MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 chromosome

Total Repeats: 46418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_017221	CCA	2	6	626198	626203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201080
12003	NC_017221	CAT	2	6	626223	626228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201080
12004	NC_017221	GGT	2	6	626250	626255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201080
12005	NC_017221	GC	4	8	626304	626311	0 %	0 %	50 %	50 %	384201080
12006	NC_017221	TGA	2	6	626316	626321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201080
12007	NC_017221	GGT	2	6	626386	626391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201080
12008	NC_017221	ACGC	2	8	626393	626400	25 %	0 %	25 %	50 %	384201080
12009	NC_017221	CGA	2	6	626445	626450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201080
12010	NC_017221	CAT	2	6	626478	626483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201080
12011	NC_017221	ACG	2	6	626555	626560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201080
12012	NC_017221	TCA	2	6	626573	626578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201080
12013	NC_017221	GCC	2	6	626605	626610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201080
12014	NC_017221	CAT	2	6	626670	626675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201080
12015	NC_017221	CGC	2	6	626679	626684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201080
12016	NC_017221	GCC	2	6	626704	626709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201080
12017	NC_017221	TAT	2	6	626778	626783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384201080
12018	NC_017221	CCA	2	6	626915	626920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201080
12019	NC_017221	AT	3	6	626997	627002	50 %	50 %	0 %	0 %	384201080
12020	NC_017221	TAC	2	6	627028	627033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201080
12021	NC_017221	CAGC	2	8	627066	627073	25 %	0 %	25 %	50 %	384201080
12022	NC_017221	GAC	2	6	627205	627210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201081
12023	NC_017221	CCTG	2	8	627272	627279	0 %	25 %	25 %	50 %	384201081
12024	NC_017221	CGC	2	6	627376	627381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201081
12025	NC_017221	AC	3	6	627431	627436	50 %	0 %	0 %	50 %	384201081
12026	NC_017221	CGT	2	6	627441	627446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201081
12027	NC_017221	CGA	2	6	627468	627473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201081
12028	NC_017221	GCCG	2	8	627543	627550	0 %	0 %	50 %	50 %	384201081
12029	NC_017221	AC	3	6	627639	627644	50 %	0 %	0 %	50 %	384201081
12030	NC_017221	CCA	2	6	627647	627652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201081
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12032	NC_017221	GCC	3	9	627712	627720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201081
12033	NC_017221	GGA	2	6	627828	627833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384201081
12034	NC_017221	TGC	2	6	627937	627942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201082
12035	NC_017221	TCG	2	6	627962	627967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201082
12036	NC_017221	TCT	2	6	628027	628032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201082
12037	NC_017221	GC	3	6	628055	628060	0 %	0 %	50 %	50 %	384201082
12038	NC_017221	GCT	2	6	628064	628069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201082
12039	NC_017221	GCA	2	6	628115	628120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201082
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12042	NC_017221	CAT	2	6	628268	628273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201082
12043	NC_017221	TGA	2	6	628313	628318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201082
12044	NC_017221	TTC	2	6	628467	628472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201082
12045	NC_017221	CAG	3	9	628494	628502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201082
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12048	NC_017221	GTA	2	6	628566	628571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201082
12049	NC_017221	CTGG	2	8	628574	628581	0 %	25 %	50 %	25 %	384201082
12050	NC_017221	TGC	2	6	628693	628698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201082
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12052	NC_017221	TGA	2	6	628742	628747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201082
12053	NC_017221	GGA	2	6	628751	628756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384201082
12054	NC_017221	GTCA	2	8	628791	628798	25 %	25 %	25 %	25 %	384201082
12055	NC_017221	ACC	2	6	628818	628823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201082
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12059	NC_017221	CGA	2	6	629249	629254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201082
12060	NC_017221	TCGA	2	8	629275	629282	25 %	25 %	25 %	25 %	384201082
12061	NC_017221	CG	3	6	629308	629313	0 %	0 %	50 %	50 %	384201082
12062	NC_017221	CGG	2	6	629318	629323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201082
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12065	NC_017221	AGGTG	2	10	629447	629456	20 %	20 %	60 %	0 %	384201082
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12068	NC_017221	CGC	2	6	629568	629573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201082
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12073	NC_017221	TGCC	2	8	629814	629821	0 %	25 %	25 %	50 %	384201083
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12085	NC_017221	TGG	2	6	630366	630371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201083
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12087	NC_017221	CTG	2	6	630422	630427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201083
12088	NC_017221	TAC	2	6	630532	630537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201083
12089	NC_017221	AGC	2	6	630540	630545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201083
12090	NC_017221	T	6	6	630654	630659	0 %	100 %	0 %	0 %	384201083
12091	NC_017221	CGG	2	6	630667	630672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201083
12092	NC_017221	TGCG	2	8	630681	630688	0 %	25 %	50 %	25 %	384201083
12093	NC_017221	CGAT	2	8	630758	630765	25 %	25 %	25 %	25 %	384201083
12094	NC_017221	TTGGC	2	10	630862	630871	0 %	40 %	40 %	20 %	384201083
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12097	NC_017221	AGTG	2	8	631024	631031	25 %	25 %	50 %	0 %	384201083
12098	NC_017221	CCA	2	6	631086	631091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201083
12099	NC_017221	CCT	2	6	631094	631099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201083
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12102	NC_017221	GAA	2	6	631654	631659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201084
12103	NC_017221	CTG	3	9	631680	631688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201084
12104	NC_017221	AAG	2	6	631748	631753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201084
12105	NC_017221	GGC	2	6	631784	631789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201084
