MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 chromosome

Total Repeats: 46418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017221	ACC	2	6	788511	788516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201212
15002	NC_017221	GCCTTC	2	12	788549	788560	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384201212
15003	NC_017221	CAT	2	6	788599	788604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201212
15004	NC_017221	TGCG	2	8	788609	788616	0 %	25 %	50 %	25 %	384201212
15005	NC_017221	CGTA	2	8	788620	788627	25 %	25 %	25 %	25 %	384201212
15006	NC_017221	ACC	2	6	788634	788639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201212
15007	NC_017221	CCG	2	6	788643	788648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201212
15008	NC_017221	GCC	2	6	788657	788662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201212
15009	NC_017221	GCC	2	6	788669	788674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201212
15010	NC_017221	AC	3	6	788680	788685	50 %	0 %	0 %	50 %	384201212
15011	NC_017221	CGA	2	6	788686	788691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201212
15012	NC_017221	CCG	2	6	788736	788741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201212
15013	NC_017221	CTG	2	6	788807	788812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201212
15014	NC_017221	CGG	2	6	788815	788820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201212
15015	NC_017221	CGA	2	6	788848	788853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201212
15016	NC_017221	GCG	2	6	788865	788870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201212
15017	NC_017221	CGGAC	2	10	788887	788896	20 %	0 %	40 %	40 %	384201212
15018	NC_017221	CGA	2	6	788923	788928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201212
15019	NC_017221	TTG	2	6	788955	788960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384201212
15020	NC_017221	AGC	2	6	788980	788985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201212
15021	NC_017221	ATG	2	6	789072	789077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201213
15022	NC_017221	CA	3	6	789115	789120	50 %	0 %	0 %	50 %	384201213
15023	NC_017221	ATG	2	6	789192	789197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201213
15024	NC_017221	CAC	2	6	789267	789272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201213
15025	NC_017221	CCG	2	6	789341	789346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201213
15026	NC_017221	CGA	2	6	789371	789376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201213
15027	NC_017221	GCC	2	6	789409	789414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201213
15028	NC_017221	GCG	2	6	789430	789435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201213
15029	NC_017221	CGG	2	6	789464	789469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201213
15030	NC_017221	CTGC	2	8	789530	789537	0 %	25 %	25 %	50 %	384201213
15031	NC_017221	GCCG	2	8	789552	789559	0 %	0 %	50 %	50 %	384201213
15032	NC_017221	CAC	2	6	789567	789572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201213
15033	NC_017221	TGCGC	2	10	789605	789614	0 %	20 %	40 %	40 %	384201213
15034	NC_017221	TGA	2	6	789672	789677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201213
15035	NC_017221	CGA	2	6	789679	789684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201214
15036	NC_017221	CGA	2	6	789715	789720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201214
15037	NC_017221	GCT	2	6	789821	789826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201214
15038	NC_017221	ATG	2	6	789852	789857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201214
15039	NC_017221	CGA	2	6	789901	789906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201214
15040	NC_017221	CTCG	2	8	789964	789971	0 %	25 %	25 %	50 %	384201214
15041	NC_017221	CCG	2	6	790044	790049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201214
15042	NC_017221	CCG	2	6	790086	790091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201214
15043	NC_017221	GAA	2	6	790129	790134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201214
15044	NC_017221	ACC	2	6	790175	790180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201214
15045	NC_017221	GGCC	2	8	790258	790265	0 %	0 %	50 %	50 %	384201214
15046	NC_017221	CGC	2	6	790275	790280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201214
15047	NC_017221	CGC	2	6	790299	790304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201214
15048	NC_017221	TCG	2	6	790308	790313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201214
15049	NC_017221	GTG	2	6	790370	790375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201214
15050	NC_017221	GGCG	2	8	790442	790449	0 %	0 %	75 %	25 %	384201214
15051	NC_017221	GTT	2	6	790515	790520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384201215
15052	NC_017221	GTGC	2	8	790554	790561	0 %	25 %	50 %	25 %	384201215
15053	NC_017221	ACC	2	6	790584	790589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201215
15054	NC_017221	CGC	2	6	790655	790660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201215
15055	NC_017221	GAA	2	6	790676	790681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201215
