MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT127

Total Repeats: 2425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017202	TCT	2	6	162	167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183675
2	NC_017202	TAG	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183675
3	NC_017202	CAA	2	6	405	410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183675
4	NC_017202	TTG	2	6	475	480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183675
5	NC_017202	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	384183675
6	NC_017202	GT	3	6	508	513	0 %	50 %	50 %	0 %	384183675
7	NC_017202	ATA	2	6	520	525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183675
8	NC_017202	TATC	2	8	589	596	25 %	50 %	0 %	25 %	384183675
9	NC_017202	ATGA	2	8	600	607	50 %	25 %	25 %	0 %	384183675
10	NC_017202	TAT	2	6	632	637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183675
11	NC_017202	AGG	2	6	650	655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183675
12	NC_017202	AAC	2	6	658	663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183675
13	NC_017202	ATCG	2	8	714	721	25 %	25 %	25 %	25 %	384183675
14	NC_017202	TACAG	2	10	729	738	40 %	20 %	20 %	20 %	384183675
15	NC_017202	TTA	2	6	760	765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183675
16	NC_017202	GTC	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183675
17	NC_017202	TTA	2	6	829	834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183675
18	NC_017202	CTT	2	6	854	859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183675
19	NC_017202	ACT	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183675
20	NC_017202	A	6	6	971	976	100 %	0 %	0 %	0 %	384183675
21	NC_017202	CTGG	2	8	1198	1205	0 %	25 %	50 %	25 %	384183676
22	NC_017202	GAA	2	6	1278	1283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
23	NC_017202	TCT	2	6	1365	1370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
24	NC_017202	TTA	2	6	1386	1391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
25	NC_017202	CAA	2	6	1404	1409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183676
26	NC_017202	AAT	2	6	1422	1427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183676
27	NC_017202	TTC	2	6	1480	1485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
28	NC_017202	TATG	2	8	1490	1497	25 %	50 %	25 %	0 %	384183676
29	NC_017202	AAGCA	2	10	1519	1528	60 %	0 %	20 %	20 %	384183676
30	NC_017202	GTATA	2	10	1547	1556	40 %	40 %	20 %	0 %	384183676
31	NC_017202	A	6	6	1714	1719	100 %	0 %	0 %	0 %	384183676
32	NC_017202	ATG	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
33	NC_017202	CAAA	2	8	1923	1930	75 %	0 %	0 %	25 %	384183676
34	NC_017202	A	6	6	1935	1940	100 %	0 %	0 %	0 %	384183676
35	NC_017202	AGCA	2	8	1957	1964	50 %	0 %	25 %	25 %	384183676
36	NC_017202	A	6	6	1971	1976	100 %	0 %	0 %	0 %	384183676
37	NC_017202	TTA	2	6	1999	2004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
38	NC_017202	GAA	2	6	2103	2108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
39	NC_017202	AAC	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183676
40	NC_017202	TTA	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
41	NC_017202	CGA	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183676
42	NC_017202	TGAAT	2	10	2267	2276	40 %	40 %	20 %	0 %	384183676
43	NC_017202	ATG	3	9	2350	2358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
44	NC_017202	TAT	2	6	2379	2384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
45	NC_017202	CAT	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183676
46	NC_017202	TGA	2	6	2468	2473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
47	NC_017202	ATG	2	6	2488	2493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
48	NC_017202	TA	3	6	2553	2558	50 %	50 %	0 %	0 %	384183676
49	NC_017202	A	6	6	2603	2608	100 %	0 %	0 %	0 %	384183676
50	NC_017202	AGA	2	6	2681	2686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
51	NC_017202	CTT	2	6	2706	2711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
52	NC_017202	CAAT	2	8	2804	2811	50 %	25 %	0 %	25 %	384183676
53	NC_017202	ATG	3	9	2950	2958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
54	NC_017202	ATC	2	6	3011	3016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183676
55	NC_017202	CTT	3	9	3037	3045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
56	NC_017202	TAC	2	6	3179	3184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183676
57	NC_017202	CTT	2	6	3219	3224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
58	NC_017202	CAT	2	6	3225	3230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183676
59	NC_017202	GAA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
60	NC_017202	AC	3	6	3300	3305	50 %	0 %	0 %	50 %	384183676
61	NC_017202	TTG	2	6	3306	3311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183676
62	NC_017202	CTC	2	6	3325	3330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384183676
63	NC_017202	T	6	6	3358	3363	0 %	100 %	0 %	0 %	384183676
64	NC_017202	TGG	2	6	3371	3376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183676
65	NC_017202	AGA	2	6	3377	3382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
66	NC_017202	TAA	2	6	3430	3435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183676
67	NC_017202	TAA	2	6	3608	3613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183676
68	NC_017202	TAAA	2	8	3643	3650	75 %	25 %	0 %	0 %	384183676
69	NC_017202	CAAT	2	8	3658	3665	50 %	25 %	0 %	25 %	384183676
70	NC_017202	T	6	6	3684	3689	0 %	100 %	0 %	0 %	384183676
