MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp38

Total Repeats: 529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017237	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207454
2	NC_017237	A	6	6	45	50	100 %	0 %	0 %	0 %	384207454
3	NC_017237	CTT	2	6	73	78	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207454
4	NC_017237	TTA	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207454
5	NC_017237	A	7	7	126	132	100 %	0 %	0 %	0 %	384207454
6	NC_017237	AT	3	6	142	147	50 %	50 %	0 %	0 %	384207454
7	NC_017237	GAT	2	6	192	197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207454
8	NC_017237	ATT	2	6	198	203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207454
9	NC_017237	A	6	6	223	228	100 %	0 %	0 %	0 %	384207454
10	NC_017237	A	6	6	242	247	100 %	0 %	0 %	0 %	384207454
11	NC_017237	A	7	7	707	713	100 %	0 %	0 %	0 %	384207455
12	NC_017237	TCA	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207455
13	NC_017237	A	6	6	779	784	100 %	0 %	0 %	0 %	384207455
14	NC_017237	TCT	2	6	852	857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207455
15	NC_017237	ATT	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207455
16	NC_017237	AAT	2	6	915	920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207455
17	NC_017237	AT	4	8	1043	1050	50 %	50 %	0 %	0 %	384207455
18	NC_017237	A	6	6	1067	1072	100 %	0 %	0 %	0 %	384207455
19	NC_017237	A	6	6	1078	1083	100 %	0 %	0 %	0 %	384207455
20	NC_017237	A	7	7	1096	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	384207455
21	NC_017237	GGA	2	6	1146	1151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207455
22	NC_017237	AGC	2	6	1226	1231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207455
23	NC_017237	TTC	2	6	1303	1308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207455
24	NC_017237	AG	3	6	1334	1339	50 %	0 %	50 %	0 %	384207455
25	NC_017237	A	8	8	1346	1353	100 %	0 %	0 %	0 %	384207455
26	NC_017237	TTA	2	6	1379	1384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207455
27	NC_017237	TAA	2	6	2292	2297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207456
28	NC_017237	A	6	6	2301	2306	100 %	0 %	0 %	0 %	384207456
29	NC_017237	ATTT	2	8	2339	2346	25 %	75 %	0 %	0 %	384207456
30	NC_017237	ACT	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207456
31	NC_017237	ATC	2	6	2396	2401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207456
32	NC_017237	ATT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207456
33	NC_017237	T	6	6	2518	2523	0 %	100 %	0 %	0 %	384207456
34	NC_017237	ATT	2	6	2525	2530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207456
35	NC_017237	AAT	2	6	2558	2563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207456
36	NC_017237	TTG	2	6	2569	2574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207456
37	NC_017237	TCA	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207456
38	NC_017237	CAA	2	6	2602	2607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207456
39	NC_017237	T	6	6	2670	2675	0 %	100 %	0 %	0 %	384207456
40	NC_017237	TAT	2	6	2717	2722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207456
41	NC_017237	ATCA	2	8	2783	2790	50 %	25 %	0 %	25 %	384207456
42	NC_017237	TAA	2	6	2803	2808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207456
43	NC_017237	ATC	2	6	2838	2843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207456
44	NC_017237	TAG	2	6	2851	2856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207456
45	NC_017237	TTA	2	6	2917	2922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207456
46	NC_017237	CAG	2	6	3019	3024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207456
47	NC_017237	AAC	2	6	3039	3044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207456
48	NC_017237	A	6	6	3101	3106	100 %	0 %	0 %	0 %	384207456
49	NC_017237	CTA	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207456
50	NC_017237	GTA	2	6	3157	3162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207456
51	NC_017237	CAT	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207456
52	NC_017237	CAAAA	2	10	3184	3193	80 %	0 %	0 %	20 %	384207456
53	NC_017237	CTTC	2	8	3267	3274	0 %	50 %	0 %	50 %	384207456
54	NC_017237	TCT	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207456
55	NC_017237	TTG	2	6	3325	3330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207456
56	NC_017237	CAA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207456
57	NC_017237	ATTT	2	8	3437	3444	25 %	75 %	0 %	0 %	384207456
58	NC_017237	TTA	2	6	3465	3470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207456
59	NC_017237	ATC	2	6	3545	3550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207456
60	NC_017237	CA	3	6	3593	3598	50 %	0 %	0 %	50 %	384207456
61	NC_017237	A	8	8	3611	3618	100 %	0 %	0 %	0 %	384207456
62	NC_017237	T	7	7	3631	3637	0 %	100 %	0 %	0 %	384207456
63	NC_017237	ATT	2	6	3641	3646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207456
64	NC_017237	AAGAA	2	10	3758	3767	80 %	0 %	20 %	0 %	384207456
65	NC_017237	CT	3	6	3768	3773	0 %	50 %	0 %	50 %	384207456
66	NC_017237	ATATGT	2	12	3774	3785	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384207456
67	NC_017237	T	6	6	3832	3837	0 %	100 %	0 %	0 %	384207456
68	NC_017237	TTA	2	6	3891	3896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207456
69	NC_017237	TAAA	2	8	3925	3932	75 %	25 %	0 %	0 %	384207456
