MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 chromosome

Total Repeats: 46418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017221	AGT	2	6	577394	577399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201036
11002	NC_017221	CGA	2	6	577557	577562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201037
11003	NC_017221	GCTG	2	8	577563	577570	0 %	25 %	50 %	25 %	384201037
11004	NC_017221	AGCG	2	8	577608	577615	25 %	0 %	50 %	25 %	384201037
11005	NC_017221	CTG	2	6	577636	577641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201037
11006	NC_017221	TTG	2	6	577667	577672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384201037
11007	NC_017221	GC	3	6	577748	577753	0 %	0 %	50 %	50 %	384201037
11008	NC_017221	TGGA	2	8	577829	577836	25 %	25 %	50 %	0 %	384201037
11009	NC_017221	GCC	2	6	577843	577848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201037
11010	NC_017221	GGT	2	6	577906	577911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201037
11011	NC_017221	CCA	2	6	577944	577949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201037
11012	NC_017221	AGC	2	6	577970	577975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201037
11013	NC_017221	AGC	2	6	577977	577982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201037
11014	NC_017221	TGG	2	6	578040	578045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201037
11015	NC_017221	CGC	2	6	578085	578090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201037
11016	NC_017221	ATG	2	6	578129	578134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201037
11017	NC_017221	GTAGAC	2	12	578368	578379	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384201037
11018	NC_017221	GA	4	8	578428	578435	50 %	0 %	50 %	0 %	384201037
11019	NC_017221	GGT	2	6	578475	578480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201037
11020	NC_017221	GAT	2	6	578482	578487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201037
11021	NC_017221	GTT	2	6	578551	578556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384201037
11022	NC_017221	TCG	2	6	578600	578605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201037
11023	NC_017221	ATC	2	6	578644	578649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201037
11024	NC_017221	GTA	2	6	578653	578658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201037
11025	NC_017221	GTG	2	6	578677	578682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201037
11026	NC_017221	GCG	2	6	578699	578704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201037
11027	NC_017221	TGC	2	6	578705	578710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201037
11028	NC_017221	GTTGCC	2	12	578803	578814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201037
11029	NC_017221	AGA	2	6	578831	578836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201037
11030	NC_017221	ATC	2	6	578837	578842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201037
11031	NC_017221	TTCGAC	2	12	578845	578856	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384201037
11032	NC_017221	CGA	2	6	578898	578903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201037
11033	NC_017221	ACC	2	6	579121	579126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201038
11034	NC_017221	CGGT	2	8	579191	579198	0 %	25 %	50 %	25 %	384201038
11035	NC_017221	GCG	2	6	579218	579223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201038
11036	NC_017221	TCT	2	6	579227	579232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201038
11037	NC_017221	GCG	2	6	579364	579369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201038
11038	NC_017221	GT	3	6	579587	579592	0 %	50 %	50 %	0 %	384201038
11039	NC_017221	CGG	2	6	579639	579644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201038
11040	NC_017221	GCG	2	6	579656	579661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201038
11041	NC_017221	CCATG	2	10	579963	579972	20 %	20 %	20 %	40 %	384201039
11042	NC_017221	CTT	2	6	580026	580031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201039
11043	NC_017221	TCA	2	6	580052	580057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201039
11044	NC_017221	CTG	2	6	580161	580166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201039
11045	NC_017221	CTG	2	6	580254	580259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201039
11046	NC_017221	CCG	2	6	580525	580530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201040
11047	NC_017221	GGT	2	6	580545	580550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201040
11048	NC_017221	TCGC	2	8	580551	580558	0 %	25 %	25 %	50 %	384201040
11049	NC_017221	GTA	2	6	580596	580601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201040
11050	NC_017221	CGG	2	6	580661	580666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201040
11051	NC_017221	GGC	2	6	580695	580700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201040
11052	NC_017221	GCG	2	6	580759	580764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201040
11053	NC_017221	CGCGGG	2	12	580842	580853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201040
11054	NC_017221	GGC	2	6	580899	580904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201040
11055	NC_017221	GCG	2	6	580915	580920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201040
11056	NC_017221	TCA	2	6	580927	580932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201040
11057	NC_017221	GAT	2	6	580973	580978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201040
11058	NC_017221	CAC	2	6	581001	581006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201040
11059	NC_017221	TCC	2	6	581023	581028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201040
11060	NC_017221	GGC	2	6	581049	581054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201040
11061	NC_017221	ACC	2	6	581061	581066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201040
11062	NC_017221	TGCC	2	8	581108	581115	0 %	25 %	25 %	50 %	384201040
11063	NC_017221	GCG	2	6	581160	581165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201040
11064	NC_017221	TCA	2	6	581180	581185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201040
11065	NC_017221	CCAG	2	8	581249	581256	25 %	0 %	25 %	50 %	384201040
11066	NC_017221	GAT	2	6	581438	581443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201040
