MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 chromosome 1

Total Repeats: 75390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016589	GGCG	2	8	762	769	0 %	0 %	75 %	25 %	377819445
2	NC_016589	CG	3	6	768	773	0 %	0 %	50 %	50 %	377819445
3	NC_016589	GTG	2	6	811	816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377819445
4	NC_016589	CGA	2	6	840	845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819445
5	NC_016589	CTA	2	6	855	860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377819445
6	NC_016589	CTG	2	6	874	879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819445
7	NC_016589	CGA	2	6	885	890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819445
8	NC_016589	CGCA	2	8	916	923	25 %	0 %	25 %	50 %	377819445
9	NC_016589	TTC	2	6	931	936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377819445
10	NC_016589	TCG	2	6	953	958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819445
11	NC_016589	ATC	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377819445
12	NC_016589	CGA	2	6	1017	1022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819445
13	NC_016589	TC	3	6	1031	1036	0 %	50 %	0 %	50 %	377819445
14	NC_016589	GCC	2	6	1068	1073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819445
15	NC_016589	TTC	2	6	1150	1155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377819445
16	NC_016589	GC	3	6	1196	1201	0 %	0 %	50 %	50 %	377819445
17	NC_016589	CTG	2	6	1279	1284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819445
18	NC_016589	AGA	2	6	1322	1327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377819445
19	NC_016589	ACA	2	6	1343	1348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377819445
20	NC_016589	GC	3	6	1393	1398	0 %	0 %	50 %	50 %	377819445
21	NC_016589	CGG	2	6	1470	1475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819445
22	NC_016589	TGC	2	6	1493	1498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819445
23	NC_016589	CGG	2	6	1517	1522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819445
24	NC_016589	ACG	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819445
25	NC_016589	TCT	2	6	1883	1888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377819446
26	NC_016589	CGC	2	6	1923	1928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819446
27	NC_016589	CGAC	2	8	1993	2000	25 %	0 %	25 %	50 %	377819446
28	NC_016589	CCA	2	6	2056	2061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377819446
29	NC_016589	CGC	2	6	2066	2071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819446
30	NC_016589	GC	3	6	2070	2075	0 %	0 %	50 %	50 %	377819446
31	NC_016589	GCT	2	6	2078	2083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819446
32	NC_016589	TGCG	2	8	2092	2099	0 %	25 %	50 %	25 %	377819446
33	NC_016589	CGC	2	6	2186	2191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819446
34	NC_016589	CGA	2	6	2192	2197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819446
35	NC_016589	GCA	2	6	2297	2302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819446
36	NC_016589	TAC	2	6	2313	2318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377819446
37	NC_016589	TGC	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819446
38	NC_016589	GTG	2	6	2337	2342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377819446
39	NC_016589	CGAC	2	8	2368	2375	25 %	0 %	25 %	50 %	377819446
40	NC_016589	TCG	2	6	2394	2399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819446
41	NC_016589	CG	3	6	2420	2425	0 %	0 %	50 %	50 %	377819446
42	NC_016589	ATC	2	6	2436	2441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377819446
43	NC_016589	CGA	3	9	2486	2494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819446
44	NC_016589	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819446
45	NC_016589	TCG	2	6	2563	2568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819446
46	NC_016589	GC	3	6	2660	2665	0 %	0 %	50 %	50 %	377819446
47	NC_016589	TCG	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819446
48	NC_016589	GAA	2	6	2766	2771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377819446
49	NC_016589	GC	3	6	2893	2898	0 %	0 %	50 %	50 %	377819446
50	NC_016589	TCA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377819446
51	NC_016589	ACA	2	6	3110	3115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377819447
52	NC_016589	ACA	2	6	3122	3127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377819447
53	NC_016589	TCG	2	6	3139	3144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819447
54	NC_016589	CGA	2	6	3261	3266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819447
55	NC_016589	CGA	2	6	3285	3290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819447
56	NC_016589	CGT	2	6	3297	3302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819447
57	NC_016589	CGA	2	6	3369	3374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819447
58	NC_016589	AGCGC	2	10	3389	3398	20 %	0 %	40 %	40 %	377819447