15056	NC_017221	GCC	2	6	790723	790728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201215
15057	NC_017221	CGG	2	6	790814	790819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201215
15058	NC_017221	CTG	2	6	790830	790835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201215
15059	NC_017221	GTG	2	6	790845	790850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201215
15060	NC_017221	ATGGG	2	10	790857	790866	20 %	20 %	60 %	0 %	384201215
15061	NC_017221	GCC	2	6	790878	790883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201215
15062	NC_017221	TGC	2	6	790894	790899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201215
15063	NC_017221	GAAC	2	8	790913	790920	50 %	0 %	25 %	25 %	384201215
15064	NC_017221	CGC	2	6	790943	790948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201215
15065	NC_017221	CGG	2	6	790963	790968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201215
15066	NC_017221	GCC	2	6	791049	791054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201215
15067	NC_017221	CTC	2	6	791121	791126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201215
15068	NC_017221	A	6	6	791149	791154	100 %	0 %	0 %	0 %	384201215
15069	NC_017221	CTG	2	6	791232	791237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201216
15070	NC_017221	CCG	2	6	791239	791244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201216
15071	NC_017221	TGCGCC	2	12	791269	791280	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384201216
15072	NC_017221	GCC	2	6	791325	791330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201216
15073	NC_017221	CAA	2	6	791399	791404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201216
15074	NC_017221	CGG	2	6	791465	791470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201216
15075	NC_017221	GCC	2	6	791514	791519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201216
15076	NC_017221	CCG	2	6	791536	791541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201216
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15078	NC_017221	CA	3	6	791622	791627	50 %	0 %	0 %	50 %	384201216
15079	NC_017221	GGC	2	6	791630	791635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201216
15080	NC_017221	GC	3	6	791634	791639	0 %	0 %	50 %	50 %	384201216
15081	NC_017221	CG	3	6	791647	791652	0 %	0 %	50 %	50 %	384201216
15082	NC_017221	GGC	2	6	791655	791660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201216
15083	NC_017221	GCT	2	6	791698	791703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201216
15084	NC_017221	ATG	2	6	791739	791744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201216
15085	NC_017221	GGT	2	6	791811	791816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201216
15086	NC_017221	GC	3	6	791837	791842	0 %	0 %	50 %	50 %	384201216
15087	NC_017221	GAG	2	6	792073	792078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384201217
15088	NC_017221	TCA	2	6	792101	792106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201217
15089	NC_017221	TCG	2	6	792155	792160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201217
15090	NC_017221	AATCG	2	10	792187	792196	40 %	20 %	20 %	20 %	384201217
15091	NC_017221	GGGCGT	2	12	792204	792215	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384201217
15092	NC_017221	CG	3	6	792324	792329	0 %	0 %	50 %	50 %	384201217
15093	NC_017221	CCAAC	2	10	792358	792367	40 %	0 %	0 %	60 %	384201217
15094	NC_017221	CGTG	2	8	792420	792427	0 %	25 %	50 %	25 %	384201217
15095	NC_017221	CGC	2	6	792441	792446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201217
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15099	NC_017221	CG	3	6	792512	792517	0 %	0 %	50 %	50 %	384201217
15100	NC_017221	CG	3	6	792535	792540	0 %	0 %	50 %	50 %	384201217
15101	NC_017221	GCCCAC	2	12	792553	792564	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384201217
15102	NC_017221	TCG	2	6	792617	792622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201217
15103	NC_017221	ATC	2	6	792691	792696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201217
15104	NC_017221	TGAT	2	8	792701	792708	25 %	50 %	25 %	0 %	384201217
15105	NC_017221	GGATT	2	10	792725	792734	20 %	40 %	40 %	0 %	384201217
15106	NC_017221	GCC	3	9	792773	792781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201217
15107	NC_017221	CGT	2	6	792783	792788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201217
15108	NC_017221	CAG	2	6	792796	792801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201217
15109	NC_017221	GCC	2	6	792812	792817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201217
15110	NC_017221	GCA	2	6	792822	792827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201217
15111	NC_017221	GGT	2	6	792847	792852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201217
15112	NC_017221	TCC	2	6	792872	792877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201217
15113	NC_017221	GT	3	6	792947	792952	0 %	50 %	50 %	0 %	384201217
15114	NC_017221	CGG	2	6	792966	792971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201217
15115	NC_017221	TTG	2	6	792995	793000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384201217
