MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_017223	TCG	2	6	589534	589539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203066
13503	NC_017223	GCC	2	6	589540	589545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203066
13504	NC_017223	CGG	2	6	589561	589566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203066
13505	NC_017223	CGGC	2	8	589574	589581	0 %	0 %	50 %	50 %	384203066
13506	NC_017223	CCA	2	6	589583	589588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203066
13507	NC_017223	GC	3	6	589653	589658	0 %	0 %	50 %	50 %	384203066
13508	NC_017223	GGC	2	6	589684	589689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203066
13509	NC_017223	GTC	2	6	589725	589730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203066
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13512	NC_017223	GGC	2	6	589778	589783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203066
13513	NC_017223	TGG	2	6	589796	589801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203066
13514	NC_017223	ACG	2	6	589828	589833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203066
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13516	NC_017223	GCA	2	6	589997	590002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203066
13517	NC_017223	AGC	2	6	590014	590019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203066
13518	NC_017223	CTG	2	6	590028	590033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203066
13519	NC_017223	CCCG	2	8	590037	590044	0 %	0 %	25 %	75 %	384203066
13520	NC_017223	CG	3	6	590081	590086	0 %	0 %	50 %	50 %	384203066
13521	NC_017223	GC	3	6	590097	590102	0 %	0 %	50 %	50 %	384203066
13522	NC_017223	GCAG	2	8	590147	590154	25 %	0 %	50 %	25 %	384203066
13523	NC_017223	GAGC	2	8	590274	590281	25 %	0 %	50 %	25 %	384203066
13524	NC_017223	GGCG	2	8	590292	590299	0 %	0 %	75 %	25 %	384203066
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13528	NC_017223	GCC	2	6	591530	591535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203067
13529	NC_017223	CAGC	2	8	591559	591566	25 %	0 %	25 %	50 %	384203067
13530	NC_017223	CGCTG	2	10	591567	591576	0 %	20 %	40 %	40 %	384203067
13531	NC_017223	CGGC	2	8	591591	591598	0 %	0 %	50 %	50 %	384203067
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13536	NC_017223	GTC	2	6	591740	591745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203067
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13543	NC_017223	CGC	2	6	591960	591965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203067
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13551	NC_017223	GCCG	2	8	592243	592250	0 %	0 %	50 %	50 %	384203067
13552	NC_017223	GCG	2	6	592281	592286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203067
13553	NC_017223	CGCC	2	8	592308	592315	0 %	0 %	25 %	75 %	384203067
13554	NC_017223	GCT	2	6	592327	592332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203067
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13558	NC_017223	GTC	2	6	592415	592420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203067
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13856	NC_017223	CGCGC	2	10	602760	602769	0 %	0 %	40 %	60 %	384203078
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13858	NC_017223	TGA	2	6	602884	602889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203078
13859	NC_017223	GCCAC	2	10	602893	602902	20 %	0 %	20 %	60 %	384203078
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13981	NC_017223	TCG	2	6	607019	607024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203082
13982	NC_017223	CGC	2	6	607052	607057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203082
13983	NC_017223	GC	3	6	607070	607075	0 %	0 %	50 %	50 %	384203082
13984	NC_017223	GC	3	6	607083	607088	0 %	0 %	50 %	50 %	384203082
13985	NC_017223	CG	4	8	607099	607106	0 %	0 %	50 %	50 %	384203082
13986	NC_017223	AGC	2	6	607121	607126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203082
13987	NC_017223	GTC	2	6	607132	607137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203082
13988	NC_017223	TCG	2	6	607178	607183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203082
13989	NC_017223	GTC	2	6	607204	607209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203082
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13991	NC_017223	GCGTG	2	10	607227	607236	0 %	20 %	60 %	20 %	384203082
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13993	NC_017223	GGC	2	6	607303	607308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203082
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13999	NC_017223	CCAG	2	8	607509	607516	25 %	0 %	25 %	50 %	384203082
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