MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp17

Total Repeats: 429

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017232	TAA	2	6	721	726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206381
2	NC_017232	TTG	2	6	838	843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206381
3	NC_017232	GCTT	2	8	848	855	0 %	50 %	25 %	25 %	384206381
4	NC_017232	TGA	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206381
5	NC_017232	T	6	6	997	1002	0 %	100 %	0 %	0 %	384206381
6	NC_017232	A	6	6	1027	1032	100 %	0 %	0 %	0 %	384206381
7	NC_017232	TAA	2	6	1033	1038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206381
8	NC_017232	AAT	2	6	1039	1044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206381
9	NC_017232	A	6	6	1051	1056	100 %	0 %	0 %	0 %	384206381
10	NC_017232	T	7	7	1137	1143	0 %	100 %	0 %	0 %	384206381
11	NC_017232	T	6	6	1180	1185	0 %	100 %	0 %	0 %	384206381
12	NC_017232	GAT	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206381
13	NC_017232	T	6	6	1208	1213	0 %	100 %	0 %	0 %	384206381
14	NC_017232	ACT	2	6	1221	1226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206381
15	NC_017232	CTCATA	2	12	1240	1251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206381
16	NC_017232	T	6	6	1271	1276	0 %	100 %	0 %	0 %	384206382
17	NC_017232	ATC	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206382
18	NC_017232	TAC	2	6	1364	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206382
19	NC_017232	TAA	2	6	1375	1380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206382
20	NC_017232	TAT	2	6	1600	1605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206383
21	NC_017232	TTC	2	6	1643	1648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206383
22	NC_017232	TAA	2	6	1669	1674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206383
23	NC_017232	T	7	7	1686	1692	0 %	100 %	0 %	0 %	384206383
24	NC_017232	ATA	2	6	1694	1699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206383
25	NC_017232	TCTT	2	8	1701	1708	0 %	75 %	0 %	25 %	384206383
26	NC_017232	AT	3	6	1787	1792	50 %	50 %	0 %	0 %	384206383
27	NC_017232	TCT	2	6	1962	1967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206384
28	NC_017232	AT	3	6	1983	1988	50 %	50 %	0 %	0 %	384206384
29	NC_017232	TAA	2	6	2011	2016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206384
30	NC_017232	TAC	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206384
31	NC_017232	AAT	2	6	2090	2095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206384
32	NC_017232	A	6	6	2126	2131	100 %	0 %	0 %	0 %	384206384
33	NC_017232	ATT	2	6	2154	2159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206384
34	NC_017232	ATC	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206384
35	NC_017232	A	6	6	2228	2233	100 %	0 %	0 %	0 %	384206384
36	NC_017232	TCAAAA	2	12	2239	2250	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384206384
37	NC_017232	TAA	2	6	2264	2269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206384
38	NC_017232	TAT	2	6	2292	2297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206385
39	NC_017232	TA	3	6	2312	2317	50 %	50 %	0 %	0 %	384206385
40	NC_017232	TTTG	2	8	2419	2426	0 %	75 %	25 %	0 %	384206385
41	NC_017232	TTA	2	6	2466	2471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206385
42	NC_017232	TAA	2	6	2473	2478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206385
43	NC_017232	CAT	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206385
44	NC_017232	TTC	2	6	2534	2539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206385
45	NC_017232	AGAT	2	8	2595	2602	50 %	25 %	25 %	0 %	384206386
46	NC_017232	ATA	2	6	2614	2619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206386
47	NC_017232	TCT	2	6	2763	2768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206386
48	NC_017232	T	6	6	2780	2785	0 %	100 %	0 %	0 %	384206386
49	NC_017232	TAA	2	6	2868	2873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206386
50	NC_017232	CA	3	6	2877	2882	50 %	0 %	0 %	50 %	384206386
51	NC_017232	AAT	2	6	2890	2895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206386
52	NC_017232	ATC	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206386
53	NC_017232	TCT	2	6	3022	3027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206386
