MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-7

Total Repeats: 590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017235	TTA	2	6	92	97	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206452
2	NC_017235	TCA	2	6	112	117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206452
3	NC_017235	GAA	2	6	154	159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206452
4	NC_017235	TCT	2	6	163	168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206452
5	NC_017235	A	6	6	176	181	100 %	0 %	0 %	0 %	384206452
6	NC_017235	T	6	6	192	197	0 %	100 %	0 %	0 %	384206452
7	NC_017235	AAAT	2	8	201	208	75 %	25 %	0 %	0 %	384206452
8	NC_017235	T	6	6	217	222	0 %	100 %	0 %	0 %	384206452
9	NC_017235	AAC	2	6	232	237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206452
10	NC_017235	TTA	2	6	283	288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206452
11	NC_017235	ATCA	2	8	372	379	50 %	25 %	0 %	25 %	384206452
12	NC_017235	ACT	2	6	456	461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206452
13	NC_017235	TCA	2	6	475	480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206452
14	NC_017235	A	7	7	480	486	100 %	0 %	0 %	0 %	384206452
15	NC_017235	AAC	2	6	521	526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206452
16	NC_017235	ATT	2	6	541	546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206452
17	NC_017235	ACCA	2	8	555	562	50 %	0 %	0 %	50 %	384206452
18	NC_017235	AT	3	6	571	576	50 %	50 %	0 %	0 %	384206452
19	NC_017235	TAATAT	2	12	850	861	50 %	50 %	0 %	0 %	384206453
20	NC_017235	A	7	7	863	869	100 %	0 %	0 %	0 %	384206453
21	NC_017235	ATTAAT	2	12	877	888	50 %	50 %	0 %	0 %	384206453
22	NC_017235	AGA	2	6	919	924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206453
23	NC_017235	ACT	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206453
24	NC_017235	A	6	6	978	983	100 %	0 %	0 %	0 %	384206453
25	NC_017235	ATTT	2	8	1011	1018	25 %	75 %	0 %	0 %	384206453
26	NC_017235	TGG	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206453
27	NC_017235	AGG	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206453
28	NC_017235	AT	3	6	1117	1122	50 %	50 %	0 %	0 %	384206453
29	NC_017235	CCA	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206453
30	NC_017235	TAC	2	6	1176	1181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206453
31	NC_017235	ATT	2	6	1229	1234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206453
32	NC_017235	CATTTA	2	12	1236	1247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384206453
33	NC_017235	A	7	7	1273	1279	100 %	0 %	0 %	0 %	384206453
34	NC_017235	A	7	7	1349	1355	100 %	0 %	0 %	0 %	384206453
35	NC_017235	TTA	2	6	1357	1362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206453
36	NC_017235	TAT	2	6	1425	1430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
37	NC_017235	AAT	2	6	1465	1470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
38	NC_017235	TTA	2	6	1483	1488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
39	NC_017235	TCT	2	6	1503	1508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
40	NC_017235	T	6	6	1511	1516	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
41	NC_017235	TCT	2	6	1557	1562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
42	NC_017235	ATT	2	6	1595	1600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
43	NC_017235	TTTTCT	2	12	1605	1616	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384206454
44	NC_017235	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206454
45	NC_017235	CTT	3	9	1660	1668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
46	NC_017235	AAGTA	2	10	1689	1698	60 %	20 %	20 %	0 %	384206454
47	NC_017235	TTC	2	6	1790	1795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
48	NC_017235	CAT	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206454
49	NC_017235	A	6	6	1866	1871	100 %	0 %	0 %	0 %	384206454
50	NC_017235	ATA	2	6	1899	1904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
51	NC_017235	AAT	2	6	1905	1910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
52	NC_017235	T	6	6	1910	1915	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
53	NC_017235	CA	3	6	1961	1966	50 %	0 %	0 %	50 %	384206454
54	NC_017235	TC	3	6	2003	2008	0 %	50 %	0 %	50 %	384206454
55	NC_017235	TCT	2	6	2088	2093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
56	NC_017235	TATC	2	8	2095	2102	25 %	50 %	0 %	25 %	384206454
57	NC_017235	A	6	6	2141	2146	100 %	0 %	0 %	0 %	384206454
58	NC_017235	TGA	2	6	2160	2165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206454
59	NC_017235	TCA	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206454
60	NC_017235	TAA	2	6	2216	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
61	NC_017235	ATT	2	6	2231	2236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
62	NC_017235	TAA	2	6	2311	2316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
63	NC_017235	TAT	2	6	2345	2350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
64	NC_017235	TTTGA	2	10	2375	2384	20 %	60 %	20 %	0 %	384206454
65	NC_017235	TAA	2	6	2452	2457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
66	NC_017235	ACT	2	6	2465	2470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206454
67	NC_017235	T	7	7	2569	2575	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
68	NC_017235	AT	3	6	2617	2622	50 %	50 %	0 %	0 %	384206454
69	NC_017235	TAAGT	2	10	2676	2685	40 %	40 %	20 %	0 %	384206454