15116	NC_017221	GGC	2	6	793024	793029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201217
15117	NC_017221	TCG	2	6	793070	793075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201217
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15119	NC_017221	CTC	2	6	793297	793302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201217
15120	NC_017221	CCT	2	6	793329	793334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201217
15121	NC_017221	GCG	2	6	793362	793367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201217
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15124	NC_017221	GAT	2	6	793467	793472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201217
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15130	NC_017221	CACGT	2	10	793950	793959	20 %	20 %	20 %	40 %	384201218
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15151	NC_017221	ACA	2	6	794889	794894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201218
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15238	NC_017221	GC	3	6	799358	799363	0 %	0 %	50 %	50 %	384201221
15239	NC_017221	GAC	2	6	799369	799374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201221
15240	NC_017221	CGC	2	6	799396	799401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201221
15241	NC_017221	CGG	2	6	799466	799471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201221
15242	NC_017221	CTGGC	2	10	799674	799683	0 %	20 %	40 %	40 %	384201221
15243	NC_017221	CCA	2	6	799756	799761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201221
15244	NC_017221	TGG	2	6	799804	799809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201221
15245	NC_017221	CGG	3	9	799858	799866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201221
15246	NC_017221	CG	3	6	799872	799877	0 %	0 %	50 %	50 %	384201221
15247	NC_017221	CCGG	2	8	799903	799910	0 %	0 %	50 %	50 %	384201221
15248	NC_017221	GTC	2	6	799916	799921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201221
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15250	NC_017221	ATG	2	6	799937	799942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201221
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15252	NC_017221	CGG	2	6	800059	800064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201221
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15255	NC_017221	TCG	2	6	800157	800162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201221
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15257	NC_017221	ACC	2	6	800247	800252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201221
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15260	NC_017221	TCG	2	6	800445	800450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201221
15261	NC_017221	ATG	2	6	800451	800456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201221
15262	NC_017221	ATCGT	2	10	800457	800466	20 %	40 %	20 %	20 %	384201221
15263	NC_017221	TCG	2	6	800550	800555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201221
15264	NC_017221	CGTG	2	8	800627	800634	0 %	25 %	50 %	25 %	384201221
15265	NC_017221	CGTG	2	8	800674	800681	0 %	25 %	50 %	25 %	384201221
15266	NC_017221	TG	3	6	800715	800720	0 %	50 %	50 %	0 %	384201221
15267	NC_017221	TCA	2	6	800787	800792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201221
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15269	NC_017221	CCAG	2	8	800912	800919	25 %	0 %	25 %	50 %	384201222
15270	NC_017221	TTC	2	6	800944	800949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201222
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15272	NC_017221	AGCCA	2	10	800992	801001	40 %	0 %	20 %	40 %	384201222
15273	NC_017221	GGCA	2	8	801111	801118	25 %	0 %	50 %	25 %	384201222
15274	NC_017221	CG	3	6	801201	801206	0 %	0 %	50 %	50 %	384201222
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15277	NC_017221	ACGTT	2	10	801416	801425	20 %	40 %	20 %	20 %	384201222
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15284	NC_017221	ACA	2	6	801648	801653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201224
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15292	NC_017221	GTC	2	6	801904	801909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201224
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15305	NC_017221	TGC	2	6	802260	802265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201224
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15309	NC_017221	CGT	2	6	802379	802384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201224
15310	NC_017221	TGG	2	6	802557	802562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201224
15311	NC_017221	GCGCC	2	10	802597	802606	0 %	0 %	40 %	60 %	384201224
15312	NC_017221	GACG	2	8	802616	802623	25 %	0 %	50 %	25 %	384201224
15313	NC_017221	GCC	2	6	802659	802664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201224
15314	NC_017221	CCCA	2	8	802667	802674	25 %	0 %	0 %	75 %	384201224
15315	NC_017221	GGCCGA	2	12	802711	802722	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384201224
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15317	NC_017221	CAA	2	6	802840	802845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201224
