MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 chromosome

Total Repeats: 46418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_017221	CGG	2	6	887276	887281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201298
17002	NC_017221	CGG	2	6	887298	887303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201298
17003	NC_017221	GAGG	2	8	887313	887320	25 %	0 %	75 %	0 %	384201298
17004	NC_017221	TCC	2	6	887341	887346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201298
17005	NC_017221	AGC	2	6	887384	887389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201298
17006	NC_017221	GAA	3	9	887681	887689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201299
17007	NC_017221	TGC	2	6	887728	887733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201299
17008	NC_017221	GCG	2	6	887743	887748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201299
17009	NC_017221	CAT	2	6	887792	887797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201299
17010	NC_017221	CGG	3	9	887855	887863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201299
17011	NC_017221	CTG	2	6	887877	887882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201299
17012	NC_017221	ATCAAG	2	12	887976	887987	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384201299
17013	NC_017221	CCG	2	6	888022	888027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201299
17014	NC_017221	CTC	2	6	888083	888088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201299
17015	NC_017221	CTT	2	6	888089	888094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201299
17016	NC_017221	CCA	2	6	888097	888102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201299
17017	NC_017221	AGC	2	6	888148	888153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201299
17018	NC_017221	GAC	2	6	888174	888179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201299
17019	NC_017221	ACC	2	6	888180	888185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201299
17020	NC_017221	CAA	2	6	888341	888346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201299
17021	NC_017221	CGA	2	6	888428	888433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201299
17022	NC_017221	CCG	2	6	888436	888441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201299
17023	NC_017221	GTCC	2	8	888482	888489	0 %	25 %	25 %	50 %	384201299
17024	NC_017221	GCC	2	6	888492	888497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201299
17025	NC_017221	AAG	2	6	888522	888527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201299
17026	NC_017221	TCC	2	6	888579	888584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201299
17027	NC_017221	ACG	2	6	888601	888606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201299
17028	NC_017221	CGT	2	6	888621	888626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201299
17029	NC_017221	CCG	2	6	888691	888696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201299
17030	NC_017221	CCAAGG	2	12	888775	888786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201299
17031	NC_017221	ACG	2	6	888820	888825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201299
17032	NC_017221	GTG	2	6	888856	888861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201299
17033	NC_017221	ACG	2	6	888874	888879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201299
17034	NC_017221	CGT	2	6	888881	888886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201299
17035	NC_017221	AAC	2	6	888900	888905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201299
17036	NC_017221	CCA	2	6	888922	888927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201299
17037	NC_017221	GCT	3	9	889056	889064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201299
17038	NC_017221	GCT	2	6	889128	889133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201299
17039	NC_017221	TGA	2	6	889148	889153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201299
17040	NC_017221	CAA	2	6	889157	889162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201299
17041	NC_017221	CAG	2	6	889170	889175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201299
17042	NC_017221	TCC	2	6	889186	889191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201299
17043	NC_017221	TAC	2	6	889218	889223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201299
17044	NC_017221	AAG	2	6	889311	889316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201299
17045	NC_017221	TCT	2	6	889631	889636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201300
17046	NC_017221	GAT	2	6	889652	889657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201300
17047	NC_017221	GAA	2	6	889829	889834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201300
17048	NC_017221	CGA	2	6	889883	889888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201300
17049	NC_017221	GTC	2	6	889959	889964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201300
17050	NC_017221	AAG	2	6	889986	889991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201300
17051	NC_017221	TC	3	6	890023	890028	0 %	50 %	0 %	50 %	384201300
17052	NC_017221	TGC	2	6	890029	890034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201300
17053	NC_017221	TCGGT	2	10	890164	890173	0 %	40 %	40 %	20 %	384201300
17054	NC_017221	ATC	2	6	890187	890192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201300
17055	NC_017221	TCC	2	6	890214	890219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201300
17056	NC_017221	GGTCA	2	10	890271	890280	20 %	20 %	40 %	20 %	384201300
17057	NC_017221	TGC	2	6	890281	890286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201300
17058	NC_017221	GTC	2	6	890316	890321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201300
17059	NC_017221	GTG	2	6	890356	890361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201300
17060	NC_017221	TGG	2	6	890443	890448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201300
17061	NC_017221	CTC	2	6	890662	890667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201301
17062	NC_017221	CGA	2	6	890669	890674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201301
