MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-3

Total Repeats: 711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017226	A	7	7	60	66	100 %	0 %	0 %	0 %	384206064
2	NC_017226	TG	3	6	67	72	0 %	50 %	50 %	0 %	384206064
3	NC_017226	TA	3	6	118	123	50 %	50 %	0 %	0 %	384206064
4	NC_017226	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	384206064
5	NC_017226	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206064
6	NC_017226	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206064
7	NC_017226	ACT	2	6	329	334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206064
8	NC_017226	TTGATT	2	12	415	426	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384206064
9	NC_017226	TAA	3	9	449	457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206064
10	NC_017226	ATA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206064
11	NC_017226	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	384206064
12	NC_017226	A	6	6	586	591	100 %	0 %	0 %	0 %	384206064
13	NC_017226	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	384206064
14	NC_017226	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206064
15	NC_017226	AGT	3	9	714	722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206064
16	NC_017226	TAA	2	6	854	859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206064
17	NC_017226	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206064
18	NC_017226	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	384206064
19	NC_017226	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206064
20	NC_017226	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206064
21	NC_017226	AGTA	2	8	1110	1117	50 %	25 %	25 %	0 %	384206064
22	NC_017226	AGTA	2	8	1206	1213	50 %	25 %	25 %	0 %	384206064
23	NC_017226	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206064
24	NC_017226	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206064
25	NC_017226	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206064
26	NC_017226	GAA	2	6	1318	1323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206065
27	NC_017226	AAG	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206065
28	NC_017226	AGG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206065
29	NC_017226	CAG	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206065
30	NC_017226	AG	4	8	1509	1516	50 %	0 %	50 %	0 %	384206065
31	NC_017226	ATT	2	6	1533	1538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206065
32	NC_017226	AGC	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206065
33	NC_017226	TAA	2	6	1602	1607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206065
34	NC_017226	A	6	6	1794	1799	100 %	0 %	0 %	0 %	384206065
35	NC_017226	TTC	3	9	1812	1820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206065
36	NC_017226	ATT	2	6	1843	1848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206065
37	NC_017226	AGA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206065
38	NC_017226	AATT	2	8	1896	1903	50 %	50 %	0 %	0 %	384206065
39	NC_017226	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206066
40	NC_017226	A	6	6	2049	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	384206066
41	NC_017226	CAA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206066
42	NC_017226	GGT	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206066
43	NC_017226	AGC	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206066
44	NC_017226	TGG	3	9	2279	2287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206066
45	NC_017226	TGA	2	6	2288	2293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206066
46	NC_017226	ACT	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206066
47	NC_017226	AGA	2	6	2513	2518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206066
48	NC_017226	TTAT	2	8	2520	2527	25 %	75 %	0 %	0 %	384206066
49	NC_017226	GTAA	2	8	2567	2574	50 %	25 %	25 %	0 %	384206066
50	NC_017226	GTT	2	6	2602	2607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206067
51	NC_017226	GCAG	2	8	2628	2635	25 %	0 %	50 %	25 %	384206067
52	NC_017226	CAAG	2	8	2665	2672	50 %	0 %	25 %	25 %	384206067
53	NC_017226	AGA	2	6	2694	2699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206067
54	NC_017226	GATTC	2	10	2710	2719	20 %	40 %	20 %	20 %	384206067
55	NC_017226	GAT	2	6	2728	2733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206067
56	NC_017226	A	6	6	2749	2754	100 %	0 %	0 %	0 %	384206067
57	NC_017226	GTT	2	6	2807	2812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206067
58	NC_017226	GC	3	6	2829	2834	0 %	0 %	50 %	50 %	384206067
59	NC_017226	AGA	2	6	2877	2882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206067
60	NC_017226	A	6	6	2898	2903	100 %	0 %	0 %	0 %	384206067
61	NC_017226	TA	3	6	2952	2957	50 %	50 %	0 %	0 %	384206067
62	NC_017226	CTGATA	2	12	2972	2983	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206067
63	NC_017226	ATGT	2	8	3002	3009	25 %	50 %	25 %	0 %	384206067
64	NC_017226	TAA	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206067
65	NC_017226	ATAA	2	8	3109	3116	75 %	25 %	0 %	0 %	384206067
66	NC_017226	TTA	2	6	3125	3130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206067
67	NC_017226	CT	3	6	3175	3180	0 %	50 %	0 %	50 %	384206067
68	NC_017226	CAAT	2	8	3191	3198	50 %	25 %	0 %	25 %	384206067
69	NC_017226	AGAT	2	8	3234	3241	50 %	25 %	25 %	0 %	384206067
70	NC_017226	ATT	2	6	3254	3259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206067