59	NC_016589	GGC	2	6	3430	3435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819447
60	NC_016589	GGC	2	6	3466	3471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819447
61	NC_016589	GGCGTG	2	12	3478	3489	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	377819447
62	NC_016589	CGTG	2	8	3491	3498	0 %	25 %	50 %	25 %	377819447
63	NC_016589	AAG	2	6	3544	3549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377819447
64	NC_016589	CG	4	8	3564	3571	0 %	0 %	50 %	50 %	377819447
65	NC_016589	CGT	2	6	3573	3578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819447
66	NC_016589	TCG	2	6	3593	3598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819447
67	NC_016589	TGT	2	6	3630	3635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377819447
68	NC_016589	AAC	2	6	3754	3759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377819447
69	NC_016589	GCGT	2	8	3761	3768	0 %	25 %	50 %	25 %	377819447
70	NC_016589	GCG	2	6	3821	3826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819447
71	NC_016589	TCG	2	6	3836	3841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819447
72	NC_016589	CAA	2	6	3849	3854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377819447
73	NC_016589	TGC	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819447
74	NC_016589	AAC	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377819447
75	NC_016589	CGG	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819447
76	NC_016589	GC	3	6	4017	4022	0 %	0 %	50 %	50 %	377819447
77	NC_016589	TCA	2	6	4037	4042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377819447
78	NC_016589	TCG	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819447
79	NC_016589	GAA	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377819447
80	NC_016589	GAC	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819447
81	NC_016589	CGA	2	6	4098	4103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819447
82	NC_016589	CGTG	2	8	4121	4128	0 %	25 %	50 %	25 %	377819447
83	NC_016589	GTC	2	6	4185	4190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819447
84	NC_016589	GC	4	8	4197	4204	0 %	0 %	50 %	50 %	377819447
85	NC_016589	GAA	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377819447
86	NC_016589	TCG	2	6	4217	4222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819447
87	NC_016589	ACG	2	6	4259	4264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819447
88	NC_016589	ATC	2	6	4270	4275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377819447
89	NC_016589	TCG	2	6	4286	4291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819447
90	NC_016589	GCG	2	6	4294	4299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819447
91	NC_016589	GC	3	6	4315	4320	0 %	0 %	50 %	50 %	377819447
92	NC_016589	CGC	2	6	4339	4344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819447
93	NC_016589	TCG	2	6	4427	4432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819447
94	NC_016589	CGG	2	6	4442	4447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819447
95	NC_016589	GC	3	6	4528	4533	0 %	0 %	50 %	50 %	377819447
96	NC_016589	CAT	4	12	4638	4649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377819447
97	NC_016589	GC	3	6	4670	4675	0 %	0 %	50 %	50 %	377819447
98	NC_016589	TTC	2	6	4699	4704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377819447
99	NC_016589	TCG	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819447
100	NC_016589	TATATC	2	12	4738	4749	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	377819447
101	NC_016589	CCG	2	6	4756	4761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819447
102	NC_016589	ACTG	2	8	4857	4864	25 %	25 %	25 %	25 %	377819447
103	NC_016589	CGAG	2	8	4865	4872	25 %	0 %	50 %	25 %	377819447
104	NC_016589	GCGT	2	8	4914	4921	0 %	25 %	50 %	25 %	377819447
105	NC_016589	GGT	2	6	4938	4943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377819447
106	NC_016589	ACG	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819447
107	NC_016589	ATC	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377819447
108	NC_016589	GCG	2	6	5026	5031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819447
109	NC_016589	GCT	2	6	5032	5037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819447
110	NC_016589	GCG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819447
111	NC_016589	TCA	2	6	5151	5156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377819447
112	NC_016589	CCG	2	6	5201	5206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819447
113	NC_016589	AGC	2	6	5213	5218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819447
114	NC_016589	CGG	2	6	5228	5233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819447
115	NC_016589	GCG	2	6	5276	5281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819447
116	NC_016589	CGCGGA	2	12	5331	5342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	377819447
117	NC_016589	AGC	2	6	5357	5362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819447