70	NC_017237	AAT	2	6	4531	4536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207457
71	NC_017237	ATA	2	6	4586	4591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207457
72	NC_017237	TTTA	2	8	4603	4610	25 %	75 %	0 %	0 %	384207457
73	NC_017237	AAT	2	6	4611	4616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207457
74	NC_017237	TAT	2	6	4626	4631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207457
75	NC_017237	CTA	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207457
76	NC_017237	TAA	2	6	4672	4677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207457
77	NC_017237	GTT	2	6	4700	4705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207457
78	NC_017237	TAA	2	6	4762	4767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207457
79	NC_017237	T	8	8	4778	4785	0 %	100 %	0 %	0 %	384207457
80	NC_017237	AGCA	2	8	4786	4793	50 %	0 %	25 %	25 %	384207457
81	NC_017237	ATT	2	6	4802	4807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207457
82	NC_017237	ATT	2	6	4847	4852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207457
83	NC_017237	TCT	2	6	4951	4956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207457
84	NC_017237	CAT	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207457
85	NC_017237	T	8	8	4992	4999	0 %	100 %	0 %	0 %	384207457
86	NC_017237	TAT	2	6	5088	5093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207457
87	NC_017237	TTA	3	9	6655	6663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207458
88	NC_017237	T	7	7	6698	6704	0 %	100 %	0 %	0 %	384207458
89	NC_017237	AAT	3	9	6737	6745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207458
90	NC_017237	A	6	6	6751	6756	100 %	0 %	0 %	0 %	384207458
91	NC_017237	T	8	8	7059	7066	0 %	100 %	0 %	0 %	384207459
92	NC_017237	T	6	6	7076	7081	0 %	100 %	0 %	0 %	384207459
93	NC_017237	TATT	2	8	7088	7095	25 %	75 %	0 %	0 %	384207459
94	NC_017237	T	9	9	7105	7113	0 %	100 %	0 %	0 %	384207459
95	NC_017237	TATT	2	8	7149	7156	25 %	75 %	0 %	0 %	384207459
96	NC_017237	TAAAT	2	10	7171	7180	60 %	40 %	0 %	0 %	384207459
97	NC_017237	T	6	6	7180	7185	0 %	100 %	0 %	0 %	384207459
98	NC_017237	TAA	2	6	7200	7205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207459
99	NC_017237	AAG	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207459
100	NC_017237	TTA	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207460
101	NC_017237	T	6	6	7331	7336	0 %	100 %	0 %	0 %	384207460
102	NC_017237	T	7	7	7345	7351	0 %	100 %	0 %	0 %	384207460
103	NC_017237	CCA	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384207460
104	NC_017237	ATT	2	6	7365	7370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207460
105	NC_017237	TAA	2	6	7381	7386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207460
106	NC_017237	TATT	2	8	7387	7394	25 %	75 %	0 %	0 %	384207460
107	NC_017237	ATAA	2	8	7398	7405	75 %	25 %	0 %	0 %	384207460
108	NC_017237	TTAAT	2	10	7463	7472	40 %	60 %	0 %	0 %	384207461
109	NC_017237	CTA	2	6	7481	7486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207461
110	NC_017237	AGA	2	6	7500	7505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207461
111	NC_017237	T	7	7	7509	7515	0 %	100 %	0 %	0 %	384207461
112	NC_017237	T	6	6	7521	7526	0 %	100 %	0 %	0 %	384207461
113	NC_017237	ATC	2	6	7530	7535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207461
114	NC_017237	ATT	2	6	7539	7544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207461
115	NC_017237	ATT	2	6	7548	7553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207461
116	NC_017237	GAT	2	6	7575	7580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207461
117	NC_017237	ATTGCA	2	12	7639	7650	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384207461
118	NC_017237	TTC	2	6	7659	7664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207461
119	NC_017237	ATT	2	6	7711	7716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207461
120	NC_017237	T	6	6	7738	7743	0 %	100 %	0 %	0 %	384207461
121	NC_017237	T	6	6	7791	7796	0 %	100 %	0 %	0 %	384207461
122	NC_017237	TGT	2	6	7857	7862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207461
123	NC_017237	ATTT	2	8	7898	7905	25 %	75 %	0 %	0 %	384207461
124	NC_017237	TTG	2	6	7906	7911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207461
125	NC_017237	ATATA	2	10	7967	7976	60 %	40 %	0 %	0 %	384207461
126	NC_017237	TATT	2	8	7994	8001	25 %	75 %	0 %	0 %	384207461
127	NC_017237	ATTAT	2	10	8026	8035	40 %	60 %	0 %	0 %	384207461
128	NC_017237	T	9	9	8062	8070	0 %	100 %	0 %	0 %	384207461
129	NC_017237	TTC	2	6	8079	8084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207461
130	NC_017237	T	6	6	8097	8102	0 %	100 %	0 %	0 %	384207461
131	NC_017237	AAT	2	6	8109	8114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207461
132	NC_017237	ATT	2	6	8152	8157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207461
133	NC_017237	ATTT	2	8	8190	8197	25 %	75 %	0 %	0 %	384207461
134	NC_017237	A	7	7	8233	8239	100 %	0 %	0 %	0 %	384207461
135	NC_017237	TTA	2	6	8240	8245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207461
136	NC_017237	A	6	6	8627	8632	100 %	0 %	0 %	0 %	384207462
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138	NC_017237	TCA	2	6	8642	8647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207462
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