MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_017243	GTA	2	6	260707	260712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207738
6503	NC_017243	GAAA	2	8	260718	260725	75 %	0 %	25 %	0 %	384207738
6504	NC_017243	TTA	2	6	260755	260760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207738
6505	NC_017243	AAG	2	6	260903	260908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207738
6506	NC_017243	CAG	2	6	260957	260962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207738
6507	NC_017243	AT	3	6	261012	261017	50 %	50 %	0 %	0 %	384207738
6508	NC_017243	ATAG	2	8	261021	261028	50 %	25 %	25 %	0 %	384207738
6509	NC_017243	TAT	2	6	261050	261055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207738
6510	NC_017243	ATT	2	6	261177	261182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207738
6511	NC_017243	CTT	2	6	261188	261193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207738
6512	NC_017243	AGTAT	2	10	261252	261261	40 %	40 %	20 %	0 %	384207738
6513	NC_017243	TTA	2	6	261373	261378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207738
6514	NC_017243	CATT	2	8	261386	261393	25 %	50 %	0 %	25 %	384207738
6515	NC_017243	TGT	2	6	261425	261430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207738
6516	NC_017243	TAG	2	6	261497	261502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207738
6517	NC_017243	TAT	2	6	261515	261520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207738
6518	NC_017243	ATA	2	6	261535	261540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207738
6519	NC_017243	GTT	2	6	261597	261602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207738
6520	NC_017243	ATTG	2	8	261641	261648	25 %	50 %	25 %	0 %	384207738
6521	NC_017243	CAATC	2	10	261665	261674	40 %	20 %	0 %	40 %	384207738
6522	NC_017243	CATA	2	8	261686	261693	50 %	25 %	0 %	25 %	384207738
6523	NC_017243	TAA	2	6	261738	261743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207738
6524	NC_017243	T	7	7	261746	261752	0 %	100 %	0 %	0 %	384207738
6525	NC_017243	T	7	7	261755	261761	0 %	100 %	0 %	0 %	384207738
6526	NC_017243	ATTA	2	8	262684	262691	50 %	50 %	0 %	0 %	384207739
6527	NC_017243	CAC	2	6	262697	262702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384207739
6528	NC_017243	GTA	2	6	262732	262737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207739
6529	NC_017243	TTGA	2	8	262763	262770	25 %	50 %	25 %	0 %	384207739
6530	NC_017243	ATT	2	6	262782	262787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207739
6531	NC_017243	CATC	2	8	262790	262797	25 %	25 %	0 %	50 %	384207739
6532	NC_017243	AAG	2	6	262910	262915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207739
6533	NC_017243	AAG	2	6	262928	262933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207739
6534	NC_017243	CAG	4	12	262982	262993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207739
6535	NC_017243	TTA	2	6	263038	263043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207739
6536	NC_017243	CAT	2	6	263048	263053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207739
6537	NC_017243	CTG	2	6	263081	263086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207739
6538	NC_017243	GCC	2	6	263103	263108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384207739
6539	NC_017243	TAT	2	6	263120	263125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207739
6540	NC_017243	CTTG	2	8	263188	263195	0 %	50 %	25 %	25 %	384207739
6541	NC_017243	AGA	2	6	263247	263252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207739
6542	NC_017243	AGTAT	2	10	263301	263310	40 %	40 %	20 %	0 %	384207739
6543	NC_017243	TAT	2	6	263321	263326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207739
6544	NC_017243	TGT	2	6	263346	263351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207739
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6546	NC_017243	GTATAG	2	12	263399	263410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207739
6547	NC_017243	TA	3	6	263466	263471	50 %	50 %	0 %	0 %	384207739
6548	NC_017243	CCG	2	6	263473	263478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384207739
6549	NC_017243	ACCTAT	2	12	263517	263528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207739
6550	NC_017243	CAG	2	6	263552	263557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207739
6551	NC_017243	GATT	2	8	263621	263628	25 %	50 %	25 %	0 %	384207739
6552	NC_017243	AAG	2	6	263725	263730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207739
6553	NC_017243	CATA	2	8	263753	263760	50 %	25 %	0 %	25 %	384207739
6554	NC_017243	TAA	2	6	263787	263792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207739
6555	NC_017243	T	6	6	263814	263819	0 %	100 %	0 %	0 %	384207739
6556	NC_017243	TTA	2	6	264219	264224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207740
6557	NC_017243	ACA	2	6	264271	264276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207740
6558	NC_017243	TAT	2	6	264281	264286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207740
6559	NC_017243	TTA	2	6	264328	264333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207740
6560	NC_017243	ATG	2	6	264484	264489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207740
6561	NC_017243	CTT	2	6	264554	264559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207740
6562	NC_017243	TC	3	6	264574	264579	0 %	50 %	0 %	50 %	384207740
6563	NC_017243	TAA	2	6	264627	264632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207740
6564	NC_017243	ACT	2	6	264636	264641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207740
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6567	NC_017243	TA	3	6	264846	264851	50 %	50 %	0 %	0 %	384207740
6568	NC_017243	AGTAT	2	10	264870	264879	40 %	40 %	20 %	0 %	384207740
6569	NC_017243	TCTTT	2	10	264913	264922	0 %	80 %	0 %	20 %	384207740
6570	NC_017243	ATA	2	6	264926	264931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207740
6571	NC_017243	ATT	3	9	265008	265016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207740
6572	NC_017243	TAC	2	6	265032	265037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207740
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6574	NC_017243	TAG	2	6	265139	265144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207740
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6578	NC_017243	CATA	2	8	265328	265335	50 %	25 %	0 %	25 %	384207740
6579	NC_017243	GCTA	2	8	265350	265357	25 %	25 %	25 %	25 %	384207740
6580	NC_017243	AAATTA	2	12	265708	265719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207741
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6589	NC_017243	TAA	2	6	266080	266085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207741
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6591	NC_017243	TCT	2	6	266161	266166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207741
6592	NC_017243	TCATT	2	10	266181	266190	20 %	60 %	0 %	20 %	384207741
6593	NC_017243	CTGTT	2	10	266255	266264	0 %	60 %	20 %	20 %	384207741
6594	NC_017243	AG	3	6	266303	266308	50 %	0 %	50 %	0 %	384207741
6595	NC_017243	TTA	2	6	266352	266357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207741
6596	NC_017243	TA	3	6	266374	266379	50 %	50 %	0 %	0 %	384207741
6597	NC_017243	CTT	2	6	266400	266405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207741
6598	NC_017243	AGCAT	2	10	266426	266435	40 %	20 %	20 %	20 %	384207741
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6601	NC_017243	GCT	2	6	266513	266518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207741
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6604	NC_017243	CT	4	8	266604	266611	0 %	50 %	0 %	50 %	384207741
6605	NC_017243	CAT	2	6	266619	266624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207741
6606	NC_017243	T	6	6	266665	266670	0 %	100 %	0 %	0 %	384207741
6607	NC_017243	TC	3	6	266684	266689	0 %	50 %	0 %	50 %	384207741
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6610	NC_017243	T	6	6	266741	266746	0 %	100 %	0 %	0 %	384207741
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6615	NC_017243	CCTATT	2	12	266914	266925	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384207742
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6620	NC_017243	A	6	6	267411	267416	100 %	0 %	0 %	0 %	384207742
6621	NC_017243	AAT	2	6	267439	267444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207742
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6997	NC_017243	CATT	2	8	282800	282807	25 %	50 %	0 %	25 %	384207754
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