MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT6880

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017210	TAGAAA	2	12	454	465	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384183659
2	NC_017210	ATC	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183659
3	NC_017210	A	7	7	570	576	100 %	0 %	0 %	0 %	384183659
4	NC_017210	TAAA	2	8	631	638	75 %	25 %	0 %	0 %	384183659
5	NC_017210	TAA	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183659
6	NC_017210	TA	3	6	690	695	50 %	50 %	0 %	0 %	384183659
7	NC_017210	ATTGT	2	10	709	718	20 %	60 %	20 %	0 %	384183659
8	NC_017210	AATT	2	8	772	779	50 %	50 %	0 %	0 %	384183659
9	NC_017210	AAT	2	6	867	872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183659
10	NC_017210	CA	3	6	901	906	50 %	0 %	0 %	50 %	384183659
11	NC_017210	TGAA	2	8	934	941	50 %	25 %	25 %	0 %	384183659
12	NC_017210	ATGAAA	2	12	969	980	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384183659
13	NC_017210	ATT	2	6	1004	1009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183659
14	NC_017210	AT	3	6	1631	1636	50 %	50 %	0 %	0 %	384183660
15	NC_017210	AAG	3	9	1723	1731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183660
16	NC_017210	GA	3	6	1758	1763	50 %	0 %	50 %	0 %	384183660
17	NC_017210	TA	3	6	1779	1784	50 %	50 %	0 %	0 %	384183660
18	NC_017210	AAC	2	6	1816	1821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183660
19	NC_017210	GAA	2	6	1842	1847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183660
20	NC_017210	ATT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183661
21	NC_017210	TTG	2	6	2404	2409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183661
22	NC_017210	A	6	6	2417	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	384183661
23	NC_017210	GTA	2	6	2509	2514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183661
24	NC_017210	CATT	2	8	2536	2543	25 %	50 %	0 %	25 %	384183661
25	NC_017210	AGA	2	6	2685	2690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183661
26	NC_017210	ACA	2	6	2742	2747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183661
27	NC_017210	A	6	6	2809	2814	100 %	0 %	0 %	0 %	384183661
28	NC_017210	AGT	2	6	2904	2909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183661
29	NC_017210	ACA	2	6	2928	2933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183661
30	NC_017210	A	6	6	2972	2977	100 %	0 %	0 %	0 %	384183661
31	NC_017210	CAA	2	6	2983	2988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183661
32	NC_017210	A	7	7	3004	3010	100 %	0 %	0 %	0 %	384183661
33	NC_017210	AAAAG	2	10	3012	3021	80 %	0 %	20 %	0 %	384183661
34	NC_017210	GAA	2	6	3088	3093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183661
35	NC_017210	AAC	2	6	3108	3113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183661
36	NC_017210	A	7	7	3145	3151	100 %	0 %	0 %	0 %	384183661
37	NC_017210	GA	3	6	3183	3188	50 %	0 %	50 %	0 %	384183661
38	NC_017210	TTA	2	6	3215	3220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183661
39	NC_017210	A	6	6	3245	3250	100 %	0 %	0 %	0 %	384183661
40	NC_017210	ACAA	2	8	3269	3276	75 %	0 %	0 %	25 %	384183661
41	NC_017210	ACAA	2	8	3353	3360	75 %	0 %	0 %	25 %	384183661
42	NC_017210	A	6	6	3439	3444	100 %	0 %	0 %	0 %	384183661
43	NC_017210	TTA	2	6	3479	3484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183661
44	NC_017210	A	7	7	3976	3982	100 %	0 %	0 %	0 %	384183662
45	NC_017210	T	7	7	4007	4013	0 %	100 %	0 %	0 %	384183662
46	NC_017210	ATGAAA	2	12	4493	4504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384183663
47	NC_017210	A	6	6	4502	4507	100 %	0 %	0 %	0 %	384183663
48	NC_017210	TAT	2	6	4536	4541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183663
49	NC_017210	GTT	2	6	4559	4564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183663
50	NC_017210	AGA	2	6	4573	4578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183663
51	NC_017210	ACA	2	6	4616	4621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183663
52	NC_017210	A	7	7	4621	4627	100 %	0 %	0 %	0 %	384183663
53	NC_017210	ATT	2	6	4685	4690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183663
54	NC_017210	AT	3	6	4714	4719	50 %	50 %	0 %	0 %	384183663
55	NC_017210	AATTAG	2	12	4740	4751	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384183663
56	NC_017210	ATA	2	6	4863	4868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183663
57	NC_017210	AAT	2	6	4904	4909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183663
58	NC_017210	TGG	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183663
59	NC_017210	CAA	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183663
60	NC_017210	AAT	2	6	5015	5020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183663
61	NC_017210	ATT	2	6	5068	5073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183663
62	NC_017210	CAG	2	6	5091	5096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183663
63	NC_017210	CAG	2	6	5106	5111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183663
64	NC_017210	CA	3	6	5165	5170	50 %	0 %	0 %	50 %	384183663
65	NC_017210	GTTG	2	8	5199	5206	0 %	50 %	50 %	0 %	384183663
66	NC_017210	TAA	2	6	5224	5229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183663
67	NC_017210	T	7	7	5725	5731	0 %	100 %	0 %	0 %	384183664
68	NC_017210	TTA	2	6	5747	5752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183664
69	NC_017210	T	7	7	5758	5764	0 %	100 %	0 %	0 %	384183664
70	NC_017210	ATT	2	6	5906	5911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183664
71	NC_017210	TTC	2	6	5977	5982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183664
72	NC_017210	TTA	2	6	5993	5998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183664
73	NC_017210	TTTGTT	2	12	6034	6045	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384183664
74	NC_017210	TTTTG	2	10	6149	6158	0 %	80 %	20 %	0 %	384183664
75	NC_017210	CATA	2	8	6159	6166	50 %	25 %	0 %	25 %	384183664
76	NC_017210	TTC	2	6	6202	6207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183664
77	NC_017210	AT	3	6	6222	6227	50 %	50 %	0 %	0 %	384183664
78	NC_017210	TTC	2	6	6247	6252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183664
79	NC_017210	TG	3	6	6275	6280	0 %	50 %	50 %	0 %	384183664
80	NC_017210	TTA	2	6	6299	6304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183664
81	NC_017210	TTG	2	6	6388	6393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183664
82	NC_017210	TAA	2	6	6422	6427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183664
83	NC_017210	A	6	6	6538	6543	100 %	0 %	0 %	0 %	384183664
84	NC_017210	ATA	2	6	6547	6552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183664
85	NC_017210	GA	3	6	6557	6562	50 %	0 %	50 %	0 %	384183664
86	NC_017210	GT	3	6	6576	6581	0 %	50 %	50 %	0 %	384183664
87	NC_017210	TGG	2	6	6641	6646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183664
88	NC_017210	TCT	3	9	6686	6694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183664
89	NC_017210	T	7	7	6705	6711	0 %	100 %	0 %	0 %	384183664

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.