MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB-12 chromosome

Total Repeats: 39740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017214	CGC	2	6	384	389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189769
2	NC_017214	TC	3	6	394	399	0 %	50 %	0 %	50 %	384189769
3	NC_017214	GGA	2	6	418	423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189769
4	NC_017214	AGC	2	6	424	429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189769
5	NC_017214	GAC	2	6	433	438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189769
6	NC_017214	GGCAAG	2	12	439	450	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384189769
7	NC_017214	GCC	2	6	478	483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189769
8	NC_017214	GCC	2	6	550	555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189769
9	NC_017214	CGA	2	6	608	613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189769
10	NC_017214	CAT	2	6	771	776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189769
11	NC_017214	ACA	2	6	779	784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189769
12	NC_017214	AAG	2	6	796	801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189769
13	NC_017214	CGA	2	6	876	881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189769
14	NC_017214	AAG	2	6	892	897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189769
15	NC_017214	AGG	2	6	1004	1009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189769
16	NC_017214	ACCT	2	8	1045	1052	25 %	25 %	0 %	50 %	384189769
17	NC_017214	CCA	2	6	1094	1099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189769
18	NC_017214	GAG	2	6	1270	1275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189769
19	NC_017214	GTC	2	6	1372	1377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189769
20	NC_017214	CGA	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189769
21	NC_017214	CAC	2	6	1422	1427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189769
22	NC_017214	TCG	2	6	1469	1474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189769
23	NC_017214	AGG	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189769
24	NC_017214	GAT	2	6	1530	1535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189769
25	NC_017214	GGA	2	6	1542	1547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189769
26	NC_017214	GAA	2	6	1551	1556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189769
27	NC_017214	GGCCA	2	10	1564	1573	20 %	0 %	40 %	40 %	384189769
28	NC_017214	TCG	2	6	1625	1630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189769
29	NC_017214	GT	3	6	1923	1928	0 %	50 %	50 %	0 %	384189770
30	NC_017214	GCT	2	6	1947	1952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189770
31	NC_017214	TGG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384189770
32	NC_017214	GAGG	2	8	2118	2125	25 %	0 %	75 %	0 %	384189770
33	NC_017214	CGGTC	2	10	2154	2163	0 %	20 %	40 %	40 %	384189770
34	NC_017214	GTC	2	6	2166	2171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189770
35	NC_017214	CAT	2	6	2184	2189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189770
36	NC_017214	CGC	2	6	2195	2200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189770
37	NC_017214	GTC	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189770
38	NC_017214	CGT	2	6	2246	2251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189770
39	NC_017214	TCG	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189770
40	NC_017214	CAG	2	6	2340	2345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189770
41	NC_017214	GC	3	6	2347	2352	0 %	0 %	50 %	50 %	384189770
42	NC_017214	GGC	2	6	2411	2416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189770
43	NC_017214	GCG	2	6	2437	2442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189770
44	NC_017214	ACG	2	6	2452	2457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189770
45	NC_017214	ACG	2	6	2491	2496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189770
46	NC_017214	ACC	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189770
47	NC_017214	CGC	3	9	2564	2572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189770
48	NC_017214	GC	3	6	2571	2576	0 %	0 %	50 %	50 %	384189770
49	NC_017214	CAG	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189770
50	NC_017214	CGA	2	6	2666	2671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189770
51	NC_017214	CG	3	6	2733	2738	0 %	0 %	50 %	50 %	384189770
52	NC_017214	GAG	2	6	2743	2748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189770
53	NC_017214	ACC	2	6	2803	2808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189770
54	NC_017214	AGC	2	6	2824	2829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189770
55	NC_017214	CGC	2	6	2869	2874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189770
56	NC_017214	CCG	2	6	2888	2893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189770
57	NC_017214	ATC	2	6	2934	2939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189770
58	NC_017214	GCACG	2	10	2955	2964	20 %	0 %	40 %	40 %	384189770
59	NC_017214	GCG	2	6	2973	2978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189770
60	NC_017214	CAG	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189770
61	NC_017214	CGT	2	6	3002	3007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189770
62	NC_017214	ACG	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189770
63	NC_017214	CGC	2	6	3065	3070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189770
64	NC_017214	GC	3	6	3084	3089	0 %	0 %	50 %	50 %	384189770
65	NC_017214	CGC	2	6	3151	3156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189770
66	NC_017214	CA	3	6	3261	3266	50 %	0 %	0 %	50 %	384189770
