MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p2

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017140	AAAC	2	8	99	106	75 %	0 %	0 %	25 %	384044080
2	NC_017140	AAG	2	6	115	120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044080
3	NC_017140	A	7	7	159	165	100 %	0 %	0 %	0 %	384044080
4	NC_017140	A	8	8	173	180	100 %	0 %	0 %	0 %	384044080
5	NC_017140	TAC	2	6	196	201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044080
6	NC_017140	AAAT	2	8	206	213	75 %	25 %	0 %	0 %	384044080
7	NC_017140	GAAA	2	8	257	264	75 %	0 %	25 %	0 %	384044080
8	NC_017140	GAA	2	6	316	321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044080
9	NC_017140	AAG	2	6	368	373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044080
10	NC_017140	TTC	2	6	418	423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044080
11	NC_017140	ATGA	2	8	1495	1502	50 %	25 %	25 %	0 %	384044081
12	NC_017140	GAA	2	6	1525	1530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
13	NC_017140	TTA	2	6	1607	1612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044081
14	NC_017140	A	6	6	1623	1628	100 %	0 %	0 %	0 %	384044081
15	NC_017140	A	7	7	1688	1694	100 %	0 %	0 %	0 %	384044081
16	NC_017140	TC	3	6	1699	1704	0 %	50 %	0 %	50 %	384044081
17	NC_017140	TCA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044081
18	NC_017140	CA	3	6	1761	1766	50 %	0 %	0 %	50 %	384044081
19	NC_017140	A	7	7	1779	1785	100 %	0 %	0 %	0 %	384044081
20	NC_017140	GAA	2	6	1786	1791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
21	NC_017140	AAT	2	6	1792	1797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044081
22	NC_017140	CAA	2	6	1879	1884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044081
23	NC_017140	GCT	2	6	1927	1932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044081
24	NC_017140	AGA	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
25	NC_017140	AACA	2	8	1978	1985	75 %	0 %	0 %	25 %	384044081
26	NC_017140	GAA	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
27	NC_017140	AAAT	2	8	2030	2037	75 %	25 %	0 %	0 %	384044081
28	NC_017140	ATG	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044081
29	NC_017140	AT	3	6	2061	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	384044081
30	NC_017140	TTC	2	6	2070	2075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044081
31	NC_017140	ACA	2	6	2082	2087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044081
32	NC_017140	AGC	2	6	2109	2114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044081
33	NC_017140	ACA	2	6	2118	2123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044081
34	NC_017140	GAA	3	9	2128	2136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
35	NC_017140	A	8	8	2138	2145	100 %	0 %	0 %	0 %	384044081
36	NC_017140	ATT	2	6	2160	2165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044081
37	NC_017140	AAT	2	6	2547	2552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044082
38	NC_017140	T	6	6	2565	2570	0 %	100 %	0 %	0 %	384044082
39	NC_017140	T	6	6	2585	2590	0 %	100 %	0 %	0 %	384044082
40	NC_017140	TTA	2	6	2625	2630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044082
41	NC_017140	TCT	2	6	2815	2820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044082
42	NC_017140	CAA	2	6	2830	2835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044082
43	NC_017140	A	6	6	2847	2852	100 %	0 %	0 %	0 %	384044082
44	NC_017140	TAA	2	6	2873	2878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044082
45	NC_017140	A	6	6	2877	2882	100 %	0 %	0 %	0 %	384044082
46	NC_017140	TTC	2	6	2883	2888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044082
47	NC_017140	TTTC	2	8	2972	2979	0 %	75 %	0 %	25 %	384044083
48	NC_017140	CAAGTT	2	12	3030	3041	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384044083
49	NC_017140	TC	3	6	3074	3079	0 %	50 %	0 %	50 %	384044083
50	NC_017140	TTTA	2	8	3100	3107	25 %	75 %	0 %	0 %	384044083
51	NC_017140	TCC	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044083
52	NC_017140	AAG	2	6	3341	3346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044084
53	NC_017140	ATC	2	6	3350	3355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044084
54	NC_017140	TCA	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044084
55	NC_017140	ATT	2	6	3689	3694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044084
56	NC_017140	TCA	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044084
57	NC_017140	GCT	3	9	3766	3774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044085
58	NC_017140	CAT	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044085
59	NC_017140	ATCTT	2	10	3810	3819	20 %	60 %	0 %	20 %	384044085
60	NC_017140	T	6	6	3856	3861	0 %	100 %	0 %	0 %	384044085
61	NC_017140	CTT	3	9	3865	3873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044085
62	NC_017140	GTC	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044085
63	NC_017140	TTCT	2	8	3931	3938	0 %	75 %	0 %	25 %	384044085
64	NC_017140	TC	3	6	3941	3946	0 %	50 %	0 %	50 %	384044085
65	NC_017140	TGT	2	6	3972	3977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384044085
66	NC_017140	TTC	2	6	3978	3983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044085
67	NC_017140	TCT	2	6	4005	4010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044085
68	NC_017140	GAA	2	6	4018	4023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044085
69	NC_017140	CTT	2	6	4040	4045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044085
