MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus coagulans 36D1 chromosome

Total Repeats: 58724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19003	NC_016023	TGC	2	6	1133879	1133884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347751478
19004	NC_016023	CTG	2	6	1133947	1133952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347751478
19005	NC_016023	CAT	2	6	1133982	1133987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347751478
19006	NC_016023	ACG	2	6	1134062	1134067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347751478
19007	NC_016023	ACG	2	6	1134137	1134142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347751478
19008	NC_016023	GCA	2	6	1134168	1134173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347751478
19009	NC_016023	CTG	2	6	1134182	1134187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347751478
19010	NC_016023	CTC	2	6	1134188	1134193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347751478
19011	NC_016023	CGAT	2	8	1134224	1134231	25 %	25 %	25 %	25 %	347751478
19012	NC_016023	GCA	2	6	1134244	1134249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347751478
19013	NC_016023	TTTC	2	8	1134287	1134294	0 %	75 %	0 %	25 %	347751478
19014	NC_016023	ATC	2	6	1134304	1134309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347751478
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19016	NC_016023	GAA	2	6	1134478	1134483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347751478
19017	NC_016023	CAT	2	6	1134798	1134803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347751479
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19019	NC_016023	TCAGCT	2	12	1134950	1134961	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347751479
19020	NC_016023	AGA	2	6	1135065	1135070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347751479
19021	NC_016023	ATCC	2	8	1135111	1135118	25 %	25 %	0 %	50 %	347751479
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19024	NC_016023	T	6	6	1135211	1135216	0 %	100 %	0 %	0 %	347751479
19025	NC_016023	ATT	2	6	1135244	1135249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347751479
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19117	NC_016023	GTA	2	6	1140160	1140165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347751483
19118	NC_016023	GAT	2	6	1140188	1140193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347751483
19119	NC_016023	CAT	2	6	1140247	1140252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347751483
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19232	NC_016023	TCA	2	6	1147025	1147030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347751489
19233	NC_016023	CAT	2	6	1147047	1147052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347751489
19234	NC_016023	GCT	2	6	1147056	1147061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347751489
19235	NC_016023	CGC	2	6	1147262	1147267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347751489
19236	NC_016023	TGT	2	6	1147303	1147308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347751489
19237	NC_016023	TGA	2	6	1147401	1147406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347751489
19238	NC_016023	AGC	2	6	1147463	1147468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347751489
19239	NC_016023	TCCGCT	2	12	1147472	1147483	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	347751489
19240	NC_016023	AGA	2	6	1147493	1147498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347751489
19241	NC_016023	C	6	6	1147514	1147519	0 %	0 %	0 %	100 %	347751489
19242	NC_016023	TCAA	2	8	1147556	1147563	50 %	25 %	0 %	25 %	347751489
19243	NC_016023	T	6	6	1147594	1147599	0 %	100 %	0 %	0 %	347751489
19244	NC_016023	TGA	2	6	1147787	1147792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347751490
19245	NC_016023	A	6	6	1147825	1147830	100 %	0 %	0 %	0 %	347751490
19246	NC_016023	CAC	2	6	1147854	1147859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347751490
19247	NC_016023	ATTT	2	8	1147892	1147899	25 %	75 %	0 %	0 %	347751490
19248	NC_016023	TTTG	2	8	1147965	1147972	0 %	75 %	25 %	0 %	347751490
19249	NC_016023	T	6	6	1148008	1148013	0 %	100 %	0 %	0 %	347751490
19250	NC_016023	TCA	2	6	1148087	1148092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347751490
19251	NC_016023	TAC	2	6	1148107	1148112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347751490
19252	NC_016023	TTGC	2	8	1148374	1148381	0 %	50 %	25 %	25 %	347751491
19253	NC_016023	TTG	2	6	1148425	1148430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347751491
19254	NC_016023	CTT	2	6	1148436	1148441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347751491
19255	NC_016023	GAA	2	6	1148461	1148466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347751491
19256	NC_016023	GCCG	2	8	1148469	1148476	0 %	0 %	50 %	50 %	347751491
19257	NC_016023	T	6	6	1148480	1148485	0 %	100 %	0 %	0 %	347751491
19258	NC_016023	GT	3	6	1148498	1148503	0 %	50 %	50 %	0 %	347751491
19259	NC_016023	GGA	2	6	1148550	1148555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347751491
19260	NC_016023	CTTG	2	8	1148572	1148579	0 %	50 %	25 %	25 %	347751491