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12107	NC_017221	TGACC	2	10	631843	631852	20 %	20 %	20 %	40 %	384201084
12108	NC_017221	AAC	2	6	631868	631873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201084
12109	NC_017221	CAG	2	6	631877	631882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201084
12110	NC_017221	CAA	2	6	631900	631905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201084
12111	NC_017221	ACG	2	6	631914	631919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201084
12112	NC_017221	CAT	2	6	631930	631935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201084
12113	NC_017221	TCC	2	6	631940	631945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201084
12114	NC_017221	GAA	2	6	631975	631980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201084
12115	NC_017221	GCTGAG	2	12	631985	631996	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384201084
12116	NC_017221	AAG	2	6	632048	632053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201084
12117	NC_017221	GCG	2	6	632091	632096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201084
12118	NC_017221	GTG	2	6	632177	632182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201084
12119	NC_017221	ACA	2	6	632205	632210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201084
12120	NC_017221	TGA	2	6	632263	632268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201084
12121	NC_017221	ACAAGT	2	12	632298	632309	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384201084
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12124	NC_017221	ATC	2	6	632405	632410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201084
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12230	NC_017221	GCCG	2	8	636303	636310	0 %	0 %	50 %	50 %	384201087
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12233	NC_017221	CGG	2	6	636381	636386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201087
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12235	NC_017221	CG	3	6	636643	636648	0 %	0 %	50 %	50 %	384201088
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12356	NC_017221	CCT	2	6	642768	642773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201094
12357	NC_017221	TGA	3	9	642786	642794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201094
12358	NC_017221	CACGC	2	10	642802	642811	20 %	0 %	20 %	60 %	384201094
12359	NC_017221	CTT	2	6	642844	642849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201094
12360	NC_017221	ATG	2	6	642884	642889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201094
12361	NC_017221	GTT	2	6	642936	642941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384201094
12362	NC_017221	CCG	2	6	642944	642949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201094
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12365	NC_017221	TTGC	2	8	643150	643157	0 %	50 %	25 %	25 %	384201094
12366	NC_017221	TGC	2	6	643230	643235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201094
12367	NC_017221	CGG	2	6	643236	643241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201094
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12370	NC_017221	CG	4	8	643323	643330	0 %	0 %	50 %	50 %	384201094
12371	NC_017221	AAT	2	6	643402	643407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384201094
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12374	NC_017221	GGC	2	6	643507	643512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201094
12375	NC_017221	TAC	2	6	643524	643529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201094
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12379	NC_017221	ATC	2	6	643696	643701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201094
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12382	NC_017221	CGGGT	2	10	643832	643841	0 %	20 %	60 %	20 %	384201094
12383	NC_017221	TCC	2	6	643949	643954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201094
12384	NC_017221	GGT	2	6	643960	643965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201094
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12460	NC_017221	CGG	3	9	648093	648101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201098
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12470	NC_017221	CAA	2	6	648798	648803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201099
12471	NC_017221	GCT	2	6	649038	649043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201099
12472	NC_017221	TCA	2	6	649082	649087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201099
12473	NC_017221	CGTA	2	8	649109	649116	25 %	25 %	25 %	25 %	384201099
12474	NC_017221	AACC	2	8	649118	649125	50 %	0 %	0 %	50 %	384201099
12475	NC_017221	TTC	2	6	649189	649194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201099
12476	NC_017221	CT	3	6	649200	649205	0 %	50 %	0 %	50 %	384201099
12477	NC_017221	GCG	2	6	649244	649249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201099
12478	NC_017221	GCCGC	2	10	649288	649297	0 %	0 %	40 %	60 %	384201099
12479	NC_017221	GAT	2	6	649378	649383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201099
12480	NC_017221	CAT	2	6	649401	649406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201099
12481	NC_017221	ATT	2	6	649425	649430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384201099
12482	NC_017221	CGC	2	6	649434	649439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201099
12483	NC_017221	CAGAC	2	10	649447	649456	40 %	0 %	20 %	40 %	384201099
12484	NC_017221	GGC	2	6	649549	649554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201099
12485	NC_017221	TGC	2	6	649562	649567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201099
12486	NC_017221	TGC	2	6	649604	649609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201099
12487	NC_017221	TTGA	2	8	649612	649619	25 %	50 %	25 %	0 %	384201099
12488	NC_017221	CTT	2	6	649650	649655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201099
12489	NC_017221	CGC	2	6	649746	649751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201099
12490	NC_017221	TGC	2	6	649754	649759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201099
12491	NC_017221	ATG	3	9	649891	649899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201100
12492	NC_017221	CTG	2	6	649995	650000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201100
12493	NC_017221	GCGG	2	8	650040	650047	0 %	0 %	75 %	25 %	384201100
12494	NC_017221	GAA	2	6	650072	650077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201100
12495	NC_017221	CGC	2	6	650115	650120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201100
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12497	NC_017221	GCG	2	6	650148	650153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201100
12498	NC_017221	GC	3	6	650217	650222	0 %	0 %	50 %	50 %	384201100
12499	NC_017221	CCAAGG	2	12	650263	650274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201100
12500	NC_017221	CTG	2	6	650304	650309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201100

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