MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 chromosome

Total Repeats: 46418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017221	GCG	2	6	675940	675945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201122
13002	NC_017221	CCGCA	2	10	676011	676020	20 %	0 %	20 %	60 %	384201122
13003	NC_017221	GTG	2	6	676047	676052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201122
13004	NC_017221	CCA	2	6	676057	676062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201122
13005	NC_017221	TCT	3	9	676102	676110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201122
13006	NC_017221	GCT	2	6	676154	676159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201122
13007	NC_017221	TTC	2	6	676188	676193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201122
13008	NC_017221	GCT	2	6	676214	676219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201122
13009	NC_017221	ACC	2	6	676296	676301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201122
13010	NC_017221	ACG	3	9	676426	676434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201122
13011	NC_017221	ACC	2	6	676483	676488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201122
13012	NC_017221	GCA	2	6	676497	676502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201122
13013	NC_017221	GAA	2	6	676550	676555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201122
13014	NC_017221	AAGG	2	8	676563	676570	50 %	0 %	50 %	0 %	384201122
13015	NC_017221	CCA	2	6	676733	676738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201123
13016	NC_017221	GACC	2	8	676743	676750	25 %	0 %	25 %	50 %	384201123
13017	NC_017221	ATC	2	6	676807	676812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201123
13018	NC_017221	GGC	2	6	676849	676854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201123
13019	NC_017221	CGC	2	6	676869	676874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201123
13020	NC_017221	GAA	2	6	676902	676907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201123
13021	NC_017221	AAG	2	6	676975	676980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201123
13022	NC_017221	CCGC	2	8	677006	677013	0 %	0 %	25 %	75 %	384201123
13023	NC_017221	GAG	3	9	677131	677139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384201123
13024	NC_017221	CGCCGG	2	12	677151	677162	0 %	0 %	50 %	50 %	384201123
13025	NC_017221	CGA	2	6	677181	677186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13026	NC_017221	GGAA	2	8	677216	677223	50 %	0 %	50 %	0 %	384201123
13027	NC_017221	TCGAGC	2	12	677225	677236	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13028	NC_017221	CGT	2	6	677259	677264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13029	NC_017221	GTC	2	6	677266	677271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13030	NC_017221	GACC	2	8	677346	677353	25 %	0 %	25 %	50 %	384201123
13031	NC_017221	CAT	2	6	677388	677393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201123
13032	NC_017221	CGTGG	2	10	677395	677404	0 %	20 %	60 %	20 %	384201123
13033	NC_017221	CGG	2	6	677415	677420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201123
13034	NC_017221	CAT	2	6	677460	677465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201123
13035	NC_017221	CG	3	6	677483	677488	0 %	0 %	50 %	50 %	384201123
13036	NC_017221	TCC	2	6	677497	677502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201123
13037	NC_017221	CGA	2	6	677574	677579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13038	NC_017221	CCT	2	6	677612	677617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201123
13039	NC_017221	CGCTT	2	10	677656	677665	0 %	40 %	20 %	40 %	384201123
13040	NC_017221	ACC	2	6	677698	677703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201123
13041	NC_017221	CCG	2	6	677825	677830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201123
13042	NC_017221	AAG	2	6	677831	677836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201123
13043	NC_017221	CCGA	2	8	677866	677873	25 %	0 %	25 %	50 %	384201123
13044	NC_017221	GC	3	6	677895	677900	0 %	0 %	50 %	50 %	384201123
13045	NC_017221	GCG	2	6	677909	677914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201123
13046	NC_017221	CCA	2	6	677939	677944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201123
13047	NC_017221	TCA	2	6	677978	677983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201123
13048	NC_017221	GCT	2	6	678030	678035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13049	NC_017221	AAG	2	6	678037	678042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201123
13050	NC_017221	GCC	2	6	678175	678180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201123
13051	NC_017221	CGC	2	6	678189	678194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201123
13052	NC_017221	TAC	3	9	678202	678210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201123
13053	NC_017221	GCT	2	6	678212	678217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13054	NC_017221	CGA	2	6	678222	678227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13055	NC_017221	CG	3	6	678242	678247	0 %	0 %	50 %	50 %	384201123
13056	NC_017221	ATC	2	6	678262	678267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201123
13057	NC_017221	CGTG	2	8	678317	678324	0 %	25 %	50 %	25 %	384201123
13058	NC_017221	CAT	2	6	678360	678365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201123
13059	NC_017221	GAA	2	6	678471	678476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201123
13060	NC_017221	CGG	2	6	678510	678515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201123
13061	NC_017221	CG	3	6	678537	678542	0 %	0 %	50 %	50 %	384201123
13062	NC_017221	GCC	2	6	678550	678555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201123
13063	NC_017221	CAC	2	6	678573	678578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201123
13064	NC_017221	AAG	2	6	678631	678636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201123
13065	NC_017221	GCC	2	6	678694	678699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201123
13066	NC_017221	CGG	2	6	678744	678749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201123
13067	NC_017221	ACG	2	6	678770	678775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13068	NC_017221	AGC	2	6	678779	678784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13069	NC_017221	CAA	2	6	678786	678791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201123
13070	NC_017221	GCC	2	6	678842	678847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201123
