MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-7

Total Repeats: 583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017231	A	6	6	60	65	100 %	0 %	0 %	0 %	384206263
2	NC_017231	TG	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	384206263
3	NC_017231	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	384206263
4	NC_017231	T	6	6	134	139	0 %	100 %	0 %	0 %	384206263
5	NC_017231	AGA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206263
6	NC_017231	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206263
7	NC_017231	ACT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206263
8	NC_017231	TTGATT	2	12	414	425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384206263
9	NC_017231	TAA	2	6	448	453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206263
10	NC_017231	ATA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206263
11	NC_017231	T	6	6	559	564	0 %	100 %	0 %	0 %	384206263
12	NC_017231	ATTT	3	12	572	583	25 %	75 %	0 %	0 %	384206263
13	NC_017231	A	6	6	585	590	100 %	0 %	0 %	0 %	384206263
14	NC_017231	T	6	6	628	633	0 %	100 %	0 %	0 %	384206263
15	NC_017231	CT	3	6	674	679	0 %	50 %	0 %	50 %	384206263
16	NC_017231	CAA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206263
17	NC_017231	CTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206263
18	NC_017231	AGT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206263
19	NC_017231	TAA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206263
20	NC_017231	TTA	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206263
21	NC_017231	TTAA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	384206263
22	NC_017231	ATG	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206263
23	NC_017231	ATT	2	6	1047	1052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206263
24	NC_017231	AGTA	2	8	1109	1116	50 %	25 %	25 %	0 %	384206263
25	NC_017231	AGTA	2	8	1205	1212	50 %	25 %	25 %	0 %	384206263
26	NC_017231	TAA	2	6	1240	1245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206263
27	NC_017231	GAG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206263
28	NC_017231	ATT	2	6	1273	1278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206263
29	NC_017231	TTA	2	6	1482	1487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206264
30	NC_017231	AGG	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206264
31	NC_017231	ATT	2	6	1645	1650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206265
32	NC_017231	TGC	2	6	1700	1705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206265
33	NC_017231	TAA	2	6	1733	1738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206265
34	NC_017231	AATGGA	2	12	1773	1784	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384206265
35	NC_017231	GAAAA	2	10	1798	1807	80 %	0 %	20 %	0 %	384206265
36	NC_017231	A	6	6	1804	1809	100 %	0 %	0 %	0 %	384206265
37	NC_017231	T	7	7	1835	1841	0 %	100 %	0 %	0 %	384206265
38	NC_017231	GAG	2	6	1899	1904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206265
39	NC_017231	TGT	2	6	1940	1945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206265
40	NC_017231	TTA	2	6	1948	1953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206265
41	NC_017231	GAT	2	6	1974	1979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206265
42	NC_017231	GAC	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206265
43	NC_017231	GTC	2	6	2021	2026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206265
44	NC_017231	T	7	7	2030	2036	0 %	100 %	0 %	0 %	384206265
45	NC_017231	GAAA	3	12	2096	2107	75 %	0 %	25 %	0 %	384206265
46	NC_017231	TTAT	2	8	2113	2120	25 %	75 %	0 %	0 %	384206265
47	NC_017231	TAA	2	6	2123	2128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206265
48	NC_017231	CAAG	2	8	2172	2179	50 %	0 %	25 %	25 %	384206265
49	NC_017231	CTA	2	6	2218	2223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206265
50	NC_017231	CAC	2	6	2224	2229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206265
51	NC_017231	TGA	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206265
52	NC_017231	TGC	2	6	2240	2245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206265
53	NC_017231	CTT	2	6	2286	2291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206265
54	NC_017231	A	6	6	2384	2389	100 %	0 %	0 %	0 %	384206265
55	NC_017231	TTG	2	6	2398	2403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206265
56	NC_017231	CTGCA	2	10	2452	2461	20 %	20 %	20 %	40 %	384206265
57	NC_017231	GTG	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206265
58	NC_017231	CTA	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206265
59	NC_017231	ACT	2	6	2534	2539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206265
60	NC_017231	TTAC	2	8	2611	2618	25 %	50 %	0 %	25 %	384206265
61	NC_017231	TAC	2	6	2651	2656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206265
62	NC_017231	TGG	2	6	2748	2753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206266
63	NC_017231	ACA	2	6	2797	2802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206266
64	NC_017231	GTT	2	6	2809	2814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206266
65	NC_017231	TAA	2	6	2840	2845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206266
66	NC_017231	TGCT	2	8	2978	2985	0 %	50 %	25 %	25 %	384206266
67	NC_017231	ATT	2	6	3016	3021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206266