118	NC_016589	AGC	2	6	5393	5398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819447
119	NC_016589	ACG	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819447
120	NC_016589	GCG	2	6	5427	5432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819447
121	NC_016589	CTG	2	6	5434	5439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819447
122	NC_016589	GCG	2	6	5464	5469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819447
123	NC_016589	GCGG	2	8	5541	5548	0 %	0 %	75 %	25 %	377819447
124	NC_016589	CTT	2	6	5908	5913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377819448
125	NC_016589	CCCA	2	8	5919	5926	25 %	0 %	0 %	75 %	377819448
126	NC_016589	CGC	2	6	6100	6105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819448
127	NC_016589	CG	3	6	6118	6123	0 %	0 %	50 %	50 %	377819448
128	NC_016589	GA	3	6	6154	6159	50 %	0 %	50 %	0 %	377819448
129	NC_016589	CCG	3	9	6202	6210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819448
130	NC_016589	ATC	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377819448
131	NC_016589	CGAG	2	8	6229	6236	25 %	0 %	50 %	25 %	377819448
132	NC_016589	CCA	2	6	6250	6255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377819448
133	NC_016589	CG	3	6	6293	6298	0 %	0 %	50 %	50 %	377819448
134	NC_016589	CGC	2	6	6332	6337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819448
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245	NC_016589	GC	3	6	11050	11055	0 %	0 %	50 %	50 %	377819452
246	NC_016589	GAA	2	6	11060	11065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377819452
247	NC_016589	TCGC	2	8	11078	11085	0 %	25 %	25 %	50 %	377819452
248	NC_016589	GCGCA	2	10	11126	11135	20 %	0 %	40 %	40 %	377819452
249	NC_016589	AGTGG	2	10	11140	11149	20 %	20 %	60 %	0 %	377819452
250	NC_016589	CGA	2	6	11158	11163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819452
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253	NC_016589	CGG	2	6	11221	11226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819452
254	NC_016589	GC	3	6	11262	11267	0 %	0 %	50 %	50 %	377819452
255	NC_016589	ACGT	2	8	11330	11337	25 %	25 %	25 %	25 %	377819452
256	NC_016589	CGAA	2	8	11344	11351	50 %	0 %	25 %	25 %	377819452
257	NC_016589	CCG	3	9	11352	11360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819452
258	NC_016589	GCG	2	6	11416	11421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377819452
259	NC_016589	GCC	2	6	11471	11476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819453
260	NC_016589	CG	3	6	11487	11492	0 %	0 %	50 %	50 %	377819453
261	NC_016589	GCCCGC	2	12	11521	11532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819453
262	NC_016589	CGC	2	6	11536	11541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819453
263	NC_016589	CGAG	2	8	11544	11551	25 %	0 %	50 %	25 %	377819453
264	NC_016589	CGA	2	6	11598	11603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819453
265	NC_016589	GCGCC	2	10	11604	11613	0 %	0 %	40 %	60 %	377819453
266	NC_016589	GCC	2	6	11659	11664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819453
267	NC_016589	TTCG	2	8	11667	11674	0 %	50 %	25 %	25 %	377819453
268	NC_016589	CG	3	6	11673	11678	0 %	0 %	50 %	50 %	377819453
269	NC_016589	GC	3	6	11679	11684	0 %	0 %	50 %	50 %	377819453
270	NC_016589	AAG	2	6	11717	11722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377819453
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286	NC_016589	CG	3	6	12160	12165	0 %	0 %	50 %	50 %	377819453
287	NC_016589	GCC	2	6	12170	12175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819453
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294	NC_016589	CGAT	2	8	12354	12361	25 %	25 %	25 %	25 %	377819453
295	NC_016589	AATGC	2	10	12383	12392	40 %	20 %	20 %	20 %	377819453
296	NC_016589	CGA	3	9	12393	12401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819453
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373	NC_016589	CCGG	2	8	17482	17489	0 %	0 %	50 %	50 %	377819458
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375	NC_016589	AGC	2	6	17526	17531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377819458
376	NC_016589	CGT	2	6	17603	17608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819458
377	NC_016589	CG	3	6	17695	17700	0 %	0 %	50 %	50 %	377819458
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381	NC_016589	TGC	2	6	17874	17879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377819458
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384	NC_016589	CATCGA	2	12	18016	18027	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	377819458
385	NC_016589	GCC	3	9	18032	18040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377819458
386	NC_016589	CG	3	6	18041	18046	0 %	0 %	50 %	50 %	377819458
387	NC_016589	GCGT	2	8	18106	18113	0 %	25 %	50 %	25 %	377819458
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500	NC_016589	CG	3	6	22959	22964	0 %	0 %	50 %	50 %	377819461

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