MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_017223	TCA	2	6	545286	545291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203025
12503	NC_017223	GC	3	6	545329	545334	0 %	0 %	50 %	50 %	384203025
12504	NC_017223	TTGC	2	8	545390	545397	0 %	50 %	25 %	25 %	384203025
12505	NC_017223	CGCT	2	8	545453	545460	0 %	25 %	25 %	50 %	384203025
12506	NC_017223	GAC	2	6	545497	545502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203025
12507	NC_017223	TTG	2	6	545504	545509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384203025
12508	NC_017223	AGCG	2	8	545545	545552	25 %	0 %	50 %	25 %	384203025
12509	NC_017223	GGC	2	6	546677	546682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203026
12510	NC_017223	GCA	2	6	546778	546783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203026
12511	NC_017223	GC	3	6	546801	546806	0 %	0 %	50 %	50 %	384203026
12512	NC_017223	GGC	2	6	546863	546868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203026
12513	NC_017223	TCAA	2	8	546897	546904	50 %	25 %	0 %	25 %	384203026
12514	NC_017223	TTTC	2	8	546916	546923	0 %	75 %	0 %	25 %	384203026
12515	NC_017223	CGT	2	6	547088	547093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203027
12516	NC_017223	AGGT	2	8	547143	547150	25 %	25 %	50 %	0 %	384203027
12517	NC_017223	CAT	2	6	547181	547186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203027
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12519	NC_017223	AT	3	6	547293	547298	50 %	50 %	0 %	0 %	384203027
12520	NC_017223	CAG	2	6	547340	547345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203027
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12522	NC_017223	GCA	2	6	547471	547476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203027
12523	NC_017223	GTC	3	9	547518	547526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203027
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12527	NC_017223	GCA	2	6	547666	547671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203027
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12541	NC_017223	GCTG	2	8	548383	548390	0 %	25 %	50 %	25 %	384203028
12542	NC_017223	GC	3	6	548413	548418	0 %	0 %	50 %	50 %	384203028
12543	NC_017223	GCG	2	6	548434	548439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203028
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12545	NC_017223	CTTCCA	2	12	548812	548823	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384203029
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12549	NC_017223	CGCC	2	8	548881	548888	0 %	0 %	25 %	75 %	384203029
12550	NC_017223	GGCC	2	8	548912	548919	0 %	0 %	50 %	50 %	384203029
12551	NC_017223	GCCG	2	8	548975	548982	0 %	0 %	50 %	50 %	384203029
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12622	NC_017223	CAGCGC	2	12	552576	552587	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384203033
12623	NC_017223	CGG	2	6	552641	552646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203033
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12983	NC_017223	TGC	2	6	566862	566867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203043
12984	NC_017223	GCA	2	6	566893	566898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203043
12985	NC_017223	CGGC	2	8	566949	566956	0 %	0 %	50 %	50 %	384203043
12986	NC_017223	GAC	2	6	566990	566995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203043
12987	NC_017223	GCG	2	6	567010	567015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203043
12988	NC_017223	CGC	2	6	567079	567084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203043
12989	NC_017223	GCG	2	6	567105	567110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203043
12990	NC_017223	GC	3	6	567139	567144	0 %	0 %	50 %	50 %	384203043
12991	NC_017223	GGTC	2	8	567232	567239	0 %	25 %	50 %	25 %	384203043
12992	NC_017223	GC	4	8	567242	567249	0 %	0 %	50 %	50 %	384203043
12993	NC_017223	TGC	2	6	567261	567266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203043
12994	NC_017223	TCG	2	6	567318	567323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203043
12995	NC_017223	CGC	2	6	567361	567366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203043
12996	NC_017223	GC	3	6	567365	567370	0 %	0 %	50 %	50 %	384203043
12997	NC_017223	AAGCA	2	10	567407	567416	60 %	0 %	20 %	20 %	384203043
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12999	NC_017223	CGCCGT	2	12	567499	567510	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384203043
13000	NC_017223	ATCA	2	8	567570	567577	50 %	25 %	0 %	25 %	384203044

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