MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017223	GCC	2	6	648572	648577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203119
15003	NC_017223	CCG	3	9	648582	648590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203119
15004	NC_017223	TCG	2	6	648613	648618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203119
15005	NC_017223	GGGC	2	8	648658	648665	0 %	0 %	75 %	25 %	384203120
15006	NC_017223	GA	3	6	648691	648696	50 %	0 %	50 %	0 %	384203120
15007	NC_017223	CGC	2	6	648707	648712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203120
15008	NC_017223	GCT	2	6	648719	648724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203120
15009	NC_017223	CG	3	6	648725	648730	0 %	0 %	50 %	50 %	384203120
15010	NC_017223	CAG	2	6	648813	648818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203120
15011	NC_017223	CAC	2	6	648819	648824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203120
15012	NC_017223	GC	3	6	648836	648841	0 %	0 %	50 %	50 %	384203120
15013	NC_017223	TGA	2	6	648851	648856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203120
15014	NC_017223	GAC	2	6	648873	648878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203120
15015	NC_017223	CAG	2	6	648909	648914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203120
15016	NC_017223	CTG	3	9	648960	648968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203120
15017	NC_017223	GCC	2	6	648969	648974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203120
15018	NC_017223	GCGCC	2	10	648994	649003	0 %	0 %	40 %	60 %	384203120
15019	NC_017223	GCC	2	6	649045	649050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203120
15020	NC_017223	TGG	2	6	649114	649119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203120
15021	NC_017223	GGCG	2	8	649157	649164	0 %	0 %	75 %	25 %	384203120
15022	NC_017223	CGG	2	6	649173	649178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203120
15023	NC_017223	GCC	2	6	649215	649220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203120
15024	NC_017223	GC	3	6	649246	649251	0 %	0 %	50 %	50 %	384203120
15025	NC_017223	CGA	2	6	649257	649262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203120
15026	NC_017223	CGC	2	6	649325	649330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203120
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15028	NC_017223	GC	3	6	649430	649435	0 %	0 %	50 %	50 %	384203121
15029	NC_017223	TCG	2	6	649463	649468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203121
15030	NC_017223	ACG	2	6	649484	649489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203121
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15032	NC_017223	CGG	2	6	649608	649613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203121
15033	NC_017223	CAG	4	12	649624	649635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203121
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15035	NC_017223	GCTC	2	8	649695	649702	0 %	25 %	25 %	50 %	384203121
15036	NC_017223	GCC	2	6	649733	649738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203121
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15039	NC_017223	GC	3	6	649815	649820	0 %	0 %	50 %	50 %	384203121
15040	NC_017223	GCG	2	6	649831	649836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203121
15041	NC_017223	GAC	2	6	650002	650007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203121
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15043	NC_017223	TGC	2	6	650058	650063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203121
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15045	NC_017223	GC	4	8	650094	650101	0 %	0 %	50 %	50 %	384203121
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15052	NC_017223	GCA	2	6	650280	650285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203121
15053	NC_017223	AGGT	2	8	650360	650367	25 %	25 %	50 %	0 %	384203121
15054	NC_017223	CGA	2	6	650415	650420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203121
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15056	NC_017223	GCC	2	6	650500	650505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203121
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15069	NC_017223	CAT	2	6	650836	650841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203121
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15071	NC_017223	CAG	2	6	650881	650886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203121
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15101	NC_017223	GTCG	2	8	652317	652324	0 %	25 %	50 %	25 %	384203123
15102	NC_017223	CGGT	2	8	652432	652439	0 %	25 %	50 %	25 %	384203123
15103	NC_017223	GC	4	8	652481	652488	0 %	0 %	50 %	50 %	384203123
15104	NC_017223	GC	3	6	652571	652576	0 %	0 %	50 %	50 %	384203123
15105	NC_017223	CACGTT	2	12	652596	652607	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384203123
15106	NC_017223	GC	3	6	652611	652616	0 %	0 %	50 %	50 %	384203123
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15109	NC_017223	GC	3	6	652692	652697	0 %	0 %	50 %	50 %	384203123
15110	NC_017223	GC	3	6	652718	652723	0 %	0 %	50 %	50 %	384203123
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15118	NC_017223	GCCG	2	8	653040	653047	0 %	0 %	50 %	50 %	384203123
15119	NC_017223	GAT	2	6	653052	653057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203123
15120	NC_017223	GAT	2	6	653061	653066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203123
15121	NC_017223	TTG	2	6	653071	653076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384203123
15122	NC_017223	GTC	2	6	653124	653129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203123
15123	NC_017223	AGC	2	6	653131	653136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203123
15124	NC_017223	CGATCT	2	12	653141	653152	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384203123
15125	NC_017223	GCC	2	6	653166	653171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203123
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15127	NC_017223	CGG	2	6	653279	653284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203123
15128	NC_017223	GCG	2	6	653290	653295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203123
15129	NC_017223	CGG	3	9	653309	653317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203123
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15131	NC_017223	GCA	2	6	654870	654875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203124
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15134	NC_017223	GGC	2	6	654963	654968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203124
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15136	NC_017223	GTC	2	6	655048	655053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203124
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15140	NC_017223	CGC	2	6	655209	655214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203124
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15144	NC_017223	TCT	2	6	655392	655397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384203124