11067	NC_017221	GAC	2	6	581451	581456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201040
11068	NC_017221	GCCGG	2	10	581464	581473	0 %	0 %	60 %	40 %	384201040
11069	NC_017221	TTG	2	6	581500	581505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384201040
11070	NC_017221	CGC	2	6	581543	581548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201040
11071	NC_017221	CCGC	2	8	581557	581564	0 %	0 %	25 %	75 %	384201040
11072	NC_017221	TCCT	2	8	581577	581584	0 %	50 %	0 %	50 %	384201040
11073	NC_017221	GCC	2	6	581655	581660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201040
11074	NC_017221	CGC	2	6	581661	581666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201040
11075	NC_017221	CGC	2	6	581682	581687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201040
11076	NC_017221	TG	3	6	581707	581712	0 %	50 %	50 %	0 %	384201040
11077	NC_017221	AAT	2	6	581722	581727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384201040
11078	NC_017221	AG	3	6	581770	581775	50 %	0 %	50 %	0 %	384201040
11079	NC_017221	CAG	2	6	581787	581792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201040
11080	NC_017221	ATC	2	6	581811	581816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201040
11081	NC_017221	AAC	2	6	581895	581900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201040
11082	NC_017221	GCC	2	6	582010	582015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201040
11083	NC_017221	GGC	2	6	582039	582044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201040
11084	NC_017221	TTC	2	6	582048	582053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201040
11085	NC_017221	TGGC	2	8	582059	582066	0 %	25 %	50 %	25 %	384201040
11086	NC_017221	CCG	2	6	582079	582084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201040
11087	NC_017221	GCTC	2	8	582116	582123	0 %	25 %	25 %	50 %	384201040
11088	NC_017221	GAC	2	6	582126	582131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201041
11089	NC_017221	GGTG	2	8	582145	582152	0 %	25 %	75 %	0 %	384201041
11090	NC_017221	CGG	2	6	582220	582225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201041
11091	NC_017221	CCG	2	6	582268	582273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201041
11092	NC_017221	GGAC	2	8	582307	582314	25 %	0 %	50 %	25 %	384201041
11093	NC_017221	CCG	2	6	582337	582342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201041
11094	NC_017221	GGCAAG	2	12	582346	582357	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384201041
11095	NC_017221	GCC	2	6	582395	582400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201041
11096	NC_017221	AT	3	6	582441	582446	50 %	50 %	0 %	0 %	384201041
11097	NC_017221	A	6	6	582686	582691	100 %	0 %	0 %	0 %	384201042
11098	NC_017221	AAC	2	6	582693	582698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201042
11099	NC_017221	GTG	2	6	582770	582775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201043
11100	NC_017221	TCA	2	6	582810	582815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201043
11101	NC_017221	CTC	2	6	582817	582822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201043
11102	NC_017221	CTT	2	6	582829	582834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201043
11103	NC_017221	TCG	2	6	582839	582844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201043
11104	NC_017221	CGC	2	6	582852	582857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201043
11105	NC_017221	GAA	2	6	582875	582880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201043
11106	NC_017221	GAA	2	6	582971	582976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201043
11107	NC_017221	CTG	3	9	583063	583071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201043
11108	NC_017221	GTG	2	6	583085	583090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201043
11109	NC_017221	ATG	2	6	583134	583139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201043
11110	NC_017221	GCC	2	6	583181	583186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201043
11111	NC_017221	CAGCAA	2	12	583198	583209	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384201043
11112	NC_017221	CAG	2	6	583314	583319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201044
11113	NC_017221	GCAA	2	8	583357	583364	50 %	0 %	25 %	25 %	384201044
11114	NC_017221	ACC	2	6	583393	583398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201044
11115	NC_017221	GTG	2	6	583402	583407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201044
11116	NC_017221	GTG	2	6	583426	583431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201044
11117	NC_017221	TCG	2	6	583519	583524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201044
11118	NC_017221	TTC	2	6	583540	583545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384201044
11119	NC_017221	CATC	2	8	583547	583554	25 %	25 %	0 %	50 %	384201044
11120	NC_017221	ACC	2	6	583588	583593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201044
11121	NC_017221	GTG	2	6	583603	583608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201044
11122	NC_017221	GCC	2	6	583653	583658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201044
11123	NC_017221	CAT	2	6	583688	583693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201044
11124	NC_017221	ACG	2	6	583722	583727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201044
11125	NC_017221	TGA	2	6	583757	583762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201044
11126	NC_017221	CAT	2	6	583778	583783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201044
11127	NC_017221	CAG	2	6	583815	583820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201044
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11129	NC_017221	CCG	2	6	583853	583858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201044
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11139	NC_017221	CGA	2	6	584236	584241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201044
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11147	NC_017221	CGC	2	6	584768	584773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201045
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11154	NC_017221	CATC	2	8	585268	585275	25 %	25 %	0 %	50 %	384201045
11155	NC_017221	GTC	2	6	585290	585295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201045
