MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 plasmid pMC1

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017189	GAA	2	6	359	364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162395
2	NC_017189	AGA	3	9	406	414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162395
3	NC_017189	ATAC	2	8	415	422	50 %	25 %	0 %	25 %	384162395
4	NC_017189	GTT	2	6	701	706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162396
5	NC_017189	TGC	2	6	750	755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162396
6	NC_017189	AG	3	6	776	781	50 %	0 %	50 %	0 %	384162396
7	NC_017189	T	6	6	798	803	0 %	100 %	0 %	0 %	384162396
8	NC_017189	AG	3	6	809	814	50 %	0 %	50 %	0 %	384162396
9	NC_017189	T	6	6	1026	1031	0 %	100 %	0 %	0 %	384162397
10	NC_017189	GTT	2	6	1052	1057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162397
11	NC_017189	CTC	2	6	1080	1085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384162397
12	NC_017189	TCGT	2	8	1088	1095	0 %	50 %	25 %	25 %	384162397
13	NC_017189	AAG	2	6	1117	1122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162397
14	NC_017189	T	6	6	1159	1164	0 %	100 %	0 %	0 %	384162397
15	NC_017189	TGAT	2	8	1235	1242	25 %	50 %	25 %	0 %	384162398
16	NC_017189	T	7	7	1331	1337	0 %	100 %	0 %	0 %	384162398
17	NC_017189	TAG	2	6	1340	1345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162398
18	NC_017189	TGA	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162399
19	NC_017189	ATA	2	6	1397	1402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162399
20	NC_017189	GTT	2	6	1464	1469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162399
21	NC_017189	TTC	2	6	1487	1492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162399
22	NC_017189	T	6	6	1598	1603	0 %	100 %	0 %	0 %	384162399
23	NC_017189	AT	3	6	1671	1676	50 %	50 %	0 %	0 %	384162399
24	NC_017189	T	6	6	1759	1764	0 %	100 %	0 %	0 %	384162399
25	NC_017189	AAAC	2	8	1773	1780	75 %	0 %	0 %	25 %	384162399
26	NC_017189	TTTC	2	8	1825	1832	0 %	75 %	0 %	25 %	384162399
27	NC_017189	TTG	2	6	1896	1901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162399
28	NC_017189	GTA	2	6	2012	2017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162399
29	NC_017189	TCA	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162399
30	NC_017189	TTC	2	6	2081	2086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162399
31	NC_017189	ATG	2	6	2103	2108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162399
32	NC_017189	TGA	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162399
33	NC_017189	A	6	6	2151	2156	100 %	0 %	0 %	0 %	384162399
34	NC_017189	ATA	2	6	2162	2167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162399
35	NC_017189	TCT	2	6	2190	2195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162399
36	NC_017189	GGCTTT	2	12	2198	2209	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384162399
37	NC_017189	TGT	2	6	2236	2241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162399
38	NC_017189	TGT	2	6	2370	2375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162399
39	NC_017189	TGA	2	6	2377	2382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162399
40	NC_017189	CTT	2	6	2413	2418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162399
41	NC_017189	GACG	2	8	3085	3092	25 %	0 %	50 %	25 %	384162400
42	NC_017189	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162400
43	NC_017189	TG	3	6	3268	3273	0 %	50 %	50 %	0 %	384162400
44	NC_017189	TTG	2	6	3316	3321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162400
45	NC_017189	ACTG	2	8	3365	3372	25 %	25 %	25 %	25 %	384162400
46	NC_017189	GAT	2	6	3416	3421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162400
47	NC_017189	A	6	6	3450	3455	100 %	0 %	0 %	0 %	384162400
48	NC_017189	ATC	2	6	3523	3528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162400
49	NC_017189	TTA	2	6	3543	3548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162400
50	NC_017189	AGA	2	6	3556	3561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162400
51	NC_017189	ATG	2	6	3720	3725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162400
52	NC_017189	TGT	2	6	3776	3781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162400
53	NC_017189	GAT	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162400
54	NC_017189	CGG	2	6	3866	3871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162400
