MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens TA208 chromosome

Total Repeats: 72893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017188	AT	3	6	419	424	50 %	50 %	0 %	0 %	384157613
2	NC_017188	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
3	NC_017188	CTGG	2	8	567	574	0 %	25 %	50 %	25 %	384157613
4	NC_017188	AT	3	6	607	612	50 %	50 %	0 %	0 %	384157613
5	NC_017188	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157613
6	NC_017188	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157613
7	NC_017188	ATCGG	2	10	775	784	20 %	20 %	40 %	20 %	384157613
8	NC_017188	GCA	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
9	NC_017188	TTTA	3	12	849	860	25 %	75 %	0 %	0 %	384157613
10	NC_017188	G	7	7	862	868	0 %	0 %	100 %	0 %	384157613
11	NC_017188	GTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384157613
12	NC_017188	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157613
13	NC_017188	TCA	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157613
14	NC_017188	GAT	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157613
15	NC_017188	AACA	2	8	1079	1086	75 %	0 %	0 %	25 %	384157613
16	NC_017188	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157613
17	NC_017188	CAAA	2	8	1131	1138	75 %	0 %	0 %	25 %	384157613
18	NC_017188	CCG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384157613
19	NC_017188	GAAA	2	8	1268	1275	75 %	0 %	25 %	0 %	384157613
20	NC_017188	GTT	2	6	1375	1380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384157613
21	NC_017188	GCT	2	6	1423	1428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157613
22	NC_017188	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157613
23	NC_017188	CAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
24	NC_017188	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157613
25	NC_017188	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157613
26	NC_017188	GA	3	6	1644	1649	50 %	0 %	50 %	0 %	384157613
27	NC_017188	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157613
28	NC_017188	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157613
29	NC_017188	AGC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
30	NC_017188	CAG	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
31	NC_017188	GAAA	2	8	1725	1732	75 %	0 %	25 %	0 %	384157613
32	NC_017188	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384157613
33	NC_017188	AAC	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157614
34	NC_017188	TCAT	2	8	2100	2107	25 %	50 %	0 %	25 %	384157614
35	NC_017188	AGA	3	9	2114	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157614
36	NC_017188	CGAT	2	8	2140	2147	25 %	25 %	25 %	25 %	384157614
37	NC_017188	TGC	2	6	2164	2169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157614
38	NC_017188	TTC	2	6	2178	2183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157614
39	NC_017188	A	6	6	2196	2201	100 %	0 %	0 %	0 %	384157614
40	NC_017188	AATTT	2	10	2272	2281	40 %	60 %	0 %	0 %	384157614
41	NC_017188	CAT	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157614
42	NC_017188	ATT	2	6	2456	2461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157614
43	NC_017188	CGT	2	6	2537	2542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157614
44	NC_017188	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157614
45	NC_017188	TTA	2	6	2611	2616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157614
46	NC_017188	TTC	2	6	2655	2660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157614
47	NC_017188	GCT	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157614
48	NC_017188	TCG	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157614
49	NC_017188	CTT	2	6	2770	2775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157614
50	NC_017188	GA	3	6	2783	2788	50 %	0 %	50 %	0 %	384157614
51	NC_017188	CAA	2	6	2795	2800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157614
52	NC_017188	TCA	2	6	2844	2849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157614
53	NC_017188	AGT	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157614
54	NC_017188	GCTG	2	8	2885	2892	0 %	25 %	50 %	25 %	384157614
55	NC_017188	TTCA	2	8	2921	2928	25 %	50 %	0 %	25 %	384157614
56	NC_017188	AT	3	6	2936	2941	50 %	50 %	0 %	0 %	384157614
57	NC_017188	ATG	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157614
58	NC_017188	AAAC	2	8	3073	3080	75 %	0 %	0 %	25 %	384157614
59	NC_017188	CGG	2	6	3291	3296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157615
60	NC_017188	GAGC	2	8	3315	3322	25 %	0 %	50 %	25 %	384157615
61	NC_017188	CAA	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157615
62	NC_017188	CGC	2	6	3355	3360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384157615
63	NC_017188	GTC	2	6	3418	3423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157615
64	NC_017188	GC	3	6	3489	3494	0 %	0 %	50 %	50 %	384157616
65	NC_017188	ATC	2	6	3526	3531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157616
66	NC_017188	CGCAC	2	10	3596	3605	20 %	0 %	20 %	60 %	384157616
67	NC_017188	GAAG	2	8	3655	3662	50 %	0 %	50 %	0 %	384157616
68	NC_017188	TGA	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157616
69	NC_017188	A	6	6	3709	3714	100 %	0 %	0 %	0 %	384157616
70	NC_017188	AGC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157616
71	NC_017188	TCAG	2	8	3755	3762	25 %	25 %	25 %	25 %	384157616
72	NC_017188	GAG	3	9	3834	3842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384157616
73	NC_017188	A	6	6	3905	3910	100 %	0 %	0 %	0 %	384157616
74	NC_017188	AGC	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157616
75	NC_017188	AAAAGA	2	12	4197	4208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384157616
76	NC_017188	ATT	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157616
77	NC_017188	GAT	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157616
78	NC_017188	T	6	6	4256	4261	0 %	100 %	0 %	0 %	384157616
79	NC_017188	CAG	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157616
80	NC_017188	ACG	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157616