67	NC_017214	ATG	2	6	3271	3276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189771
68	NC_017214	AC	3	6	3290	3295	50 %	0 %	0 %	50 %	384189771
69	NC_017214	CG	3	6	3341	3346	0 %	0 %	50 %	50 %	384189771
70	NC_017214	GCTC	2	8	3361	3368	0 %	25 %	25 %	50 %	384189771
71	NC_017214	CGAG	2	8	3403	3410	25 %	0 %	50 %	25 %	384189771
72	NC_017214	CCG	2	6	3472	3477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189771
73	NC_017214	GAC	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189771
74	NC_017214	GTC	2	6	3506	3511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189771
75	NC_017214	GCA	2	6	3667	3672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189771
76	NC_017214	TCG	2	6	3675	3680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189771
77	NC_017214	CA	3	6	3754	3759	50 %	0 %	0 %	50 %	384189771
78	NC_017214	TGG	2	6	3769	3774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384189771
79	NC_017214	GAA	2	6	3794	3799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189771
80	NC_017214	GTC	2	6	3818	3823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189771
81	NC_017214	GCC	2	6	3873	3878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189771
82	NC_017214	ACC	2	6	3894	3899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189771
83	NC_017214	TCA	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189771
84	NC_017214	GTC	2	6	3980	3985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189771
85	NC_017214	GGC	2	6	4036	4041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189771
86	NC_017214	TCG	2	6	4044	4049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189771
87	NC_017214	CTG	2	6	4163	4168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189771
88	NC_017214	GAA	2	6	4181	4186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189771
89	NC_017214	TCC	3	9	4293	4301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384189771
90	NC_017214	TGC	2	6	4347	4352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189771
91	NC_017214	CGT	2	6	4420	4425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189771
92	NC_017214	CGT	2	6	4447	4452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189771
93	NC_017214	CAT	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189771
94	NC_017214	GTG	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384189771
95	NC_017214	ACG	2	6	4628	4633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189771
96	NC_017214	GGC	2	6	4804	4809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189772
97	NC_017214	GCAAT	2	10	4824	4833	40 %	20 %	20 %	20 %	384189772
98	NC_017214	CAC	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189772
99	NC_017214	GTC	2	6	4880	4885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189772
100	NC_017214	CGT	2	6	4933	4938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189772
101	NC_017214	GCC	2	6	4958	4963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189772
102	NC_017214	ATCG	2	8	4991	4998	25 %	25 %	25 %	25 %	384189772
103	NC_017214	CGG	2	6	5144	5149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189772
104	NC_017214	TCG	2	6	5217	5222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189772
105	NC_017214	GTC	2	6	5288	5293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189772
106	NC_017214	CGC	2	6	5308	5313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189772
107	NC_017214	TCG	2	6	5368	5373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189772
108	NC_017214	ATTC	2	8	5389	5396	25 %	50 %	0 %	25 %	384189772
109	NC_017214	AACG	2	8	5507	5514	50 %	0 %	25 %	25 %	384189772
110	NC_017214	ATC	2	6	5565	5570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189772
111	NC_017214	CAT	2	6	5603	5608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189773
112	NC_017214	CGC	2	6	5612	5617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189773
113	NC_017214	GAA	2	6	5768	5773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189773
114	NC_017214	GCA	2	6	5871	5876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189774
115	NC_017214	GCC	2	6	5890	5895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189774
116	NC_017214	GT	3	6	5922	5927	0 %	50 %	50 %	0 %	384189774
117	NC_017214	TG	4	8	5970	5977	0 %	50 %	50 %	0 %	384189774
118	NC_017214	GTT	2	6	6010	6015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189774
119	NC_017214	CGG	2	6	6072	6077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189774
120	NC_017214	GCA	2	6	6102	6107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189774
121	NC_017214	CGA	2	6	6153	6158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189774
122	NC_017214	GGC	2	6	6193	6198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189774
123	NC_017214	CG	3	6	6204	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	384189774
124	NC_017214	GCC	2	6	6232	6237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189774
125	NC_017214	ACG	2	6	6242	6247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189774
126	NC_017214	GTC	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189774
127	NC_017214	CCG	2	6	6329	6334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189774
128	NC_017214	CCT	2	6	6342	6347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384189774
129	NC_017214	CGAGG	2	10	6355	6364	20 %	0 %	60 %	20 %	384189774
130	NC_017214	ACG	2	6	6424	6429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189774
131	NC_017214	TTC	2	6	6449	6454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189774
132	NC_017214	CGA	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189774
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