MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24213	NC_017223	TCA	2	6	1054950	1054955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203443
24214	NC_017223	GGT	2	6	1054966	1054971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203443
24215	NC_017223	ATG	2	6	1054988	1054993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203443
24216	NC_017223	TGATGC	2	12	1055019	1055030	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384203443
24217	NC_017223	GTC	2	6	1055035	1055040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203443
24218	NC_017223	CGGC	2	8	1055060	1055067	0 %	0 %	50 %	50 %	384203443
24219	NC_017223	CG	3	6	1055094	1055099	0 %	0 %	50 %	50 %	384203443
24220	NC_017223	TGA	2	6	1055286	1055291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203443
24221	NC_017223	GCT	2	6	1055325	1055330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203443
24222	NC_017223	CTGG	2	8	1055389	1055396	0 %	25 %	50 %	25 %	384203443
24223	NC_017223	CGT	2	6	1055397	1055402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203443
24224	NC_017223	CGC	2	6	1055421	1055426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203443
24225	NC_017223	CAG	2	6	1055461	1055466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203443
24226	NC_017223	TCG	3	9	1055492	1055500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203443
24227	NC_017223	CTC	2	6	1055550	1055555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384203444
24228	NC_017223	GCC	2	6	1055619	1055624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203444
24229	NC_017223	GTG	2	6	1055655	1055660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203444
24230	NC_017223	GAA	2	6	1055721	1055726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384203444
24231	NC_017223	ACC	2	6	1055773	1055778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203444
24232	NC_017223	TGC	2	6	1055791	1055796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203444
24233	NC_017223	TCG	2	6	1055824	1055829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203444
24234	NC_017223	CAG	2	6	1055874	1055879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203444
24235	NC_017223	GATGCG	2	12	1055943	1055954	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384203444
24236	NC_017223	GC	3	6	1055961	1055966	0 %	0 %	50 %	50 %	384203444
24237	NC_017223	CGA	2	6	1055996	1056001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203444
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24244	NC_017223	CGA	2	6	1056219	1056224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203444
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24250	NC_017223	CG	3	6	1056320	1056325	0 %	0 %	50 %	50 %	384203444
24251	NC_017223	CGG	2	6	1056343	1056348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203444
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24328	NC_017223	CGA	2	6	1059183	1059188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203445
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24330	NC_017223	CTG	2	6	1059313	1059318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203445
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24333	NC_017223	CCA	2	6	1059380	1059385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203445
24334	NC_017223	CAT	2	6	1059393	1059398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203445
24335	NC_017223	CCTGG	2	10	1059450	1059459	0 %	20 %	40 %	40 %	384203445
24336	NC_017223	CGGC	2	8	1059461	1059468	0 %	0 %	50 %	50 %	384203445
24337	NC_017223	GC	3	6	1059478	1059483	0 %	0 %	50 %	50 %	384203445
24338	NC_017223	CTG	2	6	1059490	1059495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203445
24339	NC_017223	GGC	2	6	1059496	1059501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203445
24340	NC_017223	CCG	2	6	1059503	1059508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203445
24341	NC_017223	CAC	2	6	1059513	1059518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203445
24342	NC_017223	GCA	2	6	1059537	1059542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203445
24343	NC_017223	CTG	2	6	1059562	1059567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203445
24344	NC_017223	TCA	2	6	1059626	1059631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203445
24345	NC_017223	TGG	2	6	1059653	1059658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203445
24346	NC_017223	CTA	3	9	1059675	1059683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203445
24347	NC_017223	TGA	2	6	1059692	1059697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203445
24348	NC_017223	CCG	2	6	1059725	1059730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203445
24349	NC_017223	CGA	2	6	1059732	1059737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203445
24350	NC_017223	CAT	2	6	1059744	1059749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203445
24351	NC_017223	GGCAAG	2	12	1059778	1059789	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384203445
24352	NC_017223	GGC	2	6	1059837	1059842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203445
24353	NC_017223	CTG	2	6	1059850	1059855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203445
24354	NC_017223	GGCGT	2	10	1059868	1059877	0 %	20 %	60 %	20 %	384203445
24355	NC_017223	CTG	2	6	1059946	1059951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203445
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24373	NC_017223	CCG	3	9	1060682	1060690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203446
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24449	NC_017223	CAAGAC	2	12	1063050	1063061	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384203447
24450	NC_017223	CGAGGG	2	12	1063104	1063115	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384203447
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24454	NC_017223	GGC	2	6	1063338	1063343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203447
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24457	NC_017223	TGGG	2	8	1063423	1063430	0 %	25 %	75 %	0 %	384203447
24458	NC_017223	GAA	2	6	1063449	1063454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384203447
24459	NC_017223	GGC	2	6	1063491	1063496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203447
24460	NC_017223	CGA	2	6	1063524	1063529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203447
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24462	NC_017223	TCG	2	6	1063571	1063576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203447
24463	NC_017223	GCG	2	6	1063577	1063582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203447
24464	NC_017223	TCG	2	6	1063586	1063591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203447
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24485	NC_017223	CGG	2	6	1064507	1064512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203448
24486	NC_017223	CGG	2	6	1064519	1064524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203448
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24490	NC_017223	TTC	2	6	1064799	1064804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384203448
24491	NC_017223	CTG	2	6	1064823	1064828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203448
24492	NC_017223	GTT	3	9	1064901	1064909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384203448
24493	NC_017223	GC	3	6	1064921	1064926	0 %	0 %	50 %	50 %	384203448
24494	NC_017223	GTC	2	6	1064932	1064937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203448
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