_017243	CCG	2	6	3208746	3208751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384210291
81503	NC_017243	A	6	6	3208761	3208766	100 %	0 %	0 %	0 %	384210291
81504	NC_017243	TCA	2	6	3208788	3208793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210291
81505	NC_017243	ATA	2	6	3208800	3208805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210291
81506	NC_017243	CT	3	6	3208889	3208894	0 %	50 %	0 %	50 %	384210291
81507	NC_017243	AAG	2	6	3209009	3209014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384210291
81508	NC_017243	T	8	8	3209052	3209059	0 %	100 %	0 %	0 %	384210291
81509	NC_017243	CAT	3	9	3209265	3209273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210292
81510	NC_017243	T	6	6	3209275	3209280	0 %	100 %	0 %	0 %	384210292
81511	NC_017243	TCA	2	6	3209285	3209290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210292
81512	NC_017243	TTC	3	9	3209305	3209313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210292
81513	NC_017243	TCA	2	6	3209342	3209347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210292
81514	NC_017243	CTT	2	6	3209394	3209399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210292
81515	NC_017243	ATTTA	2	10	3209461	3209470	40 %	60 %	0 %	0 %	384210292
81516	NC_017243	TTA	2	6	3209492	3209497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210292
81517	NC_017243	GCAT	2	8	3209540	3209547	25 %	25 %	25 %	25 %	384210292
81518	NC_017243	CTT	2	6	3209550	3209555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210292
81519	NC_017243	TGT	2	6	3209680	3209685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384210292
81520	NC_017243	ATT	2	6	3209689	3209694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210292
81521	NC_017243	AAC	2	6	3209767	3209772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384210292
81522	NC_017243	TCT	2	6	3209846	3209851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210292
81523	NC_017243	ATG	2	6	3209873	3209878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210292
81524	NC_017243	TG	3	6	3209905	3209910	0 %	50 %	50 %	0 %	384210292
81525	NC_017243	CCG	2	6	3210113	3210118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384210292
81526	NC_017243	CAA	2	6	3210129	3210134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384210292
81527	NC_017243	T	6	6	3210139	3210144	0 %	100 %	0 %	0 %	384210292
81528	NC_017243	TTA	2	6	3210161	3210166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210292
81529	NC_017243	CTT	2	6	3210170	3210175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210292
81530	NC_017243	ATC	2	6	3210197	3210202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210292
81531	NC_017243	TGTT	2	8	3210220	3210227	0 %	75 %	25 %	0 %	384210292
81532	NC_017243	TGA	2	6	3210235	3210240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210292
81533	NC_017243	TGA	2	6	3210307	3210312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210292
81534	NC_017243	TAA	2	6	3210363	3210368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210292
81535	NC_017243	TAT	2	6	3210369	3210374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210292
81536	NC_017243	T	6	6	3210444	3210449	0 %	100 %	0 %	0 %	384210292
81537	NC_017243	TCA	2	6	3210560	3210565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210292
81538	NC_017243	GATT	2	8	3210626	3210633	25 %	50 %	25 %	0 %	384210292
81539	NC_017243	AGA	2	6	3210646	3210651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384210292
81540	NC_017243	TAAA	2	8	3210673	3210680	75 %	25 %	0 %	0 %	384210292
81541	NC_017243	AAAT	2	8	3210693	3210700	75 %	25 %	0 %	0 %	384210292
81542	NC_017243	ATATAA	3	18	3210705	3210722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210292
81543	NC_017243	TAT	2	6	3210757	3210762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210292
81544	NC_017243	TATAA	2	10	3210777	3210786	60 %	40 %	0 %	0 %	384210292
81545	NC_017243	TA	3	6	3210808	3210813	50 %	50 %	0 %	0 %	384210292
81546	NC_017243	T	7	7	3210832	3210838	0 %	100 %	0 %	0 %	384210292
81547	NC_017243	TTA	2	6	3210875	3210880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210292
81548	NC_017243	GAT	3	9	3210929	3210937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210292
81549	NC_017243	TA	3	6	3210961	3210966	50 %	50 %	0 %	0 %	384210292
81550	NC_017243	CTG	2	6	3210968	3210973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384210292
81551	NC_017243	TAT	2	6	3210985	3210990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210292
81552	NC_017243	ATA	2	6	3211009	3211014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210292
81553	NC_017243	AGA	2	6	3211034	3211039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384210292
81554	NC_017243	T	6	6	3211046	3211051	0 %	100 %	0 %	0 %	384210292
81555	NC_017243	AT	4	8	3211141	3211148	50 %	50 %	0 %	0 %	384210292
81556	NC_017243	A	6	6	3211208	3211213	100 %	0 %	0 %	0 %	384210292
81557	NC_017243	TCTG	2	8	3211252	3211259	0 %	50 %	25 %	25 %	384210292
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81559	NC_017243	ATTT	2	8	3211344	3211351	25 %	75 %	0 %	0 %	384210292
81560	NC_017243	TA	3	6	3211366	3211371	50 %	50 %	0 %	0 %	384210292
81561	NC_017243	ATC	2	6	3211402	3211407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210292
81562	NC_017243	TTA	2	6	3211424	3211429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210292
81563	NC_017243	AATA	2	8	3211431	3211438	75 %	25 %	0 %	0 %	384210292
81564	NC_017243	CAT	2	6	3211462	3211467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210292
81565	NC_017243	TAT	2	6	3211479	3211484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210292
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81567	NC_017243	CATTT	2	10	3211519	3211528	20 %	60 %	0 %	20 %	384210292
81568	NC_017243	T	6	6	3211547	3211552	0 %	100 %	0 %	0 %	384210292
81569	NC_017243	TCT	3	9	3211562	3211570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210292
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81573	NC_017243	ATA	2	6	3211698	3211703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210292
81574	NC_017243	ATA	2	6	3211710	3211715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210292
81575	NC_017243	ATA	2	6	3211731	3211736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210292
81576	NC_017243	GTA	2	6	3211775	3211780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210292
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81578	NC_017243	TAT	2	6	3211813	3211818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210292
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81581	NC_017243	ATTA	2	8	3212216	3212223	50 %	50 %	0 %	0 %	384210293
81582	NC_017243	CCAA	2	8	3212229	3212236	50 %	0 %	0 %	50 %	384210293
81583	NC_017243	CATTT	2	10	3212303	3212312	20 %	60 %	0 %	20 %	384210293
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81586	NC_017243	TA	3	6	3212381	3212386	50 %	50 %	0 %	0 %	384210293
81587	NC_017243	CTT	2	6	3212428	3212433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210293
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81589	NC_017243	CATT	2	8	3212499	3212506	25 %	50 %	0 %	25 %	384210293
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81607	NC_017243	TCT	2	6	3213137	3213142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210294
81608	NC_017243	GCA	2	6	3213212	3213217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384210294
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81612	NC_017243	GCTC	2	8	3213381	3213388	0 %	25 %	25 %	50 %	384210294
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81616	NC_017243	TCTAT	2	10	3213647	3213656	20 %	60 %	0 %	20 %	384210294
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