13071	NC_017221	GCT	2	6	678858	678863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13072	NC_017221	CGG	2	6	678936	678941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201123
13073	NC_017221	GAG	2	6	678958	678963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384201123
13074	NC_017221	CGC	2	6	678984	678989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201123
13075	NC_017221	CGA	2	6	679017	679022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13076	NC_017221	TCG	2	6	679029	679034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13077	NC_017221	CG	3	6	679142	679147	0 %	0 %	50 %	50 %	384201123
13078	NC_017221	GCT	2	6	679201	679206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13079	NC_017221	CAT	2	6	679212	679217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201123
13080	NC_017221	CTG	3	9	679255	679263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13081	NC_017221	CGG	2	6	679275	679280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201123
13082	NC_017221	CAG	2	6	679297	679302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13083	NC_017221	TGC	2	6	679322	679327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13084	NC_017221	CGC	2	6	679455	679460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201123
13085	NC_017221	ACG	2	6	679463	679468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13086	NC_017221	GAG	2	6	679552	679557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384201123
13087	NC_017221	CG	3	6	679769	679774	0 %	0 %	50 %	50 %	384201123
13088	NC_017221	GCC	3	9	679804	679812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201123
13089	NC_017221	GCC	2	6	679816	679821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201123
13090	NC_017221	CAC	2	6	679836	679841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201123
13091	NC_017221	AGC	2	6	679928	679933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201123
13092	NC_017221	TGA	2	6	679960	679965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201123
13093	NC_017221	CAG	2	6	679973	679978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201124
13094	NC_017221	TG	4	8	680050	680057	0 %	50 %	50 %	0 %	384201124
13095	NC_017221	CTC	2	6	680079	680084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201124
13096	NC_017221	TGC	2	6	680140	680145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201124
13097	NC_017221	GCC	2	6	680148	680153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201124
13098	NC_017221	GC	3	6	680159	680164	0 %	0 %	50 %	50 %	384201124
13099	NC_017221	GCA	2	6	680166	680171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201124
13100	NC_017221	TCA	2	6	680263	680268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201124
13101	NC_017221	TCG	2	6	680272	680277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201124
13102	NC_017221	GCG	2	6	680287	680292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201124
13103	NC_017221	CCA	2	6	680299	680304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201124
13104	NC_017221	GCT	2	6	680369	680374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201124
13105	NC_017221	GC	3	6	680386	680391	0 %	0 %	50 %	50 %	384201124
13106	NC_017221	GCG	2	6	680503	680508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201124
13107	NC_017221	ATC	2	6	680598	680603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201124
13108	NC_017221	CCA	2	6	680608	680613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201124
13109	NC_017221	CG	3	6	680734	680739	0 %	0 %	50 %	50 %	384201124
13110	NC_017221	CGC	2	6	680792	680797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201124
13111	NC_017221	AGCCA	2	10	680802	680811	40 %	0 %	20 %	40 %	384201124
13112	NC_017221	ACGT	2	8	680830	680837	25 %	25 %	25 %	25 %	384201124
13113	NC_017221	GC	3	6	681145	681150	0 %	0 %	50 %	50 %	384201125
13114	NC_017221	ACC	2	6	681153	681158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201125
13115	NC_017221	CCA	2	6	681183	681188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201125
13116	NC_017221	GGC	2	6	681265	681270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201125
13117	NC_017221	GTG	2	6	681293	681298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201125
13118	NC_017221	TTG	2	6	681323	681328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384201125
13119	NC_017221	GGA	2	6	681337	681342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384201125
13120	NC_017221	GCC	2	6	681350	681355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201125
13121	NC_017221	CGC	2	6	681395	681400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201125
13122	NC_017221	AGC	2	6	681405	681410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201125
13123	NC_017221	GC	3	6	681409	681414	0 %	0 %	50 %	50 %	384201125
13124	NC_017221	GTG	2	6	681434	681439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201125
13125	NC_017221	CGC	2	6	681453	681458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201125
13126	NC_017221	GCC	2	6	681480	681485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201125
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13133	NC_017221	CTG	2	6	681777	681782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201126
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13143	NC_017221	TGA	2	6	682506	682511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201127
13144	NC_017221	GGCA	2	8	682522	682529	25 %	0 %	50 %	25 %	384201127
13145	NC_017221	GCTCT	2	10	682571	682580	0 %	40 %	20 %	40 %	384201127
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13148	NC_017221	CTG	2	6	682850	682855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201127
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13152	NC_017221	AT	3	6	682961	682966	50 %	50 %	0 %	0 %	384201127
13153	NC_017221	GAG	2	6	683048	683053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384201127
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13155	NC_017221	GCGA	2	8	683101	683108	25 %	0 %	50 %	25 %	384201127
13156	NC_017221	TCGGC	2	10	683142	683151	0 %	20 %	40 %	40 %	384201127
13157	NC_017221	GGCC	2	8	683217	683224	0 %	0 %	50 %	50 %	384201127
13158	NC_017221	CGC	2	6	683230	683235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201127
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13189	NC_017221	GCCAT	2	10	684604	684613	20 %	20 %	20 %	40 %	384201127
