MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Blastococcus saxobsidens DD2

Total Repeats: 135391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016943	GCA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733552
2	NC_016943	CGC	2	6	374	379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733552
3	NC_016943	CCG	2	6	504	509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733552
4	NC_016943	CGA	3	9	521	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733552
5	NC_016943	CCG	2	6	536	541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733552
6	NC_016943	GC	3	6	566	571	0 %	0 %	50 %	50 %	379733552
7	NC_016943	GAG	2	6	573	578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379733552
8	NC_016943	CGA	2	6	602	607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733552
9	NC_016943	CGT	2	6	638	643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379733552
10	NC_016943	CCG	2	6	649	654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733552
11	NC_016943	CGGC	2	8	684	691	0 %	0 %	50 %	50 %	379733552
12	NC_016943	C	6	6	704	709	0 %	0 %	0 %	100 %	379733552
13	NC_016943	CAC	2	6	782	787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379733552
14	NC_016943	GAC	2	6	849	854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733552
15	NC_016943	TGC	2	6	868	873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379733552
16	NC_016943	TCGACG	2	12	877	888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379733552
17	NC_016943	GCGA	2	8	894	901	25 %	0 %	50 %	25 %	379733552
18	NC_016943	GGT	2	6	915	920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379733552
19	NC_016943	CCG	2	6	938	943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733552
20	NC_016943	CCGG	4	16	952	967	0 %	0 %	50 %	50 %	379733552
21	NC_016943	CGC	2	6	1040	1045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733552
22	NC_016943	GGCCGT	2	12	1046	1057	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379733552
23	NC_016943	AC	3	6	1122	1127	50 %	0 %	0 %	50 %	379733552
24	NC_016943	CTG	2	6	1128	1133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379733552
25	NC_016943	CGC	2	6	1151	1156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733552
26	NC_016943	GTGCGG	2	12	1173	1184	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379733552
27	NC_016943	GAG	2	6	1197	1202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379733552
28	NC_016943	TCA	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379733552
29	NC_016943	CCGG	2	8	1234	1241	0 %	0 %	50 %	50 %	379733552
30	NC_016943	CCG	2	6	1253	1258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733552
31	NC_016943	CTG	2	6	1281	1286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379733552
32	NC_016943	CGA	2	6	1289	1294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733552
33	NC_016943	GC	3	6	1310	1315	0 %	0 %	50 %	50 %	379733552
34	NC_016943	AGG	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379733552
35	NC_016943	TTC	2	6	1335	1340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379733552
36	NC_016943	AGCA	2	8	1368	1375	50 %	0 %	25 %	25 %	379733552
37	NC_016943	CCG	2	6	1398	1403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733552
38	NC_016943	AAG	2	6	1404	1409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379733552
39	NC_016943	GAC	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733552
40	NC_016943	GGA	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379733552
41	NC_016943	TCA	2	6	1456	1461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379733552
42	NC_016943	GAA	2	6	1508	1513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379733552
43	NC_016943	CAA	2	6	1634	1639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379733552
44	NC_016943	GCA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733552
45	NC_016943	CGA	2	6	1691	1696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733552
46	NC_016943	CCG	2	6	1714	1719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733552
47	NC_016943	ATC	2	6	1722	1727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379733552
48	NC_016943	GCC	2	6	1731	1736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733552
49	NC_016943	CGG	2	6	1738	1743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379733552
50	NC_016943	GGA	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379733552
51	NC_016943	CCT	2	6	1870	1875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379733552
52	NC_016943	CGG	2	6	1877	1882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379733552
53	NC_016943	ACCAC	2	10	1888	1897	40 %	0 %	0 %	60 %	379733552
54	NC_016943	AAG	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379733552
55	NC_016943	TGA	2	6	1930	1935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379733552
56	NC_016943	GCGA	2	8	1936	1943	25 %	0 %	50 %	25 %	379733552
57	NC_016943	GCCG	2	8	2283	2290	0 %	0 %	50 %	50 %	379733553
58	NC_016943	TG	3	6	2327	2332	0 %	50 %	50 %	0 %	379733553
59	NC_016943	GAC	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733553
60	NC_016943	CGC	2	6	2369	2374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733553
61	NC_016943	CCG	2	6	2375	2380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733553
62	NC_016943	GTCGAC	2	12	2392	2403	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379733553
63	NC_016943	CGG	2	6	2464	2469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379733553
64	NC_016943	CCA	2	6	2470	2475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379733553
65	NC_016943	CGC	2	6	2485	2490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733553
66	NC_016943	CACC	2	8	2497	2504	25 %	0 %	0 %	75 %	379733553
67	NC_016943	GA	3	6	3051	3056	50 %	0 %	50 %	0 %	379733554
68	NC_016943	GC	3	6	3107	3112	0 %	0 %	50 %	50 %	379733554
69	NC_016943	CTG	2	6	3176	3181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379733554
70	NC_016943	GCT	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379733554
71	NC_016943	CCG	2	6	3321	3326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733554
72	NC_016943	GCA	2	6	3351	3356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733554
73	NC_016943	CG	3	6	3358	3363	0 %	0 %	50 %	50 %	379733554
74	NC_016943	CCCT	2	8	3398	3405	0 %	25 %	0 %	75 %	379733554
75	NC_016943	CCG	2	6	3420	3425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733554
76	NC_016943	TCG	2	6	3432	3437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379733554
77	NC_016943	CGC	2	6	3478	3483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733554
78	NC_016943	CGA	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733554
79	NC_016943	CGA	3	9	3532	3540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733554
80	NC_016943	GCC	2	6	3554	3559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733554
