MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1001 chromosome 2

Total Repeats: 63001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015137	GCA	2	6	116	121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527924
2	NC_015137	CCA	2	6	133	138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323527924
3	NC_015137	CTG	2	6	145	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527924
4	NC_015137	AAG	2	6	178	183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323527924
5	NC_015137	CAGCCG	2	12	207	218	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	323527924
6	NC_015137	CGC	2	6	241	246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527924
7	NC_015137	GGC	2	6	255	260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527924
8	NC_015137	CGA	2	6	278	283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527924
9	NC_015137	GCCGAC	2	12	285	296	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	323527924
10	NC_015137	CGC	2	6	346	351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527924
11	NC_015137	CGA	2	6	374	379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527924
12	NC_015137	CGC	2	6	388	393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527924
13	NC_015137	TGA	2	6	520	525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323527925
14	NC_015137	CTG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527925
15	NC_015137	CG	3	6	541	546	0 %	0 %	50 %	50 %	323527925
16	NC_015137	GCA	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527925
17	NC_015137	GCT	2	6	667	672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527925
18	NC_015137	GGC	2	6	763	768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527925
19	NC_015137	CTTC	2	8	799	806	0 %	50 %	0 %	50 %	323527925
20	NC_015137	CTG	3	9	845	853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527925
21	NC_015137	GCT	2	6	889	894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527925
22	NC_015137	GTT	2	6	910	915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323527925
23	NC_015137	GCC	2	6	918	923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527925
24	NC_015137	CGG	2	6	973	978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527925
25	NC_015137	CGC	2	6	980	985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527925
26	NC_015137	CG	4	8	1018	1025	0 %	0 %	50 %	50 %	323527925
27	NC_015137	CTG	2	6	1037	1042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527925
28	NC_015137	CG	3	6	1043	1048	0 %	0 %	50 %	50 %	323527925
29	NC_015137	GC	3	6	1059	1064	0 %	0 %	50 %	50 %	323527925
30	NC_015137	TCG	2	6	1077	1082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527925
31	NC_015137	GGC	2	6	1151	1156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527925
32	NC_015137	TCGC	2	8	1173	1180	0 %	25 %	25 %	50 %	323527925
33	NC_015137	GCG	2	6	1188	1193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527925
34	NC_015137	TCT	2	6	1194	1199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323527925
35	NC_015137	CGA	2	6	1205	1210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527925
36	NC_015137	CGC	2	6	1211	1216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527925
37	NC_015137	TCC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	323527925
38	NC_015137	GGC	2	6	1280	1285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527925
39	NC_015137	GCG	2	6	1296	1301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527925
40	NC_015137	GGCG	2	8	1318	1325	0 %	0 %	75 %	25 %	323527925
41	NC_015137	TCG	2	6	1332	1337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527925
42	NC_015137	TTC	2	6	1379	1384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323527925
43	NC_015137	GC	3	6	1454	1459	0 %	0 %	50 %	50 %	323527925
44	NC_015137	CGG	3	9	1462	1470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527925
45	NC_015137	CGG	2	6	1567	1572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527925
46	NC_015137	GC	3	6	1578	1583	0 %	0 %	50 %	50 %	323527925
47	NC_015137	TCG	2	6	1719	1724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527925
48	NC_015137	CGG	2	6	1729	1734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527925
49	NC_015137	CCT	2	6	1752	1757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	323527925
50	NC_015137	GAC	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527925
51	NC_015137	CG	4	8	1798	1805	0 %	0 %	50 %	50 %	323527925
52	NC_015137	CGG	2	6	1822	1827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527925
53	NC_015137	CGT	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527925
54	NC_015137	GCC	2	6	1912	1917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527925
55	NC_015137	CTT	2	6	1991	1996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323527925
56	NC_015137	TCG	2	6	2037	2042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527925
57	NC_015137	CGT	2	6	2203	2208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527926
58	NC_015137	GAC	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527926
59	NC_015137	GAC	2	6	2235	2240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527926
60	NC_015137	CGT	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527926
61	NC_015137	GC	3	6	2267	2272	0 %	0 %	50 %	50 %	323527926
62	NC_015137	GCC	2	6	2300	2305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527926
63	NC_015137	TGC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527926
64	NC_015137	GC	3	6	2543	2548	0 %	0 %	50 %	50 %	323527926
65	NC_015137	GCT	2	6	2564	2569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527926
66	NC_015137	GTA	2	6	2601	2606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323527926
67	NC_015137	GCC	2	6	2628	2633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527926
68	NC_015137	CCG	2	6	2642	2647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527926
69	NC_015137	TCG	2	6	2680	2685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527926
70	NC_015137	CCG	2	6	2696	2701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527926
71	NC_015137	CGC	2	6	2711	2716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527926
72	NC_015137	CG	3	6	2768	2773	0 %	0 %	50 %	50 %	323527926
73	NC_015137	CTT	2	6	2816	2821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323527926
74	NC_015137	TGA	2	6	2917	2922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323527926
75	NC_015137	GAT	2	6	2987	2992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323527926
76	NC_015137	CCG	2	6	3044	3049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527926
77	NC_015137	GCC	2	6	3105	3110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527926