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13210	NC_017221	CG	3	6	685785	685790	0 %	0 %	50 %	50 %	384201129
13211	NC_017221	GTA	2	6	685897	685902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201129
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13220	NC_017221	TGA	2	6	686427	686432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201130
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13227	NC_017221	CAG	2	6	686828	686833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201130
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13230	NC_017221	ATC	2	6	687004	687009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201131
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13238	NC_017221	CG	3	6	687617	687622	0 %	0 %	50 %	50 %	384201131
13239	NC_017221	CAT	2	6	687638	687643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201131
13240	NC_017221	CTG	2	6	687645	687650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201131
13241	NC_017221	CGG	2	6	687653	687658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201131
13242	NC_017221	TCG	2	6	687664	687669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201131
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13255	NC_017221	GTCA	2	8	688310	688317	25 %	25 %	25 %	25 %	384201132
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13266	NC_017221	CTG	2	6	688583	688588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201132
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13352	NC_017221	ACGC	2	8	693644	693651	25 %	0 %	25 %	50 %	384201140
13353	NC_017221	CCA	2	6	693697	693702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201140
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13356	NC_017221	ATGA	2	8	693897	693904	50 %	25 %	25 %	0 %	384201140
13357	NC_017221	CGG	2	6	693922	693927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201140
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13360	NC_017221	CGC	2	6	694009	694014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201140
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13362	NC_017221	CGGA	2	8	694212	694219	25 %	0 %	50 %	25 %	384201141
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13442	NC_017221	GTC	2	6	698705	698710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201146
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13447	NC_017221	ATG	2	6	698943	698948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201146
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13456	NC_017221	CGAA	2	8	699260	699267	50 %	0 %	25 %	25 %	384201146
13457	NC_017221	GGT	2	6	699275	699280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201146
13458	NC_017221	AGGC	2	8	699317	699324	25 %	0 %	50 %	25 %	384201146
13459	NC_017221	ATC	2	6	699417	699422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201146
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13461	NC_017221	CTG	2	6	699485	699490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201146
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13463	NC_017221	CG	4	8	699589	699596	0 %	0 %	50 %	50 %	384201146
13464	NC_017221	CCTT	2	8	699645	699652	0 %	50 %	0 %	50 %	384201146
13465	NC_017221	CGT	2	6	699670	699675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201146
13466	NC_017221	TCG	2	6	699726	699731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201146
13467	NC_017221	GCC	2	6	699801	699806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201146
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13469	NC_017221	CCG	2	6	700024	700029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201147
13470	NC_017221	GCG	3	9	700173	700181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201147
13471	NC_017221	GC	3	6	700187	700192	0 %	0 %	50 %	50 %	384201147
13472	NC_017221	CGT	2	6	700364	700369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201147
13473	NC_017221	CG	3	6	700374	700379	0 %	0 %	50 %	50 %	384201147
13474	NC_017221	ATC	2	6	700380	700385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201147
13475	NC_017221	TGG	2	6	700465	700470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201147
13476	NC_017221	GCC	2	6	700514	700519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201147
13477	NC_017221	CTG	2	6	700611	700616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201147
13478	NC_017221	ATGG	2	8	700632	700639	25 %	25 %	50 %	0 %	384201147
13479	NC_017221	GCC	3	9	700650	700658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201147
13480	NC_017221	CCA	2	6	700669	700674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201147
13481	NC_017221	GGCT	2	8	700677	700684	0 %	25 %	50 %	25 %	384201147
13482	NC_017221	CGA	2	6	700691	700696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201147
13483	NC_017221	GCT	2	6	700727	700732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201147
13484	NC_017221	GGA	2	6	700752	700757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384201147
13485	NC_017221	CGT	2	6	700793	700798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201147
13486	NC_017221	CTG	2	6	700851	700856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201147
13487	NC_017221	CGC	2	6	700883	700888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201147
13488	NC_017221	CG	3	6	701014	701019	0 %	0 %	50 %	50 %	384201147
13489	NC_017221	GGC	2	6	701066	701071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201147
13490	NC_017221	GGTT	2	8	701083	701090	0 %	50 %	50 %	0 %	384201147
13491	NC_017221	GCC	2	6	701160	701165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201147
13492	NC_017221	GC	3	6	701168	701173	0 %	0 %	50 %	50 %	384201147
13493	NC_017221	ATC	2	6	701216	701221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201147
13494	NC_017221	CGA	2	6	701231	701236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201147
13495	NC_017221	ACG	2	6	701299	701304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201147
13496	NC_017221	TATG	2	8	701444	701451	25 %	50 %	25 %	0 %	384201147
13497	NC_017221	TCC	2	6	701635	701640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201148
13498	NC_017221	AGC	2	6	701677	701682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201148
13499	NC_017221	GAA	3	9	701761	701769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201148
13500	NC_017221	GCA	2	6	701831	701836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201148

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