15318	NC_017221	CGC	2	6	802882	802887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201224
15319	NC_017221	CTG	2	6	802964	802969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201224
15320	NC_017221	GCATGT	2	12	802978	802989	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384201224
15321	NC_017221	TC	3	6	803025	803030	0 %	50 %	0 %	50 %	384201224
15322	NC_017221	GAT	2	6	803072	803077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201224
15323	NC_017221	GGT	2	6	803122	803127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201224
15324	NC_017221	GGTGCC	2	12	803369	803380	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384201225
15325	NC_017221	CGC	2	6	803401	803406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201225
15326	NC_017221	TCGC	2	8	803421	803428	0 %	25 %	25 %	50 %	384201225
15327	NC_017221	GCA	2	6	803485	803490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201225
15328	NC_017221	CGA	2	6	803530	803535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201225
15329	NC_017221	GTC	2	6	803564	803569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201225
15330	NC_017221	CAT	2	6	803647	803652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201225
15331	NC_017221	TCA	2	6	803694	803699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201225
15332	NC_017221	CAG	2	6	803816	803821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201225
15333	NC_017221	CGTCAA	2	12	803827	803838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384201225
15334	NC_017221	CCA	2	6	803901	803906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201225
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15336	NC_017221	CCA	2	6	803983	803988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201225
15337	NC_017221	CGC	2	6	804001	804006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201225
15338	NC_017221	ATC	2	6	804014	804019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201225
15339	NC_017221	CCA	2	6	804033	804038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201225
15340	NC_017221	CAT	2	6	804067	804072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201225
15341	NC_017221	CTC	2	6	804170	804175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201225
15342	NC_017221	CAA	2	6	804190	804195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201225
15343	NC_017221	CGC	2	6	804229	804234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201225
15344	NC_017221	CCG	2	6	804267	804272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201225
15345	NC_017221	T	6	6	804427	804432	0 %	100 %	0 %	0 %	384201226
15346	NC_017221	GGA	2	6	804449	804454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384201226
15347	NC_017221	GGT	2	6	804488	804493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201226
15348	NC_017221	GGC	2	6	804554	804559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201226
15349	NC_017221	TCC	2	6	804717	804722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201226
15350	NC_017221	AGC	2	6	804723	804728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201226
15351	NC_017221	GCA	2	6	804745	804750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201226
15352	NC_017221	GC	3	6	804759	804764	0 %	0 %	50 %	50 %	384201226
15353	NC_017221	ATC	3	9	804768	804776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201226
15354	NC_017221	CCA	2	6	804847	804852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201226
15355	NC_017221	TCAT	2	8	804873	804880	25 %	50 %	0 %	25 %	384201226
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15357	NC_017221	GAT	2	6	804947	804952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201226
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15476	NC_017221	GT	3	6	811506	811511	0 %	50 %	50 %	0 %	384201233
15477	NC_017221	CAG	2	6	811532	811537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201233
15478	NC_017221	TGC	2	6	811572	811577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201233
15479	NC_017221	CGT	2	6	811603	811608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201233
15480	NC_017221	GAAG	2	8	811675	811682	50 %	0 %	50 %	0 %	384201233
15481	NC_017221	GGCTC	2	10	811884	811893	0 %	20 %	40 %	40 %	384201234
15482	NC_017221	CGAT	2	8	811962	811969	25 %	25 %	25 %	25 %	384201234
15483	NC_017221	GCC	2	6	811984	811989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201234
15484	NC_017221	CGA	2	6	812079	812084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201234
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15486	NC_017221	CGC	2	6	812117	812122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201234
15487	NC_017221	CAGC	2	8	812142	812149	25 %	0 %	25 %	50 %	384201234
15488	NC_017221	ATG	2	6	812180	812185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201234
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15492	NC_017221	CGG	2	6	812342	812347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201234
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15499	NC_017221	GGA	2	6	812699	812704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384201234
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