MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-3

Total Repeats: 412

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015916	ATT	2	6	280	285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128142
2	NC_015916	A	6	6	363	368	100 %	0 %	0 %	0 %	343128142
3	NC_015916	ATATC	2	10	383	392	40 %	40 %	0 %	20 %	343128142
4	NC_015916	ATC	2	6	408	413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128142
5	NC_015916	ATATA	2	10	1291	1300	60 %	40 %	0 %	0 %	343128143
6	NC_015916	T	7	7	1317	1323	0 %	100 %	0 %	0 %	343128143
7	NC_015916	A	6	6	1388	1393	100 %	0 %	0 %	0 %	343128143
8	NC_015916	CAG	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343128143
9	NC_015916	AAG	2	6	1449	1454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128143
10	NC_015916	CAAATC	2	12	1455	1466	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	343128143
11	NC_015916	AAG	3	9	1467	1475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128143
12	NC_015916	TAA	2	6	1480	1485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128143
13	NC_015916	A	6	6	1492	1497	100 %	0 %	0 %	0 %	343128143
14	NC_015916	ATAG	2	8	1541	1548	50 %	25 %	25 %	0 %	343128143
15	NC_015916	A	7	7	1561	1567	100 %	0 %	0 %	0 %	343128143
16	NC_015916	GAA	3	9	1571	1579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128143
17	NC_015916	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	343128143
18	NC_015916	TGGG	2	8	1622	1629	0 %	25 %	75 %	0 %	343128143
19	NC_015916	ATA	2	6	1656	1661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128143
20	NC_015916	TAA	2	6	1720	1725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128143
21	NC_015916	AACA	2	8	1761	1768	75 %	0 %	0 %	25 %	343128143
22	NC_015916	GAC	2	6	1811	1816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343128143
23	NC_015916	A	8	8	1838	1845	100 %	0 %	0 %	0 %	343128143
24	NC_015916	ATT	2	6	1903	1908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128143
25	NC_015916	TTA	2	6	1949	1954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128143
26	NC_015916	ATA	2	6	1965	1970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128143
27	NC_015916	A	8	8	2038	2045	100 %	0 %	0 %	0 %	343128143
28	NC_015916	GAA	2	6	2048	2053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128143
29	NC_015916	ATAC	2	8	2084	2091	50 %	25 %	0 %	25 %	343128143
30	NC_015916	TA	3	6	2101	2106	50 %	50 %	0 %	0 %	343128143
31	NC_015916	ATG	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128144
32	NC_015916	CAG	2	6	2289	2294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343128144
33	NC_015916	TAA	2	6	2331	2336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128144
34	NC_015916	GCA	2	6	4004	4009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343128145
35	NC_015916	ATT	3	9	4010	4018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128145
36	NC_015916	AAT	2	6	4036	4041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128145
37	NC_015916	TTTA	2	8	4068	4075	25 %	75 %	0 %	0 %	343128145
38	NC_015916	TTATT	2	10	4102	4111	20 %	80 %	0 %	0 %	343128145
39	NC_015916	CTT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128145
40	NC_015916	CTT	2	6	4136	4141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128145
41	NC_015916	TA	3	6	4156	4161	50 %	50 %	0 %	0 %	343128145
42	NC_015916	GCT	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343128145
43	NC_015916	A	6	6	4231	4236	100 %	0 %	0 %	0 %	343128145
44	NC_015916	ATA	2	6	4268	4273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128145
45	NC_015916	TATC	2	8	5627	5634	25 %	50 %	0 %	25 %	343128146
46	NC_015916	T	6	6	5642	5647	0 %	100 %	0 %	0 %	343128146
47	NC_015916	AT	3	6	5681	5686	50 %	50 %	0 %	0 %	343128146
48	NC_015916	AG	3	6	5693	5698	50 %	0 %	50 %	0 %	343128146
49	NC_015916	T	6	6	5739	5744	0 %	100 %	0 %	0 %	343128146
50	NC_015916	AT	3	6	6661	6666	50 %	50 %	0 %	0 %	343128147
51	NC_015916	T	7	7	6681	6687	0 %	100 %	0 %	0 %	343128147