55	NC_017189	GGA	2	6	3914	3919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162400
56	NC_017189	GAA	2	6	3942	3947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162400
57	NC_017189	A	7	7	4024	4030	100 %	0 %	0 %	0 %	384162400
58	NC_017189	GAA	2	6	4179	4184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162401
59	NC_017189	T	6	6	4207	4212	0 %	100 %	0 %	0 %	384162401
60	NC_017189	TGA	2	6	4220	4225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162401
61	NC_017189	GAT	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162401
62	NC_017189	GAA	2	6	4306	4311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162401
63	NC_017189	GCG	2	6	4327	4332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162401
64	NC_017189	TTG	2	6	4337	4342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162401
65	NC_017189	CTG	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162401
66	NC_017189	A	6	6	4476	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	384162401
67	NC_017189	TGA	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162401
68	NC_017189	ATA	2	6	4583	4588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162401
69	NC_017189	AT	3	6	4603	4608	50 %	50 %	0 %	0 %	384162401
70	NC_017189	GTTT	2	8	4652	4659	0 %	75 %	25 %	0 %	384162401
71	NC_017189	AAG	2	6	4696	4701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162401
72	NC_017189	TGAT	2	8	4742	4749	25 %	50 %	25 %	0 %	384162401
73	NC_017189	AAG	2	6	4827	4832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162401
74	NC_017189	TTA	2	6	4851	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162401
75	NC_017189	GGA	2	6	4906	4911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162401
76	NC_017189	CTG	2	6	4916	4921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162401
77	NC_017189	CAG	2	6	4925	4930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162401
78	NC_017189	TA	3	6	4940	4945	50 %	50 %	0 %	0 %	384162401
79	NC_017189	TAA	2	6	4954	4959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162401
80	NC_017189	TCT	2	6	5266	5271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162402
81	NC_017189	CGG	2	6	5296	5301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162402
82	NC_017189	TG	3	6	5311	5316	0 %	50 %	50 %	0 %	384162402
83	NC_017189	A	6	6	5362	5367	100 %	0 %	0 %	0 %	384162402
84	NC_017189	TC	3	6	5394	5399	0 %	50 %	0 %	50 %	384162402
85	NC_017189	TTCT	2	8	5409	5416	0 %	75 %	0 %	25 %	384162402
86	NC_017189	TCA	2	6	5527	5532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162402
87	NC_017189	GCT	2	6	5539	5544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162402
88	NC_017189	TTCA	2	8	5691	5698	25 %	50 %	0 %	25 %	384162402
89	NC_017189	CGG	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162402
90	NC_017189	TGA	2	6	5767	5772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162402
91	NC_017189	CAA	2	6	5941	5946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162403
92	NC_017189	GAT	2	6	5973	5978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162403
93	NC_017189	AG	3	6	5988	5993	50 %	0 %	50 %	0 %	384162403
94	NC_017189	TG	3	6	6025	6030	0 %	50 %	50 %	0 %	384162403
95	NC_017189	CTG	2	6	6051	6056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162403
96	NC_017189	TTC	2	6	6062	6067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162403
97	NC_017189	T	6	6	6107	6112	0 %	100 %	0 %	0 %	384162403
98	NC_017189	TTC	2	6	6125	6130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162403
99	NC_017189	AG	3	6	6198	6203	50 %	0 %	50 %	0 %	384162403
100	NC_017189	T	6	6	6208	6213	0 %	100 %	0 %	0 %	384162403
101	NC_017189	TGC	2	6	6259	6264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162403
102	NC_017189	GTT	2	6	6280	6285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162403
103	NC_017189	TCA	2	6	6309	6314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162403
104	NC_017189	CTG	2	6	6336	6341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162403
105	NC_017189	GCTT	2	8	6467	6474	0 %	50 %	25 %	25 %	384162403
106	NC_017189	TGA	2	6	6489	6494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162403
107	NC_017189	CAG	2	6	6524	6529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162403
108	NC_017189	TCTT	2	8	6555	6562	0 %	75 %	0 %	25 %	384162403
109	NC_017189	CGGA	2	8	6603	6610	25 %	0 %	50 %	25 %	384162403

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.