81	NC_017188	GAA	2	6	4357	4362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157616
82	NC_017188	GAT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157616
83	NC_017188	GAT	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157616
84	NC_017188	CAC	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384157616
85	NC_017188	AGTGA	2	10	4548	4557	40 %	20 %	40 %	0 %	384157616
86	NC_017188	GAC	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157617
87	NC_017188	TCG	2	6	4621	4626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157617
88	NC_017188	GAA	2	6	4665	4670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157617
89	NC_017188	GACA	2	8	4677	4684	50 %	0 %	25 %	25 %	384157617
90	NC_017188	GAAA	2	8	4685	4692	75 %	0 %	25 %	0 %	384157617
91	NC_017188	AGT	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157617
92	NC_017188	CCGT	2	8	4701	4708	0 %	25 %	25 %	50 %	384157617
93	NC_017188	AT	4	8	4747	4754	50 %	50 %	0 %	0 %	384157617
94	NC_017188	GAA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157617
95	NC_017188	CAG	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157618
96	NC_017188	ATG	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157618
97	NC_017188	TCG	2	6	5010	5015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157618
98	NC_017188	ACA	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157618
99	NC_017188	CGGT	2	8	5118	5125	0 %	25 %	50 %	25 %	384157618
100	NC_017188	TCA	2	6	5160	5165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157618
101	NC_017188	TTC	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157618
102	NC_017188	CGG	2	6	5218	5223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157618
103	NC_017188	AAC	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157618
104	NC_017188	TCAT	2	8	5592	5599	25 %	50 %	0 %	25 %	384157618
105	NC_017188	TTGCA	2	10	5649	5658	20 %	40 %	20 %	20 %	384157618
106	NC_017188	GGC	2	6	5720	5725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157618
107	NC_017188	AAG	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157618
108	NC_017188	TGA	2	6	5824	5829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157618
109	NC_017188	GA	3	6	5833	5838	50 %	0 %	50 %	0 %	384157618
110	NC_017188	CAT	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157618
111	NC_017188	TTC	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157618
112	NC_017188	CTT	2	6	5969	5974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157618
113	NC_017188	GGC	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157618
114	NC_017188	A	6	6	6044	6049	100 %	0 %	0 %	0 %	384157618
115	NC_017188	TTC	2	6	6118	6123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157618
116	NC_017188	GCGG	2	8	6170	6177	0 %	0 %	75 %	25 %	384157618
117	NC_017188	GGGAC	2	10	6190	6199	20 %	0 %	60 %	20 %	384157618
118	NC_017188	TC	3	6	6271	6276	0 %	50 %	0 %	50 %	384157618
119	NC_017188	TTA	2	6	6413	6418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157618
120	NC_017188	TTC	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157618
121	NC_017188	ATT	2	6	6446	6451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157618
122	NC_017188	GCC	2	6	6478	6483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384157618
123	NC_017188	GCA	2	6	6496	6501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157618
124	NC_017188	AGC	2	6	6534	6539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157618
125	NC_017188	TGA	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157618
126	NC_017188	AC	3	6	7023	7028	50 %	0 %	0 %	50 %	384157619
127	NC_017188	TCAG	2	8	7050	7057	25 %	25 %	25 %	25 %	384157619
128	NC_017188	TCCT	2	8	7070	7077	0 %	50 %	0 %	50 %	384157619
129	NC_017188	AATG	2	8	7165	7172	50 %	25 %	25 %	0 %	384157619
130	NC_017188	A	6	6	7202	7207	100 %	0 %	0 %	0 %	384157619
131	NC_017188	TCG	2	6	7218	7223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157619
132	NC_017188	ACC	2	6	7242	7247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384157619
133	NC_017188	TTG	2	6	7317	7322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384157619
134	NC_017188	TTCGG	2	10	7337	7346	0 %	40 %	40 %	20 %	384157619
135	NC_017188	TCC	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384157619
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259	NC_017188	A	6	6	16139	16144	100 %	0 %	0 %	0 %	384157624
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261	NC_017188	AGA	2	6	16167	16172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157624
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266	NC_017188	AAG	2	6	16282	16287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157624
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373	NC_017188	T	6	6	23143	23148	0 %	100 %	0 %	0 %	384157631
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381	NC_017188	CT	3	6	23620	23625	0 %	50 %	0 %	50 %	384157632
382	NC_017188	GAA	2	6	23659	23664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157632
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384	NC_017188	TCG	2	6	23798	23803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157632
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387	NC_017188	TGC	2	6	23853	23858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157632
388	NC_017188	GCG	2	6	23912	23917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157632
389	NC_017188	TGAA	2	8	24032	24039	50 %	25 %	25 %	0 %	384157632
390	NC_017188	CAG	2	6	24046	24051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157632
391	NC_017188	GCT	2	6	24118	24123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157632
392	NC_017188	GAAGGT	2	12	24147	24158	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384157632
393	NC_017188	GAT	2	6	24213	24218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157632
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401	NC_017188	GACCT	2	10	24521	24530	20 %	20 %	20 %	40 %	384157632
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