54	NC_017232	CA	3	6	3043	3048	50 %	0 %	0 %	50 %	384206386
55	NC_017232	T	7	7	3065	3071	0 %	100 %	0 %	0 %	384206386
56	NC_017232	AGA	2	6	3163	3168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206386
57	NC_017232	T	7	7	3205	3211	0 %	100 %	0 %	0 %	384206386
58	NC_017232	T	7	7	3288	3294	0 %	100 %	0 %	0 %	384206386
59	NC_017232	ATTAT	2	10	3313	3322	40 %	60 %	0 %	0 %	384206387
60	NC_017232	ATTA	2	8	3330	3337	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
61	NC_017232	ATTA	2	8	3351	3358	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
62	NC_017232	ATTA	2	8	3372	3379	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
63	NC_017232	ATTA	2	8	3393	3400	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
64	NC_017232	ATTA	2	8	3414	3421	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
65	NC_017232	AT	3	6	3431	3436	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
66	NC_017232	AT	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
67	NC_017232	AT	3	6	3473	3478	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
68	NC_017232	AT	3	6	3494	3499	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
69	NC_017232	AT	3	6	3515	3520	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
70	NC_017232	AT	3	6	3536	3541	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
71	NC_017232	AT	3	6	3557	3562	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
72	NC_017232	AT	3	6	3578	3583	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
73	NC_017232	AT	3	6	3599	3604	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
74	NC_017232	AT	3	6	3620	3625	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
75	NC_017232	AT	3	6	3641	3646	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
76	NC_017232	AT	3	6	3662	3667	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
77	NC_017232	AT	3	6	3683	3688	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
78	NC_017232	TAG	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206387
79	NC_017232	ATTAA	2	10	3720	3729	60 %	40 %	0 %	0 %	384206387
80	NC_017232	TAAT	2	8	3733	3740	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
81	NC_017232	CTA	2	6	3748	3753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206387
82	NC_017232	CTT	2	6	4923	4928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206388
83	NC_017232	TGAA	2	8	4939	4946	50 %	25 %	25 %	0 %	384206388
84	NC_017232	T	9	9	4981	4989	0 %	100 %	0 %	0 %	384206388
85	NC_017232	AT	3	6	5003	5008	50 %	50 %	0 %	0 %	384206388
86	NC_017232	TTA	2	6	5027	5032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206388
87	NC_017232	A	6	6	5843	5848	100 %	0 %	0 %	0 %	384206389
88	NC_017232	ACA	2	6	5860	5865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206389
89	NC_017232	CTTT	2	8	5906	5913	0 %	75 %	0 %	25 %	384206389
90	NC_017232	AAAT	2	8	5948	5955	75 %	25 %	0 %	0 %	384206389
91	NC_017232	T	6	6	5971	5976	0 %	100 %	0 %	0 %	384206389
92	NC_017232	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	384206389
93	NC_017232	ATTACG	2	12	6122	6133	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206389
94	NC_017232	ACAAAA	2	12	6145	6156	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384206389
95	NC_017232	A	6	6	6161	6166	100 %	0 %	0 %	0 %	384206389
96	NC_017232	AAT	2	6	6186	6191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206389
97	NC_017232	ACG	2	6	6212	6217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206389
98	NC_017232	AACAA	2	10	6218	6227	80 %	0 %	0 %	20 %	384206389
99	NC_017232	ACC	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206389
100	NC_017232	TAT	2	6	6247	6252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206389
101	NC_017232	GATA	2	8	6270	6277	50 %	25 %	25 %	0 %	384206389
102	NC_017232	A	6	6	6277	6282	100 %	0 %	0 %	0 %	384206389
103	NC_017232	GAA	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206389
104	NC_017232	CAAAA	2	10	6431	6440	80 %	0 %	0 %	20 %	384206389
105	NC_017232	A	6	6	6466	6471	100 %	0 %	0 %	0 %	384206389
106	NC_017232	ATA	2	6	6482	6487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206389
107	NC_017232	AAG	2	6	6491	6496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206389
