MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT83

Total Repeats: 1412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017206	ATA	2	6	52	57	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189672
2	NC_017206	T	7	7	105	111	0 %	100 %	0 %	0 %	384189672
3	NC_017206	CAT	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189672
4	NC_017206	T	6	6	261	266	0 %	100 %	0 %	0 %	384189672
5	NC_017206	AT	3	6	380	385	50 %	50 %	0 %	0 %	384189673
6	NC_017206	T	6	6	535	540	0 %	100 %	0 %	0 %	384189673
7	NC_017206	TAG	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189673
8	NC_017206	TTGA	2	8	643	650	25 %	50 %	25 %	0 %	384189673
9	NC_017206	AGA	2	6	669	674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189673
10	NC_017206	GAG	2	6	754	759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189673
11	NC_017206	AATT	2	8	863	870	50 %	50 %	0 %	0 %	384189674
12	NC_017206	T	6	6	1213	1218	0 %	100 %	0 %	0 %	384189675
13	NC_017206	TTG	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189675
14	NC_017206	A	6	6	1284	1289	100 %	0 %	0 %	0 %	384189675
15	NC_017206	AAT	2	6	1309	1314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189675
16	NC_017206	T	7	7	1314	1320	0 %	100 %	0 %	0 %	384189675
17	NC_017206	TAT	2	6	1329	1334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189675
18	NC_017206	T	6	6	1386	1391	0 %	100 %	0 %	0 %	384189675
19	NC_017206	ATTTTT	2	12	1392	1403	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384189675
20	NC_017206	CTTT	2	8	1439	1446	0 %	75 %	0 %	25 %	384189675
21	NC_017206	CTG	2	6	1469	1474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189675
22	NC_017206	TTAT	2	8	1540	1547	25 %	75 %	0 %	0 %	384189675
23	NC_017206	ATTT	2	8	1571	1578	25 %	75 %	0 %	0 %	384189675
24	NC_017206	TTC	2	6	1584	1589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189675
25	NC_017206	A	6	6	1636	1641	100 %	0 %	0 %	0 %	384189675
26	NC_017206	CT	3	6	1642	1647	0 %	50 %	0 %	50 %	384189675
27	NC_017206	CAT	2	6	1704	1709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189675
28	NC_017206	CTT	2	6	1750	1755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189675
29	NC_017206	AGT	2	6	1798	1803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189675
30	NC_017206	AAC	2	6	1839	1844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189675
31	NC_017206	CAC	2	6	1886	1891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189675
32	NC_017206	AGTA	2	8	1897	1904	50 %	25 %	25 %	0 %	384189675
33	NC_017206	T	6	6	1941	1946	0 %	100 %	0 %	0 %	384189675
34	NC_017206	TCT	2	6	1966	1971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189675
35	NC_017206	T	7	7	2043	2049	0 %	100 %	0 %	0 %	384189675
36	NC_017206	CTA	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189675
37	NC_017206	TTTC	2	8	2158	2165	0 %	75 %	0 %	25 %	384189675
38	NC_017206	ACA	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189675
39	NC_017206	TTC	2	6	2193	2198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189675
40	NC_017206	TCT	2	6	2208	2213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189675
41	NC_017206	AC	3	6	2243	2248	50 %	0 %	0 %	50 %	384189675
42	NC_017206	CTT	2	6	2261	2266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189675
43	NC_017206	ATT	2	6	2346	2351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189675
44	NC_017206	TCT	2	6	2356	2361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189675
45	NC_017206	AGT	2	6	2378	2383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189675
46	NC_017206	CTA	2	6	2845	2850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189676
47	NC_017206	TAA	2	6	2922	2927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189676
48	NC_017206	TTC	2	6	2998	3003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189676
49	NC_017206	CGC	2	6	3016	3021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189676
50	NC_017206	GTT	2	6	3037	3042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189676
51	NC_017206	AAG	2	6	3059	3064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189676
52	NC_017206	AAATC	2	10	3084	3093	60 %	20 %	0 %	20 %	384189676
53	NC_017206	ATC	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189676
54	NC_017206	TCA	2	6	3165	3170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189676
55	NC_017206	ATT	2	6	3233	3238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189676
56	NC_017206	T	6	6	3287	3292	0 %	100 %	0 %	0 %	384189676
57	NC_017206	TCTA	2	8	3309	3316	25 %	50 %	0 %	25 %	384189676
58	NC_017206	A	6	6	3316	3321	100 %	0 %	0 %	0 %	384189676
59	NC_017206	A	6	6	3328	3333	100 %	0 %	0 %	0 %	384189676
60	NC_017206	AT	3	6	3392	3397	50 %	50 %	0 %	0 %	384189676
61	NC_017206	GAA	2	6	3421	3426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189676
62	NC_017206	AGA	2	6	3429	3434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189676
63	NC_017206	AATG	2	8	3444	3451	50 %	25 %	25 %	0 %	384189676
64	NC_017206	TGTATA	2	12	3527	3538	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384189676
65	NC_017206	GCC	2	6	3597	3602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189676
66	NC_017206	AAGA	2	8	3621	3628	75 %	0 %	25 %	0 %	384189676
67	NC_017206	T	6	6	3649	3654	0 %	100 %	0 %	0 %	384189676
68	NC_017206	CAA	2	6	3742	3747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189676
69	NC_017206	CAA	2	6	3761	3766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189676