71	NC_017202	ATT	2	6	3759	3764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
72	NC_017202	GT	3	6	3775	3780	0 %	50 %	50 %	0 %	384183676
73	NC_017202	TA	3	6	3790	3795	50 %	50 %	0 %	0 %	384183676
74	NC_017202	AGA	2	6	3809	3814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
75	NC_017202	AGA	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
76	NC_017202	CTTT	2	8	4179	4186	0 %	75 %	0 %	25 %	384183677
77	NC_017202	ACA	2	6	4214	4219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183677
78	NC_017202	ATA	2	6	4223	4228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183677
79	NC_017202	TCT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
80	NC_017202	TTC	2	6	4271	4276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
81	NC_017202	AGG	2	6	4280	4285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183677
82	NC_017202	ATC	2	6	4367	4372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183677
83	NC_017202	AGA	2	6	4444	4449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183677
84	NC_017202	ATG	2	6	4519	4524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183677
85	NC_017202	AT	3	6	4636	4641	50 %	50 %	0 %	0 %	384183677
86	NC_017202	T	7	7	4711	4717	0 %	100 %	0 %	0 %	384183677
87	NC_017202	GATA	2	8	4749	4756	50 %	25 %	25 %	0 %	384183677
88	NC_017202	CTT	2	6	4797	4802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
89	NC_017202	T	6	6	4877	4882	0 %	100 %	0 %	0 %	384183677
90	NC_017202	T	6	6	4916	4921	0 %	100 %	0 %	0 %	384183677
91	NC_017202	TTTAAT	2	12	4937	4948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183677
92	NC_017202	AT	3	6	4953	4958	50 %	50 %	0 %	0 %	384183677
93	NC_017202	TCT	2	6	4991	4996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
94	NC_017202	ATT	2	6	5077	5082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183677
95	NC_017202	ACCT	2	8	5092	5099	25 %	25 %	0 %	50 %	384183677
96	NC_017202	ACC	2	6	5170	5175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183677
97	NC_017202	AT	3	6	5185	5190	50 %	50 %	0 %	0 %	384183677
98	NC_017202	TCG	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183677
99	NC_017202	AATACG	2	12	5233	5244	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384183677
100	NC_017202	ATA	2	6	5304	5309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183677
101	NC_017202	A	6	6	5313	5318	100 %	0 %	0 %	0 %	384183677
102	NC_017202	T	6	6	5341	5346	0 %	100 %	0 %	0 %	384183677
103	NC_017202	TTA	2	6	5357	5362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183677
104	NC_017202	T	7	7	5515	5521	0 %	100 %	0 %	0 %	384183677
105	NC_017202	TTC	2	6	5527	5532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
106	NC_017202	A	6	6	5534	5539	100 %	0 %	0 %	0 %	384183677
107	NC_017202	A	6	6	5608	5613	100 %	0 %	0 %	0 %	384183677
108	NC_017202	A	6	6	5848	5853	100 %	0 %	0 %	0 %	384183678
109	NC_017202	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	384183678
110	NC_017202	CGG	2	6	6009	6014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384183678
111	NC_017202	AACA	2	8	6193	6200	75 %	0 %	0 %	25 %	384183678
112	NC_017202	CCA	2	6	6262	6267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183678
113	NC_017202	AC	3	6	6365	6370	50 %	0 %	0 %	50 %	384183678
114	NC_017202	AGA	2	6	6384	6389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183678
115	NC_017202	TA	3	6	6592	6597	50 %	50 %	0 %	0 %	384183679
116	NC_017202	T	6	6	6643	6648	0 %	100 %	0 %	0 %	384183679
117	NC_017202	AGA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183679
118	NC_017202	AGG	2	6	6695	6700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183679
119	NC_017202	AG	3	6	6737	6742	50 %	0 %	50 %	0 %	384183679
120	NC_017202	TAA	2	6	6768	6773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183679
121	NC_017202	ATT	2	6	6838	6843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183680
122	NC_017202	AAG	2	6	6853	6858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183680
123	NC_017202	CAG	2	6	6885	6890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183680
124	NC_017202	TAA	2	6	6934	6939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183680
125	NC_017202	AGTG	2	8	7010	7017	25 %	25 %	50 %	0 %	384183680
126	NC_017202	GAC	2	6	7025	7030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183680
127	NC_017202	ACC	2	6	7042	7047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183680
128	NC_017202	A	6	6	7137	7142	100 %	0 %	0 %	0 %	384183680
129	NC_017202	AAAG	2	8	7192	7199	75 %	0 %	25 %	0 %	384183680
130	NC_017202	TGA	2	6	7249	7254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183680
131	NC_017202	GA	3	6	7258	7263	50 %	0 %	50 %	0 %	384183680
132	NC_017202	A	6	6	7627	7632	100 %	0 %	0 %	0 %	384183681
133	NC_017202	ACA	2	6	7636	7641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183681
134	NC_017202	TAA	2	6	7706	7711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183681
135	NC_017202	GATAT	2	10	7714	7723	40 %	40 %	20 %	0 %	384183681
136	NC_017202	AGA	2	6	7726	7731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183681
137	NC_017202	GA	3	6	7730	7735	50 %	0 %	50 %	0 %	384183681
138	NC_017202	AT	3	6	7762	7767	50 %	50 %	0 %	0 %	384183681
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269	NC_017202	CAT	2	6	18414	18419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183690
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273	NC_017202	CTC	2	6	18514	18519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384183690
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