MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017223	CTGGA	2	10	567580	567589	20 %	20 %	40 %	20 %	384203044
13002	NC_017223	TGA	2	6	567608	567613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203044
13003	NC_017223	CGG	2	6	567674	567679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203044
13004	NC_017223	CG	3	6	567713	567718	0 %	0 %	50 %	50 %	384203044
13005	NC_017223	CAC	2	6	567744	567749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203044
13006	NC_017223	GGC	2	6	567783	567788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203044
13007	NC_017223	CCA	2	6	567803	567808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203044
13008	NC_017223	CGTGGC	2	12	567834	567845	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384203044
13009	NC_017223	CGC	2	6	567900	567905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203044
13010	NC_017223	TTG	2	6	570006	570011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384203045
13011	NC_017223	CGA	2	6	570037	570042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203045
13012	NC_017223	CCG	2	6	570114	570119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203045
13013	NC_017223	GGC	2	6	570215	570220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203045
13014	NC_017223	CG	3	6	570230	570235	0 %	0 %	50 %	50 %	384203045
13015	NC_017223	TCG	2	6	570246	570251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203045
13016	NC_017223	CGT	2	6	570283	570288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203045
13017	NC_017223	CGGC	2	8	570366	570373	0 %	0 %	50 %	50 %	384203045
13018	NC_017223	CAGG	2	8	570407	570414	25 %	0 %	50 %	25 %	384203045
13019	NC_017223	CG	3	6	570512	570517	0 %	0 %	50 %	50 %	384203045
13020	NC_017223	GC	3	6	570524	570529	0 %	0 %	50 %	50 %	384203045
13021	NC_017223	CGC	2	6	570565	570570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203045
13022	NC_017223	CAG	2	6	570572	570577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203045
13023	NC_017223	CGT	2	6	570616	570621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203045
13024	NC_017223	CGG	2	6	570674	570679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203045
13025	NC_017223	GC	3	6	570694	570699	0 %	0 %	50 %	50 %	384203045
13026	NC_017223	GCCGC	2	10	570731	570740	0 %	0 %	40 %	60 %	384203045
13027	NC_017223	GC	3	6	570823	570828	0 %	0 %	50 %	50 %	384203045
13028	NC_017223	GC	3	6	570921	570926	0 %	0 %	50 %	50 %	384203046
13029	NC_017223	CG	3	6	570945	570950	0 %	0 %	50 %	50 %	384203046
13030	NC_017223	GCG	2	6	570963	570968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203046
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13032	NC_017223	CG	3	6	571011	571016	0 %	0 %	50 %	50 %	384203046
13033	NC_017223	GC	4	8	571037	571044	0 %	0 %	50 %	50 %	384203046
13034	NC_017223	GGCCGC	2	12	571083	571094	0 %	0 %	50 %	50 %	384203046
13035	NC_017223	CCGGG	2	10	571107	571116	0 %	0 %	60 %	40 %	384203046
13036	NC_017223	GC	4	8	571119	571126	0 %	0 %	50 %	50 %	384203046
13037	NC_017223	CG	3	6	571155	571160	0 %	0 %	50 %	50 %	384203046
13038	NC_017223	GCA	2	6	571185	571190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203046
13039	NC_017223	GCGCG	2	10	571197	571206	0 %	0 %	60 %	40 %	384203046
13040	NC_017223	GCC	2	6	571231	571236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203046
13041	NC_017223	TGC	2	6	571242	571247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203046
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13043	NC_017223	TCG	2	6	571415	571420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203046
13044	NC_017223	CGG	3	9	571477	571485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203046
13045	NC_017223	GCG	2	6	571539	571544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203046
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13049	NC_017223	GC	3	6	571621	571626	0 %	0 %	50 %	50 %	384203046
13050	NC_017223	CGA	2	6	571647	571652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203046
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13053	NC_017223	CGGC	2	8	571707	571714	0 %	0 %	50 %	50 %	384203046
13054	NC_017223	CGC	2	6	571716	571721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203046
13055	NC_017223	GC	3	6	571720	571725	0 %	0 %	50 %	50 %	384203046
13056	NC_017223	GCA	2	6	571791	571796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203046
13057	NC_017223	GC	3	6	571803	571808	0 %	0 %	50 %	50 %	384203046
13058	NC_017223	GC	3	6	571816	571821	0 %	0 %	50 %	50 %	384203046
13059	NC_017223	GTCAGC	2	12	571871	571882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384203046
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13062	NC_017223	CCG	2	6	571980	571985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203046
13063	NC_017223	CG	3	6	572010	572015	0 %	0 %	50 %	50 %	384203046
13064	NC_017223	CAC	2	6	572020	572025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203046
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13069	NC_017223	CAGC	2	8	572563	572570	25 %	0 %	25 %	50 %	384203047
13070	NC_017223	GCCG	2	8	572624	572631	0 %	0 %	50 %	50 %	384203047
13071	NC_017223	GGT	2	6	572636	572641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203047
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13107	NC_017223	TGGA	2	8	574611	574618	25 %	25 %	50 %	0 %	384203049
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13122	NC_017223	T	8	8	574969	574976	0 %	100 %	0 %	0 %	384203049
13123	NC_017223	CGGC	2	8	575156	575163	0 %	0 %	50 %	50 %	384203050
13124	NC_017223	GC	3	6	575162	575167	0 %	0 %	50 %	50 %	384203050
13125	NC_017223	CGG	2	6	575255	575260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203050
