MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 chromosome

Total Repeats: 23080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_015921	CTT	2	6	897258	897263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128138
23002	NC_015921	AAAT	2	8	897277	897284	75 %	25 %	0 %	0 %	343128138
23003	NC_015921	ATT	2	6	897348	897353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128138
23004	NC_015921	ATA	2	6	897372	897377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128138
23005	NC_015921	AAGAG	2	10	897406	897415	60 %	0 %	40 %	0 %	343128138
23006	NC_015921	TGA	2	6	897439	897444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128138
23007	NC_015921	TAT	2	6	897469	897474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128138
23008	NC_015921	TTTA	2	8	897493	897500	25 %	75 %	0 %	0 %	343128138
23009	NC_015921	AATA	2	8	897538	897545	75 %	25 %	0 %	0 %	343128138
23010	NC_015921	AG	3	6	897569	897574	50 %	0 %	50 %	0 %	343128138
23011	NC_015921	CCATT	2	10	897604	897613	20 %	40 %	0 %	40 %	343128138
23012	NC_015921	CTT	2	6	897657	897662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128138
23013	NC_015921	TGA	2	6	897886	897891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128138
23014	NC_015921	TAA	2	6	897934	897939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128138
23015	NC_015921	AGA	2	6	897952	897957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128138
23016	NC_015921	AGCTA	2	10	897961	897970	40 %	20 %	20 %	20 %	343128138
23017	NC_015921	ATA	2	6	898010	898015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128138
23018	NC_015921	AG	3	6	898049	898054	50 %	0 %	50 %	0 %	343128138
23019	NC_015921	ATG	2	6	898062	898067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128138
23020	NC_015921	AGT	2	6	898099	898104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128138
23021	NC_015921	GAA	2	6	898142	898147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128138
23022	NC_015921	GTG	2	6	898197	898202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343128138
23023	NC_015921	GGA	2	6	898234	898239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343128138
23024	NC_015921	A	6	6	898393	898398	100 %	0 %	0 %	0 %	343128139
23025	NC_015921	CAA	2	6	898470	898475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343128139
23026	NC_015921	GATA	2	8	898573	898580	50 %	25 %	25 %	0 %	343128139
23027	NC_015921	ATG	2	6	898605	898610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128139
23028	NC_015921	ATT	2	6	898659	898664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128139
23029	NC_015921	ACCCA	2	10	898704	898713	40 %	0 %	0 %	60 %	343128139
23030	NC_015921	TAT	2	6	898831	898836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128139
23031	NC_015921	TTAAGG	2	12	898896	898907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128139
23032	NC_015921	AG	3	6	898918	898923	50 %	0 %	50 %	0 %	343128139
23033	NC_015921	ATTACA	2	12	898934	898945	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343128139
23034	NC_015921	AGA	2	6	898954	898959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128139
23035	NC_015921	TGT	2	6	898978	898983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128139
23036	NC_015921	GA	3	6	899010	899015	50 %	0 %	50 %	0 %	343128139
23037	NC_015921	TCT	2	6	899038	899043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128139
23038	NC_015921	TAA	2	6	899059	899064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128139
23039	NC_015921	GAT	2	6	899087	899092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128139
23040	NC_015921	AGA	2	6	899191	899196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128139
23041	NC_015921	GTT	2	6	899219	899224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128139
23042	NC_015921	TAT	2	6	899263	899268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128139
23043	NC_015921	ATA	2	6	899284	899289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128139
23044	NC_015921	AGT	2	6	899354	899359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128140
23045	NC_015921	AAT	2	6	899365	899370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128140
23046	NC_015921	TTG	2	6	899475	899480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128140
23047	NC_015921	TGC	2	6	899572	899577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343128140
23048	NC_015921	TTGTTT	2	12	899586	899597	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	343128140
23049	NC_015921	TTG	2	6	899601	899606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128140
23050	NC_015921	ATT	2	6	899621	899626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128140
23051	NC_015921	TTAA	2	8	899663	899670	50 %	50 %	0 %	0 %	343128140
23052	NC_015921	T	6	6	899718	899723	0 %	100 %	0 %	0 %	343128140
23053	NC_015921	TGG	2	6	899728	899733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343128140
23054	NC_015921	CCTT	2	8	899761	899768	0 %	50 %	0 %	50 %	343128140
23055	NC_015921	TAG	2	6	899793	899798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128140
23056	NC_015921	TTG	2	6	899817	899822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128140
23057	NC_015921	TTTTA	2	10	899933	899942	20 %	80 %	0 %	0 %	343128140
23058	NC_015921	TAT	2	6	900056	900061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128140
23059	NC_015921	A	6	6	900074	900079	100 %	0 %	0 %	0 %	343128140
23060	NC_015921	ATA	2	6	900102	900107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128140
23061	NC_015921	TTGG	2	8	900201	900208	0 %	50 %	50 %	0 %	343128140
23062	NC_015921	TGT	2	6	900228	900233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128140
23063	NC_015921	TAT	2	6	900247	900252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128140
23064	NC_015921	GCT	2	6	900329	900334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343128140
23065	NC_015921	GAT	2	6	900374	900379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128140
23066	NC_015921	TGC	2	6	900406	900411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343128140
23067	NC_015921	T	6	6	900418	900423	0 %	100 %	0 %	0 %	343128140
23068	NC_015921	ATT	2	6	900464	900469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128140
23069	NC_015921	TGT	2	6	900487	900492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128140
23070	NC_015921	TCA	2	6	900500	900505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128140
23071	NC_015921	AAT	2	6	900529	900534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128140
23072	NC_015921	T	6	6	900550	900555	0 %	100 %	0 %	0 %	343128140
23073	NC_015921	GTT	2	6	900575	900580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128140
23074	NC_015921	CTT	2	6	900594	900599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128140
23075	NC_015921	TTA	2	6	900606	900611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128140
23076	NC_015921	TAA	2	6	900615	900620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128140
23077	NC_015921	CACC	2	8	900621	900628	25 %	0 %	0 %	75 %	343128140
23078	NC_015921	GTTT	2	8	900688	900695	0 %	75 %	25 %	0 %	343128140
23079	NC_015921	ATT	2	6	900700	900705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128140
23080	NC_015921	TTA	2	6	900735	900740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128140

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.