70	NC_017140	GCT	2	6	4494	4499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044086
71	NC_017140	GTG	2	6	4507	4512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384044086
72	NC_017140	ATG	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044086
73	NC_017140	CAA	2	6	4722	4727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044086
74	NC_017140	TGG	2	6	4777	4782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384044086
75	NC_017140	CCAT	2	8	4792	4799	25 %	25 %	0 %	50 %	384044086
76	NC_017140	CAT	2	6	4829	4834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044086
77	NC_017140	AGAA	2	8	4869	4876	75 %	0 %	25 %	0 %	384044086
78	NC_017140	CCAA	2	8	4984	4991	50 %	0 %	0 %	50 %	384044086
79	NC_017140	TTC	2	6	5059	5064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044086
80	NC_017140	GAA	2	6	5102	5107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
81	NC_017140	AGCG	2	8	5118	5125	25 %	0 %	50 %	25 %	384044086
82	NC_017140	CCG	2	6	5186	5191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044086
83	NC_017140	A	6	6	5212	5217	100 %	0 %	0 %	0 %	384044086
84	NC_017140	GAAA	2	8	5219	5226	75 %	0 %	25 %	0 %	384044086
85	NC_017140	AAG	2	6	5299	5304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
86	NC_017140	GAA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
87	NC_017140	CAA	3	9	5394	5402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044086
88	NC_017140	ATA	2	6	5524	5529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044086
89	NC_017140	TGA	2	6	5530	5535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044086
90	NC_017140	CGT	2	6	5538	5543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044086
91	NC_017140	AGC	2	6	5592	5597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044086
92	NC_017140	GAA	3	9	5634	5642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
93	NC_017140	TC	3	6	5665	5670	0 %	50 %	0 %	50 %	384044086
94	NC_017140	AGAA	2	8	5674	5681	75 %	0 %	25 %	0 %	384044086
95	NC_017140	TCA	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044086
96	NC_017140	ACA	2	6	5711	5716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044086
97	NC_017140	AGA	2	6	5750	5755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
98	NC_017140	A	6	6	6019	6024	100 %	0 %	0 %	0 %	384044086
99	NC_017140	A	7	7	6026	6032	100 %	0 %	0 %	0 %	384044086
100	NC_017140	AAAG	2	8	6086	6093	75 %	0 %	25 %	0 %	384044086
101	NC_017140	GAA	2	6	6108	6113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
102	NC_017140	GA	3	6	6139	6144	50 %	0 %	50 %	0 %	384044086
103	NC_017140	GAT	2	6	6174	6179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044086
104	NC_017140	AG	3	6	6204	6209	50 %	0 %	50 %	0 %	384044086
105	NC_017140	CAA	2	6	6300	6305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044086
106	NC_017140	GAA	2	6	6318	6323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
107	NC_017140	CAA	2	6	6330	6335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044086
108	NC_017140	TTA	2	6	6540	6545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044087
109	NC_017140	CTA	2	6	6596	6601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044087
110	NC_017140	ATA	2	6	6618	6623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044087
111	NC_017140	AATTG	2	10	6639	6648	40 %	40 %	20 %	0 %	384044087
112	NC_017140	A	6	6	6670	6675	100 %	0 %	0 %	0 %	384044087
113	NC_017140	A	6	6	6691	6696	100 %	0 %	0 %	0 %	384044087
114	NC_017140	CAA	3	9	6698	6706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044087
115	NC_017140	T	6	6	6727	6732	0 %	100 %	0 %	0 %	384044087
116	NC_017140	ATT	2	6	6741	6746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044087
117	NC_017140	AAG	2	6	6768	6773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044087
118	NC_017140	TAA	2	6	6786	6791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044087
119	NC_017140	TAT	2	6	6795	6800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044087
120	NC_017140	TCC	2	6	6855	6860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044087
121	NC_017140	CA	3	6	6875	6880	50 %	0 %	0 %	50 %	384044087
122	NC_017140	A	6	6	6894	6899	100 %	0 %	0 %	0 %	384044087
123	NC_017140	TCT	2	6	6958	6963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044087
124	NC_017140	GGT	2	6	6976	6981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384044087
125	NC_017140	AT	4	8	7059	7066	50 %	50 %	0 %	0 %	384044087
126	NC_017140	TTG	2	6	7086	7091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384044087
127	NC_017140	TTCT	2	8	7094	7101	0 %	75 %	0 %	25 %	384044087
128	NC_017140	ATA	2	6	7109	7114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044087
129	NC_017140	AAT	2	6	7142	7147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044087
130	NC_017140	ATTT	2	8	7186	7193	25 %	75 %	0 %	0 %	384044088
131	NC_017140	CCT	2	6	7194	7199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044088
132	NC_017140	CTC	2	6	7271	7276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044088
133	NC_017140	CTTT	2	8	7292	7299	0 %	75 %	0 %	25 %	384044088
134	NC_017140	CCTC	2	8	7305	7312	0 %	25 %	0 %	75 %	384044088
135	NC_017140	AT	3	6	7370	7375	50 %	50 %	0 %	0 %	384044088
136	NC_017140	TTAAA	2	10	7387	7396	60 %	40 %	0 %	0 %	384044088
137	NC_017140	T	6	6	7407	7412	0 %	100 %	0 %	0 %	384044088
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.