68	NC_017231	GAA	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206266
69	NC_017231	AAG	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206266
70	NC_017231	CAG	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206266
71	NC_017231	A	6	6	3113	3118	100 %	0 %	0 %	0 %	384206266
72	NC_017231	TTA	2	6	3149	3154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206267
73	NC_017231	AAAAC	2	10	3188	3197	80 %	0 %	0 %	20 %	384206267
74	NC_017231	ATTT	2	8	3375	3382	25 %	75 %	0 %	0 %	384206267
75	NC_017231	TAT	2	6	3385	3390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206267
76	NC_017231	TTG	2	6	3401	3406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206267
77	NC_017231	TAT	2	6	3408	3413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206267
78	NC_017231	A	6	6	3457	3462	100 %	0 %	0 %	0 %	384206267
79	NC_017231	AAT	2	6	3493	3498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206267
80	NC_017231	TA	3	6	3523	3528	50 %	50 %	0 %	0 %	384206267
81	NC_017231	GAT	2	6	3529	3534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206267
82	NC_017231	CTTA	2	8	3561	3568	25 %	50 %	0 %	25 %	384206267
83	NC_017231	AAAT	2	8	3604	3611	75 %	25 %	0 %	0 %	384206268
84	NC_017231	A	6	6	3653	3658	100 %	0 %	0 %	0 %	384206268
85	NC_017231	CTTG	2	8	3668	3675	0 %	50 %	25 %	25 %	384206268
86	NC_017231	A	6	6	3683	3688	100 %	0 %	0 %	0 %	384206268
87	NC_017231	GAT	2	6	3732	3737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206268
88	NC_017231	ATG	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206268
89	NC_017231	AATT	2	8	3814	3821	50 %	50 %	0 %	0 %	384206268
90	NC_017231	GCA	2	6	3886	3891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206269
91	NC_017231	A	6	6	3894	3899	100 %	0 %	0 %	0 %	384206269
92	NC_017231	A	6	6	3946	3951	100 %	0 %	0 %	0 %	384206269
93	NC_017231	A	6	6	4003	4008	100 %	0 %	0 %	0 %	384206269
94	NC_017231	AAAC	2	8	4014	4021	75 %	0 %	0 %	25 %	384206269
95	NC_017231	AAG	2	6	4121	4126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206269
96	NC_017231	TTG	2	6	4241	4246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206269
97	NC_017231	AGC	2	6	4302	4307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206269
98	NC_017231	AGG	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206269
99	NC_017231	A	6	6	4330	4335	100 %	0 %	0 %	0 %	384206269
100	NC_017231	GAACT	2	10	4364	4373	40 %	20 %	20 %	20 %	384206269
101	NC_017231	T	6	6	4387	4392	0 %	100 %	0 %	0 %	384206269
102	NC_017231	AGA	2	6	4464	4469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206269
103	NC_017231	CAAG	2	8	4480	4487	50 %	0 %	25 %	25 %	384206269
104	NC_017231	CTAAAT	2	12	4522	4533	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206269
105	NC_017231	A	7	7	4539	4545	100 %	0 %	0 %	0 %	384206269
106	NC_017231	GCG	2	6	4589	4594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206269
107	NC_017231	CTA	2	6	4654	4659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206269
108	NC_017231	A	6	6	4659	4664	100 %	0 %	0 %	0 %	384206269
109	NC_017231	AT	3	6	4683	4688	50 %	50 %	0 %	0 %	384206269
110	NC_017231	AGA	2	6	4689	4694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206269
111	NC_017231	A	6	6	4699	4704	100 %	0 %	0 %	0 %	384206269
112	NC_017231	A	6	6	4795	4800	100 %	0 %	0 %	0 %	384206269
113	NC_017231	AGA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206269
114	NC_017231	ACC	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206269
115	NC_017231	T	6	6	4957	4962	0 %	100 %	0 %	0 %	384206269
116	NC_017231	TTGG	3	12	4996	5007	0 %	50 %	50 %	0 %	384206269
117	NC_017231	CCT	2	6	5029	5034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206269
118	NC_017231	CAAAAA	2	12	5040	5051	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384206269
119	NC_017231	A	7	7	5047	5053	100 %	0 %	0 %	0 %	384206269
120	NC_017231	C	6	6	5066	5071	0 %	0 %	0 %	100 %	384206269
121	NC_017231	ATT	2	6	5175	5180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206270
122	NC_017231	AAT	2	6	5181	5186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206270
123	NC_017231	ATA	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206270
124	NC_017231	A	6	6	5259	5264	100 %	0 %	0 %	0 %	384206270
125	NC_017231	TAA	2	6	5299	5304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206270
126	NC_017231	T	7	7	5330	5336	0 %	100 %	0 %	0 %	384206270
127	NC_017231	T	6	6	5406	5411	0 %	100 %	0 %	0 %	384206270
128	NC_017231	GTT	2	6	5455	5460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206270
129	NC_017231	TTA	2	6	5473	5478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206270
130	NC_017231	TAT	2	6	5481	5486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206270
131	NC_017231	AT	3	6	5536	5541	50 %	50 %	0 %	0 %	384206270
132	NC_017231	GTG	2	6	5548	5553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206270
133	NC_017231	ACT	2	6	5598	5603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206270
134	NC_017231	T	6	6	5615	5620	0 %	100 %	0 %	0 %	384206270
135	NC_017231	AAC	2	6	5650	5655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206270
136	NC_017231	TGA	2	6	5765	5770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206270
137	NC_017231	AGT	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206270
138	NC_017231	A	7	7	5888	5894	100 %	0 %	0 %	0 %	384206271
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