70	NC_017206	A	7	7	3820	3826	100 %	0 %	0 %	0 %	384189676
71	NC_017206	TGAT	2	8	3827	3834	25 %	50 %	25 %	0 %	384189676
72	NC_017206	CAT	2	6	4989	4994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189677
73	NC_017206	T	6	6	5030	5035	0 %	100 %	0 %	0 %	384189677
74	NC_017206	AT	3	6	5052	5057	50 %	50 %	0 %	0 %	384189677
75	NC_017206	TC	3	6	5184	5189	0 %	50 %	0 %	50 %	384189677
76	NC_017206	A	7	7	5233	5239	100 %	0 %	0 %	0 %	384189677
77	NC_017206	GAA	2	6	5292	5297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189677
78	NC_017206	TTCAT	2	10	5328	5337	20 %	60 %	0 %	20 %	384189677
79	NC_017206	CTAT	2	8	5351	5358	25 %	50 %	0 %	25 %	384189677
80	NC_017206	AGG	2	6	5419	5424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189677
81	NC_017206	ACA	2	6	5490	5495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189677
82	NC_017206	CAA	2	6	5522	5527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189677
83	NC_017206	CTT	2	6	5539	5544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189677
84	NC_017206	CGC	2	6	5602	5607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189677
85	NC_017206	AGAA	2	8	5640	5647	75 %	0 %	25 %	0 %	384189677
86	NC_017206	TAT	2	6	5885	5890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189678
87	NC_017206	AGA	2	6	5894	5899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189678
88	NC_017206	TTA	2	6	5904	5909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189678
89	NC_017206	GAA	2	6	5919	5924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189678
90	NC_017206	CAA	2	6	5931	5936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189678
91	NC_017206	T	6	6	5953	5958	0 %	100 %	0 %	0 %	384189678
92	NC_017206	ATG	2	6	5967	5972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189678
93	NC_017206	TGA	2	6	6002	6007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189678
94	NC_017206	TAG	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189678
95	NC_017206	A	6	6	6123	6128	100 %	0 %	0 %	0 %	384189678
96	NC_017206	A	6	6	6153	6158	100 %	0 %	0 %	0 %	384189678
97	NC_017206	AGA	2	6	6194	6199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189678
98	NC_017206	T	6	6	6201	6206	0 %	100 %	0 %	0 %	384189678
99	NC_017206	A	7	7	6212	6218	100 %	0 %	0 %	0 %	384189678
100	NC_017206	A	7	7	6238	6244	100 %	0 %	0 %	0 %	384189678
101	NC_017206	AAT	2	6	6276	6281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189678
102	NC_017206	AT	4	8	6280	6287	50 %	50 %	0 %	0 %	384189678
103	NC_017206	ATA	2	6	6292	6297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189678
104	NC_017206	AAG	2	6	6300	6305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189678
105	NC_017206	AATT	2	8	6325	6332	50 %	50 %	0 %	0 %	384189678
106	NC_017206	A	7	7	6334	6340	100 %	0 %	0 %	0 %	384189678
107	NC_017206	A	6	6	6443	6448	100 %	0 %	0 %	0 %	384189678
108	NC_017206	A	6	6	6461	6466	100 %	0 %	0 %	0 %	384189678
109	NC_017206	GAAT	2	8	6491	6498	50 %	25 %	25 %	0 %	384189678
110	NC_017206	GA	3	6	6502	6507	50 %	0 %	50 %	0 %	384189678
111	NC_017206	GAA	2	6	6704	6709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189679
112	NC_017206	GCC	2	6	6710	6715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189679
113	NC_017206	A	7	7	6779	6785	100 %	0 %	0 %	0 %	384189679
114	NC_017206	ATT	2	6	6800	6805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189679
115	NC_017206	AATTA	2	10	6839	6848	60 %	40 %	0 %	0 %	384189679
116	NC_017206	TA	3	6	7070	7075	50 %	50 %	0 %	0 %	384189680
117	NC_017206	TATT	2	8	7161	7168	25 %	75 %	0 %	0 %	384189680
118	NC_017206	CACAT	2	10	7169	7178	40 %	20 %	0 %	40 %	384189680
119	NC_017206	CAA	2	6	7187	7192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189680
120	NC_017206	TGA	2	6	7203	7208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189680
121	NC_017206	ACA	2	6	7235	7240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189680
122	NC_017206	TCA	2	6	7255	7260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189680
123	NC_017206	ATT	2	6	7291	7296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189680
124	NC_017206	TGAT	2	8	7307	7314	25 %	50 %	25 %	0 %	384189680
125	NC_017206	GAT	2	6	7363	7368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189680
126	NC_017206	A	6	6	7414	7419	100 %	0 %	0 %	0 %	384189680
127	NC_017206	CAA	2	6	7478	7483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189680
128	NC_017206	ATC	2	6	7526	7531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189680
129	NC_017206	AGT	3	9	7566	7574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189680
130	NC_017206	GCG	2	6	7615	7620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189680
131	NC_017206	ATG	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189680
132	NC_017206	AAAAG	2	10	7663	7672	80 %	0 %	20 %	0 %	384189680
133	NC_017206	TTG	2	6	7709	7714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189680
134	NC_017206	AGA	2	6	7755	7760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189680
135	NC_017206	GTT	2	6	7762	7767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189680
136	NC_017206	GAAA	2	8	7821	7828	75 %	0 %	25 %	0 %	384189680
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138	NC_017206	ATT	2	6	7999	8004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189680
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