19261	NC_016023	TG	3	6	1148587	1148592	0 %	50 %	50 %	0 %	347751491
19262	NC_016023	CAG	2	6	1148634	1148639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347751491
19263	NC_016023	ATGCCG	2	12	1148956	1148967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347751492
19264	NC_016023	CCG	3	9	1148965	1148973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347751492
19265	NC_016023	T	6	6	1149008	1149013	0 %	100 %	0 %	0 %	347751492
19266	NC_016023	CCG	2	6	1149085	1149090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347751492
19267	NC_016023	CTT	2	6	1149182	1149187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347751492
19268	NC_016023	AGC	2	6	1149211	1149216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347751492
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19270	NC_016023	ATG	2	6	1149247	1149252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347751492
19271	NC_016023	T	7	7	1149307	1149313	0 %	100 %	0 %	0 %	347751492
19272	NC_016023	ACA	2	6	1149340	1149345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347751492
19273	NC_016023	CTG	2	6	1149380	1149385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347751492
19274	NC_016023	CGT	2	6	1149438	1149443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347751492
19275	NC_016023	CTT	2	6	1149484	1149489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347751492
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19278	NC_016023	GCA	2	6	1149677	1149682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347751492
19279	NC_016023	CCGCC	2	10	1149764	1149773	0 %	0 %	20 %	80 %	347751492
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19282	NC_016023	GCA	2	6	1149814	1149819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347751492
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19286	NC_016023	GCCGG	2	10	1149908	1149917	0 %	0 %	60 %	40 %	347751492
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19295	NC_016023	TGA	2	6	1150685	1150690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347751493
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19298	NC_016023	TC	3	6	1150747	1150752	0 %	50 %	0 %	50 %	347751493
19299	NC_016023	ATGC	2	8	1150815	1150822	25 %	25 %	25 %	25 %	347751493
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19303	NC_016023	GGTA	2	8	1151126	1151133	25 %	25 %	50 %	0 %	347751493
19304	NC_016023	CGT	2	6	1151301	1151306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347751493
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19321	NC_016023	A	6	6	1152234	1152239	100 %	0 %	0 %	0 %	347751494
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19323	NC_016023	A	6	6	1152321	1152326	100 %	0 %	0 %	0 %	347751494
19324	NC_016023	GGC	2	6	1152373	1152378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347751494
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19326	NC_016023	GTGCTC	2	12	1152512	1152523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347751494
19327	NC_016023	GGGC	2	8	1152576	1152583	0 %	0 %	75 %	25 %	347751494
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19331	NC_016023	TTC	2	6	1152737	1152742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347751494
19332	NC_016023	A	6	6	1152768	1152773	100 %	0 %	0 %	0 %	347751494
19333	NC_016023	ACG	2	6	1153185	1153190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347751494
19334	NC_016023	TTGCC	2	10	1153234	1153243	0 %	40 %	20 %	40 %	347751494
19335	NC_016023	TAA	2	6	1153273	1153278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347751494
19336	NC_016023	AGG	2	6	1153291	1153296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347751494
19337	NC_016023	ACAG	2	8	1153378	1153385	50 %	0 %	25 %	25 %	347751495
19338	NC_016023	ATA	2	6	1153386	1153391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347751495
19339	NC_016023	TA	3	6	1153404	1153409	50 %	50 %	0 %	0 %	347751495
19340	NC_016023	AT	3	6	1153451	1153456	50 %	50 %	0 %	0 %	347751495
19341	NC_016023	CTTT	2	8	1153509	1153516	0 %	75 %	0 %	25 %	347751495
19342	NC_016023	CT	3	6	1153559	1153564	0 %	50 %	0 %	50 %	347751495
19343	NC_016023	TTC	3	9	1153592	1153600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347751495
19344	NC_016023	GTA	2	6	1153650	1153655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347751495
19345	NC_016023	TCTT	2	8	1153691	1153698	0 %	75 %	0 %	25 %	347751495
19346	NC_016023	CTT	2	6	1153720	1153725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347751495
19347	NC_016023	TG	3	6	1153843	1153848	0 %	50 %	50 %	0 %	347751495
19348	NC_016023	ATC	3	9	1153849	1153857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347751495
19349	NC_016023	TC	3	6	1153859	1153864	0 %	50 %	0 %	50 %	347751495
19350	NC_016023	AATG	2	8	1153893	1153900	50 %	25 %	25 %	0 %	347751495
19351	NC_016023	CTT	2	6	1153930	1153935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347751495
19352	NC_016023	CAT	2	6	1153958	1153963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347751495
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19464	NC_016023	CTC	2	6	1160720	1160725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347751499
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