MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-4

Total Repeats: 365

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017234	ACA	2	6	904	909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206320
2	NC_017234	TATG	2	8	916	923	25 %	50 %	25 %	0 %	384206320
3	NC_017234	TG	3	6	922	927	0 %	50 %	50 %	0 %	384206320
4	NC_017234	T	7	7	928	934	0 %	100 %	0 %	0 %	384206320
5	NC_017234	A	7	7	980	986	100 %	0 %	0 %	0 %	384206320
6	NC_017234	A	6	6	1025	1030	100 %	0 %	0 %	0 %	384206320
7	NC_017234	AAC	2	6	1049	1054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206320
8	NC_017234	ACC	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206320
9	NC_017234	AGA	2	6	1088	1093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206320
10	NC_017234	T	6	6	1172	1177	0 %	100 %	0 %	0 %	384206320
11	NC_017234	ATG	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206320
12	NC_017234	TGA	2	6	1193	1198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206320
13	NC_017234	ACA	2	6	1203	1208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206320
14	NC_017234	ATAGC	2	10	1252	1261	40 %	20 %	20 %	20 %	384206320
15	NC_017234	AGAA	2	8	1280	1287	75 %	0 %	25 %	0 %	384206320
16	NC_017234	TAAT	2	8	1288	1295	50 %	50 %	0 %	0 %	384206320
17	NC_017234	A	6	6	1346	1351	100 %	0 %	0 %	0 %	384206320
18	NC_017234	TTA	2	6	1419	1424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206320
19	NC_017234	GAT	2	6	1458	1463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206320
20	NC_017234	A	9	9	1512	1520	100 %	0 %	0 %	0 %	384206320
21	NC_017234	AAC	2	6	1538	1543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206320
22	NC_017234	GAA	2	6	2852	2857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206321
23	NC_017234	AGA	2	6	2914	2919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206321
24	NC_017234	AGA	2	6	2954	2959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206321
25	NC_017234	TATACT	2	12	2960	2971	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384206321
26	NC_017234	AGC	2	6	3059	3064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206321
27	NC_017234	A	6	6	3107	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	384206321
28	NC_017234	A	6	6	3168	3173	100 %	0 %	0 %	0 %	384206321
29	NC_017234	TAT	2	6	3174	3179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206321
30	NC_017234	TAA	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206321
31	NC_017234	A	6	6	3187	3192	100 %	0 %	0 %	0 %	384206321
32	NC_017234	TTA	2	6	3218	3223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206321
33	NC_017234	TAA	2	6	3262	3267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206321
34	NC_017234	GAA	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206321
35	NC_017234	A	6	6	3336	3341	100 %	0 %	0 %	0 %	384206321
36	NC_017234	TAA	2	6	3354	3359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206321
37	NC_017234	TA	3	6	4880	4885	50 %	50 %	0 %	0 %	384206322
38	NC_017234	TATT	2	8	4896	4903	25 %	75 %	0 %	0 %	384206322
39	NC_017234	TAA	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206322
40	NC_017234	AGA	3	9	4993	5001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206322
41	NC_017234	TAAA	2	8	5004	5011	75 %	25 %	0 %	0 %	384206322
42	NC_017234	A	6	6	5017	5022	100 %	0 %	0 %	0 %	384206322
43	NC_017234	ACT	2	6	5026	5031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206322
44	NC_017234	A	6	6	5041	5046	100 %	0 %	0 %	0 %	384206322
45	NC_017234	TA	3	6	5081	5086	50 %	50 %	0 %	0 %	384206322
46	NC_017234	AAT	2	6	5089	5094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206322
47	NC_017234	GAAT	2	8	5121	5128	50 %	25 %	25 %	0 %	384206322
48	NC_017234	TTGG	2	8	5139	5146	0 %	50 %	50 %	0 %	384206322
49	NC_017234	GA	3	6	5180	5185	50 %	0 %	50 %	0 %	384206322
50	NC_017234	AGA	2	6	5198	5203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206322
51	NC_017234	A	7	7	5278	5284	100 %	0 %	0 %	0 %	384206322
52	NC_017234	AGC	2	6	5306	5311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206322
53	NC_017234	A	6	6	5354	5359	100 %	0 %	0 %	0 %	384206322
54	NC_017234	A	6	6	5415	5420	100 %	0 %	0 %	0 %	384206322
55	NC_017234	TAT	2	6	5421	5426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206322
56	NC_017234	TAA	2	6	5430	5435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206322
57	NC_017234	A	6	6	5434	5439	100 %	0 %	0 %	0 %	384206322
58	NC_017234	TTA	2	6	5465	5470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206322
59	NC_017234	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206322
60	NC_017234	TTA	2	6	6870	6875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206323
61	NC_017234	TA	3	6	6883	6888	50 %	50 %	0 %	0 %	384206323
62	NC_017234	AC	3	6	7173	7178	50 %	0 %	0 %	50 %	384206324
63	NC_017234	A	6	6	7250	7255	100 %	0 %	0 %	0 %	384206324
64	NC_017234	TTA	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206324
65	NC_017234	CAAC	2	8	7377	7384	50 %	0 %	0 %	50 %	384206324
66	NC_017234	TAC	2	6	7424	7429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206324
67	NC_017234	A	6	6	7445	7450	100 %	0 %	0 %	0 %	384206324
68	NC_017234	AATA	2	8	7469	7476	75 %	25 %	0 %	0 %	384206324
69	NC_017234	AGA	2	6	7485	7490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206324