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11162	NC_017221	CGG	2	6	585432	585437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201046
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11193	NC_017221	TCG	2	6	586732	586737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201047
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11198	NC_017221	CCTT	2	8	586823	586830	0 %	50 %	0 %	50 %	384201047
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11217	NC_017221	CAGAT	2	10	587633	587642	40 %	20 %	20 %	20 %	384201048
11218	NC_017221	TGCAC	2	10	587659	587668	20 %	20 %	20 %	40 %	384201048
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11221	NC_017221	CCA	2	6	587806	587811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201048
11222	NC_017221	GCG	2	6	587922	587927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201048
11223	NC_017221	GCCT	2	8	588005	588012	0 %	25 %	25 %	50 %	384201049
11224	NC_017221	GAA	2	6	588086	588091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201049
11225	NC_017221	TGA	3	9	588130	588138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201049
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11227	NC_017221	GC	3	6	588227	588232	0 %	0 %	50 %	50 %	384201049
11228	NC_017221	TCC	2	6	588264	588269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384201049
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11230	NC_017221	TGG	2	6	588370	588375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201049
11231	NC_017221	GTC	2	6	588392	588397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201049
11232	NC_017221	CG	3	6	588548	588553	0 %	0 %	50 %	50 %	384201049
11233	NC_017221	CGG	2	6	588589	588594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201049
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11238	NC_017221	TCG	2	6	588937	588942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201050
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11353	NC_017221	AAC	2	6	594103	594108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201056
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11355	NC_017221	TGG	2	6	594155	594160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201056
11356	NC_017221	CAA	2	6	594162	594167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201056
11357	NC_017221	CTG	2	6	594175	594180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201056
11358	NC_017221	A	6	6	594183	594188	100 %	0 %	0 %	0 %	384201056
11359	NC_017221	CAAAGA	2	12	594243	594254	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384201056
11360	NC_017221	GTATC	2	10	594302	594311	20 %	40 %	20 %	20 %	384201056
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11366	NC_017221	GTG	2	6	594670	594675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201056
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11372	NC_017221	GCC	2	6	594823	594828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201056
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11384	NC_017221	CCG	2	6	595241	595246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201056
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11387	NC_017221	GCTC	2	8	595416	595423	0 %	25 %	25 %	50 %	384201056
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11444	NC_017221	ACCA	2	8	598011	598018	50 %	0 %	0 %	50 %	384201059
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11469	NC_017221	GAG	2	6	599535	599540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384201060
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11471	NC_017221	CGA	2	6	599597	599602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201060
11472	NC_017221	CGGCT	2	10	599624	599633	0 %	20 %	40 %	40 %	384201060
11473	NC_017221	GC	3	6	599638	599643	0 %	0 %	50 %	50 %	384201060
11474	NC_017221	CCA	3	9	599704	599712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201060
11475	NC_017221	CGA	2	6	599714	599719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201060
11476	NC_017221	ACC	3	9	599842	599850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201060
11477	NC_017221	GC	3	6	599869	599874	0 %	0 %	50 %	50 %	384201060
11478	NC_017221	CCTG	2	8	599921	599928	0 %	25 %	25 %	50 %	384201060
11479	NC_017221	CCGCC	2	10	599986	599995	0 %	0 %	20 %	80 %	384201060
11480	NC_017221	CGA	2	6	600011	600016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201060
11481	NC_017221	CGC	2	6	600032	600037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201060
11482	NC_017221	GCC	2	6	600078	600083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201060
11483	NC_017221	GAAG	2	8	600128	600135	50 %	0 %	50 %	0 %	384201060
11484	NC_017221	TCA	2	6	600199	600204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201060
11485	NC_017221	CCA	2	6	600208	600213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201060
11486	NC_017221	CAT	2	6	600290	600295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201060
11487	NC_017221	CCG	2	6	600335	600340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201060
11488	NC_017221	GTTC	2	8	600379	600386	0 %	50 %	25 %	25 %	384201060
11489	NC_017221	CGA	2	6	600452	600457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201060
11490	NC_017221	GAG	2	6	600552	600557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384201060
11491	NC_017221	GGC	2	6	600558	600563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201060
11492	NC_017221	GTG	2	6	600600	600605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201060
11493	NC_017221	CGA	2	6	600611	600616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201060
11494	NC_017221	GCT	2	6	600650	600655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201060
11495	NC_017221	CAT	3	9	600719	600727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201060
11496	NC_017221	ACC	2	6	600732	600737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201060
11497	NC_017221	GCC	2	6	600765	600770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201060
11498	NC_017221	CAA	2	6	600794	600799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201060
11499	NC_017221	AGC	2	6	600847	600852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201060
11500	NC_017221	GAC	2	6	600882	600887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201060

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