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15147	NC_017223	TCT	2	6	655518	655523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384203124
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15149	NC_017223	TCGA	2	8	655640	655647	25 %	25 %	25 %	25 %	384203124
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15152	NC_017223	CAC	2	6	655756	655761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203124
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15179	NC_017223	CGATC	2	10	656606	656615	20 %	20 %	20 %	40 %	384203125
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15201	NC_017223	CGA	2	6	657559	657564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203125
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15211	NC_017223	CGG	2	6	658698	658703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203126
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15221	NC_017223	GATG	2	8	658950	658957	25 %	25 %	50 %	0 %	384203126
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15224	NC_017223	ACG	2	6	659054	659059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203126
15225	NC_017223	GC	4	8	659097	659104	0 %	0 %	50 %	50 %	384203126
15226	NC_017223	TGA	2	6	659163	659168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203126
15227	NC_017223	GCG	2	6	659251	659256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203127
15228	NC_017223	ATG	2	6	659257	659262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203127
15229	NC_017223	CCT	2	6	659267	659272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384203127
15230	NC_017223	TCG	2	6	659356	659361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203127
15231	NC_017223	GC	3	6	659379	659384	0 %	0 %	50 %	50 %	384203127
15232	NC_017223	CAG	2	6	659433	659438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203127
15233	NC_017223	GTGC	2	8	659442	659449	0 %	25 %	50 %	25 %	384203127
15234	NC_017223	GCC	2	6	659470	659475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203127
15235	NC_017223	TGC	2	6	659492	659497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203127
15236	NC_017223	CG	3	6	659528	659533	0 %	0 %	50 %	50 %	384203127
15237	NC_017223	CGG	2	6	659543	659548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203127
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15239	NC_017223	CGGC	2	8	659599	659606	0 %	0 %	50 %	50 %	384203127
15240	NC_017223	GC	4	8	659605	659612	0 %	0 %	50 %	50 %	384203127
15241	NC_017223	GC	3	6	659616	659621	0 %	0 %	50 %	50 %	384203127
15242	NC_017223	CGT	2	6	659645	659650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203127
15243	NC_017223	GGC	2	6	659667	659672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203127
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15359	NC_017223	CAT	2	6	667106	667111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203131
15360	NC_017223	CAT	2	6	667193	667198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203131
15361	NC_017223	TCA	2	6	667266	667271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203132
15362	NC_017223	GCG	2	6	667288	667293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203132
15363	NC_017223	GC	3	6	667346	667351	0 %	0 %	50 %	50 %	384203132
15364	NC_017223	GAC	3	9	667352	667360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203132
15365	NC_017223	ATC	2	6	667376	667381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203132
15366	NC_017223	CGG	2	6	667408	667413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203132
15367	NC_017223	GACCGC	2	12	667457	667468	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384203132
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15370	NC_017223	GGAC	2	8	667534	667541	25 %	0 %	50 %	25 %	384203132
15371	NC_017223	CGG	2	6	667599	667604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203132
15372	NC_017223	CTT	2	6	667657	667662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384203132
15373	NC_017223	TCG	2	6	667677	667682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203132
15374	NC_017223	GCA	2	6	667687	667692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203132
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15376	NC_017223	CGA	2	6	667732	667737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203132
15377	NC_017223	GC	5	10	667739	667748	0 %	0 %	50 %	50 %	384203132
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15380	NC_017223	GCGCTG	2	12	667796	667807	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384203132
15381	NC_017223	GCG	2	6	667808	667813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203132
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15384	NC_017223	AGC	2	6	667977	667982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203132
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15388	NC_017223	CGG	2	6	668268	668273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203133
15389	NC_017223	CAT	2	6	668286	668291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203133
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15478	NC_017223	TTC	2	6	671014	671019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384203137
15479	NC_017223	GAC	2	6	671020	671025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203137
15480	NC_017223	GAA	2	6	671098	671103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384203137
15481	NC_017223	TCG	2	6	671111	671116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203137
15482	NC_017223	CG	4	8	671118	671125	0 %	0 %	50 %	50 %	384203137
15483	NC_017223	GAG	2	6	671152	671157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384203137
15484	NC_017223	CGG	2	6	671190	671195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203137
15485	NC_017223	GTC	2	6	671215	671220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203137
15486	NC_017223	GCGCT	2	10	671257	671266	0 %	20 %	40 %	40 %	384203137
15487	NC_017223	GCT	2	6	671268	671273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203137
15488	NC_017223	TGA	2	6	671405	671410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203137
15489	NC_017223	CG	3	6	671426	671431	0 %	0 %	50 %	50 %	384203137
15490	NC_017223	CGG	3	9	671460	671468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203137
15491	NC_017223	GC	3	6	671526	671531	0 %	0 %	50 %	50 %	384203137
15492	NC_017223	CTG	2	6	671600	671605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203138
15493	NC_017223	CGG	2	6	671628	671633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203138
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15495	NC_017223	GGGC	2	8	671689	671696	0 %	0 %	75 %	25 %	384203138
15496	NC_017223	GC	3	6	671711	671716	0 %	0 %	50 %	50 %	384203138
15497	NC_017223	TGG	2	6	671718	671723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203138
15498	NC_017223	GTC	3	9	671756	671764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203138
15499	NC_017223	GCGG	2	8	671780	671787	0 %	0 %	75 %	25 %	384203138
15500	NC_017223	CAT	2	6	671788	671793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203138

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