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13233	NC_017223	GGCT	2	8	580156	580163	0 %	25 %	50 %	25 %	384203055
13234	NC_017223	GTG	2	6	580201	580206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203055
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13236	NC_017223	GCGCC	2	10	580266	580275	0 %	0 %	40 %	60 %	384203055
13237	NC_017223	CGG	2	6	580284	580289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203055
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13239	NC_017223	CCCTG	2	10	580345	580354	0 %	20 %	20 %	60 %	384203056
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13241	NC_017223	GCA	2	6	580438	580443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203056
13242	NC_017223	CG	3	6	580444	580449	0 %	0 %	50 %	50 %	384203056
13243	NC_017223	CAT	2	6	580493	580498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203056
13244	NC_017223	GATC	2	8	580526	580533	25 %	25 %	25 %	25 %	384203056
13245	NC_017223	CGG	2	6	580534	580539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203056
13246	NC_017223	GCCG	2	8	580559	580566	0 %	0 %	50 %	50 %	384203056
13247	NC_017223	GGC	2	6	580583	580588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203056
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13249	NC_017223	GC	3	6	580660	580665	0 %	0 %	50 %	50 %	384203056
13250	NC_017223	CGA	2	6	580670	580675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203056
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13253	NC_017223	CGA	2	6	580772	580777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203056
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13271	NC_017223	GCT	2	6	581329	581334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203057
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13273	NC_017223	GCC	2	6	581359	581364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203057
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13345	NC_017223	CGC	2	6	583898	583903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203060
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13347	NC_017223	AGC	2	6	583955	583960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203060
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13349	NC_017223	GCA	2	6	584037	584042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203060
13350	NC_017223	GGTC	2	8	584070	584077	0 %	25 %	50 %	25 %	384203060
13351	NC_017223	GCG	2	6	584115	584120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203060
13352	NC_017223	GC	3	6	584123	584128	0 %	0 %	50 %	50 %	384203060
13353	NC_017223	GGC	3	9	584143	584151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203060
13354	NC_017223	GAC	2	6	584191	584196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203060
13355	NC_017223	TTG	2	6	584231	584236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384203060
13356	NC_017223	GCGCG	2	10	584319	584328	0 %	0 %	60 %	40 %	384203060
13357	NC_017223	CGC	3	9	584329	584337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203060
13358	NC_017223	C	6	6	584337	584342	0 %	0 %	0 %	100 %	384203060
13359	NC_017223	GC	3	6	584349	584354	0 %	0 %	50 %	50 %	384203060
13360	NC_017223	GGCA	2	8	584386	584393	25 %	0 %	50 %	25 %	384203060
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13362	NC_017223	CGG	2	6	584429	584434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203060
13363	NC_017223	CGT	2	6	584458	584463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203060
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13474	NC_017223	CAGA	2	8	588550	588557	50 %	0 %	25 %	25 %	384203065
13475	NC_017223	TGG	2	6	588558	588563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203065
13476	NC_017223	CGT	2	6	588624	588629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203065
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13478	NC_017223	TGC	2	6	588674	588679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203065
13479	NC_017223	CGT	2	6	588685	588690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203065
13480	NC_017223	GCT	2	6	588738	588743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203065
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13482	NC_017223	ACGGC	2	10	588800	588809	20 %	0 %	40 %	40 %	384203065
13483	NC_017223	CTTG	2	8	588840	588847	0 %	50 %	25 %	25 %	384203065
13484	NC_017223	T	6	6	588904	588909	0 %	100 %	0 %	0 %	384203065
13485	NC_017223	CAC	2	6	588910	588915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203065
13486	NC_017223	GC	3	6	588933	588938	0 %	0 %	50 %	50 %	384203065
13487	NC_017223	CCA	2	6	588942	588947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203065
13488	NC_017223	CAG	2	6	588955	588960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203065
13489	NC_017223	CGCGGC	2	12	588961	588972	0 %	0 %	50 %	50 %	384203065
13490	NC_017223	GCC	2	6	589111	589116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203066
13491	NC_017223	GC	3	6	589157	589162	0 %	0 %	50 %	50 %	384203066
13492	NC_017223	TGG	2	6	589205	589210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203066
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13494	NC_017223	GCGTC	2	10	589316	589325	0 %	20 %	40 %	40 %	384203066
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13496	NC_017223	AGA	2	6	589349	589354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384203066
13497	NC_017223	C	6	6	589360	589365	0 %	0 %	0 %	100 %	384203066
13498	NC_017223	GC	4	8	589431	589438	0 %	0 %	50 %	50 %	384203066
13499	NC_017223	GGC	2	6	589443	589448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203066
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