52	NC_015916	TGT	2	6	6695	6700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128147
53	NC_015916	A	6	6	6716	6721	100 %	0 %	0 %	0 %	343128147
54	NC_015916	AAT	2	6	6762	6767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128147
55	NC_015916	GAA	2	6	6768	6773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128147
56	NC_015916	AGA	2	6	6782	6787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128147
57	NC_015916	GAA	2	6	6792	6797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128147
58	NC_015916	GAA	2	6	6825	6830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128147
59	NC_015916	AAG	2	6	6850	6855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128147
60	NC_015916	TAA	2	6	6905	6910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128147
61	NC_015916	ATA	2	6	6934	6939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128147
62	NC_015916	T	6	6	6979	6984	0 %	100 %	0 %	0 %	343128147
63	NC_015916	TATCA	2	10	7035	7044	40 %	40 %	0 %	20 %	343128147
64	NC_015916	ATG	2	6	7045	7050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128147
65	NC_015916	AAT	2	6	7061	7066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128147
66	NC_015916	ATA	2	6	7092	7097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128147
67	NC_015916	A	6	6	7123	7128	100 %	0 %	0 %	0 %	343128147
68	NC_015916	ATTTTG	2	12	7171	7182	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	343128147
69	NC_015916	AAG	2	6	7222	7227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128147
70	NC_015916	AG	3	6	7233	7238	50 %	0 %	50 %	0 %	343128147
71	NC_015916	AT	3	6	7244	7249	50 %	50 %	0 %	0 %	343128147
72	NC_015916	ATG	2	6	7276	7281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128147
73	NC_015916	T	7	7	7292	7298	0 %	100 %	0 %	0 %	343128147
74	NC_015916	A	6	6	7310	7315	100 %	0 %	0 %	0 %	343128147
75	NC_015916	ATG	2	6	7414	7419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128147
76	NC_015916	TTGAT	2	10	7480	7489	20 %	60 %	20 %	0 %	343128147
77	NC_015916	AAT	2	6	7491	7496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128147
78	NC_015916	TAA	2	6	7517	7522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128147
79	NC_015916	TAAA	2	8	8194	8201	75 %	25 %	0 %	0 %	343128148
80	NC_015916	TTAT	2	8	8241	8248	25 %	75 %	0 %	0 %	343128148
81	NC_015916	AAT	2	6	8254	8259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128148
82	NC_015916	TTA	2	6	8272	8277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128148
83	NC_015916	T	6	6	8300	8305	0 %	100 %	0 %	0 %	343128148
84	NC_015916	T	6	6	8307	8312	0 %	100 %	0 %	0 %	343128148
85	NC_015916	TCT	2	6	8346	8351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128148
86	NC_015916	ATT	2	6	8384	8389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128148
87	NC_015916	CTTT	2	8	8394	8401	0 %	75 %	0 %	25 %	343128148
88	NC_015916	A	6	6	8408	8413	100 %	0 %	0 %	0 %	343128148
89	NC_015916	ATTTAG	2	12	8426	8437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	343128148
90	NC_015916	TTA	2	6	8442	8447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128148
91	NC_015916	AAGTA	2	10	8478	8487	60 %	20 %	20 %	0 %	343128148
92	NC_015916	T	6	6	8535	8540	0 %	100 %	0 %	0 %	343128148
93	NC_015916	TTTCTT	2	12	8572	8583	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	343128148
94	NC_015916	CAA	2	6	8635	8640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343128148
95	NC_015916	TCT	2	6	8642	8647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128148
96	NC_015916	ATA	2	6	8685	8690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128148
97	NC_015916	AAT	2	6	8691	8696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128148
98	NC_015916	T	6	6	8696	8701	0 %	100 %	0 %	0 %	343128148
99	NC_015916	TA	3	6	8732	8737	50 %	50 %	0 %	0 %	343128148
100	NC_015916	CA	3	6	8747	8752	50 %	0 %	0 %	50 %	343128148
101	NC_015916	TTGC	2	8	8802	8809	0 %	50 %	25 %	25 %	343128148