70	NC_017235	CAC	2	6	2749	2754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206454
71	NC_017235	ATT	2	6	2786	2791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
72	NC_017235	GAT	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206454
73	NC_017235	AT	3	6	2913	2918	50 %	50 %	0 %	0 %	384206454
74	NC_017235	TCA	2	6	2937	2942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206454
75	NC_017235	GGA	2	6	2961	2966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206454
76	NC_017235	CTT	2	6	2989	2994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
77	NC_017235	T	6	6	3055	3060	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
78	NC_017235	T	6	6	3064	3069	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
79	NC_017235	ATTA	2	8	3116	3123	50 %	50 %	0 %	0 %	384206454
80	NC_017235	TCT	2	6	3267	3272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
81	NC_017235	TAG	2	6	3274	3279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206454
82	NC_017235	CAT	2	6	3280	3285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206454
83	NC_017235	T	6	6	3298	3303	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
84	NC_017235	GATA	2	8	3304	3311	50 %	25 %	25 %	0 %	384206454
85	NC_017235	TCT	2	6	3312	3317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
86	NC_017235	T	6	6	3342	3347	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
87	NC_017235	ATA	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
88	NC_017235	AGC	2	6	3358	3363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206454
89	NC_017235	TAA	2	6	3448	3453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
90	NC_017235	GTG	2	6	3460	3465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206454
91	NC_017235	CAA	2	6	3469	3474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206454
92	NC_017235	AT	3	6	3520	3525	50 %	50 %	0 %	0 %	384206454
93	NC_017235	TTC	2	6	3565	3570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
94	NC_017235	ATATT	2	10	3603	3612	40 %	60 %	0 %	0 %	384206454
95	NC_017235	T	6	6	3611	3616	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
96	NC_017235	TAA	2	6	3625	3630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
97	NC_017235	T	8	8	3655	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
98	NC_017235	A	6	6	3726	3731	100 %	0 %	0 %	0 %	384206454
99	NC_017235	TTC	2	6	3794	3799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
100	NC_017235	TCT	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
101	NC_017235	TTTC	2	8	3857	3864	0 %	75 %	0 %	25 %	384206454
102	NC_017235	TTC	2	6	3944	3949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
103	NC_017235	AAGT	2	8	3960	3967	50 %	25 %	25 %	0 %	384206454
104	NC_017235	AAT	2	6	3977	3982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
105	NC_017235	TAG	2	6	3991	3996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206454
106	NC_017235	T	6	6	4082	4087	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
107	NC_017235	T	7	7	4098	4104	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
108	NC_017235	AAG	2	6	4110	4115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206454
109	NC_017235	TTC	2	6	4133	4138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
110	NC_017235	ATT	2	6	4166	4171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
111	NC_017235	TCT	2	6	4188	4193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
112	NC_017235	TCC	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206454
113	NC_017235	TAT	2	6	4265	4270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
114	NC_017235	T	7	7	4270	4276	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
115	NC_017235	ATTT	2	8	4285	4292	25 %	75 %	0 %	0 %	384206454
116	NC_017235	T	6	6	4290	4295	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
117	NC_017235	TCA	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206454
118	NC_017235	A	8	8	4309	4316	100 %	0 %	0 %	0 %	384206454
119	NC_017235	TCT	2	6	4353	4358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
120	NC_017235	AT	3	6	4389	4394	50 %	50 %	0 %	0 %	384206454
121	NC_017235	A	6	6	4400	4405	100 %	0 %	0 %	0 %	384206454
122	NC_017235	TAAAA	2	10	4412	4421	80 %	20 %	0 %	0 %	384206454
123	NC_017235	TTC	2	6	4430	4435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
124	NC_017235	GCTA	2	8	4442	4449	25 %	25 %	25 %	25 %	384206454
125	NC_017235	CTTTG	2	10	4475	4484	0 %	60 %	20 %	20 %	384206454
126	NC_017235	AT	3	6	4496	4501	50 %	50 %	0 %	0 %	384206454
127	NC_017235	T	6	6	4503	4508	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
128	NC_017235	GTC	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206454
129	NC_017235	T	6	6	4564	4569	0 %	100 %	0 %	0 %	384206454
130	NC_017235	TCA	2	6	4660	4665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206454
131	NC_017235	TAATAT	2	12	4787	4798	50 %	50 %	0 %	0 %	384206455
132	NC_017235	A	7	7	4800	4806	100 %	0 %	0 %	0 %	384206455
133	NC_017235	ATTAAT	2	12	4814	4825	50 %	50 %	0 %	0 %	384206455
134	NC_017235	A	6	6	4872	4877	100 %	0 %	0 %	0 %	384206455
135	NC_017235	AGA	2	6	4922	4927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206455
136	NC_017235	A	9	9	4941	4949	100 %	0 %	0 %	0 %	384206455
137	NC_017235	A	6	6	4981	4986	100 %	0 %	0 %	0 %	384206455
138	NC_017235	T	8	8	4992	4999	0 %	100 %	0 %	0 %	384206455
139	NC_017235	T	7	7	5056	5062	0 %	100 %	0 %	0 %	384206455
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