71	NC_017226	TTAAT	2	10	3263	3272	40 %	60 %	0 %	0 %	384206067
72	NC_017226	ATA	2	6	3310	3315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206067
73	NC_017226	TGG	2	6	3327	3332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206067
74	NC_017226	AATG	2	8	3356	3363	50 %	25 %	25 %	0 %	384206068
75	NC_017226	T	6	6	3493	3498	0 %	100 %	0 %	0 %	384206068
76	NC_017226	G	6	6	3505	3510	0 %	0 %	100 %	0 %	384206068
77	NC_017226	ATC	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206068
78	NC_017226	TGG	2	6	3639	3644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206068
79	NC_017226	CCA	2	6	3698	3703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206068
80	NC_017226	AAT	2	6	3718	3723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206068
81	NC_017226	TAG	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206068
82	NC_017226	GCA	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206068
83	NC_017226	GCAAA	2	10	3859	3868	60 %	0 %	20 %	20 %	384206068
84	NC_017226	ATG	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206068
85	NC_017226	GTAA	2	8	3919	3926	50 %	25 %	25 %	0 %	384206068
86	NC_017226	TAA	2	6	3931	3936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206068
87	NC_017226	ATT	2	6	3960	3965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206069
88	NC_017226	TGA	2	6	3966	3971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206069
89	NC_017226	ATT	2	6	3974	3979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206069
90	NC_017226	TAT	2	6	4023	4028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206069
91	NC_017226	AGA	2	6	4056	4061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206069
92	NC_017226	AGT	2	6	4179	4184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206069
93	NC_017226	AT	3	6	4263	4268	50 %	50 %	0 %	0 %	384206069
94	NC_017226	TAA	3	9	4278	4286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206069
95	NC_017226	ATT	2	6	4330	4335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206069
96	NC_017226	TTA	2	6	4340	4345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206069
97	NC_017226	A	6	6	4389	4394	100 %	0 %	0 %	0 %	384206069
98	NC_017226	TAC	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206069
99	NC_017226	ACT	2	6	4425	4430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206069
100	NC_017226	AGA	2	6	4452	4457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206069
101	NC_017226	GTG	2	6	4466	4471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206069
102	NC_017226	A	6	6	4499	4504	100 %	0 %	0 %	0 %	384206069
103	NC_017226	ATG	2	6	4555	4560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206069
104	NC_017226	CAG	2	6	4607	4612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206069
105	NC_017226	GCA	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206069
106	NC_017226	TAA	2	6	4677	4682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206069
107	NC_017226	TCAT	2	8	4833	4840	25 %	50 %	0 %	25 %	384206069
108	NC_017226	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206069
109	NC_017226	TAAAT	2	10	4925	4934	60 %	40 %	0 %	0 %	384206070
110	NC_017226	GAA	3	9	4972	4980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206070
111	NC_017226	GTT	2	6	5185	5190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206070
112	NC_017226	GAATTT	2	12	5194	5205	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206070
113	NC_017226	A	6	6	5215	5220	100 %	0 %	0 %	0 %	384206070
114	NC_017226	ATT	2	6	5246	5251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206070
115	NC_017226	TAGTGG	2	12	5256	5267	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384206070
116	NC_017226	AG	3	6	5274	5279	50 %	0 %	50 %	0 %	384206070
117	NC_017226	AG	3	6	5350	5355	50 %	0 %	50 %	0 %	384206070
118	NC_017226	AGTG	2	8	5387	5394	25 %	25 %	50 %	0 %	384206070
119	NC_017226	TGT	2	6	5480	5485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206071
120	NC_017226	GAC	2	6	5499	5504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206071
121	NC_017226	ATT	2	6	5556	5561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206071
122	NC_017226	AT	3	6	5602	5607	50 %	50 %	0 %	0 %	384206071
123	NC_017226	GGAC	2	8	5761	5768	25 %	0 %	50 %	25 %	384206071
124	NC_017226	GGT	2	6	5796	5801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206072
125	NC_017226	GGC	2	6	5840	5845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206072
126	NC_017226	AT	3	6	5905	5910	50 %	50 %	0 %	0 %	384206072
127	NC_017226	CAA	2	6	5911	5916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206072
128	NC_017226	TA	3	6	5921	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	384206072
129	NC_017226	A	6	6	6062	6067	100 %	0 %	0 %	0 %	384206072
130	NC_017226	GTA	2	6	6069	6074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206072
131	NC_017226	TTG	2	6	6093	6098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206072
132	NC_017226	AACT	2	8	6120	6127	50 %	25 %	0 %	25 %	384206072
133	NC_017226	AAT	2	6	6217	6222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206073
134	NC_017226	ATC	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206073
135	NC_017226	ACT	2	6	6277	6282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206073
136	NC_017226	TAATA	2	10	6288	6297	60 %	40 %	0 %	0 %	384206073
137	NC_017226	AT	4	8	6394	6401	50 %	50 %	0 %	0 %	384206073
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