70	NC_017234	AAG	2	6	7545	7550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206324
71	NC_017234	TAA	5	15	7576	7590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
72	NC_017234	AGA	2	6	7597	7602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206324
73	NC_017234	A	7	7	7636	7642	100 %	0 %	0 %	0 %	384206324
74	NC_017234	TAA	2	6	7648	7653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
75	NC_017234	T	6	6	7660	7665	0 %	100 %	0 %	0 %	384206324
76	NC_017234	A	7	7	7669	7675	100 %	0 %	0 %	0 %	384206324
77	NC_017234	TTC	2	6	7677	7682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206324
78	NC_017234	AATT	2	8	7713	7720	50 %	50 %	0 %	0 %	384206324
79	NC_017234	AAT	2	6	7723	7728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
80	NC_017234	TAA	2	6	7758	7763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
81	NC_017234	A	6	6	7762	7767	100 %	0 %	0 %	0 %	384206324
82	NC_017234	AAT	4	12	7769	7780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
83	NC_017234	ATAA	2	8	7781	7788	75 %	25 %	0 %	0 %	384206324
84	NC_017234	A	8	8	7799	7806	100 %	0 %	0 %	0 %	384206324
85	NC_017234	TA	3	6	7830	7835	50 %	50 %	0 %	0 %	384206324
86	NC_017234	CAA	2	6	7874	7879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206324
87	NC_017234	TAA	2	6	7963	7968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
88	NC_017234	GAAA	2	8	7997	8004	75 %	0 %	25 %	0 %	384206324
89	NC_017234	A	7	7	8002	8008	100 %	0 %	0 %	0 %	384206324
90	NC_017234	A	6	6	8020	8025	100 %	0 %	0 %	0 %	384206324
91	NC_017234	AAAT	2	8	8040	8047	75 %	25 %	0 %	0 %	384206324
92	NC_017234	A	7	7	8074	8080	100 %	0 %	0 %	0 %	384206324
93	NC_017234	TTA	3	9	8167	8175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206324
94	NC_017234	ATT	2	6	8179	8184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206324
95	NC_017234	A	7	7	8194	8200	100 %	0 %	0 %	0 %	384206324
96	NC_017234	A	6	6	8202	8207	100 %	0 %	0 %	0 %	384206324
97	NC_017234	A	6	6	8288	8293	100 %	0 %	0 %	0 %	384206325
98	NC_017234	TAAAAA	2	12	8307	8318	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206325
99	NC_017234	ATG	2	6	8374	8379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206325
100	NC_017234	ATA	2	6	8402	8407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206325
101	NC_017234	AATG	2	8	8413	8420	50 %	25 %	25 %	0 %	384206325
102	NC_017234	TTTA	2	8	8439	8446	25 %	75 %	0 %	0 %	384206325
103	NC_017234	GAA	2	6	8461	8466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206325
104	NC_017234	AAG	2	6	8486	8491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206325
105	NC_017234	TAT	2	6	8512	8517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206325
106	NC_017234	A	6	6	8535	8540	100 %	0 %	0 %	0 %	384206325
107	NC_017234	TAC	2	6	8599	8604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206325
108	NC_017234	A	6	6	8620	8625	100 %	0 %	0 %	0 %	384206325
109	NC_017234	T	6	6	8633	8638	0 %	100 %	0 %	0 %	384206325
110	NC_017234	A	7	7	8667	8673	100 %	0 %	0 %	0 %	384206325
111	NC_017234	AGA	2	6	8766	8771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206325
112	NC_017234	A	7	7	8795	8801	100 %	0 %	0 %	0 %	384206325
113	NC_017234	ATA	2	6	8808	8813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206325
114	NC_017234	GGT	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206326
115	NC_017234	AAT	2	6	8858	8863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206326
116	NC_017234	TTA	2	6	8874	8879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
117	NC_017234	ATAGAT	2	12	8904	8915	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206326
118	NC_017234	GCT	2	6	8922	8927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206326
119	NC_017234	TAT	3	9	8937	8945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
120	NC_017234	A	6	6	8960	8965	100 %	0 %	0 %	0 %	384206326
121	NC_017234	AAAT	2	8	8980	8987	75 %	25 %	0 %	0 %	384206326
122	NC_017234	TAA	2	6	9020	9025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206326
123	NC_017234	TAT	2	6	9029	9034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
124	NC_017234	ATA	3	9	9043	9051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206326
125	NC_017234	TA	3	6	9069	9074	50 %	50 %	0 %	0 %	384206326
126	NC_017234	TGA	2	6	9080	9085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206326
127	NC_017234	ATT	3	9	9097	9105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
128	NC_017234	CTAT	2	8	9120	9127	25 %	50 %	0 %	25 %	384206326
129	NC_017234	AAATT	2	10	9147	9156	60 %	40 %	0 %	0 %	384206326
130	NC_017234	TAG	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206326
131	NC_017234	CAG	2	6	9262	9267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206326
132	NC_017234	AAG	2	6	9313	9318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206326
133	NC_017234	TTA	2	6	9337	9342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
134	NC_017234	A	8	8	9357	9364	100 %	0 %	0 %	0 %	384206326
135	NC_017234	AGTA	2	8	9392	9399	50 %	25 %	25 %	0 %	384206326
136	NC_017234	TAAA	2	8	9442	9449	75 %	25 %	0 %	0 %	384206326
137	NC_017234	TAT	2	6	9491	9496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
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139	NC_017234	T	6	6	9521	9526	0 %	100 %	0 %	0 %	384206326
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.