MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12004	NC_017223	CTG	2	6	523959	523964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203002
12005	NC_017223	GCC	2	6	523975	523980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203002
12006	NC_017223	TGG	2	6	523990	523995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203002
12007	NC_017223	GCCGG	2	10	524003	524012	0 %	0 %	60 %	40 %	384203002
12008	NC_017223	TGC	2	6	524047	524052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203002
12009	NC_017223	CGA	2	6	524063	524068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203002
12010	NC_017223	CTG	2	6	524085	524090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203002
12011	NC_017223	CGCGC	2	10	524094	524103	0 %	0 %	40 %	60 %	384203002
12012	NC_017223	CGC	2	6	524116	524121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203002
12013	NC_017223	GACC	2	8	524129	524136	25 %	0 %	25 %	50 %	384203002
12014	NC_017223	GCT	2	6	524144	524149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203002
12015	NC_017223	TGC	2	6	524203	524208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203002
12016	NC_017223	CTG	2	6	524232	524237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203002
12017	NC_017223	CGA	2	6	524240	524245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203002
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12119	NC_017223	TTG	2	6	528021	528026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384203004
12120	NC_017223	CGA	2	6	528079	528084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203004
12121	NC_017223	GGT	2	6	528244	528249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203005
12122	NC_017223	GGCC	2	8	528349	528356	0 %	0 %	50 %	50 %	384203005
12123	NC_017223	TCT	2	6	528408	528413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384203005
12124	NC_017223	CCT	2	6	528468	528473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384203005
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12126	NC_017223	TGC	2	6	528561	528566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203005
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12223	NC_017223	TGG	2	6	532877	532882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203010
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12226	NC_017223	GTA	2	6	533143	533148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203010
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12228	NC_017223	ACGAAG	2	12	533243	533254	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384203010
12229	NC_017223	CTT	2	6	533329	533334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384203010
12230	NC_017223	GCA	2	6	533346	533351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203010
12231	NC_017223	CAC	2	6	533380	533385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203010
12232	NC_017223	CGGC	2	8	533391	533398	0 %	0 %	50 %	50 %	384203010
12233	NC_017223	GCTG	2	8	533452	533459	0 %	25 %	50 %	25 %	384203010
12234	NC_017223	GC	3	6	533482	533487	0 %	0 %	50 %	50 %	384203010
12235	NC_017223	GCG	2	6	533503	533508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203010
12236	NC_017223	CA	3	6	533671	533676	50 %	0 %	0 %	50 %	384203010
12237	NC_017223	CTA	2	6	534232	534237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203011
12238	NC_017223	GTC	2	6	534248	534253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203011
12239	NC_017223	GGC	2	6	534260	534265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203011
12240	NC_017223	CGC	2	6	534314	534319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203011
12241	NC_017223	GGA	2	6	534331	534336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384203011
12242	NC_017223	CTG	2	6	534353	534358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203011
12243	NC_017223	ACG	2	6	534365	534370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203011
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12245	NC_017223	CGGC	2	8	534390	534397	0 %	0 %	50 %	50 %	384203011
12246	NC_017223	ACT	2	6	534411	534416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203011
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12254	NC_017223	TGG	2	6	534711	534716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203011
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12328	NC_017223	GCCA	2	8	537488	537495	25 %	0 %	25 %	50 %	384203013
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12337	NC_017223	CAGCCC	2	12	537945	537956	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384203014
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12340	NC_017223	GC	3	6	538018	538023	0 %	0 %	50 %	50 %	384203014
12341	NC_017223	TCG	2	6	538048	538053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203014
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12345	NC_017223	CG	4	8	538229	538236	0 %	0 %	50 %	50 %	384203014
12346	NC_017223	CCCAG	2	10	538241	538250	20 %	0 %	20 %	60 %	384203014
12347	NC_017223	CTG	2	6	538254	538259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203014
12348	NC_017223	GCA	2	6	538286	538291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203014
12349	NC_017223	CG	3	6	538298	538303	0 %	0 %	50 %	50 %	384203014
12350	NC_017223	CGT	2	6	538307	538312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203014
12351	NC_017223	CTGG	2	8	538347	538354	0 %	25 %	50 %	25 %	384203014
12352	NC_017223	CAG	2	6	538368	538373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203014
12353	NC_017223	CGA	2	6	538409	538414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203014
12354	NC_017223	GC	3	6	538417	538422	0 %	0 %	50 %	50 %	384203014
12355	NC_017223	GC	3	6	538435	538440	0 %	0 %	50 %	50 %	384203014
12356	NC_017223	TCGCGC	2	12	538447	538458	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384203014
12357	NC_017223	ATG	2	6	538483	538488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203014
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12359	NC_017223	GCG	2	6	538628	538633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203014
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12479	NC_017223	ACC	2	6	543880	543885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203022
12480	NC_017223	GAT	2	6	543897	543902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203022
12481	NC_017223	CGTG	2	8	543935	543942	0 %	25 %	50 %	25 %	384203022
12482	NC_017223	CGG	2	6	543977	543982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203022
12483	NC_017223	CG	3	6	544079	544084	0 %	0 %	50 %	50 %	384203022
12484	NC_017223	GCA	2	6	544208	544213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203022
12485	NC_017223	CTTC	2	8	544232	544239	0 %	50 %	0 %	50 %	384203022
12486	NC_017223	TGA	2	6	544307	544312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203022
12487	NC_017223	GTT	2	6	544320	544325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384203022
12488	NC_017223	GCG	2	6	544435	544440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203023
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12490	NC_017223	CCAGGT	2	12	544460	544471	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384203023
12491	NC_017223	GC	3	6	544483	544488	0 %	0 %	50 %	50 %	384203023
12492	NC_017223	GGC	3	9	544502	544510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203023
12493	NC_017223	CAG	2	6	544571	544576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203024
12494	NC_017223	CCGA	2	8	544617	544624	25 %	0 %	25 %	50 %	384203024
12495	NC_017223	CG	3	6	544639	544644	0 %	0 %	50 %	50 %	384203024
12496	NC_017223	CAG	2	6	544658	544663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203024
12497	NC_017223	CGC	2	6	544670	544675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203024
12498	NC_017223	CCA	2	6	544765	544770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203024
12499	NC_017223	CGC	2	6	544800	544805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203024
12500	NC_017223	CTG	2	6	545131	545136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203025

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