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17064	NC_017221	CCA	2	6	890719	890724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201301
17065	NC_017221	TCA	2	6	890770	890775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201301
17066	NC_017221	GCT	2	6	890783	890788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201301
17067	NC_017221	TCA	2	6	890797	890802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201301
17068	NC_017221	GTG	2	6	890805	890810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201301
17069	NC_017221	CCG	2	6	890884	890889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201301
17070	NC_017221	CTA	2	6	890985	890990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201301
17071	NC_017221	CTT	2	6	891029	891034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201301
17072	NC_017221	CGG	2	6	891035	891040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201301
17073	NC_017221	TCT	2	6	891076	891081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201301
17074	NC_017221	TGC	2	6	891094	891099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201301
17075	NC_017221	GTG	2	6	891111	891116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201301
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17078	NC_017221	CCA	2	6	891331	891336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201301
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17081	NC_017221	CCGAT	2	10	891454	891463	20 %	20 %	20 %	40 %	384201301
17082	NC_017221	CCG	2	6	891481	891486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201301
17083	NC_017221	TCA	2	6	891511	891516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201301
17084	NC_017221	TGAG	2	8	891567	891574	25 %	25 %	50 %	0 %	384201301
17085	NC_017221	TGAC	2	8	891593	891600	25 %	25 %	25 %	25 %	384201302
17086	NC_017221	AGAA	2	8	891629	891636	75 %	0 %	25 %	0 %	384201302
17087	NC_017221	GCT	2	6	891645	891650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201302
17088	NC_017221	CAC	2	6	891678	891683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201302
17089	NC_017221	GTGG	2	8	891744	891751	0 %	25 %	75 %	0 %	384201302
17090	NC_017221	TCCGGC	2	12	891766	891777	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384201302
17091	NC_017221	CTG	2	6	891808	891813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201302
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17097	NC_017221	CGA	2	6	892266	892271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201302
17098	NC_017221	AAG	2	6	892291	892296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201302
17099	NC_017221	CTG	2	6	892336	892341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201302
17100	NC_017221	CGC	2	6	892362	892367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201302
17101	NC_017221	GGT	2	6	892402	892407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201302
17102	NC_017221	GCC	2	6	892445	892450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201302
17103	NC_017221	CTG	2	6	892456	892461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201302
17104	NC_017221	CGA	2	6	892467	892472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201302
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17106	NC_017221	CCG	2	6	892550	892555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201302
17107	NC_017221	TCA	2	6	892562	892567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201302
17108	NC_017221	GCC	2	6	892585	892590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201302
17109	NC_017221	GTC	2	6	892630	892635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201302
17110	NC_017221	GTCC	2	8	892643	892650	0 %	25 %	25 %	50 %	384201302
17111	NC_017221	TGC	2	6	892658	892663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201302
17112	NC_017221	GCA	2	6	892671	892676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201302
17113	NC_017221	GCC	3	9	892699	892707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201302
17114	NC_017221	CAT	2	6	892728	892733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201302
17115	NC_017221	CAC	2	6	892777	892782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201302
17116	NC_017221	CAT	2	6	892818	892823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201302
17117	NC_017221	AAG	2	6	892864	892869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201302
17118	NC_017221	CGA	2	6	892887	892892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201302
17119	NC_017221	CAC	2	6	892917	892922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201302
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17236	NC_017221	CGA	2	6	898959	898964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201308
17237	NC_017221	CTG	2	6	898966	898971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201308
17238	NC_017221	GCCG	2	8	898995	899002	0 %	0 %	50 %	50 %	384201308
17239	NC_017221	ATC	2	6	899011	899016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201308
17240	NC_017221	CGA	2	6	899037	899042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201308
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17243	NC_017221	CGC	2	6	899166	899171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201308
17244	NC_017221	CTG	2	6	899281	899286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201308
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17256	NC_017221	GTGCG	2	10	899750	899759	0 %	20 %	60 %	20 %	384201308
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17265	NC_017221	TGC	2	6	900308	900313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201308
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17351	NC_017221	A	6	6	904941	904946	100 %	0 %	0 %	0 %	384201311
17352	NC_017221	GGC	2	6	904994	904999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201311
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17383	NC_017221	TCG	2	6	906572	906577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201312
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17474	NC_017221	TGC	2	6	911013	911018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201316
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