78	NC_015137	CGCGC	2	10	3111	3120	0 %	0 %	40 %	60 %	323527926
79	NC_015137	AGC	2	6	3121	3126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527926
80	NC_015137	CGCT	2	8	3159	3166	0 %	25 %	25 %	50 %	323527926
81	NC_015137	TCA	2	6	3179	3184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323527926
82	NC_015137	GCC	2	6	3210	3215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527926
83	NC_015137	TCG	2	6	3220	3225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527926
84	NC_015137	CAG	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527926
85	NC_015137	GGC	2	6	3334	3339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527926
86	NC_015137	GC	3	6	3338	3343	0 %	0 %	50 %	50 %	323527926
87	NC_015137	CG	4	8	3360	3367	0 %	0 %	50 %	50 %	323527926
88	NC_015137	ATGG	2	8	3384	3391	25 %	25 %	50 %	0 %	323527926
89	NC_015137	GCA	2	6	3395	3400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527926
90	NC_015137	TCAT	2	8	3556	3563	25 %	50 %	0 %	25 %	323527926
91	NC_015137	GCCC	2	8	3648	3655	0 %	0 %	25 %	75 %	323527927
92	NC_015137	GGC	2	6	3699	3704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527927
93	NC_015137	CGT	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527927
94	NC_015137	CTC	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	323527927
95	NC_015137	TGA	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323527927
96	NC_015137	GCAG	2	8	3819	3826	25 %	0 %	50 %	25 %	323527927
97	NC_015137	GTT	2	6	3835	3840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323527927
98	NC_015137	CGT	2	6	3867	3872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527927
99	NC_015137	CG	3	6	3873	3878	0 %	0 %	50 %	50 %	323527927
100	NC_015137	GC	3	6	3881	3886	0 %	0 %	50 %	50 %	323527927
101	NC_015137	ATC	2	6	3938	3943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323527927
102	NC_015137	TCCA	2	8	3947	3954	25 %	25 %	0 %	50 %	323527927
103	NC_015137	CGC	2	6	3977	3982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527927
104	NC_015137	GCC	2	6	4018	4023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527927
105	NC_015137	CGG	2	6	4039	4044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527927
106	NC_015137	GCC	2	6	4063	4068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527927
107	NC_015137	CGG	2	6	4077	4082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527927
108	NC_015137	GC	4	8	4099	4106	0 %	0 %	50 %	50 %	323527927
109	NC_015137	GTC	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527927
110	NC_015137	CGG	3	9	4247	4255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527927
111	NC_015137	GC	3	6	4313	4318	0 %	0 %	50 %	50 %	323527927
112	NC_015137	GGC	2	6	4332	4337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527927
113	NC_015137	TCG	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527927
114	NC_015137	CTT	2	6	4417	4422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323527927
115	NC_015137	CAT	2	6	4486	4491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323527927
116	NC_015137	TCG	2	6	4508	4513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527927
117	NC_015137	GCA	2	6	4539	4544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527927
118	NC_015137	GAT	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323527927
119	NC_015137	GCC	2	6	4578	4583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527927
120	NC_015137	CG	3	6	4603	4608	0 %	0 %	50 %	50 %	323527927
121	NC_015137	CAG	2	6	4729	4734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527927
122	NC_015137	CCT	2	6	4812	4817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	323527927
123	NC_015137	CGG	2	6	4876	4881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527927
124	NC_015137	CTGC	2	8	4882	4889	0 %	25 %	25 %	50 %	323527927
125	NC_015137	CA	3	6	4895	4900	50 %	0 %	0 %	50 %	323527927
126	NC_015137	ATC	2	6	4988	4993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323527927
127	NC_015137	TCG	2	6	5136	5141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527927
128	NC_015137	GGC	2	6	5169	5174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527927
129	NC_015137	GCA	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527927
130	NC_015137	CGCCGT	2	12	5199	5210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	323527927
131	NC_015137	TGG	2	6	5344	5349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	323527928
132	NC_015137	ACG	2	6	5519	5524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527928
133	NC_015137	TGC	2	6	5615	5620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527928
134	NC_015137	TCG	2	6	5641	5646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527928
135	NC_015137	TCG	2	6	5677	5682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527928
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137	NC_015137	CGG	3	9	5730	5738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527928
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149	NC_015137	TAC	2	6	6151	6156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323527928
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155	NC_015137	CG	3	6	6323	6328	0 %	0 %	50 %	50 %	323527928
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168	NC_015137	TCG	2	6	7071	7076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527929
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250	NC_015137	CCG	2	6	10362	10367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527931
251	NC_015137	TCG	2	6	10472	10477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323527931
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254	NC_015137	CGAC	2	8	10623	10630	25 %	0 %	25 %	50 %	323527931
255	NC_015137	GC	3	6	10680	10685	0 %	0 %	50 %	50 %	323527931
256	NC_015137	AGC	2	6	10710	10715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323527931
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258	NC_015137	CGC	2	6	10777	10782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527931
259	NC_015137	CGG	2	6	10797	10802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323527931
260	NC_015137	CAA	2	6	10819	10824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323527931
261	NC_015137	CCG	2	6	10893	10898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323527931
262	NC_015137	AGA	2	6	10938	10943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323527931
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264	NC_015137	CG	4	8	11029	11036	0 %	0 %	50 %	50 %	323527931
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