81	NC_016943	ACCG	2	8	3560	3567	25 %	0 %	25 %	50 %	379733554
82	NC_016943	GGC	2	6	3597	3602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379733554
83	NC_016943	CGG	2	6	3621	3626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379733554
84	NC_016943	GCCC	2	8	3637	3644	0 %	0 %	25 %	75 %	379733554
85	NC_016943	GGC	2	6	3658	3663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379733554
86	NC_016943	CGTTGT	2	12	3693	3704	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379733554
87	NC_016943	GAC	3	9	3757	3765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733554
88	NC_016943	GCT	2	6	3769	3774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379733554
89	NC_016943	CG	3	6	3797	3802	0 %	0 %	50 %	50 %	379733554
90	NC_016943	CGC	2	6	3859	3864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733554
91	NC_016943	CGC	2	6	3897	3902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733554
92	NC_016943	GGTCA	2	10	3923	3932	20 %	20 %	40 %	20 %	379733554
93	NC_016943	CCGGG	2	10	3937	3946	0 %	0 %	60 %	40 %	379733554
94	NC_016943	CGA	3	9	3952	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733554
95	NC_016943	GAG	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379733554
96	NC_016943	CGC	2	6	4048	4053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733554
97	NC_016943	CG	3	6	4069	4074	0 %	0 %	50 %	50 %	379733554
98	NC_016943	CGA	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733554
99	NC_016943	CGAC	2	8	4131	4138	25 %	0 %	25 %	50 %	379733554
100	NC_016943	GAC	3	9	4136	4144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733554
101	NC_016943	CGG	2	6	4149	4154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379733554
102	NC_016943	C	6	6	4166	4171	0 %	0 %	0 %	100 %	379733554
103	NC_016943	ACG	3	9	4302	4310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733555
104	NC_016943	GGC	2	6	4356	4361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379733555
105	NC_016943	GCGCC	2	10	4379	4388	0 %	0 %	40 %	60 %	379733555
106	NC_016943	CG	3	6	4413	4418	0 %	0 %	50 %	50 %	379733555
107	NC_016943	TGG	2	6	4453	4458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379733555
108	NC_016943	CAC	2	6	4471	4476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379733555
109	NC_016943	GGT	2	6	4478	4483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379733555
110	NC_016943	CGA	2	6	4510	4515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733555
111	NC_016943	CGT	2	6	4559	4564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379733555
112	NC_016943	CGG	2	6	4571	4576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379733555
113	NC_016943	CGA	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733555
114	NC_016943	ACG	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733555
115	NC_016943	ATG	2	6	4614	4619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379733555
116	NC_016943	CGG	2	6	4658	4663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379733555
117	NC_016943	CGG	2	6	4700	4705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379733555
118	NC_016943	AGG	2	6	4711	4716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379733555
119	NC_016943	GCC	2	6	4754	4759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733555
120	NC_016943	ACG	2	6	4768	4773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733555
121	NC_016943	GCCGG	2	10	4812	4821	0 %	0 %	60 %	40 %	379733555
122	NC_016943	GCT	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379733555
123	NC_016943	GCC	2	6	4908	4913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733555
124	NC_016943	TCG	2	6	4921	4926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379733555
125	NC_016943	GCT	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379733555
126	NC_016943	CTG	2	6	4992	4997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379733555
127	NC_016943	CGC	2	6	5117	5122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733555
128	NC_016943	TCC	2	6	5142	5147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379733555
129	NC_016943	GAC	2	6	5154	5159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733555
130	NC_016943	CGA	2	6	5164	5169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733555
131	NC_016943	CGC	2	6	5180	5185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733555
132	NC_016943	CGG	2	6	5201	5206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379733555
133	NC_016943	GC	3	6	5216	5221	0 %	0 %	50 %	50 %	379733555
134	NC_016943	AGG	2	6	5233	5238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379733555
135	NC_016943	TCG	2	6	5359	5364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379733556
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263	NC_016943	CCG	2	6	8678	8683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733559
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390	NC_016943	GCA	2	6	12579	12584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733561
391	NC_016943	ACG	2	6	12591	12596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733561
392	NC_016943	GAC	2	6	12613	12618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733561
393	NC_016943	CGC	2	6	12664	12669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733561
394	NC_016943	GCCG	2	8	12741	12748	0 %	0 %	50 %	50 %	379733561
395	NC_016943	GTCG	2	8	12792	12799	0 %	25 %	50 %	25 %	379733561
396	NC_016943	GTA	2	6	12841	12846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379733561
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404	NC_016943	CAGG	2	8	13042	13049	25 %	0 %	50 %	25 %	379733561
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412	NC_016943	CGGG	2	8	13701	13708	0 %	0 %	75 %	25 %	379733562
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419	NC_016943	CAA	2	6	13987	13992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379733562
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421	NC_016943	CCGCA	2	10	14079	14088	20 %	0 %	20 %	60 %	379733562
422	NC_016943	CCGA	2	8	14117	14124	25 %	0 %	25 %	50 %	379733562
423	NC_016943	ACG	2	6	14139	14144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733562
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496	NC_016943	CGG	2	6	16816	16821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379733563
497	NC_016943	CGA	2	6	16843	16848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379733563
498	NC_016943	CGC	2	6	16891	16896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379733563
499	NC_016943	CCTCG	2	10	16966	16975	0 %	20 %	20 %	60 %	379733563
500	NC_016943	AGCGGC	2	12	16980	16991	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379733563

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