102	NC_015916	TATC	2	8	8881	8888	25 %	50 %	0 %	25 %	343128148
103	NC_015916	CTTT	2	8	8904	8911	0 %	75 %	0 %	25 %	343128148
104	NC_015916	A	6	6	8927	8932	100 %	0 %	0 %	0 %	343128148
105	NC_015916	TAT	3	9	8986	8994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128148
106	NC_015916	TAA	2	6	9002	9007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128148
107	NC_015916	T	6	6	9041	9046	0 %	100 %	0 %	0 %	343128148
108	NC_015916	TAA	2	6	9097	9102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128148
109	NC_015916	TTC	2	6	9110	9115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128148
110	NC_015916	TAT	2	6	9131	9136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128148
111	NC_015916	T	6	6	9158	9163	0 %	100 %	0 %	0 %	343128148
112	NC_015916	ACT	2	6	9251	9256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128148
113	NC_015916	T	7	7	9355	9361	0 %	100 %	0 %	0 %	343128148
114	NC_015916	AT	3	6	9403	9408	50 %	50 %	0 %	0 %	343128148
115	NC_015916	ATTC	2	8	9433	9440	25 %	50 %	0 %	25 %	343128148
116	NC_015916	TTTC	2	8	9478	9485	0 %	75 %	0 %	25 %	343128148
117	NC_015916	TAAAT	2	10	9494	9503	60 %	40 %	0 %	0 %	343128148
118	NC_015916	CCA	2	6	9534	9539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343128148
119	NC_015916	ATT	2	6	9572	9577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128148
120	NC_015916	T	7	7	9594	9600	0 %	100 %	0 %	0 %	343128148
121	NC_015916	GAT	2	6	9625	9630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128148
122	NC_015916	TTTAT	2	10	9654	9663	20 %	80 %	0 %	0 %	343128148
123	NC_015916	GGA	2	6	9747	9752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343128148
124	NC_015916	TCCT	2	8	9773	9780	0 %	50 %	0 %	50 %	343128148
125	NC_015916	AATTC	2	10	9792	9801	40 %	40 %	0 %	20 %	343128148
126	NC_015916	A	6	6	9809	9814	100 %	0 %	0 %	0 %	343128148
127	NC_015916	T	6	6	9841	9846	0 %	100 %	0 %	0 %	343128148
128	NC_015916	T	6	6	9850	9855	0 %	100 %	0 %	0 %	343128148
129	NC_015916	TTA	2	6	9876	9881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128148
130	NC_015916	TTAA	2	8	9969	9976	50 %	50 %	0 %	0 %	343128148
131	NC_015916	ATT	2	6	9984	9989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128148
132	NC_015916	TTC	2	6	10013	10018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128148
133	NC_015916	T	6	6	10022	10027	0 %	100 %	0 %	0 %	343128148
134	NC_015916	TCT	2	6	10053	10058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128148
135	NC_015916	TAG	2	6	10060	10065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128148
136	NC_015916	T	6	6	10084	10089	0 %	100 %	0 %	0 %	343128148
137	NC_015916	GATA	2	8	10090	10097	50 %	25 %	25 %	0 %	343128148
138	NC_015916	TCT	2	6	10098	10103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128148
139	NC_015916	T	7	7	10129	10135	0 %	100 %	0 %	0 %	343128148
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401	NC_015916	CTTT	2	8	24612	24619	0 %	75 %	0 %	25 %	343128165
402	NC_015916	ATCA	2	8	24680	24687	50 %	25 %	0 %	25 %	343128165
403	NC_015916	GCT	2	6	24697	24702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343128165
404	NC_015916	GTAT	2	8	24711	24718	25 %	50 %	25 %	0 %	343128165
405	NC_015916	ATT	2	6	24725	24730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128165
406	NC_015916	ATTT	2	8	24745	24752	25 %	75 %	0 %	0 %	343128165
407	NC_015916	T	7	7	24793	24799	0 %	100 %	0 %	0 %	343128165
408	NC_015916	CAT	2	6	24820	24825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128165
409	NC_015916	TTA	2	6	24838	24843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128165
410	NC_015916	TAAT	2	8	24877	24884	50 %	50 %	0 %	0 %	343128165
411	NC_015916	TCT	2	6	24915	24920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128165
412	NC_015916	TCA	2	6	24936	24941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128165

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.