108	NC_017232	AT	3	6	7385	7390	50 %	50 %	0 %	0 %	384206390
109	NC_017232	AAAAT	2	10	7419	7428	80 %	20 %	0 %	0 %	384206390
110	NC_017232	ATTA	2	8	7451	7458	50 %	50 %	0 %	0 %	384206390
111	NC_017232	TCTA	2	8	7464	7471	25 %	50 %	0 %	25 %	384206390
112	NC_017232	AATC	2	8	7528	7535	50 %	25 %	0 %	25 %	384206390
113	NC_017232	AATG	2	8	7598	7605	50 %	25 %	25 %	0 %	384206390
114	NC_017232	TAA	2	6	7630	7635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206390
115	NC_017232	TCA	2	6	7658	7663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206390
116	NC_017232	AT	3	6	7669	7674	50 %	50 %	0 %	0 %	384206390
117	NC_017232	TAA	2	6	7717	7722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206390
118	NC_017232	T	7	7	7755	7761	0 %	100 %	0 %	0 %	384206390
119	NC_017232	TC	3	6	7774	7779	0 %	50 %	0 %	50 %	384206390
120	NC_017232	TAC	2	6	7843	7848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206390
121	NC_017232	ATA	2	6	7887	7892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206390
122	NC_017232	GAA	2	6	7928	7933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206390
123	NC_017232	GATT	2	8	8012	8019	25 %	50 %	25 %	0 %	384206390
124	NC_017232	CCA	2	6	8176	8181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206391
125	NC_017232	GTT	2	6	8183	8188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206391
126	NC_017232	ATC	2	6	8205	8210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206391
127	NC_017232	TTA	2	6	8233	8238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206391
128	NC_017232	CAT	2	6	8252	8257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206391
129	NC_017232	TAT	2	6	8288	8293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206391
130	NC_017232	CAA	2	6	8306	8311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206391
131	NC_017232	AAT	2	6	8334	8339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206391
132	NC_017232	T	7	7	8365	8371	0 %	100 %	0 %	0 %	384206391
133	NC_017232	TAA	2	6	8425	8430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206391
134	NC_017232	AAAAT	2	10	8542	8551	80 %	20 %	0 %	0 %	384206391
135	NC_017232	T	6	6	8556	8561	0 %	100 %	0 %	0 %	384206391
136	NC_017232	T	6	6	8563	8568	0 %	100 %	0 %	0 %	384206391
137	NC_017232	AAT	2	6	8618	8623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206391
138	NC_017232	A	8	8	8701	8708	100 %	0 %	0 %	0 %	384206391
139	NC_017232	CATT	2	8	8741	8748	25 %	50 %	0 %	25 %	384206391
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398	NC_017232	A	6	6	22481	22486	100 %	0 %	0 %	0 %	384206405
399	NC_017232	A	7	7	22523	22529	100 %	0 %	0 %	0 %	384206405
400	NC_017232	TCAAA	2	10	22593	22602	60 %	20 %	0 %	20 %	384206405
401	NC_017232	T	6	6	22610	22615	0 %	100 %	0 %	0 %	384206405
402	NC_017232	TTA	2	6	22628	22633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206405
403	NC_017232	GATA	2	8	22794	22801	50 %	25 %	25 %	0 %	384206405
404	NC_017232	CAAG	2	8	22810	22817	50 %	0 %	25 %	25 %	384206405
405	NC_017232	CAA	2	6	22823	22828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206405
406	NC_017232	TTA	3	9	22937	22945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206405
407	NC_017232	CAAA	2	8	23295	23302	75 %	0 %	0 %	25 %	384206406
408	NC_017232	TTA	2	6	23344	23349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206406
409	NC_017232	TAA	2	6	23863	23868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206407
410	NC_017232	TCT	2	6	23873	23878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206407
411	NC_017232	TATG	2	8	23884	23891	25 %	50 %	25 %	0 %	384206407
412	NC_017232	CTGT	2	8	23918	23925	0 %	50 %	25 %	25 %	384206407
413	NC_017232	GTA	2	6	23927	23932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206407
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416	NC_017232	TAG	2	6	24189	24194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206407
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427	NC_017232	ATT	2	6	24456	24461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206408
428	NC_017232	TA	4	8	24467	24474	50 %	50 %	0 %	0 %	384206408
429	NC_017232	T	6	6	24522	24527	0 %	100 %	0 %	0 %	384206408

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.